Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3dpk_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 3.A N ASP 167.A OD2 TRP 3.A H 3.014 2.162 LYS 4.A N ILE 146.A O LYS 4.A H 2.906 2.110 ILE 6.A N ASN 144.A O ILE 6.A H 2.908 2.081 SER 9.A OG SER 142.A O SER 9.A HG 2.794 2.078 THR 11.A OG1 ILE 6.A O THR 11.A HG1 2.863 2.061 LYS 19.A N ASN 17.A OD1 LYS 19.A H 2.895 2.060 TRP 20.A N ASN 17.A O TRP 20.A H 3.215 2.356 GLU 21.A N GLU 18.A O GLU 21.A H 3.143 2.290 PHE 22.A N ALA 94.A O PHE 22.A H 2.833 2.113 ARG 24.A NE HIS 97.A O ARG 24.A HE 3.359 2.566 ARG 24.A NH1 PRO 100.A O ARG 24.A HH12 2.929 2.182 ARG 24.A NH2 HIS 97.A O ARG 24.A HH22 2.925 2.107 ARG 24.A NH2 PRO 100.A O ARG 24.A HH21 2.866 2.095 ASN 26.A N PRO 23.A O ASN 26.A H 2.947 2.107 ASN 26.A ND2 PHE 47.A O ASN 26.A HD21 3.530 2.851 LEU 27.A N ARG 24.A O LEU 27.A H 3.058 2.234 GLN 28.A N THR 45.A O GLN 28.A H 2.940 2.129 GLY 30.A N GLU 43.A O GLY 30.A H 2.772 1.941 LYS 31.A NZ GLU 43.A OE1 LYS 31.A HZ1 2.966 2.053 LEU 33.A N VAL 41.A O LEU 33.A H 2.911 2.086 GLY 36.A N GLY 39.A O GLY 36.A H 2.768 2.028 LYS 40.A N MET 59.A O LYS 40.A H 3.025 2.202 VAL 41.A N GLY 34.A O VAL 41.A H 2.958 2.121 VAL 42.A N VAL 57.A O VAL 42.A H 2.902 2.094 GLU 43.A N LYS 31.A O GLU 43.A H 2.868 2.059 ALA 44.A N VAL 55.A O ALA 44.A H 2.843 2.050 THR 45.A N GLN 28.A O THR 45.A H 2.994 2.186 ALA 46.A N LEU 53.A O ALA 46.A H 2.817 1.976 PHE 47.A N ASN 26.A O PHE 47.A H 2.862 2.025 GLY 48.A N ALA 51.A O GLY 48.A H 2.996 2.324 LEU 49.A N ALA 51.A O LEU 49.A H 3.150 2.323 LEU 53.A N ALA 46.A O LEU 53.A H 3.073 2.308 LYS 54.A NZ GLU 43.A OE2 LYS 54.A HZ1 2.825 1.977 VAL 55.A N ALA 44.A O VAL 55.A H 2.731 1.911 ALA 56.A N THR 105.A O ALA 56.A H 2.890 2.034 VAL 57.A N VAL 42.A O VAL 57.A H 2.838 2.003 LYS 58.A N VAL 103.A O LYS 58.A H 2.760 1.922 MET 59.A N LYS 40.A O MET 59.A H 2.938 2.123 LYS 61.A N PHE 38.A O LYS 61.A H 2.904 2.059 LYS 61.A NZ ALA 37.A O LYS 61.A HZ3 3.249 2.423 ALA 64.A N LYS 61.A O ALA 64.A H 3.199 2.358 GLU 68.A N HIS 65.A O GLU 68.A H 2.815 2.088 LYS 69.A N HIS 65.A O LYS 69.A H 3.157 2.391 GLU 70.A N ALA 66.A O GLU 70.A H 3.102 2.334 ALA 71.A N ASP 67.A O ALA 71.A H 3.210 2.410 LEU 72.A N GLU 68.A O LEU 72.A H 3.037 2.262 MET 73.A N LYS 69.A O MET 73.A H 3.051 2.215 SER 74.A N GLU 70.A O SER 74.A H 2.820 2.043 GLU 75.A N ALA 71.A