Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3n9s_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): MET 1.A N PRO 73.A O MET 1.A H1 2.710 1.757 MET 1.A N ILE 75.A O MET 1.A H2 2.827 1.915 VAL 3.A N VAL 77.A O VAL 3.A H 2.808 1.984 GLY 5.A N THR 99.A O GLY 5.A H 3.348 2.548 ASN 6.A N SER 130.A OG ASN 6.A H 2.962 2.154 GLU 7.A N LYS 4.A O GLU 7.A H 3.080 2.320 ILE 8.A N GLY 5.A O ILE 8.A H 3.014 2.410 LEU 9.A N GLY 5.A O LEU 9.A H 3.051 2.230 LEU 10.A N ASN 6.A O LEU 10.A H 2.979 2.151 LYS 11.A NZ GLU 15.A OE1 LYS 11.A HZ3 3.284 2.606 ALA 12.A N ILE 8.A O ALA 12.A H 3.188 2.380 HIS 13.A N LEU 9.A O HIS 13.A H 2.795 1.997 LYS 14.A N LEU 10.A O LYS 14.A H 3.028 2.193 GLU 15.A N LYS 11.A O GLU 15.A H 2.999 2.217 TYR 17.A N ALA 12.A O TYR 17.A H 3.030 2.261 GLY 18.A N LEU 301.A O GLY 18.A H 2.972 2.113 VAL 19.A N ASN 250.A O VAL 19.A H 2.736 1.927 ALA 21.A N VAL 252.A O ALA 21.A H 2.906 2.055 PHE 22.A N PHE 45.A O PHE 22.A H 2.920 2.098 ASN 23.A ND2 ASP 82.A OD2 ASN 23.A HD21 3.150 2.302 PHE 24.A N GLN 47.A O PHE 24.A H 3.079 2.321 GLU 28.A N GLU 28.A OE1 GLU 28.A H 2.846 2.165 MET 29.A N ASN 26.A OD1 MET 29.A H 3.139 2.288 LEU 30.A N ASN 26.A O LEU 30.A H 3.209 2.354 ASN 31.A N PHE 27.A O ASN 31.A H 2.856 2.009 ASN 31.A ND2 GLU 35.A OE2 ASN 31.A HD21 3.307 2.719 ASN 31.A ND2 GLN 287.A OE1 ASN 31.A HD22 2.890 2.069 ALA 32.A N GLU 28.A O ALA 32.A H 3.145 2.303 ILE 33.A N MET 29.A O ILE 33.A H 3.051 2.237 PHE 34.A N LEU 30.A O PHE 34.A H 3.029 2.177 GLU 35.A N ASN 31.A O GLU 35.A H 2.860 2.008 ALA 36.A N ALA 32.A O ALA 36.A H 3.067 2.273 GLY 37.A N ILE 33.A O GLY 37.A H 3.057 2.253 ASN 38.A N PHE 34.A O ASN 38.A H 2.860 2.041 GLU 39.A N GLU 35.A O GLU 39.A H 2.953 2.181 GLU 40.A N ALA 36.A O GLU 40.A H 2.970 2.139 SER 42.A N GLY 37.A O SER 42.A H 2.969 2.140 SER 42.A OG PRO 43.A O SER 42.A HG 2.785 2.295 LEU 44.A N PRO 76.A O LEU 44.A H 2.941 2.233 PHE 45.A N GLY 20.A O PHE 45.A H 3.202 2.350 ILE 46.A N ALA 78.A O ILE 46.A H 2.886 2.075 GLN 47.A N PHE 22.A O GLN 47.A H 2.938 2.085 GLN 47.A NE2 ASN 23.A OD1 GLN 47.A HE22 2.981 2.123 ALA 48.A N HIS 80.A O ALA 48.A H 3.098 2.311 ALA 52.A N SER 49.A OG ALA 52.A H 3.046 2.269 ILE 53.A N SER 49.A O ILE 53.A H 2.928 2.114 LYS 54.A N GLU 50.A O LYS 54.A H 2.891 2.078 TYR 55.A N