Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1jdr_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 2.A OG1 PRO 3.A O THR 2.A HG1 3.367 2.869 ALA 8.A N THR 275.A O ALA 8.A H 2.834 1.877 SER 9.A N GLY 129.A O SER 9.A H 2.791 1.853 GLU 11.A N GLU 11.A OE2 GLU 11.A H 2.837 2.003 ARG 14.A N GLU 11.A O ARG 14.A H 2.948 1.995 ARG 14.A NH1 ASP 18.A OD2 ARG 14.A HH11 2.958 2.010 SER 15.A N ASP 18.A OD1 SER 15.A H 2.946 2.035 ASP 18.A N SER 15.A O ASP 18.A H 3.047 2.356 PHE 19.A N SER 15.A O PHE 19.A H 3.394 2.450 GLN 20.A N TYR 16.A O GLN 20.A H 2.835 1.936 LYS 21.A N GLU 17.A O LYS 21.A H 3.040 2.213 VAL 22.A N ASP 18.A O VAL 22.A H 3.202 2.329 TYR 23.A N PHE 19.A O TYR 23.A H 2.875 1.913 TYR 23.A OH GLU 118.A OE1 TYR 23.A HH 2.762 1.979 ASN 24.A N GLN 20.A O ASN 24.A H 2.854 1.913 ASN 24.A ND2 GLN 20.A OE1 ASN 24.A HD22 3.030 2.440 ASN 24.A ND2 GLN 292.A OE1 ASN 24.A HD22 2.830 1.995 ALA 25.A N LYS 21.A O ALA 25.A H 2.997 2.085 ILE 26.A N VAL 22.A O ILE 26.A H 2.984 2.036 ALA 27.A N TYR 23.A O ALA 27.A H 2.798 1.837 LEU 28.A N ASN 24.A O LEU 28.A H 2.786 1.852 LYS 29.A N ALA 25.A O LYS 29.A H 3.087 2.189 LYS 29.A NZ ASP 33.A OD1 LYS 29.A HZ2 2.814 2.063 LEU 30.A N ILE 26.A O LEU 30.A H 2.894 2.003 ARG 31.A N ALA 27.A O ARG 31.A H 3.058 2.174 ARG 31.A NH1 LEU 294.A OXT ARG 31.A HH12 2.776 1.792 ARG 31.A NH2 LEU 294.A O ARG 31.A HH22 2.914 1.928 GLU 32.A N LEU 28.A O GLU 32.A H 2.919 1.989 ASP 33.A N LYS 29.A O ASP 33.A H 2.876 1.906 TYR 39.A N GLU 35.A O TYR 39.A H 2.893 1.950 ILE 40.A N TYR 36.A O ILE 40.A H 3.091 2.403 ILE 40.A N ASP 37.A O ILE 40.A H 3.136 2.275 GLY 41.A N TYR 36.A O GLY 41.A H 2.948 1.989 LEU 46.A N TYR 42.A O LEU 46.A H 3.075 2.179 VAL 47.A N GLY 43.A O VAL 47.A H 3.190 2.275 ARG 48.A N.A PRO 44.A O ARG 48.A H.A 2.998 2.048 ARG 48.A NH1.A ALA 83.A O ARG 48.A HH12.A 3.053 2.130 ARG 48.A NH2.A ALA 83.A O ARG 48.A HH22.A 3.281 2.442 LEU 49.A N VAL 45.A O LEU 49.A H 2.889 1.996 ALA 50.A N LEU 46.A O ALA 50.A H 3.002 2.055 TRP 51.A N VAL 47.A O TRP 51.A H 2.952 2.015 HIS 52.A N ARG 48.A O.A HIS 52.A H 2.791 1.840 HIS 52.A ND1 ASN 82.A OD1 HIS 52.A HD1 2.596 1.818 THR 53.A N LEU 49.A O THR 53.A H 2.931 2.009 SER 54.A N ALA 50.A O SER 54.A H 3.297 2.537 SER 54.A N TRP 51.A O SER 54.A H 3.165 2.436 SER 