O GLU 75.A H 2.987 2.221 LEU 76.A N LEU 72.A O LEU 76.A H 3.049 2.263 LYS 77.A N MET 73.A O LYS 77.A H 2.915 2.161 ILE 78.A N SER 74.A O ILE 78.A H 3.150 2.322 MET 79.A N GLU 75.A O MET 79.A H 3.051 2.192 SER 80.A N LEU 76.A O SER 80.A H 2.890 2.114 SER 80.A OG LYS 77.A O SER 80.A HG 2.967 2.317 HIS 81.A N LYS 77.A O HIS 81.A H 3.206 2.500 HIS 81.A N ILE 78.A O HIS 81.A H 3.012 2.327 LEU 82.A N ILE 78.A O LEU 82.A H 2.988 2.264 HIS 85.A N ASN 90.A OD1 HIS 85.A H 3.114 2.336 ASN 87.A N HIS 85.A ND1 ASN 87.A H 2.925 2.074 ASN 87.A ND2 ALA 163.A O ASN 87.A HD21 3.044 2.079 ILE 88.A N HIS 85.A O ILE 88.A H 3.287 2.438 VAL 89.A N ILE 165.A O VAL 89.A H 2.784 2.017 ASN 90.A N GLU 106.A OE1 ASN 90.A H 2.994 2.138 ASN 90.A ND2 HIS 85.A O ASN 90.A HD22 3.007 2.084 ASN 90.A ND2 GLU 106.A OE1 ASN 90.A HD21 3.187 2.434 ASN 90.A ND2 GLU 106.A OE2 ASN 90.A HD21 3.526 2.554 LEU 92.A N ILE 104.A O LEU 92.A H 2.804 1.949 GLY 93.A N ILE 104.A O GLY 93.A H 3.243 2.519 ALA 94.A N TRP 20.A O ALA 94.A H 2.940 2.202 CYS 95.A N LEU 102.A O CYS 95.A H 2.837 2.019 CYS 95.A SG PHE 22.A O CYS 95.A HG 3.200 1.937 THR 96.A N GLU 21.A OE1 THR 96.A H 3.238 2.434 THR 96.A N GLU 21.A OE2 THR 96.A H 3.010 2.256 THR 96.A OG1 GLU 21.A OE1 THR 96.A HG1 2.960 2.151 HIS 97.A N GLU 21.A OE2 HIS 97.A H 3.325 2.587 HIS 97.A NE2 GLU 18.A OE1 HIS 97.A HE2 2.767 1.958 HIS 97.A NE2 GLU 18.A OE2 HIS 97.A HE2 3.217 2.468 LEU 102.A N CYS 95.A O LEU 102.A H 2.918 2.093 VAL 103.A N LYS 58.A O VAL 103.A H 2.857 2.028 ILE 104.A N GLY 93.A O ILE 104.A H 2.870 2.028 THR 105.A N ALA 56.A O THR 105.A H 2.822 1.979 GLU 106.A N ASN 90.A O GLU 106.A H 3.073 2.325 TYR 110.A N LEU 157.A O TYR 110.A H 2.904 2.095 GLY 111.A N CYS 108.A O GLY 111.A H 3.390 2.541 LEU 113.A N VAL 155.A O LEU 113.A H 2.814 2.010 ASN 115.A N ASP 112.A OD2 ASN 115.A H 2.974 2.126 ASN 115.A ND2 ASP 112.A OD1 ASN 115.A HD21 2.925 1.959 PHE 116.A N ASP 112.A O PHE 116.A H 3.181 2.363 LEU 117.A N LEU 113.A O LEU 117.A H 2.827 2.001 ARG 118.A N LEU 114.A O ARG 118.A H 3.037 2.293 ARG 118.A NE GLY 219.A O ARG 118.A HE 2.723 1.820 ARG 118.A NH2 GLY 219.A O ARG 118.A HH22 2.935 2.232 SER 122.A N ASP 125.A OD1 SER 122.A H 3.315 2.486 ASP 125.A N SER 122.A OG ASP 125.A H 3.049 2.218 LEU 126.A N SER 122.A O LEU 126.A H 3.214 2.410 LEU 127.A N SER 123.A O LEU 127.A H 3.034 2.202 HIS 