Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 2yab_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 3.A N VAL 80.A O LYS 3.A H 3.052 2.216 LYS 3.A NZ ASP 79.A OD2 LYS 3.A HZ3 2.860 2.125 GLN 4.A NE2 PHE 2.A O GLN 4.A HE21 3.001 2.298 GLN 4.A NE2 GLU 82.A OE1 GLN 4.A HE22 2.897 2.058 ASP 9.A N LYS 6.A O ASP 9.A H 2.981 2.195 PHE 10.A N VAL 7.A O PHE 10.A H 2.965 2.150 TYR 11.A N VAL 7.A O TYR 11.A H 2.856 2.195 ASP 12.A N ARG 29.A O ASP 12.A H 2.982 2.228 GLY 14.A N LYS 27.A O GLY 14.A H 2.863 2.008 LEU 17.A N VAL 25.A O LEU 17.A H 2.775 1.918 GLY 18.A N VAL 25.A O GLY 18.A H 3.397 2.585 GLY 20.A N ALA 23.A O GLY 20.A H 2.815 2.031 ALA 23.A N GLY 20.A O ALA 23.A H 3.481 2.622 ILE 24.A N PHE 41.A O ILE 24.A H 2.909 2.123 VAL 25.A N GLY 18.A O VAL 25.A H 2.912 2.054 LYS 26.A N ALA 39.A O LYS 26.A H 2.920 2.119 LYS 27.A N GLU 15.A O LYS 27.A H 2.975 2.180 CYS 28.A N TYR 37.A O CYS 28.A H 2.929 2.145 ARG 29.A N ASP 12.A O ARG 29.A H 3.066 2.322 GLU 30.A N LEU 35.A O GLU 30.A H 2.910 2.117 LYS 31.A N PHE 10.A O LYS 31.A H 2.886 2.043 LYS 31.A NZ ASP 9.A O LYS 31.A HZ3 3.502 2.647 THR 33.A N GLU 30.A O THR 33.A H 3.299 2.512 GLY 34.A N GLU 30.A O GLY 34.A H 2.692 1.988 LEU 35.A N THR 33.A OG1 LEU 35.A H 3.060 2.243 TYR 37.A N CYS 28.A O TYR 37.A H 2.860 2.037 ALA 38.A N LEU 91.A O ALA 38.A H 2.821 1.976 ALA 39.A N LYS 26.A O ALA 39.A H 2.684 1.836 LYS 40.A N LEU 89.A O LYS 40.A H 2.719 1.885 LYS 40.A NZ GLU 62.A OE1 LYS 40.A HZ1 3.542 2.906 LYS 40.A NZ GLU 62.A OE2 LYS 40.A HZ1 2.894 2.009 PHE 41.A N ILE 24.A O PHE 41.A H 2.697 1.864 ILE 42.A N VAL 87.A O ILE 42.A H 2.869 2.020 LYS 43.A N PHE 22.A O LYS 43.A H 2.768 1.976 LYS 43.A NZ ASP 86.A OD1 LYS 43.A HZ1 2.993 2.113 LYS 43.A NZ ASP 86.A OD2 LYS 43.A HZ1 3.397 2.765 LYS 44.A N THR 85.A O LYS 44.A H 2.889 2.040 LYS 44.A NZ GLU 82.A OE2 LYS 44.A HZ1 2.969 2.103 LYS 44.A NZ ASN 83.A O LYS 44.A HZ2 2.826 2.162 ARG 45.A N.A VAL 54.A O ARG 45.A H.A 2.900 2.071 ARG 45.A N.B VAL 54.A O ARG 45.A H.B 2.911 2.089 ARG 45.A NE.B ARG 52.A O ARG 45.A HE.B 3.016 2.185 SER 47.A OG SER 50.A OG SER 47.A HG 2.839 2.205 SER 50.A N SER 47.A O SER 50.A H 3.182 2.338 VAL 54.A N LYS 43.A O VAL 54.A H 2.801 2.146 ARG 56.A NH1 GLU 60.A OE2 ARG 56.A