Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 1vzd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TYR 6.A N GLU 3.A O TYR 6.A H 2.934 2.162 TYR 6.A OH ILE 222.A O TYR 6.A HH 2.853 1.940 LEU 7.A N GLU 3.A O LEU 7.A H 3.522 2.601 ASP 8.A N GLN 4.A O ASP 8.A H 2.746 1.879 LEU 9.A N PRO 5.A O LEU 9.A H 2.881 2.024 ALA 10.A N TYR 6.A O ALA 10.A H 2.809 1.840 LYS 11.A N LEU 7.A O LYS 11.A H 2.769 1.896 LYS 12.A N ASP 8.A O LYS 12.A H 3.119 2.189 VAL 13.A N LEU 9.A O VAL 13.A H 2.964 1.996 LEU 14.A N ALA 10.A O LEU 14.A H 3.562 2.595 ASP 15.A N LYS 11.A O ASP 15.A H 3.098 2.259 GLU 16.A N LYS 12.A O GLU 16.A H 2.589 1.889 GLY 17.A N VAL 13.A O GLY 17.A H 2.514 1.793 HIS 18.A N SER 30.A O HIS 18.A H 3.482 2.508 LYS 20.A N THR 28.A O LYS 20.A H 3.275 2.317 THR 24.A OG1 VAL 316.A OXT THR 24.A HG1 3.111 2.133 THR 28.A N LYS 20.A O THR 28.A H 2.806 1.957 THR 28.A OG1 LYS 20.A O THR 28.A HG1 2.725 2.129 TYR 29.A N LEU 260.A O TYR 29.A H 3.277 2.509 SER 30.A N HIS 18.A O SER 30.A H 3.181 2.208 ILE 31.A N ALA 258.A O ILE 31.A H 2.977 1.997 GLY 33.A N GLY 256.A O GLY 33.A H 3.064 2.139 GLN 35.A NE2 THR 254.A OG1 GLN 35.A HE22 2.628 1.929 MET 36.A N HIS 253.A O MET 36.A H 3.193 2.273 ARG 37.A NE GLU 250.A OE1 ARG 37.A HE 2.998 2.145 ARG 37.A NE GLU 250.A OE2 ARG 37.A HE 2.918 2.101 ARG 37.A NH2 GLU 250.A OE2 ARG 37.A HH21 2.808 1.967 PHE 38.A N PHE 251.A O PHE 38.A H 2.820 1.872 LEU 40.A N GLY 249.A O LEU 40.A H 2.918 2.050 SER 41.A OG VAL 248.A O SER 41.A HG 3.168 2.395 LYS 42.A N ASP 39.A O LYS 42.A H 3.238 2.264 GLY 43.A N LEU 40.A O GLY 43.A H 3.045 2.125 LYS 51.A N TYR 307.A O LYS 51.A H 3.053 2.353 VAL 52.A N TYR 304.A OH VAL 52.A H 3.169 2.227 LEU 56.A N PRO 53.A O LEU 56.A H 3.162 2.478 ILE 57.A N PHE 54.A O ILE 57.A H 2.933 2.245 LYS 58.A N PHE 54.A O LYS 58.A H 2.800 1.882 SER 59.A N GLY 55.A O SER 59.A H 3.097 2.127 SER 59.A OG GLY 55.A O SER 59.A HG 2.879 2.017 GLN 60.A N LEU 56.A O GLN 60.A H 3.208 2.273 LEU 61.A N ILE 57.A O LEU 61.A H 3.048 2.111 LEU 62.A N LYS 58.A O LEU 62.A H 2.831 1.871 TRP 63.A N SER 59.A O TRP 63.A H 2.990 2.288 TRP 63.A N GLN 60.A O TRP 63.A H 3.122 2.310 TRP 63.A NE1 ASN 70.A O TRP 63.A HE1 2.786 1.864 PHE 64.A N GLN 60.A O PHE 64.A H 3.233 2.308 LEU 