GLY 51.A O TYR 55.A H 2.995 2.208 MET 56.A N ALA 52.A O MET 56.A H 2.882 2.085 GLY 57.A N ILE 53.A O GLY 57.A H 2.666 1.950 MET 60.A N GLY 57.A O MET 60.A H 2.955 2.247 ALA 61.A N GLY 57.A O ALA 61.A H 3.032 2.195 VAL 62.A N ILE 58.A O VAL 62.A H 3.056 2.206 GLY 63.A N ASP 59.A O GLY 63.A H 2.961 2.163 MET 64.A N MET 60.A O MET 64.A H 2.830 1.972 VAL 65.A N ALA 61.A O VAL 65.A H 3.153 2.330 LYS 66.A N VAL 62.A O LYS 66.A H 2.903 2.074 ILE 67.A N GLY 63.A O ILE 67.A H 3.129 2.311 MET 68.A N MET 64.A O MET 68.A H 3.008 2.186 CYS 69.A N VAL 65.A O CYS 69.A H 2.867 2.071 CYS 69.A SG VAL 65.A O CYS 69.A HG 3.557 2.660 GLU 70.A N LYS 66.A O GLU 70.A H 3.003 2.243 ARG 71.A N ILE 67.A O ARG 71.A H 2.940 2.210 TYR 72.A N MET 68.A O TYR 72.A H 2.984 2.283 HIS 74.A NE2 ASN 38.A OD1 HIS 74.A HE2 2.709 2.021 ILE 75.A N TYR 72.A O ILE 75.A H 3.224 2.377 VAL 77.A N MET 1.A O VAL 77.A H 3.093 2.273 ALA 78.A N LEU 44.A O ALA 78.A H 3.066 2.267 LEU 79.A N THR 99.A OG1 LEU 79.A H 3.079 2.365 HIS 80.A N ILE 46.A O HIS 80.A H 2.881 2.094 HIS 80.A ND1 SER 100.A OG no hydrogen 2.336 N/A LEU 81.A N SER 100.A O LEU 81.A H 2.942 2.151 ASP 82.A N ALA 48.A O ASP 82.A H 2.940 2.088 HIS 83.A ND1 ASP 104.A OD2 HIS 83.A HD1 2.743 1.957 GLY 84.A N MET 102.A O GLY 84.A H 2.846 2.200 THR 85.A N GLU 50.A OE2 THR 85.A H 2.957 2.170 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE1 THR 85.A HG1 2.856 2.236 THR 85.A OG1 GLU 50.A OE2 THR 85.A HG1 3.130 2.336 SER 89.A N THR 86.A OG1 SER 89.A H 3.028 2.205 SER 89.A OG GLU 50.A OE2 SER 89.A HG 2.702 1.954 CYS 90.A N THR 86.A O CYS 90.A H 3.295 2.463 CYS 90.A SG THR 86.A O CYS 90.A HG 3.552 2.502 GLU 91.A N PHE 87.A O GLU 91.A H 2.884 2.094 LYS 92.A N GLU 88.A O LYS 92.A H 2.980 2.171 ALA 93.A N SER 89.A O ALA 93.A H 3.138 2.371 VAL 94.A N CYS 90.A O VAL 94.A H 3.008 2.191 LYS 95.A N GLU 91.A O LYS 95.A H 2.992 2.141 ALA 96.A N LYS 92.A O ALA 96.A H 2.931 2.206 GLY 97.A N ALA 93.A O GLY 97.A H 3.116 2.403 GLY 97.A N VAL 94.A O GLY 97.A H 3.197 2.533 PHE 98.A N ALA 93.A O PHE 98.A H 2.937 2.114 THR 99.A N LEU 79.A O THR 99.A H 2.919 2.202 THR 99.A OG1 VAL 3.A O THR 99.A HG1 2.847 2.195 SER 100.A N LEU 79.A O SER 100.A H 3.138 2.466 VAL 101.A N SER 130.A O VAL 101.A H 2.992 2.201 MET 102.A N LEU 81.A O MET 102.A H 