Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3n4b_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.945 2.121 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.867 2.143 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.066 2.296 GLU 12.A N.A GLU 12.A OE1.A GLU 12.A H.A 2.845 2.017 GLU 12.A N.B GLU 12.A OE1.B GLU 12.A H.B 2.858 2.036 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H.A 2.836 1.988 HIS 13.A NE2 LYS 7.A O HIS 13.A HE2 3.079 2.360 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.397 2.587 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.069 2.358 TRP 14.A NE1 ASN 9.A O TRP 14.A HE1 3.010 2.363 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.116 2.262 LYS 16.A NZ HIS 13.A ND1 LYS 16.A HZ3 2.836 1.998 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.212 2.620 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.822 2.035 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H 2.865 2.009 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.102 2.242 GLY 23.A N ILE 20.A O GLY 23.A H 2.793 2.007 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 2.981 2.147 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 3.075 2.349 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.290 2.583 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.227 2.500 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 2.996 2.267 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 3.043 2.441 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE21 3.140 2.289 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE22 3.086 2.237 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.877 2.168 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.821 1.963 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H.A 2.846 2.016 THR 33.A OG1 ASP 108.A OD1 THR 33.A HG1 3.310 2.512 HIS 34.A N ASP 32.A OD1.A HIS 34.A H 3.026 2.347 THR 35.A N ASP 32.A O.A THR 35.A H 3.145 2.412 THR 35.A N ASP 32.A O.B THR 35.A H 3.076 2.331 THR 35.A N ASP 32.A OD1.A THR 35.A H 3.080 2.408 THR 35.A OG1 ASP 32.A OD2.B THR 35.A HG1 2.962 2.405 ALA 36.A N ASP 32.A O.A ALA 36.A H 3.080 2.372 ALA 36.A N ASP 32.A O.B ALA 36.A H 3.093 2.389 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 2.997 2.186 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 2.919 2.100 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 2.963 2.198 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.094 2.242 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.897 2.062 SER 48.A N.A VAL 76.A O SER 48.A H.A 2.910 2.054 SER 48.A N.B VAL 76.A O SER 48.A H.B 2.909 2.054 SER 48.A OG.B ASP 50.A OD1.A SER 48.A HG.B 3.277 2.514 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.122 2.283 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.813 1.965 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 3.011 2.232 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 2.978 2.205 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 3.276 2.482 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.923 2.101 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.875 2.125 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.967 2.129 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.071 2.237 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.263 2.424 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.096 2.280 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.859 2.050 HIS 62.A N ASN 60.A OD1 HIS 62.A H 2.894 2.070 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H 2.919 2.109 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.844 2.070 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.862 2.046 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.858 2.020 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.880 2.072 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.863 2.037 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 2.937 2.091 LYS 74.A NZ THR 53.A OG1 LYS 74.A HZ3 3.066 2.234 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ2 3.061 2.188 VAL 76.A N SER 48.A O.A VAL 76.A H 2.952 2.162 VAL 76.A N SER 48.A O.B VAL 76.A H 2.959 2.168 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.830 2.006 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.970 2.148 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.033 2.236 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.867 2.034 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.030 2.187 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 3.014 2.274 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.816 2.033 ARG 87.A NE ASP 73.A OD2 ARG 87.A HE 2.696 1.876 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.957 2.175 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD2 ARG 87.A HH21 2.983 2.279 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.888 2.033 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.957 2.108 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.934 2.184 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.024 2.248 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.802 1.945 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.871 2.062 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.783 1.939 HIS 94.A NE2 HIS 92.A NE2 no hydrogen 3.181 N/A TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.845 2.013 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.884 2.236 GLY 96.A N ALA 113.A O GLY 96.A H 3.318 2.591 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.010 2.273 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.242 2.405 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE22 2.892 2.032 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD2 GLN 101.A HE22 3.492 2.887 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 2.989 2.241 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.862 2.118 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.852 2.128 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.733 1.898 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.704 1.879 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.644 1.907 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.121 2.335 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.816 1.988 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.773 1.953 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.934 2.103 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.073 2.468 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.868 2.109 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.800 1.953 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.787 1.930 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.714 1.883 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.917 2.069 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.837 1.986 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.910 2.170 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.065 2.306 HIS 120.A NE2 TYR 49.A OH HIS 120.A HE2 2.742 1.991 TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.928 2.179 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.779 2.040 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.834 2.004 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.227 2.387 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 2.950 2.103 THR 123.A OG1 THR 85.A O THR 123.A HG1 3.272 2.498 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.210 2.352 LYS 124.