HH11 2.739 1.906 ARG 56.A NH2 GLU 82.A OE2 ARG 56.A HH21 3.298 2.451 GLU 58.A N.A CYS 55.A O GLU 58.A H.A 3.213 2.583 GLU 58.A N.B CYS 55.A O GLU 58.A H.B 3.215 2.593 ILE 59.A N CYS 55.A O ILE 59.A H.A 3.241 2.401 GLU 60.A N ARG 56.A O GLU 60.A H 2.951 2.114 ARG 61.A N GLU 57.A O ARG 61.A H 2.922 2.160 ARG 61.A NE GLU 58.A OE1.B ARG 61.A HE 3.038 2.182 ARG 61.A NH2 GLU 58.A OE2.B ARG 61.A HH21 3.082 2.243 GLU 62.A N GLU 58.A O.A GLU 62.A H 3.119 2.301 GLU 62.A N GLU 58.A O.B GLU 62.A H 3.086 2.268 VAL 63.A N ILE 59.A O VAL 63.A H 3.033 2.187 SER 64.A N GLU 60.A O SER 64.A H 2.807 1.986 ILE 65.A N ARG 61.A O ILE 65.A H 3.019 2.214 LEU 66.A N GLU 62.A O LEU 66.A H 2.939 2.088 ARG 67.A N.A VAL 63.A O ARG 67.A H.A 2.902 2.119 ARG 67.A N.B VAL 63.A O ARG 67.A H.B 2.897 2.102 ARG 67.A NH2.A THR 1.A O ARG 67.A HH22.A 3.408 2.598 GLN 68.A N ILE 65.A O GLN 68.A H.A 2.963 2.160 GLN 68.A NE2 SER 64.A O GLN 68.A HE21 3.511 2.751 GLN 68.A NE2 GLU 165.A OE1 GLN 68.A HE22 3.245 2.392 GLN 68.A NE2 GLU 165.A OE2 GLN 68.A HE22 3.302 2.678 VAL 69.A N LEU 66.A O VAL 69.A H 3.217 2.381 ASN 73.A ND2 GLN 120.A OE1 ASN 73.A HD22 3.257 2.769 ASN 73.A ND2 ILE 155.A O ASN 73.A HD21 2.997 2.157 ILE 74.A N HIS 71.A O ILE 74.A H 3.058 2.226 ILE 75.A N LEU 157.A O ILE 75.A H 3.292 2.459 THR 76.A N GLU 92.A OE1 THR 76.A H 3.150 2.467 HIS 78.A N ILE 90.A O HIS 78.A H 2.758 1.919 HIS 78.A NE2 GLU 30.A OE1 HIS 78.A HE2 2.843 2.022 ASP 79.A N ILE 90.A O ASP 79.A H 3.260 2.474 VAL 80.A N ASP 79.A OD1 VAL 80.A H 2.946 2.238 TYR 81.A N VAL 88.A O TYR 81.A H 2.925 2.089 GLU 82.A N LYS 3.A O GLU 82.A H 2.852 2.202 ASN 83.A N ASP 86.A O ASN 83.A H 3.078 2.259 THR 85.A N ASN 83.A OD1 THR 85.A H 2.987 2.284 THR 85.A OG1 ASP 86.A OD1 THR 85.A HG1 2.852 2.180 ASP 86.A N ASN 83.A OD1 ASP 86.A H 2.862 2.028 VAL 87.A N ILE 42.A O VAL 87.A H 2.901 2.133 VAL 88.A N TYR 81.A O VAL 88.A H 2.801 1.969 LEU 89.A N LYS 40.A O LEU 89.A H 2.905 2.091 ILE 90.A N ASP 79.A O ILE 90.A H 2.803 1.958 LEU 91.A N ALA 38.A O LEU 91.A H 2.714 1.863 GLU 92.A N THR 76.A O GLU 92.A H 2.882 2.050 SER 95.A N LEU 146.A O SER 95.A H 3.239 2.463 GLY 96.A N LEU 145.A O GLY 96.A H 2.717 2.005 LEU 99.A N ILE 143.A O LEU 99.A H 2.971 2.120 PHE 102.A N GLU 98.A O