2.871 2.053 ILE 103.A N GLU 132.A O ILE 103.A H 2.928 2.185 ASP 104.A N GLY 84.A O ASP 104.A H 2.762 1.903 SER 106.A N ASP 104.A OD1 SER 106.A H 3.162 2.304 SER 106.A OG ASP 104.A OD1 no hydrogen 3.283 N/A SER 106.A OG GLY 136.A O no hydrogen 3.474 N/A HIS 108.A N ALA 105.A O HIS 108.A H 2.951 2.155 ASN 113.A N ALA 109.A O ASN 113.A H 2.887 2.044 ASN 113.A ND2 GLU 134.A O ASN 113.A HD21 2.911 2.102 LEU 114.A N PHE 110.A O LEU 114.A H 2.972 2.113 GLU 115.A N GLU 111.A O GLU 115.A H 3.000 2.243 LEU 116.A N GLU 112.A O LEU 116.A H 2.851 1.992 THR 117.A N ASN 113.A O THR 117.A H 2.768 1.931 THR 117.A OG1 ASN 113.A O THR 117.A HG1 2.917 2.259 THR 117.A OG1 ASN 113.A OD1 THR 117.A HG1 3.043 2.609 SER 118.A N LEU 114.A O SER 118.A H 2.927 2.116 LYS 119.A N GLU 115.A O LYS 119.A H 3.145 2.392 VAL 120.A N LEU 116.A O VAL 120.A H 3.099 2.277 VAL 121.A N THR 117.A O VAL 121.A H 2.912 2.078 LYS 122.A N SER 118.A O LYS 122.A H 3.022 2.201 MET 123.A N LYS 119.A O MET 123.A H 3.255 2.420 ALA 124.A N VAL 120.A O ALA 124.A H 2.744 1.888 HIS 125.A N VAL 121.A O HIS 125.A H 2.817 1.960 HIS 125.A NE2 ASP 170.A OD2 HIS 125.A HE2 2.742 1.898 ASN 126.A N LYS 122.A O ASN 126.A H 3.235 2.428 ALA 127.A N MET 123.A O ALA 127.A H 3.293 2.608 ALA 127.A N ALA 124.A O ALA 127.A H 2.833 2.167 GLY 128.A N HIS 125.A O GLY 128.A H 3.043 2.207 VAL 129.A N ALA 124.A O VAL 129.A H 2.948 2.090 SER 130.A N THR 99.A O SER 130.A H 3.227 2.404 VAL 131.A N ASP 170.A OD2 VAL 131.A H 2.810 2.086 GLU 132.A N VAL 101.A O GLU 132.A H 2.879 2.053 ALA 133.A N TYR 171.A O ALA 133.A H 3.274 2.492 LEU 135.A N ALA 173.A O LEU 135.A H 3.149 2.343 ARG 137.A N VAL 153.A O ARG 137.A H 2.723 1.883 ILE 145.A N GLU 142.A O ILE 145.A H 3.221 2.565 LYS 150.A N SER 146.A O LYS 150.A H 3.026 2.357 ALA 152.A N GLU 149.A O ALA 152.A H 3.381 2.629 VAL 153.A N LYS 150.A O VAL 153.A H 3.126 2.298 LEU 154.A N LYS 150.A O LEU 154.A H 2.889 2.039 VAL 155.A N ALA 175.A O VAL 155.A H 2.983 2.136 LYS 158.A N ASN 156.A OD1 LYS 158.A H 3.052 2.430 GLU 159.A N ASN 156.A OD1 GLU 159.A H 3.296 2.473 ALA 160.A N ASN 156.A O ALA 160.A H 2.963 2.195 GLU 161.A N PRO 157.A O GLU 161.A H 3.072 2.329 GLN 162.A N LYS 158.A O GLN 162.A H 3.389 2.540 GLN 162.A NE2 GLU 166.A OE2 GLN 162.A HE22 3.397 2.551 PHE 163.A N GLU 