Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3u8r_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): ILE 1.A N ASN 143.A O no hydrogen 2.859 N/A ILE 1.A N ASP 196.A OD2 no hydrogen 2.692 N/A VAL 2.A N ASP 191.A O VAL 2.A H 2.826 1.982 SER 5.A N VAL 154.A O SER 5.A H 2.965 2.183 ALA 7.A N LEU 152.A O ALA 7.A H 2.841 1.985 MET 11.A N GLU 8.A O MET 11.A H 3.158 2.349 SER 12.A OG GLN 15.A OE1 SER 12.A HG 2.758 2.145 GLN 15.A N SER 12.A O GLN 15.A H 2.932 2.082 GLN 15.A NE2 THR 139.A O GLN 15.A HE22 3.266 2.576 VAL 16.A N ALA 30.A O VAL 16.A H 2.928 2.118 MET 17.A N ARG 62.A O MET 17.A H 2.889 2.032 LEU 18.A N CYS 28.A O LEU 18.A H 2.910 2.063 PHE 19.A N LEU 60.A O PHE 19.A H 2.828 1.977 ARG 20.A N GLU 25.A O ARG 20.A H 2.815 1.991 ARG 20.A NH2 GLU 25.A OE2 ARG 20.A HH21 3.317 2.533 LYS 21.A N ASP 58.A O LYS 21.A H 2.944 2.099 LYS 21.A NZ ASN 57.A O LYS 21.A HZ2 3.238 2.590 GLN 24.A NE2 LYS 21.A O GLN 24.A HE21 2.862 2.034 GLU 25.A N ARG 20.A O GLU 25.A H 3.310 2.540 LEU 27.A N LEU 18.A O LEU 27.A H 2.878 2.036 CYS 28.A N LEU 18.A O CYS 28.A H 3.373 2.596 CYS 28.A SG LEU 27.A O no hydrogen 3.061 N/A CYS 28.A SG SER 197.A OG no hydrogen 3.590 N/A GLY 29.A N SER 197.A O GLY 29.A H 2.756 2.002 SER 31.A N LEU 39.A O SER 31.A H 2.857 2.098 SER 31.A OG.A GLN 213.A OE1 SER 31.A HG.A 2.624 1.820 SER 31.A OG.B GLN 213.A OE1 SER 31.A HG.B 2.983 2.319 LEU 32.A N TRP 14.A O LEU 32.A H 2.856 2.075 ILE 33.A N TRP 37.A O ILE 33.A H 3.012 2.169 ARG 36.A N SER 34.A OG ARG 36.A H 3.224 2.365 ARG 36.A NE ASP 35.A OD2 ARG 36.A HE 2.813 1.975 ARG 36.A NH1 ASP 35.A OD1 ARG 36.A HH11 2.954 2.107 ARG 36.A NH1 ASP 35.A OD2 ARG 36.A HH11 3.369 2.711 TRP 37.A N SER 34.A OG TRP 37.A H 3.231 2.581 VAL 38.A N MET 103.A O VAL 38.A H 2.925 2.121 LEU 39.A N SER 31.A O LEU 39.A H 2.786 1.974 THR 40.A N ALA 101.A O THR 40.A H 2.950 2.110 THR 40.A OG1 GLY 29.A O THR 40.A HG1 2.912 2.255 HIS 43.A N ASP 99.A OD1 HIS 43.A H 2.824 2.042 HIS 43.A ND1 ASP 99.A OD2 HIS 43.A HD1 2.710 1.869 HIS 43.A NE2 SER 197.A OG HIS 43.A HE2 2.915 2.195 CYS 44.A N ALA 41.A O CYS 44.A H 3.134 2.369 CYS 44.A SG SER 197.A O no hydrogen 3.678 N/A CYS 44.A SG SER 197.A OG no hydrogen 3.732 N/A LEU 