PHE 102.A H 3.315 2.525 LEU 103.A N LEU 99.A O LEU 103.A H 2.926 2.099 ALA 104.A N PHE 100.A O ALA 104.A H 2.854 2.164 GLN 105.A N PHE 102.A O GLN 105.A H 3.152 2.326 LYS 106.A N LEU 103.A O LYS 106.A H 3.062 2.229 SER 108.A N GLU 107.A OE1 SER 108.A H 3.099 2.436 SER 110.A N GLU 113.A OE1 SER 110.A H 2.892 2.064 GLU 111.A N SER 287.A O GLU 111.A H 2.923 2.149 GLU 113.A N SER 110.A OG GLU 113.A H 3.119 2.278 ALA 114.A N SER 110.A O ALA 114.A H 2.961 2.126 THR 115.A N GLU 111.A O THR 115.A H 2.817 1.993 THR 115.A OG1 GLU 111.A O THR 115.A HG1 2.972 2.211 THR 115.A OG1 GLU 112.A O THR 115.A HG1 2.852 2.431 SER 116.A N GLU 112.A O SER 116.A H 3.249 2.555 SER 116.A N GLU 113.A O SER 116.A H 3.126 2.476 PHE 117.A N GLU 113.A O PHE 117.A H 3.292 2.508 ILE 118.A N ALA 114.A O ILE 118.A H 2.972 2.136 LYS 119.A N THR 115.A O LYS 119.A H 2.801 2.040 LYS 119.A NZ ASP 123.A OD1 LYS 119.A HZ1 3.066 2.374 GLN 120.A N SER 116.A O GLN 120.A H 3.339 2.571 GLN 120.A NE2 PRO 153.A O GLN 120.A HE22 3.138 2.282 ILE 121.A N PHE 117.A O ILE 121.A H 3.262 2.457 LEU 122.A N ILE 118.A O LEU 122.A H 2.870 2.048 ASP 123.A N LYS 119.A O ASP 123.A H 2.860 2.111 GLY 124.A N GLN 120.A O GLY 124.A H 3.169 2.342 VAL 125.A N ILE 121.A O VAL 125.A H 2.899 2.057 ASN 126.A N LEU 122.A O ASN 126.A H 2.714 1.910 TYR 127.A N ASP 123.A O TYR 127.A H 3.087 2.288 LEU 128.A N GLY 124.A O LEU 128.A H 3.121 2.307 HIS 129.A N VAL 125.A O HIS 129.A H 2.847 2.004 HIS 129.A NE2 ASP 197.A OD2 HIS 129.A HE2 2.760 1.910 THR 130.A N ASN 126.A O THR 130.A H 2.943 2.141 THR 130.A OG1 ASN 126.A O THR 130.A HG1 2.947 2.224 LYS 131.A N TYR 127.A O LYS 131.A H 3.390 2.607 LYS 132.A N HIS 129.A O LYS 132.A H 2.861 2.054 LYS 132.A NZ ASP 168.A OD1 LYS 132.A HZ2 3.394 2.558 LYS 132.A NZ ASP 168.A OD2 LYS 132.A HZ2 2.952 2.196 ILE 133.A N LEU 128.A O ILE 133.A H 2.900 2.051 ALA 134.A N HIS 164.A O ALA 134.A H 2.899 2.078 HIS 135.A N ASP 197.A OD2 HIS 135.A H 2.826 1.997 HIS 135.A NE2 ILE 158.A O HIS 135.A HE2 2.865 2.045 PHE 136.A N ASP 197.A OD1 PHE 136.A H 2.888 2.036 ASN 142.A N LYS 139.A O ASN 142.A H 2.949 2.160 ASN 142.A ND2 ASP 137.A O ASN 142.A HD21 2.889 2.038 ASN 142.A ND2 ASP 137.A OD2 ASN 142.A HD22 3.199 2.567 ASN 142.A ND2 ASP 159.A