Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1aky_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 4.A N GLU 111.A OE2 ARG 4.A H 3.134 2.351 ARG 4.A NE PRO 109.A O ARG 4.A HE 2.907 1.999 ARG 4.A NH2 PRO 109.A O ARG 4.A HH21 3.074 2.229 MET 5.A N PHE 84.A O MET 5.A H 3.030 2.091 VAL 6.A N LYS 112.A O VAL 6.A H 2.968 2.027 LEU 7.A N LEU 86.A O LEU 7.A H 2.840 1.869 ILE 8.A N ILE 114.A O ILE 8.A H 2.947 1.975 ALA 13.A N PRO 10.A O ALA 13.A H 3.098 2.186 LYS 15.A NZ GLY 9.A O LYS 15.A HZ2 3.165 2.455 GLN 18.A N GLY 14.A O GLN 18.A H 3.041 2.194 GLN 18.A N LYS 15.A O GLN 18.A H 3.313 2.605 GLN 18.A NE2 PRO 204.A O GLN 18.A HE21 3.034 2.156 ALA 19.A N LYS 15.A O ALA 19.A H 3.016 2.099 ASN 21.A ND2 GLN 18.A OE1 ASN 21.A HD22 2.931 2.097 LEU 22.A N GLN 18.A O LEU 22.A H 3.260 2.321 GLN 23.A N ALA 19.A O GLN 23.A H 2.865 1.944 GLN 23.A NE2 ALA 28.A O GLN 23.A HE22 2.937 2.074 GLU 24.A N PRO 20.A O GLU 24.A H 2.900 2.014 ARG 25.A N ASN 21.A O ARG 25.A H 3.005 2.062 PHE 26.A N LEU 22.A O PHE 26.A H 2.992 2.062 ALA 29.A N GLY 83.A O ALA 29.A H 3.069 2.120 HIS 30.A NE2 ASP 87.A OD2 HIS 30.A HE2 2.799 1.853 LEU 31.A N ILE 85.A O LEU 31.A H 2.901 1.965 THR 33.A N ASP 87.A O THR 33.A H 3.404 2.566 MET 36.A N ALA 32.A O MET 36.A H 3.084 2.163 LEU 37.A N THR 33.A O LEU 37.A H 3.004 2.048 ARG 38.A N GLY 34.A O ARG 38.A H 2.969 2.032 ARG 38.A NH2 ASP 35.A OD1 ARG 38.A HH21 3.090 2.116 SER 39.A N ASP 35.A O SER 39.A H 2.987 2.103 GLN 40.A N MET 36.A O GLN 40.A H 3.218 2.299 ILE 41.A N LEU 37.A O ILE 41.A H 3.050 2.153 ALA 42.A N ARG 38.A O ALA 42.A H 3.031 2.090 LYS 43.A N SER 39.A O LYS 43.A H 3.061 2.204 GLY 44.A N ILE 41.A O GLY 44.A H 2.851 1.983 THR 45.A N GLN 40.A O THR 45.A H 3.333 2.433 THR 45.A OG1 GLN 40.A O THR 45.A HG1 3.382 2.426 GLY 48.A N THR 45.A OG1 GLY 48.A H 3.191 2.305 LEU 49.A N THR 45.A O LEU 49.A H 2.996 2.096 GLU 50.A N GLN 46.A O GLU 50.A H 3.159 2.199 ALA 51.A N LEU 47.A O ALA 51.A H 2.906 1.954 LYS 52.A N GLY 48.A O LYS 52.A H 2.955 2.072 LYS 52.A NZ ASP 56.A OD2 LYS 52.A HZ1 2.810 1.877 LYS 53.A NZ LEU 49.A O LYS 53.A HZ1 3.387 2.481 ILE 54.A N GLU 50.A O ILE 54.A H 3.527 2.579 MET 55.A N ALA 51.A O MET 55.A H 2.857 1.891 ASP 56.A N LYS 52.A O ASP 56.A H 2.993 2.043 GLN 57.A N LYS 53.A O GLN 57.A H 3.289 2.547 GLN 57.A N ILE 54.A O GLN 57.A H 3.156 2.399 GLY 58.A N MET 55.A O GLY 58.A H 2.951 