128.A N ARG 124.A O HIS 128.A H 2.930 2.141 PHE 129.A N ASP 125.A O PHE 129.A H 2.971 2.164 SER 130.A N LEU 126.A O SER 130.A H 3.141 2.319 SER 131.A N LEU 127.A O SER 131.A H 2.935 2.126 GLN 132.A N HIS 128.A O GLN 132.A H 2.787 1.936 VAL 133.A N PHE 129.A O VAL 133.A H 2.996 2.142 ALA 134.A N SER 130.A O ALA 134.A H 3.065 2.233 GLN 135.A N SER 131.A O GLN 135.A H 2.982 2.245 GLN 135.A N GLN 132.A O GLN 135.A H 3.168 2.550 GLY 136.A N GLN 132.A O GLY 136.A H 3.064 2.260 MET 137.A N VAL 133.A O MET 137.A H 2.898 2.093 ALA 138.A N ALA 134.A O ALA 138.A H 2.835 2.047 PHE 139.A N GLN 135.A O PHE 139.A H 3.013 2.193 LEU 140.A N GLY 136.A O LEU 140.A H 3.094 2.277 ALA 141.A N MET 137.A O ALA 141.A H 2.953 2.098 SER 142.A N ALA 138.A O SER 142.A H 2.955 2.192 SER 142.A OG PHE 139.A O SER 142.A HG 2.541 1.996 LYS 143.A N LEU 140.A O LYS 143.A H 2.785 2.016 LYS 143.A NZ LEU 82.A O LYS 143.A HZ3 3.186 2.396 ASN 144.A N ALA 141.A O ASN 144.A H 3.077 2.244 ASN 144.A ND2 SER 9.A O ASN 144.A HD22 3.163 2.234 ASN 144.A ND2 THR 11.A OG1 ASN 144.A HD21 2.864 1.923 CYS 145.A N LEU 140.A O CYS 145.A H 2.967 2.129 ILE 146.A N LYS 4.A O ILE 146.A H 2.816 1.972 HIS 147.A N ASP 204.A OD2 HIS 147.A H 2.867 2.012 ARG 148.A N ASP 204.A OD1 ARG 148.A H 2.977 2.130 ARG 148.A NE ARG 2.A O ARG 148.A HE 2.907 2.052 ARG 148.A NH2 ARG 2.A O ARG 148.A HH22 2.932 2.183 ASP 149.A N HIS 147.A ND1 ASP 149.A H 3.035 2.202 ALA 152.A N GLU 214.A OE2 ALA 152.A H 2.972 2.133 ARG 153.A NE TYR 180.A OH ARG 153.A HE 2.919 2.005 ARG 153.A NH2 ASP 149.A OD2 ARG 153.A HH22 2.947 2.244 ARG 153.A NH2 TYR 180.A OH ARG 153.A HH22 3.421 2.781 ASN 154.A N ALA 151.A O ASN 154.A H 2.826 2.022 ASN 154.A ND2 ASP 149.A O ASN 154.A HD21 2.895 2.006 VAL 155.A N ALA 152.A O VAL 155.A H 3.196 2.344 LEU 156.A N LYS 164.A O LEU 156.A H 2.897 2.054 LEU 157.A N GLY 111.A O LEU 157.A H 2.870 2.052 THR 158.A N VAL 162.A O THR 158.A H 2.896 2.052 ALA 163.A N GLN 132.A OE1 ALA 163.A H 2.818 2.006 LYS 164.A N LEU 156.A O LYS 164.A H 2.805 2.000 LYS 164.A NZ GLU 86.A O LYS 164.A HZ1 2.888 2.022 LYS 164.A NZ ILE 88.A O LYS 164.A HZ3 2.992 2.278 LYS 164.A NZ GLU 106.A OE1 LYS 164.A HZ3 2.866 2.189 ILE 165.A N ASN 87.A O ILE 165.A H 3.022 2.217 GLY 169.A N ASP 167.A OD1 GLY 169.A H 3.211 2.359 ALA 171.A N PHE 168.A O ALA 171.A H 3.075 2.328 ARG 172.A NH2 ARG 153.A O