OD2 ASN 142.A HD22 3.269 2.600 ILE 143.A N PRO 140.A O ILE 143.A H 2.956 2.110 MET 144.A N LYS 156.A O MET 144.A H 2.932 2.083 LEU 145.A N GLY 97.A O LEU 145.A H 2.867 2.121 LEU 146.A N HIS 154.A O.A LEU 146.A H 2.922 2.109 LEU 146.A N HIS 154.A O.B LEU 146.A H 2.905 2.072 LYS 148.A NZ ASN 149.A OD1 LYS 148.A HZ3 3.396 2.846 ASN 149.A N ASP 147.A OD1 ASN 149.A H 2.883 2.041 ILE 155.A N GLN 120.A OE1 ILE 155.A H.A 2.824 1.976 LYS 156.A N MET 144.A O LYS 156.A H 2.821 1.993 LYS 156.A NZ PRO 72.A O LYS 156.A HZ1 3.024 2.474 LYS 156.A NZ GLU 92.A OE1 LYS 156.A HZ3 2.887 2.086 LEU 157.A N ASN 73.A O LEU 157.A H 2.891 2.049 ILE 158.A N ASN 142.A O ILE 158.A H 2.988 2.168 GLY 161.A N ASP 159.A OD1 GLY 161.A H 3.147 2.301 ALA 163.A N PHE 160.A O ALA 163.A H 3.321 2.549 HIS 164.A N ALA 134.A O HIS 164.A H 2.882 2.084 HIS 164.A ND1 GLU 165.A O HIS 164.A HD1 2.981 2.393 ILE 166.A N LYS 132.A O ILE 166.A H 2.797 1.957 VAL 170.A N GLU 167.A O VAL 170.A H 3.111 2.289 LYS 173.A NZ TYR 189.A O LYS 173.A HZ3 3.071 2.231 ILE 175.A N ASN 174.A OD1 ILE 175.A H 2.829 2.139 PHE 181.A N THR 178.A O PHE 181.A H 2.801 1.960 VAL 182.A N PRO 179.A O VAL 182.A H 3.355 2.543 GLU 185.A N GLU 185.A OE1 GLU 185.A H 2.836 2.066 ILE 186.A N ALA 183.A O ILE 186.A H 2.999 2.327 VAL 187.A N ALA 183.A O VAL 187.A H 3.248 2.426 ASN 188.A N PRO 184.A O ASN 188.A H 2.821 2.018 TYR 189.A N ILE 186.A O TYR 189.A H 3.100 2.265 GLU 190.A N GLU 185.A O GLU 190.A H 2.921 2.066 LEU 192.A N PHE 172.A O LEU 192.A H 3.002 2.241 GLU 195.A N GLU 195.A OE1 GLU 195.A H 2.873 2.082 MET 198.A N GLU 195.A O MET 198.A H 2.863 2.218 TRP 199.A N GLU 195.A O TRP 199.A H 3.189 2.410 SER 200.A N ALA 196.A O SER 200.A H 3.172 2.330 SER 200.A OG PHE 181.A O SER 200.A HG 2.949 2.373 ILE 201.A N ASP 197.A O ILE 201.A H 3.071 2.272 GLY 202.A N MET 198.A O GLY 202.A H 3.146 2.337 VAL 203.A N TRP 199.A O VAL 203.A H 3.022 2.246 ILE 204.A N SER 200.A O ILE 204.A H 2.876 2.040 THR 205.A N ILE 201.A O THR 205.A H 2.883 2.066 THR 205.A OG1 ILE 201.A O THR 205.A HG1 2.805 2.079 TYR 206.A N GLY 202.A O TYR 206.A H 3.007 2.172 ILE 207.A N VAL 203.A O ILE 207.A H 3.044 2.216 LEU 208.A N ILE 204.A O LEU 208.A H 2.903 2.102 LEU 209.A N THR 205.A O LEU 209.A H 3.028 