54.A OG ALA 50.A O SER 54.A HG 2.835 1.967 GLY 55.A N TRP 51.A O GLY 55.A H 2.632 1.816 TRP 57.A N SER 54.A O TRP 57.A H 3.229 2.306 TRP 57.A NE1 ASN 62.A OD1 TRP 57.A HE1 2.794 1.872 ASP 58.A N THR 63.A O ASP 58.A H 3.056 2.202 LYS 59.A N ARG 160.A O LYS 59.A H 3.103 2.137 LYS 59.A NZ GLN 159.A O LYS 59.A HZ1 2.786 1.916 HIS 60.A N ASP 58.A OD1 HIS 60.A H 2.977 2.084 HIS 60.A ND1 ASP 58.A OD1 HIS 60.A HD1 2.806 2.069 ASP 61.A N ASP 58.A O ASP 61.A H 3.345 2.517 ASN 62.A N ASP 58.A O ASN 62.A H 2.863 2.150 ASN 62.A ND2 LEU 4.A O ASN 62.A HD21 2.773 1.834 ASN 62.A ND2 GLY 273.A O ASN 62.A HD22 3.258 2.344 THR 63.A N ASP 61.A OD1 THR 63.A H 3.206 2.314 GLY 69.A N SER 66.A O GLY 69.A H 3.342 2.533 THR 70.A OG1 GLU 76.A OE2 THR 70.A HG1 2.796 1.949 ARG 72.A N GLY 69.A O ARG 72.A H 3.441 2.464 ARG 72.A NH1 GLY 68.A O ARG 72.A HH12 2.944 2.074 ARG 72.A NH1 GLY 69.A O ARG 72.A HH11 2.949 2.118 ARG 72.A NH2 THR 133.A O ARG 72.A HH22 2.819 2.053 PHE 73.A N THR 70.A O PHE 73.A H 2.944 1.983 LYS 74.A NZ GLU 135.A OE2 LYS 74.A HZ1 3.468 2.573 LYS 75.A NZ THR 138.A O LYS 75.A HZ2 2.883 1.983 LYS 75.A NZ ASP 140.A OD1 LYS 75.A HZ1 2.908 1.945 PHE 77.A N PHE 73.A O PHE 77.A H 2.962 2.004 ASN 78.A N LYS 74.A O ASN 78.A H 2.715 1.817 ASP 79.A N GLU 76.A O ASP 79.A H 3.155 2.219 SER 81.A N ASP 79.A OD1 SER 81.A H 3.032 2.122 ASN 82.A N ASP 79.A O ASN 82.A H 2.743 1.848 ASN 82.A ND2 GLU 76.A O ASN 82.A HD21 2.872 1.937 ALA 83.A N PRO 80.A O ALA 83.A H 3.104 2.168 GLY 84.A N GLN 86.A OE1 GLY 84.A H 2.728 1.939 LEU 85.A N ASN 82.A O LEU 85.A H 2.944 2.005 GLN 86.A N GLN 86.A OE1 GLN 86.A H 2.789 1.880 ASN 87.A N GLY 84.A O ASN 87.A H 3.162 2.231 PHE 89.A N LEU 85.A O PHE 89.A H 3.068 2.118 LYS 90.A N GLN 86.A O LYS 90.A H 2.847 1.919 PHE 91.A N ASN 87.A O PHE 91.A H 3.115 2.235 LEU 92.A N GLY 88.A O LEU 92.A H 3.075 2.179 GLU 93.A N PHE 89.A O GLU 93.A H 3.097 2.377 GLU 93.A N LYS 90.A O GLU 93.A H 3.399 2.603 HIS 96.A N LEU 92.A O HIS 96.A H 2.862 1.921 HIS 96.A NE2 ILE 102.A O HIS 96.A HE2 2.626 1.769 LYS 97.A N GLU 93.A O LYS 97.A H 2.905 2.041 GLU 98.A N PRO 94.A O GLU 98.A H 3.015 2.118 PHE 99.A N ILE 95.A O PHE 99.A H 2.955 2.063 ILE 102.A N PHE 99.A O ILE 102.A H 3.214 2.254 SER 103.A N GLU 11.A OE1 SER 103.A H 3.123 2.158 SER 103.A OG