ARG 172.A HH21 2.973 2.365 ARG 172.A NH2 ASN 154.A OD1 ARG 172.A HH22 2.683 1.930 ILE 174.A N ARG 172.A O ILE 174.A H 2.722 2.112 ASN 176.A ND2 ASP 173.A OD1 ASN 176.A HD21 3.378 2.614 ASP 177.A N ILE 174.A O ASP 177.A H 3.432 2.586 ASN 179.A N ASP 177.A OD1 ASN 179.A H 2.931 2.094 ASN 179.A ND2 ASP 177.A OD1 ASN 179.A HD21 3.188 2.432 TYR 180.A N ASP 177.A O TYR 180.A H 2.931 2.082 TYR 180.A OH ASP 149.A OD2 TYR 180.A HH 3.370 2.579 ILE 181.A N LEU 184.A O ILE 181.A H 2.703 1.850 LEU 184.A N ILE 181.A O LEU 184.A H 2.959 2.166 LYS 187.A NZ ASN 221.A OD1 LYS 187.A HZ3 3.306 2.487 LYS 187.A NZ PRO 222.A O LYS 187.A HZ1 2.864 2.035 LYS 187.A NZ TYR 223.A O LYS 187.A HZ1 3.091 2.435 LYS 187.A NZ ILE 226.A O LYS 187.A HZ2 2.843 1.936 TRP 188.A N PRO 185.A O TRP 188.A H 2.964 2.133 TRP 188.A NE1 GLU 214.A OE2 TRP 188.A HE1 2.794 1.935 MET 189.A N VAL 186.A O MET 189.A H 3.186 2.346 GLU 192.A N GLU 192.A OE1 GLU 192.A H 2.795 1.997 SER 193.A N ALA 190.A O SER 193.A H 2.998 2.402 SER 193.A OG VAL 198.A O SER 193.A HG 2.640 2.098 ILE 194.A N ALA 190.A O ILE 194.A H 3.040 2.266 PHE 195.A N PRO 191.A O PHE 195.A H 2.705 1.860 ASP 196.A N GLU 192.A O ASP 196.A H 2.856 2.114 CYS 197.A N SER 193.A O CYS 197.A H 3.170 2.561 VAL 198.A N GLU 192.A O VAL 198.A H 3.219 2.390 THR 200.A N SER 203.A OG THR 200.A H 2.872 2.057 THR 200.A OG1 GLN 202.A OE1 THR 200.A HG1 2.730 2.165 SER 203.A N THR 200.A OG1 SER 203.A H 3.016 2.238 SER 203.A OG THR 200.A O SER 203.A HG 2.692 2.157 ASP 204.A N THR 200.A O ASP 204.A H 3.101 2.303 VAL 205.A N VAL 201.A O VAL 205.A H 2.953 2.233 TRP 206.A N GLN 202.A O TRP 206.A H 3.236 2.462 SER 207.A N SER 203.A O SER 207.A H 3.262 2.496 SER 207.A OG TRP 188.A O SER 207.A HG 2.631 2.154 TYR 208.A N ASP 204.A O TYR 208.A H 2.879 2.091 GLY 209.A N VAL 205.A O GLY 209.A H 3.116 2.336 ILE 210.A N TRP 206.A O ILE 210.A H 3.268 2.481 LEU 211.A N SER 207.A O LEU 211.A H 2.963 2.164 LEU 212.A N TYR 208.A O LEU 212.A H 2.879 2.103 TRP 213.A N GLY 209.A O TRP 213.A H 3.099 2.310 TRP 213.A NE1 ALA 243.A O TRP 213.A HE1 2.890 2.097 GLU 214.A N ILE 210.A O GLU 214.A H 2.995 2.189 ILE 215.A N LEU 211.A O ILE 215.A H 2.912 2.114 PHE 216.A N LEU 212.A O PHE 216.A H 2.932 2.076 SER 217.A N TRP 213.A O SER 217.A H 2.938 2.222 SER 217.A OG GLU 214.A O SER 217.A HG 3.204 2.474 LEU 218.A N ILE 215.A O