159.A O PHE 163.A H 2.828 2.007 VAL 164.A N ALA 160.A O VAL 164.A H 3.062 2.223 LYS 165.A N GLU 161.A O LYS 165.A H 3.146 2.323 GLU 166.A N GLN 162.A O GLU 166.A H 2.944 2.103 SER 167.A N PHE 163.A O SER 167.A H 3.000 2.184 GLN 168.A N VAL 164.A O GLN 168.A H 3.051 2.268 ASP 170.A N VAL 131.A O ASP 170.A H 3.117 2.409 TYR 171.A N VAL 131.A O TYR 171.A H 3.238 2.447 LEU 172.A N PRO 206.A O LEU 172.A H 3.275 2.503 ALA 173.A N ALA 133.A O ALA 173.A H 2.885 2.061 ALA 175.A N LEU 135.A O ALA 175.A H 2.987 2.149 THR 178.A OG1 HIS 210.A O THR 178.A HG1 2.619 1.900 LYS 184.A N LYS 234.A O LYS 184.A H 3.088 2.262 LYS 184.A NZ SER 179.A O LYS 184.A HZ2 2.841 2.123 LYS 184.A NZ GLY 181.A O LYS 184.A HZ3 2.678 1.942 ASP 192.A N ILE 176.A O ASP 192.A H 2.922 2.080 PHE 193.A N LEU 191.A O PHE 193.A H 3.070 2.483 ARG 195.A N ASP 192.A OD1 ARG 195.A H 3.042 2.253 ARG 195.A NE VAL 155.A O ARG 195.A HE 2.896 2.096 ARG 195.A NH1 ASP 192.A OD2 ARG 195.A HH11 2.937 2.141 ARG 195.A NH2 ASP 151.A OD1 ARG 195.A HH22 2.886 2.176 LEU 196.A N ASP 192.A O LEU 196.A H 3.083 2.266 GLN 197.A N PHE 193.A O GLN 197.A H 2.993 2.158 GLU 198.A N GLU 194.A O GLU 198.A H 3.009 2.214 VAL 199.A N ARG 195.A O VAL 199.A H 2.952 2.135 LYS 200.A N LEU 196.A O LYS 200.A H 2.907 2.097 LYS 200.A NZ ILE 205.A O LYS 200.A HZ2 2.895 2.042 LYS 200.A NZ GLY 248.A O LYS 200.A HZ3 2.969 2.129 ARG 201.A N GLN 197.A O ARG 201.A H 2.972 2.154 LEU 202.A N GLU 198.A O LEU 202.A H 3.030 2.248 THR 203.A N VAL 199.A O THR 203.A H 2.979 2.270 THR 203.A OG1 VAL 199.A O THR 203.A HG1 2.795 2.004 ASN 204.A N LYS 200.A O ASN 204.A H 2.883 2.067 VAL 208.A N LEU 172.A O VAL 208.A H 2.753 2.045 LEU 209.A N LYS 251.A O LEU 209.A H 2.919 2.089 HIS 210.A ND1 HIS 83.A NE2 no hydrogen 3.047 N/A HIS 210.A NE2 GLU 132.A OE2 HIS 210.A HE2 2.725 1.878 ALA 212.A N ASN 253.A O ALA 212.A H 3.313 2.518 ALA 214.A N ASP 257.A OD2 ALA 214.A H 2.784 1.934 ILE 215.A N ASP 257.A OD1 ILE 215.A H 2.761 1.965 VAL 219.A N PRO 216.A O VAL 219.A H 3.079 2.476 ARG 220.A N PRO 216.A O ARG 220.A H 2.936 2.087 ARG 220.A NH1 SER 233.A O ARG 220.A HH12 3.414 2.695 ARG 220.A NH1 SER 233.A OG ARG 220.A HH12 2.739 2.126 ARG 220.A NH2 SER 233.A O ARG 220.A HH22 3.156 2.362 LYS 221.A N ASP 217.A O LYS 221.A H 2.904 2.091 SER 222.A