GLU 11.A OE1 SER 103.A HG 3.400 2.467 SER 104.A N ASP 132.A OD1 SER 104.A H 2.926 2.049 ASP 106.A N SER 103.A OG ASP 106.A H 3.210 2.299 LEU 107.A N SER 103.A O LEU 107.A H 2.989 2.073 PHE 108.A N SER 104.A O PHE 108.A H 2.808 1.848 SER 109.A N GLY 105.A O SER 109.A H 3.062 2.086 LEU 110.A N ASP 106.A O LEU 110.A H 2.849 1.938 GLY 111.A N LEU 107.A O GLY 111.A H 2.883 1.998 GLY 112.A N PHE 108.A O GLY 112.A H 3.483 2.596 VAL 113.A N SER 109.A O VAL 113.A H 3.135 2.169 THR 114.A N LEU 110.A O THR 114.A H 2.845 1.882 ALA 115.A N GLY 111.A O ALA 115.A H 2.997 2.048 VAL 116.A N GLY 112.A O VAL 116.A H 3.028 2.056 GLN 117.A N VAL 113.A O GLN 117.A H 3.089 2.110 GLN 117.A NE2 TYR 23.A OH GLN 117.A HE21 3.173 2.323 GLN 117.A NE2 PHE 286.A O GLN 117.A HE22 2.967 2.059 GLU 118.A N THR 114.A O GLU 118.A H 2.824 1.879 MET 119.A N ALA 115.A O MET 119.A H 2.907 2.083 MET 119.A N VAL 116.A O MET 119.A H 3.241 2.558 GLN 120.A N GLN 117.A O GLN 120.A H 3.073 2.272 GLY 121.A N VAL 116.A O GLY 121.A H 2.851 2.011 LYS 123.A NZ.A PHE 286.A O LYS 123.A HZ1.A 3.144 2.179 LYS 123.A NZ.A GLU 291.A OE1 LYS 123.A HZ3.A 3.449 2.632 LYS 123.A NZ.A GLU 291.A OE2 LYS 123.A HZ3.A 2.933 1.994 LYS 123.A NZ.B GLU 291.A OE1 LYS 123.A HZ3.B 2.925 1.911 LYS 123.A NZ.B GLU 291.A OE2 LYS 123.A HZ3.B 3.484 2.742 ILE 124.A N GLN 117.A OE1 ILE 124.A H 2.922 1.964 TRP 126.A N PHE 284.A O TRP 126.A H 2.825 1.882 TRP 126.A NE1 SER 109.A OG TRP 126.A HE1 2.952 1.983 ARG 127.A NH2.B PRO 281.A O ARG 127.A HH21.B 3.365 2.516 GLY 129.A N ASP 106.A OD2 GLY 129.A H 2.978 2.053 ARG 130.A N ASP 106.A OD1 ARG 130.A H 3.008 2.108 ARG 130.A NE SER 66.A OG ARG 130.A HE 2.994 2.086 ARG 130.A NE LEU 270.A O ARG 130.A HE 3.434 2.650 ARG 130.A NH1 ASP 106.A OD1 ARG 130.A HH11 2.903 1.955 ARG 130.A NH1 ARG 127.A O.A ARG 130.A HH12 2.704 1.858 ARG 130.A NH2 LEU 270.A O ARG 130.A HH21 2.894 1.914 THR 133.A N GLY 68.A O THR 133.A H 3.148 2.201 THR 137.A N PRO 134.A O THR 137.A H 2.932 1.978 THR 137.A OG1 THR 133.A OG1 THR 137.A HG1 2.769 1.954 THR 138.A N GLU 135.A O THR 138.A H 3.171 2.227 ARG 143.A NH1 THR 63.A OG1 ARG 143.A HH12 2.995 2.132 ARG 143.A NH2 THR 56.A O ARG 143.A HH21 2.865 1.890 ARG 143.A NH2 THR 63.A OG1 ARG 143.A HH22 2.893 2.015 TYR 153.A N ASP 150.A OD2 TYR 153.A H 