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 124.A HZ1 3.123 2.345 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.021 2.164 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.173 2.351 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.935 2.236 LYS 130.A N ASP 127.A OD2 LYS 130.A H 2.902 2.127 LYS 130.A NZ ASP 127.A OD1 LYS 130.A HZ3 3.161 2.457 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 3.011 2.243 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.110 2.340 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.077 2.256 GLN 133.A NE2.A GLY 129.A O GLN 133.A HE22.A 3.024 2.201 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 2.979 2.177 GLN 134.A NE2 LYS 130.A O GLN 134.A HE22 3.314 2.497 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.131 2.411 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.853 2.047 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.931 2.137 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.165 2.442 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.924 2.103 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.832 2.002 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.859 2.102 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.964 2.110 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.923 2.096 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.843 2.017 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 2.989 2.147 LYS 151.A NZ LEU 182.A O LYS 151.A HZ1 3.188 2.300 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.015 2.201 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.122 2.277 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE22 3.123 2.440 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD2 GLN 155.A HE22 3.261 2.440 LYS 156.A NZ ASN 175.A O LYS 156.A HZ1 3.379 2.726 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.000 2.397 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.110 2.289 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.950 2.194 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.196 2.426 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H 3.291 2.457 SER 163.A N VAL 160.A O SER 163.A H 2.940 2.114 SER 163.A OG VAL 160.A O SER 163.A HG 2.704 2.292 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.110 2.319 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H.A 2.918 2.080 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.805 1.960 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H.B 3.109 2.264 LYS 169.A NZ.A GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ1.A 3.282 2.577 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.962 2.182 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H.A 2.985 2.135 THR 174.A N ASP 172.A OD2.B THR 174.A H 3.307 2.617 THR 174.A OG1 ASP 172.A OD2.B THR 174.A HG1 3.214 2.491 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 2.967 2.165 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.026 2.205 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.223 2.503 ARG 179.A NH1 ASP 50.A OD1.B ARG 179.A HH12 3.062 2.390 ARG 179.A NH2 ASP 50.A OD1.B ARG 179.A HH22 3.435 2.855 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.933 2.156 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.166 2.322 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 3.006 2.161 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.357 2.505 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.874 2.048 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.138 2.282 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.979 2.153 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.841 2.028 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.822 2.042 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.817 2.059 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.255 2.510 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.766 1.906 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 2.927 2.142 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.670 1.871 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.778 2.043 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.261 2.422 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.868 2.020 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.993 2.186 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.949 2.123 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.986 2.139 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.847 2.009 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.937 2.100 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 2.926 2.084 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.861 2.081 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.854 2.034 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.094 2.278 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.156 2.349 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE21 3.005 2.153 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE22 2.921 2.106 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H 3.117 2.299 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.920 2.126 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 3.144 2.402 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H 3.217 2.581 ARG 224.A N VAL 220.A O ARG 224.A H 3.245 2.505 ARG 224.A N LEU 221.A O ARG 224.A H 3.196 2.591 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.847 2.052 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.867 2.013 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.269 2.437 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.241 2.394 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.854 2.089 ASN 227.A ND2 GLU 235.A OE2 ASN 227.A HD21 2.981 2.147 PHE 228.A N GLU 236.A O.A PHE 228.A H 2.932 2.138 PHE 228.A N GLU 236.A O.B PHE 228.A H 2.930 2.104 ASN 229.A ND2 ASN 227.A OD1 ASN 229.A HD21 3.591 2.875 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.958 2.135 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.810 1.998 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.087 2.256 GLU 236.A N.A ASN 229.A OD1 GLU 236.A H.A 2.849 2.006 GLU 236.A N.B ASN 229.A OD1 GLU 236.A H.B 2.873 2.038 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.825 1.974 ASN 241.A N ASN 241.A OD1 ASN 241.A H 2.679 2.060 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O ASN 241.A HD22 2.943 2.100 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 3.023 2.183 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.858 2.029 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.764 1.960 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.899 2.129 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.270 2.557 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.365 2.744 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.790 1.963 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE22 2.779 1.934 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ2 2.885 2.024 ARG 251.A N LYS 249.A O ARG 251.A H 2.925 2.220 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.838 1.997 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.061 2.338 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.866 2.022 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.879 2.095 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.952 2.282 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.476 2.830 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 2.980 2.128 LYS 254.A NZ GLN 252.A OE1 LYS 254.A HZ1 2.834 2.278 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.801 1.967 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.944 2.135