N ASN 218.A O SER 222.A H 2.996 2.174 TYR 223.A N VAL 219.A O TYR 223.A H 2.961 2.140 LEU 224.A N ARG 220.A O LEU 224.A H 2.874 2.028 ASP 225.A N LYS 221.A O ASP 225.A H 2.877 2.052 ALA 226.A N SER 222.A O ALA 226.A H 3.220 2.472 GLY 227.A N LEU 224.A O GLY 227.A H 2.878 2.050 GLY 228.A N TYR 223.A O GLY 228.A H 2.976 2.161 LYS 231.A N ASP 229.A OD1 LYS 231.A H 2.962 2.109 SER 233.A N LEU 230.A O SER 233.A H 3.084 2.248 LYS 234.A N ALA 182.A O LYS 234.A H 2.863 2.175 VAL 236.A N SER 213.A O VAL 236.A H 2.873 2.050 GLU 239.A N GLU 239.A OE1 GLU 239.A H 2.645 1.917 PHE 240.A N PRO 237.A O PHE 240.A H 2.930 2.324 LEU 241.A N PRO 237.A O LEU 241.A H 3.108 2.307 GLN 242.A N PHE 238.A O GLN 242.A H 3.114 2.290 GLN 242.A NE2 LEU 300.A O GLN 242.A HE22 3.143 2.325 GLU 243.A N GLU 239.A O GLU 243.A H 3.008 2.191 SER 244.A N PHE 240.A O SER 244.A H 2.791 2.026 VAL 245.A N LEU 241.A O VAL 245.A H 3.086 2.275 LYS 246.A N GLN 242.A O LYS 246.A H 3.016 2.195 GLY 247.A N GLU 243.A O GLY 247.A H 2.953 2.245 GLY 247.A N SER 244.A O GLY 247.A H 3.042 2.441 GLY 248.A N VAL 245.A O GLY 248.A H 3.119 2.303 ILE 249.A N SER 244.A O ILE 249.A H 3.011 2.160 ASN 250.A N LEU 207.A O ASN 250.A H 2.832 1.976 ASN 250.A ND2 TYR 17.A O ASN 250.A HD22 3.162 2.310 LYS 251.A N LEU 207.A O LYS 251.A H 3.166 2.419 LYS 251.A NZ GLN 47.A OE1 LYS 251.A HZ1 2.868 2.096 LYS 251.A NZ GLU 132.A OE1 LYS 251.A HZ2 3.016 2.175 LYS 251.A NZ ASN 253.A OD1 LYS 251.A HZ3 2.875 2.049 VAL 252.A N VAL 19.A O VAL 252.A H 2.935 2.145 ASN 253.A N LEU 209.A O ASN 253.A H 3.018 2.203 THR 254.A N ALA 21.A O THR 254.A H 2.874 2.039 THR 254.A OG1 VAL 252.A O THR 254.A HG1 3.192 2.401 ASP 257.A N SER 213.A OG ASP 257.A H 2.975 2.140 ARG 259.A N ASP 255.A O ARG 259.A H 3.188 2.381 ARG 259.A NE ASP 255.A OD1 ARG 259.A HE 3.019 2.255 ARG 259.A NE ASP 255.A OD2 ARG 259.A HE 3.232 2.435 ARG 259.A NH1 ASP 255.A OD2 ARG 259.A HH11 3.209 2.421 ILE 260.A N THR 256.A O ILE 260.A H 2.986 2.168 ALA 261.A N ASP 257.A O ALA 261.A H 3.095 2.239 PHE 262.A N LEU 258.A O PHE 262.A H 2.956 2.201 ILE 263.A N ARG 259.A O ILE 263.A H 2.935 2.083 ALA 264.A N ILE 260.A O ALA 264.A H 2.881 2.065 GLU 265.A N PHE 262.A O GLU 265.A H 3.203 2.558 VAL 266.A N PHE 262.A O VAL 266.A H 3.340 2.574 ARG 267.A N ILE 263.A