3.058 2.134 VAL 154.A N ASP 150.A O VAL 154.A H 3.040 2.076 ARG 155.A N ALA 151.A O ARG 155.A H 2.858 1.898 ARG 155.A NE ASP 165.A OD1 ARG 155.A HE 2.891 1.944 ARG 155.A NH1 ASP 241.A OD1 ARG 155.A HH12 3.004 2.025 ARG 155.A NH2 ASP 165.A OD1 ARG 155.A HH21 3.560 2.823 ARG 155.A NH2 ASP 165.A OD2 ARG 155.A HH21 3.066 2.139 ARG 155.A NH2 ASP 241.A OD1 ARG 155.A HH22 3.515 2.729 ARG 155.A NH2 ASP 241.A OD2 ARG 155.A HH22 2.972 1.989 THR 156.A N ASP 152.A O THR 156.A H 2.980 2.007 PHE 157.A N TYR 153.A O PHE 157.A H 2.771 1.833 PHE 158.A N VAL 154.A O PHE 158.A H 3.005 2.031 GLN 159.A N ARG 155.A O GLN 159.A H 3.334 2.626 GLN 159.A N THR 156.A O GLN 159.A H 3.125 2.303 ARG 160.A N PHE 157.A O ARG 160.A H 3.192 2.295 ARG 160.A NE TRP 57.A O ARG 160.A HE 2.829 1.967 ARG 160.A NH1 ARG 143.A O ARG 160.A HH12 2.973 2.061 ARG 160.A NH2 TRP 57.A O ARG 160.A HH21 2.997 2.185 ARG 160.A NH2 ARG 143.A O ARG 160.A HH22 3.091 2.217 LEU 161.A N PHE 158.A O LEU 161.A H 3.076 2.287 ASN 162.A N GLN 159.A O ASN 162.A H 2.980 2.096 MET 163.A N PHE 158.A O MET 163.A H 3.012 2.058 ASN 164.A N GLU 167.A OE2 ASN 164.A H 2.854 1.946 ARG 166.A NH1.A GLU 250.A OE2 ARG 166.A HH12.A 3.085 2.125 ARG 166.A NH1.A ASP 261.A OD2 ARG 166.A HH11.A 3.177 2.230 ARG 166.A NH1.B GLU 250.A OE1 ARG 166.A HH12.B 3.028 2.238 ARG 166.A NH2.A GLU 250.A OE1 ARG 166.A HH22.A 2.615 1.736 ARG 166.A NH2.B GLU 250.A OE1 ARG 166.A HH22.B 2.994 2.133 ARG 166.A NH2.B GLU 250.A OE2 ARG 166.A HH22.B 2.777 1.867 ARG 166.A NH2.B ASP 261.A OD2 ARG 166.A HH21.B 3.246 2.255 GLU 167.A N ASN 164.A OD1 GLU 167.A H 2.897 1.941 VAL 168.A N ASN 164.A O VAL 168.A H 2.944 2.007 VAL 169.A N ASP 165.A O VAL 169.A H 3.004 2.034 ALA 170.A N ARG 166.A O.A ALA 170.A H 2.949 1.999 LEU 171.A N GLU 167.A O LEU 171.A H 2.885 1.931 MET 172.A N VAL 168.A O MET 172.A H 2.942 2.013 GLY 173.A N ALA 170.A O GLY 173.A H 3.014 2.191 ALA 174.A N LEU 171.A O ALA 174.A H 3.022 2.061 HIS 175.A N MET 172.A O HIS 175.A H 2.907 1.946 HIS 175.A ND1 ASP 235.A OD1 HIS 175.A HD1 2.809 1.931 THR 176.A N GLY 173.A O THR 176.A H 2.922 2.012 LEU 177.A N ALA 174.A O LEU 177.A H 2.971 2.053 GLY 178.A N ASN 195.A O GLY 178.A H 2.838 1.880 LYS 179.A NZ THR 180.A O LYS 179.A HZ1 2.970 2.170 LYS 179.A NZ GLU 188.A OE1 LYS 179.A HZ3 