Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1ney_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ARG 2.A NE ASP 225.A OD2 ARG 2.A HE 2.795 1.940 ARG 2.A NH1 SER 200.A O ARG 2.A HH11 2.894 2.049 ARG 2.A NH2 ALA 222.A O ARG 2.A HH22 2.883 2.203 ARG 2.A NH2 ASP 225.A OD2 ARG 2.A HH22 3.567 2.938 PHE 5.A N ASP 225.A O PHE 5.A H 3.046 2.231 VAL 6.A N GLU 36.A O VAL 6.A H 2.900 2.059 GLY 7.A N PHE 227.A O GLY 7.A H 2.881 2.034 GLY 8.A N VAL 38.A O GLY 8.A H 2.806 1.964 ASN 9.A N VAL 229.A O ASN 9.A H 2.780 1.975 PHE 10.A N CYS 40.A O PHE 10.A H 3.136 2.329 LYS 11.A N ASN 9.A OD1 LYS 11.A H 2.977 2.215 LYS 11.A NZ GLU 96.A OE1 LYS 11.A HZ3 2.811 1.921 ASN 13.A ND2 PHE 10.A O ASN 13.A HD21 2.882 2.047 SER 15.A N SER 18.A OG SER 15.A H 2.948 2.130 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 2.909 2.067 LYS 20.A N LYS 16.A O LYS 20.A H 3.044 2.211 GLU 21.A N GLN 17.A O GLU 21.A H 3.157 2.340 ILE 22.A N SER 18.A O ILE 22.A H 3.088 2.282 VAL 23.A N ILE 19.A O VAL 23.A H 2.914 2.065 GLU 24.A N LYS 20.A O GLU 24.A H 2.855 2.003 ARG 25.A N GLU 21.A O ARG 25.A H 3.067 2.260 LEU 26.A N ILE 22.A O LEU 26.A H 3.210 2.385 ASN 27.A N VAL 23.A O ASN 27.A H 2.884 2.049 ASN 27.A ND2 LEU 52.A O ASN 27.A HD22 2.946 2.111 THR 28.A N GLU 24.A O THR 28.A H 3.062 2.367 THR 28.A N ARG 25.A O THR 28.A H 3.275 2.599 ALA 29.A N LEU 26.A O ALA 29.A H 3.357 2.541 GLU 36.A N PHE 4.A O GLU 36.A H 2.885 2.028 VAL 37.A N GLN 57.A O VAL 37.A H 2.865 2.024 VAL 38.A N VAL 6.A O VAL 38.A H 2.944 2.116 ILE 39.A N THR 59.A O ILE 39.A H 2.939 2.121 CYS 40.A N GLY 8.A O CYS 40.A H 2.794 2.023 TYR 45.A N PRO 42.A O TYR 45.A H 2.872 2.049 LEU 46.A N ALA 43.A O LEU 46.A H 3.162 2.304 SER 49.A N TYR 45.A O SER 49.A H 2.957 2.137 SER 49.A OG TYR 45.A O SER 49.A HG 2.868 2.157 VAL 50.A N LEU 46.A O VAL 50.A H 3.043 2.188 SER 51.A N ASP 47.A O SER 51.A H 2.983 2.180 SER 51.A OG TYR 48.A O SER 51.A HG 2.711 1.897 LEU 52.A N TYR 48.A O LEU 52.A H 3.155 2.476 LEU 52.A N SER 49.A O LEU 52.A H 3.125 2.437 VAL 53.A N SER 49.A O VAL 53.A H 3.235 2.552 VAL 53.A N VAL 50.A O VAL 53.A H 3.305 2.581 LYS 54.A N ASN 27.A OD1 LYS 54.A H 2.822 1.978 LYS 55.A NZ ALA 29.A O LYS 55.A HZ2 3.499 2.900 GLN 57.A N GLN 57.A OE1 GLN 57.A H 2.855 2.139 GLN 57.A NE2 PRO 32.A O GLN 57.A HE21 2.999 2.141 VAL 58.A N LYS 55.A O VAL 58.A H 3.055 2.214 THR 59.A N VAL 37.A O THR 59.A H 2.957 2.116 GLY 61.A N ILE 39.A O GLY 61.A H 2.821 1.976 ALA 62.A N TYR 89.A O ALA 62.A H 2.893 2.062 GLN 63.A NE2 LYS 11.A O GLN 63.A HE22 2.916 2.075 GLN 63.A NE2 CYS 40.A O GLN 63.A HE21 2.933 2.100 TYR 66.A N ASN 77.A O TYR 66.A H 2.919 2.085 PHE 73.A N GLY 71.A O PHE 73.A H 2.995 2.280 GLU 76.A N PHE 73.A O GLU 76.A H 3.132 2.287 ASN 