O ARG 267.A H 2.928 2.092 LYS 268.A N ALA 264.A O LYS 268.A H 3.060 2.306 VAL 269.A N GLU 265.A O VAL 269.A H 3.084 2.231 ALA 270.A N VAL 266.A O ALA 270.A H 3.117 2.301 ASN 271.A N ARG 267.A O ASN 271.A H 2.970 2.219 ASN 271.A ND2 ALA 226.A O ASN 271.A HD21 2.890 2.097 GLU 272.A N LYS 268.A O GLU 272.A H 2.976 2.267 ASP 273.A N VAL 269.A O ASP 273.A H 3.268 2.567 LYS 274.A NZ ALA 270.A O LYS 274.A HZ3 3.369 2.521 SER 275.A N ASP 273.A OD1 SER 275.A H 2.962 2.169 GLN 276.A N ASP 273.A O GLN 276.A H 3.139 2.292 ASP 278.A N GLN 276.A OE1 ASP 278.A H 2.973 2.140 ARG 280.A N ASP 278.A OD1 ARG 280.A H 2.946 2.225 ARG 280.A NE ASP 278.A OD1 ARG 280.A HE 3.085 2.283 ARG 280.A NH2 ASP 278.A OD1 ARG 280.A HH21 3.538 2.866 LYS 281.A N ASP 278.A O LYS 281.A H 2.980 2.243 PHE 282.A N LEU 279.A O PHE 282.A H 3.018 2.328 PHE 283.A N LEU 279.A O PHE 283.A H 2.947 2.215 SER 284.A N ARG 280.A O SER 284.A H 2.896 2.117 GLN 287.A N PHE 283.A O GLN 287.A H 2.878 2.070 LEU 288.A N SER 284.A O LEU 288.A H 3.076 2.255 ALA 289.A N PRO 285.A O ALA 289.A H 2.969 2.147 LEU 290.A N ALA 286.A O LEU 290.A H 3.102 2.270 LYS 291.A N GLN 287.A O LYS 291.A H 2.786 1.931 LYS 291.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 291.A HZ2 3.255 2.431 LYS 291.A NZ GLU 39.A OE2 LYS 291.A HZ2 2.987 2.186 ASN 292.A N LEU 288.A O ASN 292.A H 2.891 2.086 VAL 293.A N ALA 289.A O VAL 293.A H 3.065 2.267 VAL 294.A N LEU 290.A O VAL 294.A H 3.011 2.178 LYS 295.A N LYS 291.A O LYS 295.A H 2.834 2.002 LYS 295.A NZ GLU 39.A OE1 LYS 295.A HZ3 2.765 2.076 GLU 296.A N ASN 292.A O GLU 296.A H 3.075 2.227 ARG 297.A N VAL 293.A O ARG 297.A H 3.017 2.242 ARG 297.A NH1 ASP 257.A OD2 ARG 297.A HH12 2.908 2.133 ARG 297.A NH2 ASP 257.A OD2 ARG 297.A HH22 2.964 2.208 MET 298.A N VAL 294.A O MET 298.A H 2.867 2.058 LYS 299.A N LYS 295.A O LYS 299.A H 3.113 2.290 LEU 300.A N GLU 296.A O LEU 300.A H 2.971 2.171 LEU 301.A N ARG 297.A O LEU 301.A H 2.968 2.141 GLY 302.A N MET 298.A O GLY 302.A H 3.163 2.560 GLY 302.A N LYS 299.A O GLY 302.A H 3.237 2.506 SER 303.A N MET 298.A O SER 303.A H 3.098 2.414 ALA 304.A N MET 298.A O ALA 304.A H 3.355 2.571 ASN 305.A N GLU 40.A O ASN 305.A H 2.859 2.061 LYS 306.A N SER 303.A O LYS 306.A H 3.098 2.345 ILE 307.A N ASN 41.A O ILE 307.A H 3.392 2.566