2.034 GLY 59.A N ILE 54.A O GLY 59.A H 3.051 2.158 ILE 65.A N SER 62.A OG ILE 65.A H 3.269 2.304 MET 66.A N SER 62.A O MET 66.A H 3.142 2.187 VAL 67.A N ASP 63.A O VAL 67.A H 2.817 1.848 ASN 68.A N ASP 64.A O ASN 68.A H 3.134 2.186 MET 69.A N ILE 65.A O MET 69.A H 3.101 2.183 ILE 70.A N MET 66.A O ILE 70.A H 3.209 2.265 LYS 71.A N VAL 67.A O LYS 71.A H 2.958 1.998 ASP 72.A N ASN 68.A O ASP 72.A H 3.146 2.213 GLU 73.A N MET 69.A O GLU 73.A H 3.264 2.341 LEU 74.A N ILE 70.A O LEU 74.A H 2.853 1.887 THR 75.A N LYS 71.A O THR 75.A H 3.087 2.222 THR 75.A OG1 LYS 71.A O THR 75.A HG1 2.904 2.104 ASN 76.A N ASP 72.A O ASN 76.A H 2.758 1.824 ASN 77.A N GLU 73.A O ASN 77.A H 3.010 2.189 ASN 77.A ND2 GLU 73.A OE1 ASN 77.A HD22 3.278 2.591 ALA 79.A N ASN 77.A OD1 ALA 79.A H 3.303 2.421 CYS 80.A N ASN 77.A O CYS 80.A H 3.091 2.185 CYS 80.A SG GLU 73.A O no hydrogen 3.576 N/A LYS 81.A N PRO 78.A O LYS 81.A H 3.039 2.100 ASN 82.A N ALA 79.A O ASN 82.A H 3.298 2.443 PHE 84.A N ILE 3.A O PHE 84.A H 2.841 2.092 ILE 85.A N ALA 29.A O ILE 85.A H 2.733 1.780 LEU 86.A N MET 5.A O LEU 86.A H 2.930 1.954 ASP 87.A N LEU 31.A O ASP 87.A H 2.897 1.984 ARG 91.A N GLN 95.A OE1 ARG 91.A H 2.920 2.027 ARG 91.A NE GLY 88.A O ARG 91.A HE 3.010 2.089 ARG 91.A NH2 GLY 88.A O ARG 91.A HH21 3.395 2.652 GLN 95.A NE2 ASP 63.A OD1 GLN 95.A HE22 2.869 2.005 ALA 96.A N THR 92.A O ALA 96.A H 2.999 2.103 GLU 97.A N ILE 93.A O GLU 97.A H 2.874 1.930 LYS 98.A N PRO 94.A O LYS 98.A H 3.021 2.054 LEU 99.A N GLN 95.A O LEU 99.A H 3.017 2.110 ASP 100.A N ALA 96.A O ASP 100.A H 3.024 2.078 GLN 101.A N GLU 97.A O GLN 101.A H 3.121 2.196 MET 102.A N LYS 98.A O MET 102.A H 2.961 1.991 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 2.985 2.039 LYS 104.A N ASP 100.A O LYS 104.A H 3.082 2.159 GLU 105.A N GLN 101.A O GLU 105.A H 3.091 2.171 GLN 106.A N MET 102.A O GLN 106.A H 3.206 2.382 GLN 106.A NE2 THR 108.A OG1 GLN 106.A HE22 2.837 2.042 GLY 107.A N LYS 104.A O GLY 107.A H 3.275 2.460 THR 108.A N LEU 103.A O THR 108.A H 3.089 2.189 GLU 111.A N ARG 4.A O GLU 111.A H 2.831 1.880 ALA 113.A N ILE 194.A O ALA 113.A H 2.893 1.918 ILE 114.A N VAL 6.A O ILE 114.A H 2.945 2.019 GLU 115.A N ALA 196.A O GLU 115.A H 2.893 1.932 LEU 116.A N ILE 8.A O LEU 116.A H 2.860 1.887 LYS 117.A N VAL 198.A O LYS 117.A H 2.873 1.939 LEU 122.A N ASP 119.A O LEU 122.A H 3.143 2.376 LEU 