Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1am6_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): HIS 2.A ND1 TRP 3.A O HIS 2.A HD1 2.842 2.047 GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.852 1.946 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.890 2.071 ASN 9.A N GLY 6.A O ASN 9.A H 3.423 2.591 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.130 2.213 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H 2.783 1.847 HIS 13.A NE2 LYS 7.A O HIS 13.A HE2 3.032 2.274 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.354 2.498 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.269 2.487 TRP 14.A NE1 ASN 9.A O TRP 14.A HE1 3.170 2.371 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.122 2.175 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.121 2.389 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.870 1.955 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H 2.919 1.965 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.215 2.235 GLY 23.A N ILE 20.A O GLY 23.A H 2.715 1.897 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 3.078 2.147 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 2.975 2.211 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.280 2.386 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.347 2.479 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 3.115 2.397 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 2.846 2.077 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE21 3.246 2.272 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE22 3.040 2.105 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.969 2.121 SER 27.A OG SER 194.A O SER 27.A HG 3.544 3.096 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.817 1.858 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H 2.916 2.019 HIS 34.A N ASP 32.A OD1 HIS 34.A H 3.100 2.223 THR 35.A N ASP 32.A O THR 35.A H 3.140 2.254 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 2.866 1.925 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 3.024 2.046 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 2.993 2.113 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.044 2.079 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.807 1.908 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 2.896 1.927 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.104 2.170 THR 53.A OG1 GLN 51.A O THR 53.A HG1 3.570 2.659 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.718 1.805 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.835 1.896 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 2.818 1.942 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 3.221 2.476 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 2.947 1.959 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.981 2.038 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.894 2.010 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 3.021 2.037 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.167 2.215 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.234 2.264 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.094 2.145 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.864 1.928 HIS 62.A N ASN 60.A OD1 HIS 62.A H 2.897 1.956 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H 2.962 2.149 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.906 1.992 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 3.051 2.081 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.851 1.901 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.967 2.036 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.892 1.945 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 3.100 2.173 LYS 74.A N GLN 72.A O LYS 74.A H 2.730 1.979 LYS 74.A NZ THR 53.A OG1 LYS 74.A HZ2 3.350 2.480 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ1 3.012 1.992 VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 3.019 2.113 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.900 1.961 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.980 2.048 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 2.900 2.013 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.978 2.070 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.083 2.147 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.880 1.966 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1 ARG 87.A HE 2.727 1.845 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 3.013 2.257 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 87.A HH21 3.029 2.218 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.980 2.014 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.947 1.972 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 3.227 2.337 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.030 2.132 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.778 1.834 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.992 2.141 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.791 1.821 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.858 1.887 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.825 2.033 GLY 96.A N ALA 113.A O GLY 96.A H 3.425 2.565 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.114 2.318 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.249 2.355 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE22 2.776 1.976 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 3.099 2.197 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.881 2.064 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.815 2.045 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.829 1.921 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.931 1.972 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.620 1.725 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.120 2.207 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.805 1.854 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.780 1.912 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.759 1.843 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 2.934 1.953 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.158 2.473 ALA 114.A N LEU 145.A O ALA 114.A H 3.459 2.586 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.935 2.038 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.755 1.799 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.801 1.834 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.697 1.861 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 3.015 2.035 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.898 1.963 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.974 2.160 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.036 2.196 HIS 120.A NE2 TYR 49.A OH HIS 120.A HE2 2.720 1.853 TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.969 2.084 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.686 1.901 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.799 1.842 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.219 2.241 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 2.961 1.984 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.256 2.306 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.064 2.104 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.081 2.113 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.859 2.009 LYS 130.A N ASP 127.A O LYS 130.A H 3.253 2.523 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.850 2.052 LYS 130.A NZ ASP 127.A OD2 LYS 130.A HZ2 2.798 1.991 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 3.065 2.158 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.098 2.220 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.119 2.221 GLN 133.A NE2 GLY 129.A O GLN 133.A HE22 3.043 2.127 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 3.059 2.140 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.017 2.150 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.890 1.961 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.949 1.986 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.213 2.280 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.998 2.035 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.827 1.864 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.978 2.037 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.992 2.060 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.945 1.997 LYS 146.A NZ VAL 147.A O LYS 146.A HZ2 3.507 2.753 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.764 1.816 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 2.817 1.864 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.138 2.212 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.065 2.106 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE22 3.113 2.248 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.143 2.459 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.285 2.314 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.910 1.965 VAL 160.A N LYS 156.A O VAL 160.A H 3.346 2.530 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.140 2.380 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H 3.356 2.475 SER 163.A N VAL 160.A O SER 163.A H 2.924 2.061 SER 163.A OG VAL 160.A O SER 163.A HG 3.565 2.875 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.026 2.134 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.886 1.916 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.822 1.878 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H 3.257 2.316 LYS 169.A NZ GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ2 3.321 2.566 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.988 2.068 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 3.026 2.058 THR 174.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 174.A HG1 3.311 2.595 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.850 1.896 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 3.075 2.140 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.085 2.197 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.176 2.349 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.869 1.928 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.262 2.287 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 3.025 2.065 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.280 2.310 GLU 184.A N GLU 211.A OE2 GLU 184.A H 3.231 2.343 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.886 2.047 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.214 2.261 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.933 1.959 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 3.024 2.111 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.994 2.051 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.876 2.004 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.824 1.910 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.396 2.524 TYR 191.A OH SER 27.A OG TYR 191.A HH 2.684 1.918 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.754 1.793 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.910 2.112 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 3.092 2.210 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.833 1.966 CYS 203.A N LEU 201.A O CYS 203.A H 3.013 2.241 CYS 203.A SG ALA 131.A O no hydrogen 2.926 N/A CYS 203.A SG GLN 134.A O no hydrogen 2.492 N/A CYS 203.A SG CYS 203.A O no hydrogen 2.781 N/A VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.304 2.401 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.970 2.019 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 3.076 2.161 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.942 2.004 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.980 2.035 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.963 2.023 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.973 2.018 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 2.940 1.959 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.946 2.023 SER 214.A OG SER 149.A O SER 214.A HG 3.399 2.542 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.955 2.029 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.182 2.215 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.807 1.970 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.135 2.278 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE21 2.943 1.966 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE22 2.955 1.996 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H 3.178 2.214 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.951 2.103 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 3.403 2.565 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H 3.200 2.467 PHE 223.A N VAL 220.A O PHE 223.A H 3.089 2.388 ARG 224.A N VAL 220.A O ARG 224.A H 3.360 2.430 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.788 1.928 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.770 1.787 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.270 2.337 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.230 2.270 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.872 1.986 ASN 227.A ND2 GLU 235.A OE2 ASN 227.A HD21 3.002 2.125 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.895 1.929 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.974 2.037 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.750 1.934 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.249 2.426 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H 2.715 1.792 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.792 1.833 ASN 241.A N TRP 95.A O ASN 241.A H 3.371 2.550 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O ASN 241.A HD22 2.956 1.975 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 3.087 2.133 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.863 1.980 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.776 1.821 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.873 2.138 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.125 2.364 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.346 2.600 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.696 1.804 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE22 2.768 1.887 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ1 3.262 2.295 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.782 1.847 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.126 2.260 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.910 1.932 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 3.016 2.106 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.920 2.176 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.359 2.627 GLN 252.A NE2 ILE 253.A O GLN 252.A HE21 3.133 2.562 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 3.021 2.045 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.905 1.947 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.808 1.872