65.A N LEU 61.A O LEU 65.A H 2.826 1.998 HIS 66.A N TRP 63.A O HIS 66.A H 3.527 2.589 ASN 70.A N ASP 68.A OD1 ASN 70.A H 3.332 2.554 ASN 70.A ND2 ALA 136.A O ASN 70.A HD21 3.153 2.372 ILE 71.A N GLY 140.A O ILE 71.A H 2.876 1.943 ARG 72.A N ASN 70.A OD1 ARG 72.A H 2.770 1.821 ARG 72.A NE VAL 129.A O ARG 72.A HE 2.802 1.907 ARG 72.A NH1 ASP 133.A OD1 ARG 72.A HH12 2.905 2.065 ARG 72.A NH2 VAL 129.A O ARG 72.A HH21 2.907 2.042 ARG 72.A NH2 ASP 133.A OD1 ARG 72.A HH22 2.837 1.961 LEU 75.A N ILE 71.A O LEU 75.A H 2.888 1.928 GLN 76.A N ARG 72.A O GLN 76.A H 3.378 2.542 GLN 76.A NE2 ARG 72.A O GLN 76.A HE22 2.802 1.974 HIS 77.A N LEU 74.A O HIS 77.A H 3.420 2.561 ASN 79.A N LEU 74.A O ASN 79.A H 3.008 2.108 ASN 79.A ND2 SER 59.A OG ASN 79.A HD22 3.112 2.190 ILE 81.A N ASN 79.A OD1 ILE 81.A H 2.933 1.956 TRP 82.A NE1 GLN 60.A OE1 TRP 82.A HE1 2.712 1.841 ASP 83.A N HIS 80.A O ASP 83.A H 3.172 2.259 ALA 86.A N ASP 83.A O ALA 86.A H 3.384 2.627 PHE 87.A N GLU 84.A O PHE 87.A H 2.773 2.076 GLU 88.A N GLU 84.A O GLU 88.A H 2.908 2.121 LYS 89.A N TRP 85.A O LYS 89.A H 2.866 1.896 LYS 89.A NZ ASP 141.A O LYS 89.A HZ3 3.506 2.647 TRP 90.A N PHE 87.A O TRP 90.A H 3.261 2.386 VAL 91.A N PHE 87.A O VAL 91.A H 2.762 1.832 SER 93.A N TRP 90.A O SER 93.A H 2.783 1.886 TYR 96.A N SER 93.A O TYR 96.A H 2.934 2.076 HIS 97.A ND1 HIS 97.A O HIS 97.A HD1 2.814 2.076 THR 102.A N ASP 100.A O THR 102.A H 2.511 1.778 ARG 107.A N PHE 104.A O ARG 107.A H 3.381 2.405 GLN 109.A N GLY 105.A O GLN 109.A H 2.792 1.988 GLN 109.A N HIS 106.A O GLN 109.A H 3.179 2.423 GLN 109.A NE2 HIS 106.A O GLN 109.A HE22 3.299 2.435 GLU 113.A N GLU 113.A OE1 GLU 113.A H 3.183 2.481 ALA 116.A N GLU 113.A O ALA 116.A H 3.236 2.415 VAL 117.A N PHE 114.A O VAL 117.A H 2.751 1.813 TYR 118.A N PHE 114.A O TYR 118.A H 2.855 1.953 HIS 119.A N ALA 115.A O HIS 119.A H 2.895 2.057 GLU 121.A N VAL 117.A O GLU 121.A H 2.546 1.828 LYS 124.A N GLU 120.A O LYS 124.A H 3.571 2.589 PHE 125.A N GLU 121.A O PHE 125.A H 3.138 2.196 ASP 127.A N ALA 123.A O ASP 127.A H 2.895 2.111 ARG 128.A N LYS 124.A O ARG 128.A H 3.107 2.145 ARG 128.A NH2 GLU 95.A OE1 ARG 128.A HH22 3.317 2.463 VAL 129.A N PHE 125.A O VAL 129.A H 3.233 2.273 HIS 131.A N ARG 128.A O HIS 131.A