2.878 1.850 THR 180.A N GLY 189.A O THR 180.A H 2.841 1.872 THR 180.A OG1 GLY 189.A O THR 180.A HG1 2.940 2.021 HIS 181.A NE2 ASP 37.A OD2 HIS 181.A HE2 2.743 1.867 LEU 182.A N GLU 188.A OE2 LEU 182.A H 3.012 2.052 ASN 184.A N HIS 181.A O ASN 184.A H 2.811 1.999 SER 185.A N HIS 181.A O SER 185.A H 3.057 2.094 GLY 186.A N LEU 182.A O GLY 186.A H 2.825 2.028 GLY 189.A N THR 180.A O GLY 189.A H 3.134 2.209 TRP 191.A NE1 ASP 235.A OD2 TRP 191.A HE1 2.769 1.927 ASN 194.A ND2 ASP 199.A OD2 ASN 194.A HD22 2.917 1.960 ASN 195.A ND2 GLY 178.A O ASN 195.A HD21 3.034 2.095 ASN 196.A ND2 ILE 40.A O ASN 196.A HD21 3.205 2.269 VAL 197.A N ASN 194.A O VAL 197.A H 3.051 2.183 PHE 198.A N MET 119.A O PHE 198.A H 2.830 1.858 SER 201.A N ASP 199.A OD1 SER 201.A H 3.072 2.138 TYR 203.A N ASN 200.A O TYR 203.A H 3.141 2.434 TYR 203.A OH VAL 169.A O TYR 203.A HH 2.642 1.733 LEU 204.A N ASN 200.A O LEU 204.A H 3.335 2.368 ASN 205.A N SER 201.A O ASN 205.A H 2.825 1.868 ASN 205.A ND2 TRP 191.A O ASN 205.A HD21 2.873 1.957 LEU 206.A N PHE 202.A O LEU 206.A H 3.083 2.149 LEU 207.A N TYR 203.A O LEU 207.A H 3.034 2.113 ASN 208.A N LEU 204.A O ASN 208.A H 2.794 1.889 GLU 209.A N ASN 205.A O GLU 209.A H 2.926 1.995 TRP 211.A NE1 LEU 206.A O TRP 211.A HE1 3.162 2.302 LYS 212.A N ASP 224.A O LYS 212.A H 2.837 1.946 GLU 214.A N GLN 222.A O GLU 214.A H 2.917 1.952 ASN 216.A N ASN 220.A O ASN 216.A H 2.867 1.897 ASN 216.A ND2 GLY 186.A O ASN 216.A HD22 2.794 2.053 ALA 218.A N ASN 216.A OD1 ALA 218.A H 2.819 2.021 ASN 219.A N ASN 216.A O ASN 219.A H 2.859 1.962 ASN 220.A N ASN 216.A OD1 ASN 220.A H 3.042 2.087 ASN 220.A ND2 GLY 186.A O ASN 220.A HD21 2.911 1.938 GLN 222.A N GLU 214.A O GLN 222.A H 2.814 1.879 TRP 223.A N MET 231.A O TRP 223.A H 2.926 2.003 ASP 224.A N LYS 212.A O ASP 224.A H 2.859 1.890 SER 225.A N TYR 229.A O SER 225.A H 3.013 2.065 GLY 228.A N SER 225.A O GLY 228.A H 2.870 1.927 TYR 229.A N SER 225.A OG TYR 229.A H 3.122 2.265 MET 230.A N PRO 190.A O MET 230.A H 2.878 2.060 MET 231.A N TRP 223.A O MET 231.A H 2.816 1.945 LEU 232.A N ASP 235.A OD2 LEU 232.A H 2.873 1.981 THR 234.A N ALA 147.A O THR 234.A H 3.322 2.520 TYR 236.A N LEU 232.A O TYR 236.A H 2.941 1.973 SER 237.A N PRO 233.A O SER 237.A H 3.006 2.223 LEU 238.A N ASP 235.A O LEU 