LEU 218.A H 2.940 2.133 GLY 219.A N GLU 214.A O GLY 219.A H 2.671 1.855 LEU 220.A N SER 217.A OG LEU 220.A H 3.113 2.349 ASN 221.A ND2 ASN 179.A OD1 ASN 221.A HD22 2.949 2.111 ILE 226.A N TYR 223.A O ILE 226.A H 2.925 2.081 LYS 231.A N ASN 229.A OD1 LYS 231.A H 2.849 2.239 PHE 232.A N ASN 229.A O PHE 232.A H 2.685 2.073 PHE 232.A N ASN 229.A OD1 PHE 232.A H 3.184 2.424 TYR 233.A N ASN 229.A O TYR 233.A H 3.231 2.439 LYS 234.A N SER 230.A O LYS 234.A H 3.090 2.264 LEU 235.A N LYS 231.A O LEU 235.A H 3.004 2.232 VAL 236.A N PHE 232.A O VAL 236.A H 3.117 2.287 LYS 237.A N TYR 233.A O LYS 237.A H 3.009 2.167 ASP 238.A N LYS 234.A O ASP 238.A H 2.911 2.226 ASP 238.A N LEU 235.A O ASP 238.A H 2.964 2.319 GLY 239.A N VAL 236.A O GLY 239.A H 3.151 2.332 TYR 240.A N LEU 235.A O TYR 240.A H 3.001 2.156 GLN 241.A NE2 TRP 260.A O GLN 241.A HE21 3.587 3.078 GLN 244.A NE2 ALA 248.A O GLN 244.A HE21 2.849 2.027 PHE 247.A N PHE 216.A O PHE 247.A H 3.053 2.281 ALA 248.A N PRO 245.A O ALA 248.A H 3.284 2.440 ILE 252.A N PRO 249.A O ILE 252.A H 3.018 2.362 TYR 253.A N PRO 249.A O TYR 253.A H 3.112 2.317 SER 254.A N LYS 250.A O SER 254.A H 2.955 2.239 ILE 255.A N ILE 252.A O ILE 255.A H 2.974 2.353 MET 256.A N ILE 252.A O MET 256.A H 3.239 2.428 GLN 257.A N TYR 253.A O GLN 257.A H 2.992 2.170 ALA 258.A N SER 254.A O ALA 258.A H 3.060 2.240 CYS 259.A N ILE 255.A O CYS 259.A H 2.857 2.045 TRP 260.A N MET 256.A O TRP 260.A H 2.957 2.303 TRP 260.A N GLN 257.A O TRP 260.A H 3.104 2.418 ALA 261.A N ALA 258.A O ALA 261.A H 3.202 2.349 HIS 266.A N GLU 263.A O HIS 266.A H 2.964 2.187 ARG 267.A N PRO 264.A O ARG 267.A H 3.124 2.289 ARG 267.A NE ALA 261.A O ARG 267.A HE 2.757 1.826 ARG 267.A NH1 GLU 192.A OE2 ARG 267.A HH12 2.880 2.057 ARG 267.A NH1 GLN 202.A O ARG 267.A HH11 2.966 2.154 ARG 267.A NH2 GLU 192.A OE1 ARG 267.A HH21 3.049 2.193 ARG 267.A NH2 ALA 261.A O ARG 267.A HH22 3.064 2.353 THR 269.A N GLN 272.A OE1 THR 269.A H 2.966 2.151 GLN 272.A N THR 269.A OG1 GLN 272.A H 3.089 2.233 ILE 273.A N THR 269.A O ILE 273.A H 3.045 2.219 CYS 274.A N PHE 270.A O CYS 274.A H 2.885 2.055 SER 275.A N GLN 271.A O SER 275.A H 2.880 2.029 PHE 276.A N GLN 272.A O PHE 276.A H 2.951 2.102 LEU 277.A N ILE 273.A O LEU 277.A H 2.918 2.085 GLN 278.A N CYS 274.A O GLN 278.A H 2.899 2.085 GLU 279.A N SER 275.A O GLU 279.A H 3.196 2.347