2.222 SER 210.A N TYR 206.A O SER 210.A H 3.213 2.511 GLY 211.A N ILE 207.A O GLY 211.A H 2.791 1.981 SER 213.A OG GLU 180.A OE2 SER 213.A HG 2.487 1.882 GLY 217.A N THR 223.A OG1 GLY 217.A H 2.906 2.050 ASP 218.A N GLU 222.A OE1 ASP 218.A H 2.964 2.135 GLU 222.A N THR 219.A OG1 GLU 222.A H 3.304 2.475 THR 223.A N THR 219.A O THR 223.A H 3.056 2.232 LEU 224.A N LYS 220.A O LEU 224.A H 2.984 2.136 ALA 225.A N GLN 221.A O ALA 225.A H 3.128 2.330 ASN 226.A N GLU 222.A O ASN 226.A H 2.789 1.965 ASN 226.A ND2 PHE 215.A O ASN 226.A HD21 2.886 2.034 ILE 227.A N THR 223.A O ILE 227.A H 2.871 2.055 THR 228.A N LEU 224.A O THR 228.A H 3.132 2.287 THR 228.A OG1 LEU 224.A O THR 228.A HG1 3.008 2.217 THR 228.A OG1 ALA 225.A O THR 228.A HG1 3.193 2.807 ALA 229.A N ALA 225.A O ALA 229.A H 3.014 2.245 VAL 230.A N ILE 227.A O VAL 230.A H 2.897 2.077 SER 231.A N ASN 226.A O SER 231.A H 2.855 2.017 ASP 235.A N ASP 233.A OD1 ASP 235.A H 3.025 2.436 GLU 237.A N ASP 235.A OD1 GLU 237.A H 2.908 2.051 PHE 238.A N ASP 235.A O PHE 238.A H 2.924 2.086 PHE 239.A N ASP 235.A O PHE 239.A H 2.991 2.234 GLN 241.A NE2 SER 240.A O GLN 241.A HE21 3.135 2.318 THR 242.A N PHE 239.A O THR 242.A H 3.173 2.321 SER 243.A N GLU 111.A OE2 SER 243.A H 2.917 2.105 ALA 246.A N SER 243.A OG ALA 246.A H 2.973 2.175 LYS 247.A N SER 243.A O LYS 247.A H 3.098 2.276 LYS 247.A NZ GLU 244.A OE2.A LYS 247.A HZ2 2.764 2.022 ASP 248.A N GLU 244.A O.A ASP 248.A H 2.889 2.136 ASP 248.A N GLU 244.A O.B ASP 248.A H 2.841 2.082 PHE 249.A N LEU 245.A O PHE 249.A H 3.058 2.241 ILE 250.A N ALA 246.A O ILE 250.A H 3.074 2.232 ARG 251.A N LYS 247.A O ARG 251.A H 2.847 2.019 ARG 251.A NH1 GLU 244.A OE2.B ARG 251.A HH12 2.857 2.032 LYS 252.A N ASP 248.A O LYS 252.A H 3.047 2.304 LYS 252.A N PHE 249.A O LYS 252.A H 3.225 2.570 LYS 252.A NZ ASP 248.A OD1 LYS 252.A HZ1 3.036 2.273 LYS 252.A NZ ASP 248.A OD2 LYS 252.A HZ1 3.354 2.534 LEU 253.A N ILE 250.A O LEU 253.A H 3.029 2.258 LEU 254.A N ILE 250.A O LEU 254.A H 2.963 2.146 LYS 260.A N GLU 257.A O LYS 260.A H 2.967 2.159 ARG 261.A NE VAL 255.A O.A ARG 261.A HE 2.885 2.133 ARG 261.A NE VAL 255.A O.B ARG 261.A HE 2.894 2.128 ARG 261.A NH1 GLU 185.A OE2 ARG 261.A HH12 2.797 1.962 ARG 261.A NH1 GLU 195.A