45.A N ALA 42.A O LEU 45.A H 2.908 2.104 LEU 46.A N ALA 42.A O LEU 46.A H 2.847 2.097 TYR 47.A N LYS 52.A O TYR 47.A H 2.790 1.971 TRP 50.A N TYR 47.A O TRP 50.A H 3.025 2.224 ASP 51.A N PRO 48.A O ASP 51.A H 2.878 2.027 LYS 52.A N TYR 47.A O LYS 52.A H 3.142 2.291 PHE 54.A N LEU 45.A O PHE 54.A H 2.890 2.054 THR 55.A N ASP 58.A OD2 THR 55.A H 2.889 2.037 GLU 56.A N GLU 56.A OE1 GLU 56.A H 2.697 1.879 ASP 58.A N THR 55.A O ASP 58.A H 2.966 2.129 LEU 60.A N PHE 19.A O LEU 60.A H 2.885 2.062 VAL 61.A N SER 79.A O VAL 61.A H 3.010 2.162 ARG 62.A N MET 17.A O ARG 62.A H 2.918 2.120 ARG 62.A NE GLU 76.A OE1 ARG 62.A HE 2.817 2.010 ARG 62.A NH1 GLU 76.A OE1 ARG 62.A HH11 3.184 2.487 ARG 62.A NH1 GLU 76.A OE2 ARG 62.A HH11 3.131 2.340 ILE 63.A N LYS 77.A O ILE 63.A H 2.831 2.001 LYS 65.A NZ ARG 70.A O LYS 65.A HZ1 2.656 2.071 LYS 65.A NZ GLU 72.A OE1 LYS 65.A HZ2 2.772 1.940 LYS 65.A NZ GLU 76.A OE2 LYS 65.A HZ3 2.804 2.012 HIS 66.A N GLU 72.A OE1 HIS 66.A H 2.938 2.108 SER 67.A N GLU 72.A OE2 SER 67.A H 2.900 2.044 ARG 68.A N SER 150.A O ARG 68.A H 2.934 2.090 ARG 68.A NE PRO 149.A O ARG 68.A HE 2.776 2.032 ARG 70.A N SER 67.A OG.A ARG 70.A H 3.097 2.245 GLU 72.A N GLU 76.A OE2 GLU 72.A H 2.929 2.085 ILE 75.A N GLU 72.A O ILE 75.A H 3.113 2.303 GLU 76.A N GLU 72.A O GLU 76.A H 2.839 1.998 LYS 77.A N ILE 63.A O LYS 77.A H 2.862 2.038 SER 79.A N VAL 61.A O SER 79.A H 2.915 2.084 SER 79.A OG.B MET 80.A O SER 79.A HG.B 3.048 2.591 GLU 82.A N LYS 104.A O GLU 82.A H 2.763 1.960 ILE 84.A N GLU 56.A OE2 ILE 84.A H 2.854 2.020 TYR 85.A N LEU 102.A O TYR 85.A H 2.827 1.996 HIS 87.A N ILE 100.A O HIS 87.A H 3.197 2.350 TYR 90.A N HIS 87.A O TYR 90.A H 3.073 2.222 ASN 91.A N ASP 97.A O ASN 91.A H 2.892 2.060 ASN 91.A ND2 GLU 94.A OE1 ASN 91.A HD22 3.240 2.601 GLU 94.A N ASN 91.A OD1 GLU 94.A H 3.114 2.404 ASN 95.A ND2 ARG 172.A O ASN 95.A HD21 2.825 2.023 LEU 96.A N ASN 91.A O LEU 96.A H 2.898 2.251 ASP 97.A N ASN 95.A OD1 ASP 97.A H 3.123 2.358 ARG 98.A NH2 ARG 89.A O ARG 98.A HH21 2.866 2.092 ALA 101.A N THR 40.A O ALA 101.A H 2.908 2.127 LEU 102.A N TYR 85.A O LEU 102.A H 2.858 2.044 MET 103.A N VAL 38.A O MET 103.A H 2.795 2.001 LYS 104.A N LYS 83.A O LYS 104.A