123.A N ASP 120.A O LEU 123.A H 2.950 2.191 ARG 126.A N LEU 122.A O ARG 126.A H 3.474 2.534 ARG 126.A NH1 GLY 12.A O ARG 126.A HH11 3.209 2.214 ARG 126.A NH1 ALA 200.A O ARG 126.A HH12 3.358 2.547 ARG 126.A NH2 ALA 200.A O ARG 126.A HH22 2.965 2.005 ILE 127.A N LEU 123.A O ILE 127.A H 3.008 2.063 THR 128.A N VAL 124.A O THR 128.A H 2.943 1.985 GLY 129.A N ALA 125.A O GLY 129.A H 3.239 2.376 ARG 130.A N ILE 127.A O ARG 130.A H 3.276 2.324 ARG 130.A NE ASP 166.A OD2 ARG 130.A HE 2.846 1.946 ARG 130.A NH2 ASP 166.A OD1 ARG 130.A HH21 2.917 1.962 ARG 130.A NH2 ASP 166.A OD2 ARG 130.A HH21 3.073 2.268 LEU 131.A N TYR 140.A O LEU 131.A H 3.085 2.123 ILE 132.A N VAL 161.A O ILE 132.A H 2.785 1.875 HIS 133.A N ARG 138.A O HIS 133.A H 2.763 1.824 SER 136.A N HIS 133.A O SER 136.A H 2.926 2.026 GLY 137.A N HIS 133.A O GLY 137.A H 2.840 1.922 ARG 138.A NE SER 136.A OG ARG 138.A HE 3.114 2.280 ARG 138.A NH1 ASP 153.A OD2 ARG 138.A HH11 3.224 2.288 ARG 138.A NH2 SER 136.A OG ARG 138.A HH21 3.098 2.345 TYR 140.A N LEU 131.A O TYR 140.A H 2.753 1.780 TYR 140.A OH ASP 153.A OD1 TYR 140.A HH 3.026 2.089 HIS 141.A N ASN 145.A O HIS 141.A H 2.916 1.937 HIS 141.A NE2 ALA 125.A O HIS 141.A HE2 2.855 1.899 LYS 142.A N GLY 129.A O LYS 142.A H 2.915 1.941 ASN 145.A N HIS 141.A O ASN 145.A H 2.966 2.079 LYS 148.A N ASP 154.A OD2 LYS 148.A H 3.074 2.121 GLU 149.A N ASP 154.A OD1 GLU 149.A H 3.250 2.438 LYS 152.A N GLU 149.A O LYS 152.A H 3.012 2.189 ASP 153.A N GLU 158.A O ASP 153.A H 2.678 1.715 VAL 155.A N ASP 153.A OD2 VAL 155.A H 3.444 2.606 THR 156.A N ASP 153.A O THR 156.A H 3.028 2.195 GLY 157.A N ASP 153.A O GLY 157.A H 2.630 1.822 GLU 158.A N THR 156.A O GLU 158.A H 2.707 1.917 LEU 160.A N MET 151.A O LEU 160.A H 2.824 1.868 VAL 161.A N ILE 132.A O VAL 161.A H 2.822 1.868 GLN 162.A NE2 ASP 166.A O GLN 162.A HE22 3.207 2.448 ARG 163.A NE ASP 165.A OD1 ARG 163.A HE 2.933 1.967 ARG 163.A NH2 ASP 165.A OD1 ARG 163.A HH21 3.450 2.667 ARG 163.A NH2 ASP 165.A OD2 ARG 163.A HH21 2.890 1.902 ASP 166.A N ARG 163.A O ASP 166.A H 3.133 2.193 ALA 170.A N ASN 167.A OD1 ALA 170.A H 2.868 1.894 LEU 171.A N ASN 167.A O LEU 171.A H 2.703 1.784 LYS 172.A N ALA 168.A O LYS 172.A H 3.013 2.096 LYS 172.A NZ ALA 168.A O LYS 172.A HZ3 3.050 2.096 LYS 173.A N ASP 169.A O LYS 173.A H 3.442 2.499 ARG 174.A N ALA 170.A O ARG 174.A H 2.792 1.870 ARG 174.A NH1 ASP 