Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3ml2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.990 2.148 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.885 2.127 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.093 2.345 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.811 1.983 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 3.100 2.416 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.072 2.358 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.038 2.390 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.132 2.284 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.160 2.536 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.849 2.108 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.896 2.049 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.180 2.320 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.779 2.066 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 3.003 2.162 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 3.141 2.505 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.147 2.412 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.136 2.391 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 3.051 2.407 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.099 2.467 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.135 2.279 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.107 2.273 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.834 2.119 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.762 1.904 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.854 2.063 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.055 2.427 THR 34.A N ASP 31.A OD1 THR 34.A H 3.106 2.400 THR 34.A OG1 ASP 31.A OD1 THR 34.A HG1 3.408 2.818 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.982 2.287 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.099 2.391 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 3.030 2.237 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 3.150 2.456 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.021 2.175 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.755 1.931 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.809 1.964 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 2.979 2.122 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.903 2.066 ARG 55.A NE GLU 66.A OE2 ARG 55.A HE 3.064 2.260 ARG 55.A NH1 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH11 2.975 2.179 ARG 55.A NH1 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH11 3.161 2.403 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.901 2.140 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.900 2.143 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 3.007 2.223 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.172 2.345 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.207 2.354 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.169 2.347 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.792 1.971 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.874 2.051 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.944 2.166 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.855 2.063 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.903 2.093 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.922 2.108 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.955 2.125 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.906 2.083 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 3.065 2.220 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2 2.859 2.158 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 3.133 2.394 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.804 1.970 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.934 2.104 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 2.928 2.142 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.915 2.082 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.045 2.226 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 2.987 2.280 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.785 1.965 ARG 86.A NE ASP 72.A OD2 ARG 86.A HE 2.727 2.026 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.868 2.070 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD2 ARG 86.A HH21 3.083 2.429 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.790 1.938 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.953 2.104 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.973 2.221 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.080 2.305 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.982 2.131 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.926 2.149 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.673 1.822 HIS 93.A NE2 HIS 91.A NE2 no hydrogen 3.135 N/A TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.783 1.961 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.768 2.097 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.002 2.312 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.269 2.431 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22 2.868 2.014 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22 3.560 2.979 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.926 2.208 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.812 2.089 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.868 2.139 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.783 1.938 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.659 1.823 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.782 2.018 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.043 2.278 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.832 1.997 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.694 1.872 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.881 2.060 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.906 2.188 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.761 1.914 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.817 1.974 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.629 1.817 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.935 2.095 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.909 2.054 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 3.034 2.343 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.055 2.301 HIS 119.A NE2 TYR 48.A OH HIS 119.A HE2 2.661 1.937 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.948 2.218 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.808 2.071 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.820 1.988 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.157 2.313 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.928 2.086 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.275 2.496 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.238 2.385 LYS 123.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ3 3.531 2.809 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.020 2.164 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.105 2.262 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.946 2.284 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.722 1.913 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 3.053 2.239 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.116 2.322 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.080 2.303 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.240 2.545 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 2.880 2.050 GLN 133.A NE2 LYS 129.A O GLN 133.A HE22 3.263 2.459 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.002 2.276 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.807 2.018 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 3.113 2.297 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.112 2.370 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.918 2.083 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.790 1.979 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.916 2.160 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 3.156 2.329 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.946 2.134 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.816 1.993 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.997 2.170 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ1 3.404 2.598 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.081 2.249 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.051 2.207 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE22 3.151 2.397 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.366 2.554 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 2.906 2.253 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.066 2.263 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.846 2.043 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.273 2.562 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.292 2.481 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.989 2.219 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.635 2.199 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.172 2.353 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ1 3.426 2.814 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.919 2.102 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.788 1.993 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.083 2.239 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ1.A 3.147 2.439 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.889 2.155 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 3.034 2.203 THR 173.A OG1 ASN 174.A OD1 THR 173.A HG1 3.065 2.469 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 3.034 2.196 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 3.004 2.174 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.051 2.237 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.285 2.587 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.781 1.939 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.190 2.334 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 2.998 2.150 GLU 183.A N GLU 210.A OE2 GLU 183.A H 3.375 2.603 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.915 2.098 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.113 2.259 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.917 2.097 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.823 2.003 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.882 2.096 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.706 1.953 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.284 2.555 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.881 2.023 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.952 2.199 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.538 1.736 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.779 2.007 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 3.036 2.427 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.247 2.418 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.822 1.967 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 3.018 2.241 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.948 2.133 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 3.015 2.204 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.907 2.071 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 3.030 2.199 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.885 2.053 LYS 209.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ1 3.311 2.636 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.927 2.159 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.888 2.075 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.068 2.246 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.081 2.229 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 2.800 1.964 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 3.035 2.223 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.143 2.310 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.829 2.015 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.187 2.472 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.135 2.472 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.259 2.493 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.919 2.201 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.530 2.922 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.758 1.902 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.175 2.331 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.302 2.457 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.802 2.068 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.836 1.987 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.969 2.160 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.586 2.874 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.920 2.089 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.785 2.036 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 2.992 2.194 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.793 1.960 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.709 1.877 ASN 240.A N ASN 240.A OD1 ASN 240.A H 2.695 2.087 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.876 2.032 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 2.988 2.159 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.734 1.887 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.810 1.990 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.805 2.059 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.205 2.488 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.519 2.914 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.754 1.936 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.627 1.791 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ2 2.854 2.086 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.819 1.967 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 2.974 2.257 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.881 2.042 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.773 1.996 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.999 2.303 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.509 2.879 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 3.003 2.160 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.778 1.950 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.922 2.130