77.A ND2 ASN 64.A O ASN 77.A HD21 3.101 2.259 GLN 81.A N SER 78.A O GLN 81.A H 3.027 2.430 ILE 82.A N SER 78.A O ILE 82.A H 2.968 2.118 LYS 83.A N VAL 79.A O LYS 83.A H 2.976 2.143 LYS 83.A NZ GLN 118.A O LYS 83.A HZ1 2.923 2.047 ASP 84.A N ASP 80.A O ASP 84.A H 2.922 2.148 VAL 85.A N GLN 81.A O VAL 85.A H 3.251 2.530 GLY 86.A N LYS 83.A O GLY 86.A H 2.986 2.184 ALA 87.A N ILE 82.A O ALA 87.A H 3.104 2.345 LYS 88.A N VAL 60.A O LYS 88.A H 2.856 2.000 TYR 89.A OH GLU 36.A OE2 TYR 89.A HH 2.694 1.958 VAL 90.A N GLY 121.A O VAL 90.A H 2.881 2.100 ILE 91.A N ALA 62.A O ILE 91.A H 2.862 2.011 LEU 92.A N ILE 123.A O LEU 92.A H 2.928 2.080 GLU 96.A N HIS 94.A ND1 GLU 96.A H 3.042 2.193 ARG 97.A N HIS 94.A O ARG 97.A H 2.887 2.224 ARG 97.A NE GLU 103.A OE1 ARG 97.A HE 2.860 2.007 ARG 97.A NH1 GLU 103.A OE1 ARG 97.A HH11 3.548 2.896 ARG 98.A N HIS 94.A O ARG 98.A H 3.016 2.182 ARG 98.A NE GLY 93.A O ARG 98.A HE 2.854 2.144 ARG 98.A NH1 CYS 125.A O ARG 98.A HH11 2.903 2.089 SER 99.A N SER 95.A O SER 99.A H 2.905 2.120 SER 99.A OG.A SER 95.A O SER 99.A HG.A 2.800 2.096 HIS 102.A N SER 99.A O HIS 102.A H 3.180 2.408 GLU 103.A N ARG 97.A O GLU 103.A H 3.108 2.269 LYS 106.A NZ ASP 110.A OD2 LYS 106.A HZ1 2.905 2.086 PHE 107.A N ASP 104.A OD1 PHE 107.A H 2.891 2.077 ILE 108.A N ASP 104.A O ILE 108.A H 3.079 2.238 ALA 109.A N ASP 105.A O ALA 109.A H 3.013 2.195 ASP 110.A N LYS 106.A O ASP 110.A H 2.885 2.069 LYS 111.A N PHE 107.A O LYS 111.A H 2.995 2.158 LYS 111.A NZ ASN 64.A OD1 LYS 111.A HZ3 3.022 2.319 LYS 111.A NZ ALA 65.A O LYS 111.A HZ3 3.119 2.451 LYS 111.A NZ GLU 103.A OE2 LYS 111.A HZ1 2.954 2.111 THR 112.A N ILE 108.A O THR 112.A H 2.956 2.169 THR 112.A OG1 ILE 108.A O THR 112.A HG1 2.906 2.132 LYS 113.A N ALA 109.A O LYS 113.A H 3.041 2.182 PHE 114.A N ASP 110.A O PHE 114.A H 3.054 2.227 ALA 115.A N LYS 111.A O ALA 115.A H 2.895 2.048 LEU 116.A N THR 112.A O LEU 116.A H 3.059 2.206 GLY 117.A N LYS 113.A O GLY 117.A H 3.131 2.330 GLN 118.A N PHE 114.A O GLN 118.A H 3.229 2.575 GLN 118.A N ALA 115.A O GLN 118.A H 3.063 2.351 GLN 118.A NE2 ASP 80.A OD2 GLN 118.A HE21 2.794 1.942 GLY 119.A N LEU 116.A O GLY 119.A H 3.070 2.252 VAL 120.A N ALA 115.A O VAL 120.A H 3.202 2.375 GLY 121.A N LYS 88.A O GLY 121.A H 2.948 2.152 VAL 122.A N ASN 158.A O VAL 122.A H 3.028 2.203 ILE 123.A N VAL 90.A O ILE 123.A H 2.957 2.136 LEU 124.A N VAL 160.A O LEU 124.A H 2.858 2.021 CYS 125.A N LEU 92.A O CYS 125.A H 2.990 2.139 ILE 126.A N ALA 162.A O ILE 126.A H 2.983 2.150 GLY 127.A N GLN 145.A OE1 GLY 127.A H 2.908 2.098 GLU 128.A N GLU 128.A OE1 GLU 128.A H 2.811 2.060 THR 129.A N GLU 132.A OE2 THR 129.A H 2.871 2.019 LYS 133.A N THR 129.A O LYS 133.A H 2.887 2.055 LYS 134.A N LEU 130.A