O ARG 261.A HH11 2.866 2.068 ARG 261.A NH2 GLU 185.A OE1 ARG 261.A HH22 2.847 1.990 ARG 261.A NH2 VAL 255.A O.A ARG 261.A HH21 2.913 2.169 ARG 261.A NH2 VAL 255.A O.B ARG 261.A HH21 2.990 2.255 LEU 262.A N LYS 252.A O LEU 262.A H 3.112 2.294 THR 263.A N GLU 266.A OE1 THR 263.A H 2.949 2.111 GLN 265.A N GLN 265.A OE1 GLN 265.A H 2.905 2.113 GLU 266.A N THR 263.A OG1 GLU 266.A H 3.161 2.318 ALA 267.A N THR 263.A O ALA 267.A H 2.859 2.072 LEU 268.A N ILE 264.A O LEU 268.A H 2.998 2.188 ARG 269.A N GLN 265.A O ARG 269.A H 3.203 2.541 ARG 269.A N GLU 266.A O ARG 269.A H 3.162 2.492 HIS 270.A N ALA 267.A O HIS 270.A H 3.175 2.342 HIS 270.A NE2 ASP 248.A OD2 HIS 270.A HE2 2.769 1.941 TRP 272.A NE1 GLU 111.A OE1 TRP 272.A HE1 2.840 2.056 ILE 273.A N HIS 270.A O ILE 273.A H 2.915 2.223 THR 274.A N HIS 270.A O THR 274.A H 2.835 1.989 VAL 276.A N GLN 280.A OE1 VAL 276.A H 2.885 2.059 GLN 280.A N ASP 277.A OD1 GLN 280.A H 2.837 2.010 ALA 281.A N ASP 277.A O ALA 281.A H 3.358 2.540 MET 282.A N THR 278.A O MET 282.A H 3.113 2.363 MET 282.A N GLN 279.A O MET 282.A H 3.200 2.605 VAL 283.A N GLN 279.A O VAL 283.A H 3.186 2.347 ARG 284.A N GLN 280.A O ARG 284.A H 3.110 2.288 ARG 284.A NH1 TRP 272.A O ARG 284.A HH11 2.954 2.138 ARG 284.A NH1 ILE 273.A O ARG 284.A HH12 3.056 2.387 ARG 285.A N ALA 281.A O ARG 285.A H 3.115 2.316 ARG 285.A NE GLU 112.A OE1 ARG 285.A HE 2.981 2.278 ARG 285.A NH2 GLU 112.A OE1 ARG 285.A HH21 2.943 2.245 GLU 286.A N MET 282.A O GLU 286.A H 2.907 2.283 GLU 286.A N VAL 283.A O GLU 286.A H 3.144 2.422 SER 287.A N ARG 284.A O SER 287.A H 3.281 2.435 VAL 288.A N GLN 241.A O VAL 288.A H 3.357 2.559 VAL 289.A N LEU 109.A O VAL 289.A H 2.944 2.100 ASN 290.A N LEU 209.A O ASN 290.A H 2.899 2.044 ASN 290.A ND2 PHE 238.A O ASN 290.A HD21 3.178 2.319 ASN 293.A N ASN 290.A OD1 ASN 293.A H 3.023 2.179 ASN 293.A ND2 SER 210.A O ASN 293.A HD21 2.820 1.980 PHE 294.A N ASN 290.A O PHE 294.A H 3.012 2.171 LYS 295.A N LEU 291.A O LYS 295.A H 2.904 2.051 LYS 295.A NZ LYS 106.A O LYS 295.A HZ2 2.844 2.113 LYS 296.A N GLU 292.A O LYS 296.A H 3.180 2.331 GLN 297.A N ASN 293.A O GLN 297.A H 2.932 2.144 TYR 298.A N PHE 294.A O TYR 298.A H 2.892 2.190 TYR 298.A N LYS 295.A O TYR 298.A H 3.124 2.506