238.A H 3.029 2.129 ILE 239.A N TYR 236.A O ILE 239.A H 2.909 1.980 GLN 240.A N SER 237.A O GLN 240.A H 3.187 2.409 ASP 241.A N SER 237.A O ASP 241.A H 3.042 2.108 TYR 244.A N ASP 241.A OD2 TYR 244.A H 3.001 2.078 LEU 245.A N ASP 241.A O LEU 245.A H 2.840 1.920 SER 246.A N PRO 242.A O SER 246.A H 3.330 2.396 VAL 248.A N TYR 244.A O VAL 248.A H 2.940 2.000 LYS 249.A N LEU 245.A O LYS 249.A H 3.030 2.070 GLU 250.A N SER 246.A O GLU 250.A H 2.998 2.142 TYR 251.A N ILE 247.A O TYR 251.A H 2.944 1.998 TYR 251.A OH ASP 261.A OD2 TYR 251.A HH 2.817 1.902 ALA 252.A N VAL 248.A O ALA 252.A H 2.897 1.992 ASN 253.A N LYS 249.A O ASN 253.A H 3.155 2.465 ASN 253.A N GLU 250.A O ASN 253.A H 3.257 2.455 ASN 253.A ND2 LYS 249.A O ASN 253.A HD21 2.742 1.820 ASP 254.A N TYR 251.A O ASP 254.A H 3.331 2.375 LYS 257.A N ASP 254.A OD1 LYS 257.A H 2.993 2.050 LYS 257.A NZ GLU 250.A OE2 LYS 257.A HZ2 3.537 2.696 LYS 257.A NZ ASP 261.A OD1 LYS 257.A HZ1 3.360 2.334 PHE 258.A N ASP 254.A O PHE 258.A H 3.170 2.201 PHE 259.A N GLN 255.A O PHE 259.A H 3.001 2.053 LYS 260.A N ASP 256.A O LYS 260.A H 2.945 1.984 ASP 261.A N LYS 257.A O ASP 261.A H 2.886 1.927 PHE 262.A N PHE 258.A O PHE 262.A H 2.747 1.821 SER 263.A N PHE 259.A O SER 263.A H 2.940 1.978 LYS 264.A N LYS 260.A O LYS 264.A H 3.169 2.201 ALA 265.A N ASP 261.A O ALA 265.A H 3.016 2.054 PHE 266.A N PHE 262.A O PHE 266.A H 2.778 1.854 GLU 267.A N SER 263.A O GLU 267.A H 3.087 2.148 LYS 268.A N LYS 264.A O LYS 268.A H 2.946 1.996 LYS 268.A NZ GLU 167.A OE2 LYS 268.A HZ1 3.164 2.231 LEU 269.A N ALA 265.A O LEU 269.A H 2.893 1.961 LEU 270.A N PHE 266.A O LEU 270.A H 2.968 2.009 GLU 271.A N LYS 268.A O GLU 271.A H 3.001 2.197 ASN 272.A N LEU 269.A O ASN 272.A H 3.502 2.587 ASN 272.A ND2 LEU 161.A O no hydrogen 3.198 N/A ILE 274.A N GLU 271.A O ILE 274.A H 3.083 2.150 THR 275.A N HIS 6.A O THR 275.A H 2.701 1.747 ALA 280.A N PRO 277.A O ALA 280.A H 2.924 2.004 PHE 284.A N TRP 126.A O PHE 284.A H 2.700 1.786 THR 288.A N GLU 291.A OE2 THR 288.A H 2.961 2.023 LEU 289.A N GLU 118.A OE1 LEU 289.A H 3.160 2.232 GLN 292.A N THR 288.A O GLN 292.A H 3.033 2.196 GLN 292.A NE2 ASN 24.A OD1 GLN 292.A HE22 2.916 2.007 GLY 293.A N GLU 290.A O GLY 293.A H 3.098 2.220 LEU 294.A N LEU 289.A O LEU 294.A H 2.918 1.978