O LYS 134.A H 2.990 2.152 ALA 135.A N GLU 131.A O ALA 135.A H 3.050 2.274 GLY 136.A N LYS 133.A O GLY 136.A H 3.075 2.250 LYS 137.A N GLU 132.A O LYS 137.A H 2.945 2.109 VAL 141.A N LYS 137.A O VAL 141.A H 2.885 2.054 VAL 142.A N THR 138.A O VAL 142.A H 3.100 2.249 GLU 143.A N LEU 139.A O GLU 143.A H 2.934 2.102 ARG 144.A N ASP 140.A O ARG 144.A H 2.973 2.186 ARG 144.A NE.A ASP 105.A OD1 ARG 144.A HE.A 3.023 2.249 ARG 144.A NH1.B ASP 105.A OD1 ARG 144.A HH11.B 2.875 2.107 GLN 145.A N VAL 141.A O GLN 145.A H 3.006 2.165 GLN 145.A NE2 GLY 127.A O GLN 145.A HE22 3.680 3.024 LEU 146.A N VAL 142.A O LEU 146.A H 2.893 2.070 ASN 147.A N GLU 143.A O ASN 147.A H 2.774 1.936 ALA 148.A N ARG 144.A O ALA 148.A H 3.165 2.350 LEU 150.A N LEU 146.A O LEU 150.A H 2.877 2.033 GLU 151.A N ASN 147.A O GLU 151.A H 3.039 2.305 GLU 152.A N VAL 149.A O GLU 152.A H 2.903 2.151 VAL 153.A N VAL 149.A O VAL 153.A H 2.799 2.109 LYS 154.A NZ LEU 150.A O LYS 154.A HZ3 2.838 1.973 LYS 154.A NZ GLU 151.A O LYS 154.A HZ2 3.343 2.784 THR 157.A N ASP 155.A OD2 THR 157.A H 2.874 2.050 THR 157.A OG1 ASP 155.A OD2 THR 157.A HG1 2.592 1.835 VAL 159.A N PHE 156.A O VAL 159.A H 3.098 2.284 VAL 160.A N VAL 122.A O VAL 160.A H 2.871 2.023 VAL 161.A N ARG 203.A O VAL 161.A H 2.980 2.169 ALA 162.A N LEU 124.A O ALA 162.A H 2.798 1.942 TYR 163.A N LEU 205.A O TYR 163.A H 2.854 2.054 TYR 163.A OH GLU 128.A OE1 TYR 163.A HH 2.702 1.956 GLU 164.A N ILE 126.A O GLU 164.A H 2.925 2.065 VAL 166.A N GLU 128.A O VAL 166.A H 2.841 2.028 ALA 167.A N PRO 165.A O ALA 167.A H 2.981 2.192 ILE 168.A N VAL 166.A O ILE 168.A H 3.137 2.302 GLY 171.A N SER 209.A OG GLY 171.A H 2.913 2.202 ALA 174.A N TYR 206.A OH ALA 174.A H 2.944 2.132 ASP 178.A N THR 175.A OG1 ASP 178.A H 3.051 2.226 ALA 179.A N THR 175.A O ALA 179.A H 2.937 2.078 GLN 180.A N PRO 176.A O GLN 180.A H 2.933 2.092 GLN 180.A NE2 ASP 223.A OD1 GLN 180.A HE22 2.864 2.045 ASP 181.A N GLU 177.A O ASP 181.A H 3.048 2.210 ILE 182.A N ASP 178.A O ILE 182.A H 3.143 2.303 HIS 183.A N ALA 179.A O HIS 183.A H 2.858 2.004 HIS 183.A ND1 ASP 223.A O HIS 183.A HD1 3.000 2.235 ALA 184.A N GLN 180.A O ALA 184.A H 2.892 2.063 SER 185.A N ASP 181.A O SER 185.A H 3.084 2.255 SER 185.A OG.A ASP 181.A O SER 185.A HG.A 3.211 2.468 ILE 186.A N ILE 182.A O ILE 186.A H 2.877 2.028 ARG 187.A N HIS 183.A O ARG 187.A H 2.916 2.101 ARG 187.A NE ASP 223.A OD2 ARG 187.A HE 2.783 2.030 ARG 187.A NH1 ASP 223.A O ARG 187.A HH11 3.099 2.410 ARG 187.A NH1 ASP 225.A OD1 ARG 187.A HH12 2.770 1.955 ARG 187.A NH2 ALA 199.A O ARG 187.A HH22 2.889 2.084 ARG 187.A NH2 LEU 202.A O ARG 187.A HH21 2.787 1.950 LYS 188.A N ALA 184.A O LYS 188.A H 3.138 2.295 PHE 189.A N SER 185.A O PHE 189.A H 3.063 2.219 