Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1bnm_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.863 2.106 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 3.126 2.336 LYS 6.A NZ LYS 6.A O LYS 6.A HZ1 3.423 2.554 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.314 2.573 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.185 2.213 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.821 1.919 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 2.795 2.086 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.397 2.546 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.108 2.313 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.111 2.320 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.118 2.285 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.020 2.179 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.747 1.889 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.904 1.961 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.041 2.066 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.697 1.884 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 3.135 2.245 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 3.189 2.360 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.229 2.377 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.019 2.090 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 3.191 2.381 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.073 2.292 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 2.970 2.007 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 2.986 2.081 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 3.016 2.134 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.998 2.042 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.919 2.025 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 2.895 2.201 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.899 1.938 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.773 2.051 LYS 42.A NZ SER 40.A O LYS 42.A HZ1 2.867 1.880 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.810 1.959 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.946 1.970 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.300 2.362 THR 52.A OG1 GLN 50.A O THR 52.A HG1 3.172 2.282 SER 53.A OG PHE 172.A O SER 53.A HG 2.792 1.862 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.903 1.930 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.827 2.148 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 3.099 2.150 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.960 2.057 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 3.036 2.131 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.336 2.406 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 2.915 1.988 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 2.865 1.907 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.798 1.852 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.978 2.090 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.755 1.914 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.921 2.025 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 3.102 2.133 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.811 1.870 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.867 1.925 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.825 1.864 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.622 1.868 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 3.298 2.428 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.801 1.897 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.801 1.857 LYS 77.A NZ THR 84.A OG1 LYS 77.A HZ1 2.664 1.817 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 2.791 1.985 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 3.016 2.112 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.114 2.143 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 2.650 1.841 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.878 1.935 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 3.093 2.389 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 3.193 2.266 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 2.715 1.877 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.928 1.950 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 3.022 2.053 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 3.098 2.213 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.093 2.197 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.936 1.990 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 3.066 2.222 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.737 1.826 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.874 1.905 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.959 2.180 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.127 2.274 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.772 1.916 SER 102.A OG HIS 104.A O SER 102.A HG 2.903 2.107 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.922 2.189 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.921 1.976 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 3.052 2.238 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.645 1.801 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 2.927 2.017 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.843 1.891 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.707 1.932 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.729 1.826 TYR 111.A N SER 102.A OG TYR 111.A H 2.744 1.786 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.893 2.055 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.776 1.820 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.919 1.962 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.702 1.886 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.969 1.998 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.862 1.971 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.923 2.091 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.016 2.162 HIS 119.A NE2 TYR 48.A OH HIS 119.A HE2 2.639 1.794 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.958 2.064 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.622 1.909 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.733 1.771 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.259 2.309 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.946 1.988 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.090 2.158 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.395 2.433 LYS 123.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ3 3.510 2.577 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.034 2.091 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.141 2.165 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 3.325 2.596 LYS 129.A N ASP 126.A O LYS 129.A H 3.338 2.496 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD1 LYS 129.A HZ1 3.127 2.137 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD2 LYS 129.A HZ1 2.821 2.003 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 3.245 2.312 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.135 2.234 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 2.783 1.940 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.163 2.350 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 2.887 2.011 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.853 1.917 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 3.109 2.146 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.163 2.248 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 3.115 2.150 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.746 1.793 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.791 1.898 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 3.174 2.213 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.762 1.825 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.641 1.796 SER 148.A OG SER 213.A OG SER 148.A HG 3.135 2.278 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.878 1.965 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.396 2.391 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.121 2.233 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 2.980 2.100 GLN 154.A NE2 GLN 154.A O GLN 154.A HE22 3.185 2.590 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE22 3.155 2.389 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 2.911 2.115 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.227 2.289 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.993 2.085 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.405 2.515 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 3.063 2.207 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ3 2.773 2.029 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.795 1.869 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 3.050 2.094 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.161 2.225 LYS 168.A NZ GLU 230.A OE2 LYS 168.A HZ2 3.509 2.546 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.967 2.183 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.794 1.829 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.828 1.924 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.258 2.284 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 2.923 1.980 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.567 2.607 GLU 183.A N GLU 210.A OE2 GLU 183.A H 2.930 1.998 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.930 2.079 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.138 2.186 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 3.261 2.289 TYR 187.A OH LYS 42.A O TYR 187.A HH 2.708 1.874 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.939 2.161 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 3.152 2.350 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.949 2.065 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.267 2.405 TYR 190.A OH SER 26.A OG TYR 190.A HH 2.656 1.894 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.817 1.844 SER 193.A N SER 26.A OG SER 193.A H 3.042 2.139 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.992 2.117 THR 196.A OG1 PRO 197.A O THR 196.A HG1 3.188 2.450 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.883 2.024 CYS 202.A SG VAL 131.A O no hydrogen 3.587 N/A VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.342 2.494 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.801 1.898 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.934 1.992 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.938 1.994 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 3.011 2.053 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.895 1.935 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 3.154 2.232 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.803 1.853 LYS 209.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ2 3.381 2.569 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.737 1.810 SER 213.A OG SER 148.A O SER 213.A HG 3.110 2.291 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.812 1.887 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 2.891 1.932 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.356 2.528 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 2.804 1.847 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.249 2.270 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.855 2.055 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.255 2.439 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.112 2.331 PHE 222.A N VAL 219.A O PHE 222.A H 3.012 2.321 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.502 2.605 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.757 1.902 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.848 1.856 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.053 2.122 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.127 2.173 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.674 1.882 ASN 226.A ND2 LEU 225.A O ASN 226.A HD22 2.941 1.997 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.711 1.760 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.742 1.891 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.914 1.948 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.127 2.311 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.772 1.834 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.953 1.998 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.330 2.536 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.805 1.836 ASN 240.A ND2 PHE 92.A O ASN 240.A HD21 3.603 2.908 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 2.902 2.000 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 3.106 2.159 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.938 2.001 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.700 2.005 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.336 2.624 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.331 2.539 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.767 1.869 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.662 1.822 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.909 1.957 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.764 1.796 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.115 2.270 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.923 1.979 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.931 2.014 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.896 2.112 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 3.112 2.155 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.870 1.996 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 3.194 2.233