165.A O ARG 174.A HH11 2.856 2.118 ARG 174.A NH1 ASP 166.A OD1 ARG 174.A HH12 2.913 1.933 LEU 175.A N LEU 171.A O LEU 175.A H 2.939 1.995 ALA 176.A N LYS 172.A O ALA 176.A H 3.161 2.200 ALA 177.A N LYS 173.A O ALA 177.A H 2.942 2.003 TYR 178.A N ARG 174.A O TYR 178.A H 2.991 2.084 HIS 179.A N LEU 175.A O HIS 179.A H 3.034 2.068 HIS 179.A ND1 GLU 183.A OE1 HIS 179.A HD1 2.897 1.928 HIS 179.A NE2 ASP 120.A OD1 HIS 179.A HE2 3.163 2.416 HIS 179.A NE2 ASP 120.A OD2 HIS 179.A HE2 2.805 1.850 ALA 180.A N ALA 176.A O ALA 180.A H 2.958 2.023 GLN 181.A N ALA 177.A O GLN 181.A H 2.845 1.935 THR 182.A N TYR 178.A O THR 182.A H 3.015 2.211 GLU 183.A N TYR 178.A O GLU 183.A H 2.898 1.946 ILE 185.A N THR 182.A O ILE 185.A H 2.884 1.979 VAL 186.A N GLU 183.A O VAL 186.A H 3.036 2.157 ASP 187.A N PRO 184.A O ASP 187.A H 3.191 2.468 PHE 188.A N PRO 184.A O PHE 188.A H 3.536 2.624 TYR 189.A N ILE 185.A O TYR 189.A H 3.157 2.229 LYS 190.A N VAL 186.A O LYS 190.A H 2.989 2.096 LYS 191.A N ASP 187.A O LYS 191.A H 3.027 2.084 THR 192.A N PHE 188.A O THR 192.A H 3.258 2.417 THR 192.A OG1 PHE 188.A O THR 192.A HG1 3.280 2.406 GLY 193.A N LYS 190.A O GLY 193.A H 3.060 2.256 ILE 194.A N TYR 189.A O ILE 194.A H 3.104 2.257 TRP 195.A N TYR 189.A O TRP 195.A H 3.366 2.594 TRP 195.A NE1 GLU 115.A OE1 TRP 195.A HE1 2.880 1.986 ALA 196.A N ALA 113.A O ALA 196.A H 2.990 2.054 VAL 198.A N GLU 115.A O VAL 198.A H 2.857 2.031 ASP 199.A N ASP 210.A OD2 ASP 199.A H 3.329 2.431 ALA 200.A N LYS 117.A O ALA 200.A H 2.901 2.027 SER 201.A N ASP 199.A OD1 SER 201.A H 3.182 2.269 SER 201.A OG ASP 199.A OD1 SER 201.A HG 2.847 1.914 GLN 202.A NE2 ASP 199.A OD2 GLN 202.A HE22 3.516 2.665 VAL 207.A N PRO 203.A O VAL 207.A H 2.994 2.046 TRP 208.A N PRO 204.A O TRP 208.A H 2.966 2.063 ALA 209.A N ALA 205.A O ALA 209.A H 3.142 2.193 ASP 210.A N THR 206.A O ASP 210.A H 3.094 2.175 ILE 211.A N VAL 207.A O ILE 211.A H 2.899 1.974 LEU 212.A N TRP 208.A O LEU 212.A H 2.977 2.003 ASN 213.A N ALA 209.A O ASN 213.A H 3.053 2.141 ASN 213.A ND2 ASN 218.A OD1 ASN 213.A HD22 3.089 2.162 LYS 214.A N ASP 210.A O LYS 214.A H 2.907 1.968 LYS 214.A NZ GLY 197.A O LYS 214.A HZ2 3.003 2.033 LYS 214.A NZ ASP 210.A OD1 LYS 214.A HZ1 3.054 2.139 LEU 215.A N ILE 211.A O LEU 215.A H 2.932 2.129 LEU 215.A N LEU 212.A O LEU 215.A H 3.323 2.606 GLY 216.A N ASN 213.A O GLY 216.A H 3.185 2.283