H 2.822 1.909 HIS 131.A ND1 ASP 127.A O HIS 131.A HD1 2.721 1.802 ALA 136.A N ASP 132.A O ALA 136.A H 2.971 1.998 ALA 137.A N ASP 133.A O ALA 137.A H 2.940 1.961 LYS 138.A N PHE 135.A O LYS 138.A H 2.925 2.047 TYR 139.A N PHE 135.A O TYR 139.A H 2.947 2.188 GLY 140.A N ALA 136.A O GLY 140.A H 3.019 2.257 ASP 141.A N LYS 138.A O ASP 141.A H 3.100 2.119 LEU 142.A N THR 69.A O LEU 142.A H 2.766 1.942 LEU 144.A N LEU 142.A O LEU 144.A H 3.218 2.523 SER 148.A N VAL 145.A O SER 148.A H 2.696 1.987 SER 148.A OG GLY 143.A O SER 148.A HG 3.080 2.292 GLN 149.A N VAL 145.A O GLN 149.A H 3.141 2.200 GLN 149.A NE2 ALA 184.A O GLN 149.A HE22 3.198 2.389 TRP 150.A N TYR 146.A O TRP 150.A H 2.817 1.844 ARG 151.A N GLY 147.A O ARG 151.A H 3.126 2.172 ARG 151.A NE ASP 162.A OD1 ARG 151.A HE 2.869 2.034 ARG 151.A NE ASP 162.A OD2 ARG 151.A HE 3.482 2.626 ARG 151.A NH2 ASP 162.A OD2 ARG 151.A HH21 3.130 2.157 THR 155.A N ASP 159.A O THR 155.A H 2.832 1.893 THR 155.A OG1 ASP 159.A O THR 155.A HG1 2.623 1.771 ASP 159.A N LYS 157.A O ASP 159.A H 3.057 2.200 THR 160.A OG1 ALA 152.A O THR 160.A HG1 3.146 2.176 ILE 161.A N TRP 153.A O ILE 161.A H 2.989 2.046 GLN 163.A NE2 SER 183.A O GLN 163.A HE21 2.690 1.914 LEU 164.A N TRP 150.A O LEU 164.A H 3.185 2.235 GLY 165.A N ASP 162.A OD1 GLY 165.A H 3.481 2.586 ASP 166.A N ASP 162.A O ASP 166.A H 3.167 2.246 VAL 167.A N GLN 163.A O VAL 167.A H 2.881 1.924 ILE 168.A N LEU 164.A O ILE 168.A H 2.808 1.879 GLU 169.A N GLY 165.A O GLU 169.A H 2.906 2.006 GLN 170.A N ASP 166.A O GLN 170.A H 2.891 2.017 GLN 170.A NE2 ARG 179.A O GLN 170.A HE21 3.233 2.500 ILE 171.A N VAL 167.A O ILE 171.A H 2.992 2.088 THR 173.A OG1 GLU 169.A O THR 173.A HG1 3.111 2.317 HIS 174.A N GLN 170.A O HIS 174.A H 3.046 2.317 SER 177.A N PRO 175.A O SER 177.A H 2.670 1.926 VAL 182.A N TYR 202.A O VAL 182.A H 3.402 2.484 ALA 184.A N THR 200.A O ALA 184.A H 2.743 1.878 ASP 189.A N ASN 186.A O ASP 189.A H 3.274 2.387 VAL 190.A N PRO 187.A O VAL 190.A H 3.448 2.585 THR 192.A N VAL 190.A O THR 192.A H 2.672 1.909 THR 192.A OG1 PRO 191.A O THR 192.A HG1 2.985 2.089 CYS 198.A SG SER 219.A O no hydrogen 3.299 N/A HIS 199.A N TYR 146.A OH HIS 199.A H 2.927 2.090 LEU 201.A N TYR 216.A O LEU 201.A H 3.422 