H 2.912 2.062 LEU 105.A N ARG 36.A O LEU 105.A H 2.889 2.044 LYS 106.A N MET 80.A O LYS 106.A H 2.925 2.084 LYS 106.A NZ GLU 82.A OE2 LYS 106.A HZ2 2.832 1.987 VAL 109.A N ASP 35.A O VAL 109.A H 2.848 2.036 SER 112.A N ILE 115.A O SER 112.A H 2.979 2.150 TYR 114.A N SER 112.A OG TYR 114.A H 3.003 2.169 ILE 115.A N SER 112.A O ILE 115.A H 3.341 2.514 HIS 116.A N PRO 13.A O HIS 116.A H 3.053 2.260 VAL 118.A N LEU 32.A O VAL 118.A H 3.006 2.192 CYS 119.A N TRP 211.A O CYS 119.A H 3.094 2.262 GLU 124.A N GLU 124.A OE1 GLU 124.A H 2.788 2.023 THR 125.A N ASP 122.A OD1 THR 125.A H 3.024 2.189 THR 125.A OG1 ASP 122.A OD1 THR 125.A HG1 2.877 2.209 ALA 126.A N ASP 122.A O ALA 126.A H 2.971 2.125 ALA 127.A N ARG 123.A O ALA 127.A H 2.905 2.079 SER 128.A N GLU 124.A O SER 128.A H 2.921 2.111 LEU 129.A N THR 125.A O LEU 129.A H 2.867 2.064 LEU 130.A N ALA 126.A O LEU 130.A H 3.015 2.177 GLN 131.A N LEU 129.A O GLN 131.A H 2.942 2.324 GLN 131.A NE2 ALA 127.A O GLN 131.A HE21 2.839 2.009 GLY 133.A N ILE 159.A O GLY 133.A H 2.846 2.007 TYR 134.A N GLN 131.A O TYR 134.A H 3.194 2.377 GLY 136.A N LEU 157.A O GLY 136.A H 2.951 2.132 ARG 137.A N VAL 202.A O ARG 137.A H 2.760 2.012 ARG 137.A NE ASN 156.A OD1 ARG 137.A HE 3.117 2.266 VAL 138.A N VAL 155.A O VAL 138.A H 2.932 2.098 THR 139.A OG1 GLN 15.A OE1 THR 139.A HG1 2.502 1.987 GLY 140.A N GLN 153.A O GLY 140.A H 3.060 2.289 TRP 141.A NE1 HIS 66.A O TRP 141.A HE1 2.993 2.154 GLY 142.A N ASP 196.A OD1 GLY 142.A H 2.820 2.021 ASN 143.A N GLU 194.A O ASN 143.A H 2.851 2.018 ASN 143.A ND2 GLN 148.A OE1 ASN 143.A HD21 2.400 1.693 LEU 144.A N GLY 147.A O LEU 144.A H 2.919 2.096 LEU 152.A N HIS 66.A O LEU 152.A H 2.873 2.095 GLN 153.A N GLY 140.A O GLN 153.A H 3.003 2.155 VAL 154.A N SER 5.A O VAL 154.A H 2.911 2.149 VAL 155.A N VAL 138.A O VAL 155.A H 3.037 2.223 LEU 157.A N GLY 136.A O LEU 157.A H 2.828 2.028 ILE 159.A N TYR 134.A O ILE 159.A H 2.853 2.004 VAL 160.A N CYS 179.A O VAL 160.A H 2.979 2.144 GLU 161.A N GLU 161.A OE1.B GLU 161.A H 2.648 1.824 GLU 161.A N GLU 161.A OE2.A GLU 161.A H 2.822 1.966 ARG 162.A NH1.A MET 177.A O ARG 162.A HH12.A 3.002 2.286 ARG 162.A NH2.A MET 177.A O ARG 162.A HH22.A 2.759 1.963 