Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3v2j_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 3.037 2.201 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.853 2.135 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.125 2.339 GLU 11.A N GLU 11.A OE1.A no hydrogen 2.817 N/A HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.814 1.965 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.300 2.460 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.145 2.428 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.131 2.282 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ1 2.909 2.068 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.140 2.470 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.897 2.175 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.835 1.980 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.148 2.289 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.848 2.120 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.810 2.089 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.993 2.157 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 3.129 2.378 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.543 2.857 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.224 2.452 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 3.174 2.446 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.096 2.423 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.087 2.238 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.040 2.186 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.916 2.205 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.834 1.977 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.815 1.990 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.380 2.578 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD2 THR 32.A HG1 2.642 2.066 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.984 2.244 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.136 2.338 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 3.127 2.467 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 2.934 2.101 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 3.015 2.193 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.888 2.069 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.062 2.215 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.852 2.014 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.937 2.079 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.152 2.312 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.764 1.909 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.861 2.063 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.166 2.461 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 3.005 2.194 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.917 2.089 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.920 2.160 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.946 2.106 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.200 2.375 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.221 2.379 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.200 2.406 ASN 59.A ND2 HIS 61.A NE2.A ASN 59.A HD21 2.896 2.325 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.790 1.985 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 no hydrogen 2.962 N/A ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 3.041 2.241 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.873 2.064 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.863 2.041 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.867 2.018 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.938 2.101 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.922 2.094 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.976 2.126 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.909 2.268 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 3.115 2.328 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2 3.067 2.247 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 3.010 2.210 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.832 2.022 LYS 77.A N SER 45.A O no hydrogen 2.907 N/A LYS 77.A NZ THR 84.A OG1 no hydrogen 3.071 N/A GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.073 2.263 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.903 2.075 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.091 2.244 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 2.958 2.240 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.812 2.041 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.673 1.821 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.877 2.149 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 3.284 2.636 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.897 2.042 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.969 2.115 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.930 2.167 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.100 2.320 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.763 1.903 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.896 2.103 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.793 1.944 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.803 1.966 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.852 2.171 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.053 2.308 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.305 2.472 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22 2.907 2.055 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.997 2.276 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.836 2.145 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.815 2.076 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.732 1.895 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.714 1.896 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.616 1.887 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.104 2.310 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.784 1.938 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.855 2.031 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.878 2.044 ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.104 2.472 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.889 2.121 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.789 1.941 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.886 2.032 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.713 1.866 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.914 2.071 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.888 2.032 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.914 2.180 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.200 2.464 HIS 119.A NE2 TYR 48.A OH no hydrogen 2.741 N/A TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.971 2.213 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.821 2.059 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.821 1.995 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.253 2.401 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 3.008 2.158 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.162 2.380 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.157 2.303 LYS 123.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ1 3.361 2.632 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.110 2.251 TYR 124.A OH ASP 135.A OD1 TYR 124.A HH 2.513 1.926 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.124 2.322 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.951 2.274 LYS 129.A N ASP 126.A O no hydrogen 3.201 N/A LYS 129.A N ASP 126.A OD2 no hydrogen 2.889 N/A LYS 129.A NZ ASP 126.A OD1 no hydrogen 3.169 N/A ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 3.062 2.231 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.105 2.384 GLN 132.A N LYS 129.A O no hydrogen 3.110 N/A GLN 132.A NE2.A GLY 128.A O no hydrogen 3.136 N/A GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.089 2.275 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.129 2.411 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.857 2.027 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.933 2.121 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.196 2.430 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.964 2.143 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.830 2.002 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.915 2.114 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 3.043 2.205 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.962 2.138 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.786 1.953 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.036 2.197 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.052 2.219 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.199 2.376 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE22 3.111 2.344 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.011 2.423 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.155 2.335 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.946 2.171 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.225 2.436 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.376 2.538 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.989 2.184 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.748 2.341 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.102 2.272 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ1 3.569 2.837 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.871 2.027 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.763 1.933 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.223 2.374 LYS 168.A NZ GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ1 3.217 2.483 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.938 2.161 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.972 2.123 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 3.052 2.232 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.019 2.185 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.180 2.476 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.863 2.055 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.312 2.459 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.011 2.166 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.353 2.496 GLU 183.A N GLU 210.A OE2 GLU 183.A H 3.210 2.409 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.971 2.174 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.222 2.362 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 3.029 2.205 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.908 2.084 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.826 2.042 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.834 2.075 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.262 2.517 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.778 1.919 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 3.012 2.220 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.676 1.872 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.860 2.133 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 3.038 2.389 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.235 2.396 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.899 2.052 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.948 2.130 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.965 2.153 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.982 2.149 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.871 2.037 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.935 2.102 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 3.012 2.168 ILE 212.A N PHE 143.A O no hydrogen 2.916 N/A SER 213.A OG.B SER 148.A O no hydrogen 3.313 N/A VAL 214.A N LYS 145.A O no hydrogen 2.924 N/A SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.164 2.342 SER 216.A OG.A GLU 217.A OE1 no hydrogen 3.400 N/A SER 216.A OG.A GLU 217.A OE2 no hydrogen 3.420 N/A GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.198 2.390 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 2.998 2.143 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.909 2.084 VAL 219.A N SER 215.A O no hydrogen 3.183 N/A LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.967 2.167 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.225 2.539 PHE 222.A N VAL 219.A O PHE 222.A H 3.031 2.409 ARG 223.A N LEU 220.A O ARG 223.A H 3.189 2.543 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.898 2.100 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.479 2.836 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.804 1.950 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.323 2.485 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.294 2.439 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.859 2.090 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 3.021 2.176 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.907 2.102 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.662 2.974 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.001 2.201 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.907 2.094 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.109 2.295 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.817 1.979 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.795 1.947 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.902 2.059 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.009 2.187 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.885 2.044 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.777 1.959 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.797 2.131 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.353 2.694 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.305 2.658 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.764 1.941 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.823 1.982 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ2 3.177 2.319 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.933 2.078 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 2.977 2.249 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.895 2.051 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.812 2.028 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.957 2.275 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.563 2.905 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 3.014 2.160 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.832 2.004 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.906 2.074