2.451 TYR 202.A N VAL 182.A O TYR 202.A H 3.378 2.410 GLN 203.A NE2 ARG 178.A O GLN 203.A HE21 3.548 2.951 GLN 203.A NE2 PHE 204.A O GLN 203.A HE22 3.586 2.651 PHE 204.A N LEU 180.A O PHE 204.A H 2.748 1.957 TYR 205.A N SER 212.A O TYR 205.A H 3.145 2.353 LYS 210.A NZ GLU 247.A OE2 LYS 210.A HZ2 3.124 2.158 LEU 211.A N GLU 247.A O LEU 211.A H 2.970 2.024 SER 212.A N TYR 205.A O SER 212.A H 2.787 1.947 LEU 213.A N GLU 250.A O LEU 213.A H 3.009 2.292 GLN 214.A N GLN 203.A O GLN 214.A H 3.096 2.231 LEU 215.A N ILE 252.A O LEU 215.A H 2.858 1.991 TYR 216.A N LEU 201.A O TYR 216.A H 2.897 1.984 GLN 217.A N THR 254.A O GLN 217.A H 2.650 1.717 GLN 217.A NE2 SER 219.A O GLN 217.A HE22 3.225 2.389 GLN 217.A NE2 ASN 229.A OD1 GLN 217.A HE21 3.006 2.160 ARG 218.A N CYS 198.A O ARG 218.A H 3.105 2.261 ARG 218.A NE PRO 197.A O ARG 218.A HE 3.503 2.536 ARG 218.A NH2 PRO 196.A O ARG 218.A HH21 3.245 2.342 ALA 220.A N ASP 257.A O ALA 220.A H 3.139 2.166 ILE 222.A N HIS 259.A O ILE 222.A H 3.325 2.445 PHE 223.A N ASP 221.A OD1 PHE 223.A H 3.244 2.310 LEU 224.A N ASP 221.A O LEU 224.A H 3.250 2.455 LEU 224.A N ASP 221.A OD2 LEU 224.A H 2.656 1.964 VAL 226.A N ASP 221.A O VAL 226.A H 2.698 1.868 ASN 229.A N GLY 225.A O ASN 229.A H 3.428 2.554 ILE 230.A N VAL 226.A O ILE 230.A H 3.276 2.322 SER 232.A N PHE 228.A O SER 232.A H 2.842 1.871 SER 232.A OG PHE 228.A O SER 232.A HG 2.859 1.973 TYR 233.A N ASN 229.A O TYR 233.A H 3.398 2.423 ALA 234.A N ILE 230.A O ALA 234.A H 3.013 2.126 LEU 235.A N ALA 231.A O LEU 235.A H 2.800 1.891 LEU 236.A N SER 232.A O LEU 236.A H 2.639 1.859 THR 237.A N TYR 233.A O THR 237.A H 2.959 1.994 HIS 238.A N ALA 234.A O HIS 238.A H 3.176 2.482 HIS 238.A N LEU 235.A O HIS 238.A H 3.180 2.396 HIS 238.A ND1 ALA 234.A O HIS 238.A HD1 3.050 2.088 LEU 239.A N LEU 235.A O LEU 239.A H 3.141 2.170 VAL 240.A N LEU 236.A O VAL 240.A H 3.013 2.035 ALA 241.A N THR 237.A O ALA 241.A H 3.161 2.203 HIS 242.A N HIS 238.A O HIS 242.A H 3.224 2.254 GLU 243.A N LEU 239.A O GLU 243.A H 3.171 2.244 CYS 244.A N VAL 240.A O CYS 244.A H 2.888 1.910 CYS 244.A SG ILE 168.A O no hydrogen 4.012 N/A CYS 244.A SG VAL 240.A O no hydrogen 3.236 N/A LEU 246.A N ALA 241.A O LEU 246.A H 2.980 2.122 GLU 247.A N GLY 