CYS 165.A N GLU 161.A O CYS 165.A H 3.024 2.191 CYS 165.A SG VAL 160.A O no hydrogen 3.549 N/A CYS 165.A SG GLU 161.A O no hydrogen 3.488 N/A LYS 166.A N ARG 162.A O LYS 166.A H 2.854 2.027 ASP 167.A N PRO 163.A O ASP 167.A H 2.996 2.206 SER 168.A N CYS 165.A O SER 168.A H 3.173 2.392 THR 169.A N LYS 166.A O THR 169.A H 3.471 2.612 THR 169.A OG1 GLU 221.A OE1 THR 169.A HG1 2.693 2.052 ILE 171.A N THR 169.A OG1 ILE 171.A H 3.107 2.254 ARG 172.A NE GLU 94.A OE2 ARG 172.A HE 2.728 1.871 ARG 172.A NH1 GLU 94.A OE1 ARG 172.A HH11 2.822 1.964 ARG 172.A NH1 GLU 94.A OE2 ARG 172.A HH11 3.511 2.892 THR 174.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 174.A HG1 2.677 1.874 ASN 176.A N THR 174.A OG1 ASN 176.A H 3.093 2.302 ASN 176.A ND2 ASP 97.A OD1 ASN 176.A HD21 3.003 2.163 MET 177.A N THR 174.A O MET 177.A H 3.092 2.352 PHE 178.A N TYR 232.A O PHE 178.A H 2.948 2.153 ALA 180.A N GLY 230.A O ALA 180.A H 2.993 2.219 GLY 181.A N PRO 158.A O GLY 181.A H 2.873 2.056 LYS 183.A N GLU 186.A OE2 LYS 183.A H 2.843 1.993 LYS 183.A NZ GLU 161.A OE1.A LYS 183.A HZ1 2.776 2.031 LYS 183.A NZ GLU 161.A OE1.B LYS 183.A HZ1 3.099 2.243 LYS 183.A NZ GLU 161.A OE2.A LYS 183.A HZ1 2.775 1.961 GLU 186.A N LYS 183.A O GLU 186.A H 3.043 2.187 ARG 189.A NE ASP 224.A OD2 ARG 189.A HE 2.825 1.978 ARG 189.A NH1 ASP 224.A O ARG 189.A HH11 2.793 2.033 ARG 189.A NH1 ASP 224.A OD2 ARG 189.A HH11 3.541 2.906 ARG 189.A NH1 ASP 226.A OD1 ARG 189.A HH12 2.856 2.147 ARG 189.A NH2 ASP 226.A OD1 ARG 189.A HH22 2.856 2.146 GLY 190.A N ASP 224.A OD1 GLY 190.A H 2.936 2.084 ASP 191.A N VAL 2.A O ASP 191.A H 3.276 2.525 CYS 193.A N ASP 196.A OD2 CYS 193.A H 2.801 2.025 CYS 193.A SG LYS 145.A O no hydrogen 3.848 N/A ASP 196.A N CYS 193.A O ASP 196.A H 2.909 2.070 GLY 198.A N VAL 217.A O GLY 198.A H 2.898 2.041 GLY 199.A N ASP 196.A O GLY 199.A H 3.092 2.262 PHE 201.A N GLY 215.A O PHE 201.A H 2.903 2.045 VAL 202.A N ARG 137.A O VAL 202.A H 2.831 2.010 MET 203.A N TYR 212.A O MET 203.A H 2.827 2.020 SER 205.A N ARG 210.A O SER 205.A H 2.831 1.979 SER 205.A OG ASN 208.A OD1 SER 205.A HG 3.287 2.908 PHE 207.A N SER 205.A OG PHE 207.A H 3.001 2.234 ASN 208.A N SER 205.A OG ASN 208.A H 3.320 