LEU 190.A N ILE 186.A O LEU 190.A H 2.854 2.022 ALA 191.A N ARG 187.A O ALA 191.A H 2.842 2.059 SER 192.A N LYS 188.A O SER 192.A H 3.319 2.546 SER 192.A N PHE 189.A O SER 192.A H 3.182 2.567 SER 192.A OG PHE 189.A O SER 192.A HG 2.623 1.813 LYS 193.A N LEU 190.A O LYS 193.A H 3.037 2.278 LEU 194.A N LEU 190.A O LEU 194.A H 2.822 2.022 GLY 195.A N ALA 191.A O GLY 195.A H 2.980 2.318 LYS 197.A NZ GLU 201.A OE1 LYS 197.A HZ3 3.367 2.540 ALA 199.A N GLY 195.A O ALA 199.A H 3.095 2.258 SER 200.A N ASP 196.A O SER 200.A H 3.080 2.289 GLU 201.A N LYS 197.A O GLU 201.A H 3.083 2.431 GLU 201.A N ALA 198.A O GLU 201.A H 3.056 2.369 LEU 202.A N ALA 198.A O LEU 202.A H 3.000 2.395 ARG 203.A NH1 GLU 36.A OE1 ARG 203.A HH11 2.912 2.132 ARG 203.A NH2 THR 3.A O ARG 203.A HH21 3.024 2.201 ARG 203.A NH2 GLU 36.A OE1 ARG 203.A HH22 2.947 2.183 ILE 204.A N ASP 225.A OD1 ILE 204.A H 2.857 2.012 LEU 205.A N VAL 161.A O LEU 205.A H 2.754 1.899 TYR 206.A N GLY 226.A O TYR 206.A H 2.977 2.142 TYR 206.A OH GLY 208.A O TYR 206.A HH 2.738 2.058 GLY 207.A N TYR 163.A O GLY 207.A H 2.927 2.103 ASN 211.A N ASN 214.A OD1 ASN 211.A H 2.801 1.956 GLY 212.A N GLU 237.A OE1 GLY 212.A H 2.908 2.058 SER 213.A N ASN 211.A OD1 SER 213.A H 2.923 2.276 ASN 214.A N ASN 211.A OD1 ASN 214.A H 2.893 2.064 ASN 214.A ND2 SER 209.A O ASN 214.A HD22 2.938 2.099 ALA 215.A N ASN 211.A O ALA 215.A H 3.042 2.308 THR 217.A N ASN 214.A O THR 217.A H 2.881 2.155 PHE 218.A N ALA 215.A O PHE 218.A H 3.061 2.229 LYS 219.A N VAL 216.A O LYS 219.A H 3.103 2.277 LYS 219.A NZ ASN 246.A OXT LYS 219.A HZ1 3.022 2.223 LYS 221.A N PHE 218.A O LYS 221.A H 3.159 2.322 ASP 223.A N GLN 180.A OE1 ASP 223.A H 2.889 2.072 VAL 224.A N LYS 221.A O VAL 224.A H 3.097 2.283 ASP 225.A N ILE 204.A O ASP 225.A H 2.916 2.066 PHE 227.A N PHE 5.A O PHE 227.A H 3.026 2.254 LEU 228.A N TYR 206.A O LEU 228.A H 3.010 2.203 VAL 229.A N GLY 7.A O VAL 229.A H 2.856 2.038 SER 233.A N GLY 230.A O SER 233.A H 2.881 2.078 SER 233.A OG GLY 230.A O SER 233.A HG 2.768 1.958 LEU 234.A N GLY 231.A O LEU 234.A H 3.299 2.468 LYS 235.A N ALA 232.A O LYS 235.A H 3.166 2.367 PHE 238.A N LYS 235.A O PHE 238.A H 3.086 2.253 VAL 239.A N PRO 236.A O VAL 239.A H 3.088 2.289 ILE 241.A N GLU 237.A O ILE 241.A H 3.146 2.351 ILE 242.A N PHE 238.A O ILE 242.A H 3.138 2.312 ASN 243.A N VAL 239.A O ASN 243.A H 3.040 2.301 ASN 243.A ND2 SER 30.A O ASN 243.A HD22 3.300 2.637 SER 244.A N ILE 241.A O SER 244.A H 3.085 2.278 SER 244.A OG ILE 241.A O SER 244.A HG 2.790 2.089 ARG 245.A NH1 VAL 224.A O ARG 245.A HH11 3.270 2.570 ARG 245.A NH2 PHE 218.A O ARG 245.A HH21 3.039 2.479 ARG 245.A NH2 VAL 224.A O ARG 245.A HH22 2.851 2.021 ASN 246.A N ASN 243.A O ASN 246.A H 3.144 2.301