209.A O GLU 247.A H 2.794 1.833 GLY 249.A N LEU 211.A O GLY 249.A H 3.179 2.286 GLU 250.A N SER 212.A OG GLU 250.A H 3.153 2.285 PHE 251.A N PHE 38.A O PHE 251.A H 3.214 2.245 ILE 252.A N LEU 213.A O ILE 252.A H 3.045 2.138 HIS 253.A N MET 36.A O HIS 253.A H 2.842 1.893 HIS 253.A NE2 GLN 217.A OE1 no hydrogen 2.893 N/A THR 254.A N LEU 215.A O THR 254.A H 2.591 1.797 THR 254.A OG1 HIS 34.A O THR 254.A HG1 2.947 2.089 PHE 255.A N HIS 34.A O PHE 255.A H 2.903 2.065 GLY 256.A N GLN 217.A O GLY 256.A H 3.033 2.181 ASP 257.A N ARG 218.A O ASP 257.A H 2.860 1.945 ALA 258.A N ILE 31.A O ALA 258.A H 3.181 2.300 HIS 259.A N ALA 220.A O HIS 259.A H 2.953 2.004 HIS 259.A ND1 ASP 257.A O HIS 259.A HD1 2.786 1.825 LEU 260.A N TYR 29.A O LEU 260.A H 2.826 1.893 TYR 261.A OH VAL 316.A O TYR 261.A HH 2.917 2.113 TYR 261.A OH VAL 316.A OXT TYR 261.A HH 2.866 1.941 VAL 262.A N GLY 27.A O VAL 262.A H 3.113 2.157 ASN 263.A ND2 PRO 313.A O ASN 263.A HD21 3.317 2.600 HIS 264.A N TYR 261.A O HIS 264.A H 2.861 1.994 HIS 264.A ND1 HIS 264.A O HIS 264.A HD1 2.719 1.953 GLN 267.A N GLN 267.A OE1 GLN 267.A H 2.709 1.830 GLN 267.A NE2 ASN 263.A O GLN 267.A HE21 2.911 2.055 LYS 269.A N LEU 265.A O LYS 269.A H 3.512 2.582 GLU 270.A N ASP 266.A O GLU 270.A H 3.042 2.152 GLN 271.A N GLN 267.A O GLN 271.A H 3.189 2.404 GLN 271.A N ILE 268.A O GLN 271.A H 2.646 1.947 LEU 272.A N ILE 268.A O LEU 272.A H 3.171 2.357 LEU 272.A N LYS 269.A O LEU 272.A H 3.099 2.354 SER 273.A N GLU 270.A O SER 273.A H 3.030 2.091 ARG 274.A N GLN 271.A O ARG 274.A H 3.191 2.287 THR 281.A N LEU 302.A O THR 281.A H 2.910 1.937 ASN 285.A N ASP 298.A O ASN 285.A H 3.187 2.211 LYS 288.A N ASN 285.A O LYS 288.A H 3.469 2.503 LYS 288.A NZ ASP 293.A OD2 LYS 288.A HZ1 3.000 2.137 ILE 291.A N GLU 243.A OE1 ILE 291.A H 2.968 2.166 ASP 293.A N ASP 290.A O ASP 293.A H 2.862 1.890 PHE 294.A N ILE 291.A O PHE 294.A H 3.289 2.392 ASP 295.A N ASP 298.A OD2 ASP 295.A H 2.923 1.962 ASP 298.A N ASP 295.A O ASP 298.A H 2.739 1.927 ILE 299.A N MET 296.A O ILE 299.A H 3.381 2.443 LYS 300.A N GLN 283.A O LYS 300.A H 2.992 2.090 LEU 302.A N THR 281.A O LEU 302.A H 2.785 1.838 TYR 304.A OH LEU 47.A O TYR 304.A HH 2.801 1.876 TYR 307.A N THR 48.A O TYR 307.A H 2.842 1.885