2.556 ASN 208.A ND2 TYR 212.A OH ASN 208.A HD22 2.924 2.090 ASN 209.A N SER 205.A O ASN 209.A H 3.005 2.291 ARG 210.A N ASN 208.A OD1 ARG 210.A H 3.015 2.174 TYR 212.A N MET 203.A O TYR 212.A H 2.865 2.017 GLN 213.A N CYS 119.A O GLN 213.A H 2.828 2.003 GLN 213.A NE2 GLY 215.A O GLN 213.A HE21 3.052 2.228 MET 214.A N PHE 201.A O MET 214.A H 2.896 2.194 GLY 215.A N PHE 201.A O GLY 215.A H 3.101 2.292 ILE 216.A N THR 233.A O ILE 216.A H 3.223 2.526 VAL 217.A N GLY 199.A O VAL 217.A H 2.883 2.052 SER 218.A N PHE 231.A O SER 218.A H 2.997 2.191 TRP 219.A N PHE 231.A O TRP 219.A H 3.214 2.406 CYS 223.A N GLU 146.A OE2 CYS 223.A H 3.031 2.219 CYS 223.A SG ALA 192.A O no hydrogen 3.987 N/A ASP 224.A N ASP 191.A OD2 ASP 224.A H 2.928 2.079 ARG 225.A NE GLU 146.A OE2 ARG 225.A HE 3.034 2.231 ARG 225.A NH1 GLU 146.A OE1 ARG 225.A HH11 2.901 2.045 LYS 228.A N ARG 225.A O LYS 228.A H 3.177 2.330 LYS 228.A NZ SER 168.A O LYS 228.A HZ3 2.792 1.936 LYS 228.A NZ GLU 221.A OE1 LYS 228.A HZ2 2.915 2.031 GLY 230.A N ALA 180.A O GLY 230.A H 3.071 2.315 PHE 231.A N TRP 219.A O PHE 231.A H 2.881 2.052 TYR 232.A N PHE 178.A O TYR 232.A H 2.816 2.024 THR 233.A N ILE 216.A O THR 233.A H 2.890 2.123 THR 233.A OG1 ASP 99.A O THR 233.A HG1 2.797 2.005 HIS 234.A N ASN 176.A O HIS 234.A H 2.871 2.019 VAL 235.A N MET 214.A O VAL 235.A H 3.087 2.244 ARG 237.A NE ASN 176.A OD1 ARG 237.A HE 3.292 2.489 ARG 237.A NH1 ASN 176.A OD1 ARG 237.A HH11 3.323 2.538 LEU 238.A N VAL 235.A O LEU 238.A H 2.910 2.145 LYS 239.A N PHE 236.A O LYS 239.A H 3.078 2.227 LYS 239.A NZ PRO 121.A O LYS 239.A HZ2 2.852 2.096 TRP 241.A N LEU 238.A O TRP 241.A H 3.162 2.545 ILE 242.A N LEU 238.A O ILE 242.A H 3.379 2.563 GLN 243.A N LYS 239.A O GLN 243.A H 2.889 2.039 GLN 243.A NE2 ASP 247.A OD1 GLN 243.A HE21 3.533 2.807 GLN 243.A NE2 ASP 247.A OD2 GLN 243.A HE21 2.792 1.986 LYS 244.A N LYS 240.A O LYS 244.A H 3.003 2.213 LYS 244.A NZ GLN 248.A OE1 LYS 244.A HZ2 2.722 2.052 VAL 245.A N TRP 241.A O VAL 245.A H 3.074 2.235 ILE 246.A N ILE 242.A O ILE 246.A H 3.125 2.289 ASP 247.A N GLN 243.A O ASP 247.A H 2.804 1.984 GLN 248.A N LYS 244.A O GLN 248.A H 2.985 2.252 GLU 251.A N GLN 248.A O GLU 251.A H 3.077 2.266