Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3v3f_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.924 2.157 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.953 2.149 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD21 3.280 2.627 GLY 9.A N GLY 5.A O GLY 9.A H 2.739 2.143 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.791 1.940 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 2.885 2.228 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.031 2.323 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.101 2.468 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.218 2.378 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ3 2.960 2.095 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.784 2.038 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.810 1.951 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.223 2.366 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.641 1.899 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 no hydrogen 3.036 N/A ARG 24.A NH2 GLY 192.A O no hydrogen 2.726 N/A GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.249 2.395 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 2.929 2.091 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.921 2.222 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.515 3.118 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.810 1.974 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.902 2.071 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.939 2.268 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.141 2.417 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.908 2.090 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.127 2.332 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.959 2.122 SER 40.A N ASP 38.A OD1 no hydrogen 2.888 N/A SER 40.A OG ASP 38.A OD1 no hydrogen 2.925 N/A LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 2.874 2.036 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.923 2.092 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 3.043 2.194 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.041 2.193 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.800 1.966 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 3.166 2.350 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 3.384 2.592 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.903 2.080 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 3.004 2.213 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.955 2.105 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD21 2.974 2.159 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD22 3.317 2.476 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.118 2.287 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 3.003 2.187 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.937 2.119 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.843 2.005 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 3.006 2.244 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.874 2.044 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.926 2.095 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.796 2.002 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.964 2.148 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H.B 3.049 2.208 GLN 71.A N ASP 68.A O GLN 71.A H 3.360 2.511 GLN 71.A NE2 ASP 68.A OD2 GLN 71.A HE21 3.017 2.185 ALA 74.A N GLN 71.A O ALA 74.A H 3.068 2.227 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H.A 3.203 2.475 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.836 2.032 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 3.016 2.223 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.002 2.243 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.971 2.125 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.008 2.196 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 3.034 2.344 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.784 2.002 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 3.286 2.492 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 3.332 2.506 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 3.010 2.178 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 3.020 2.282 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.131 2.357 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.794 1.941 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.939 2.159 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.734 1.895 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.912 2.091 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.782 2.031 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 2.922 2.220 GLY 99.A N HIS 97.A ND1 GLY 99.A H 3.026 2.258 GLN 100.A N HIS 97.A O GLN 100.A H 3.339 2.510 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE21 2.964 2.117 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE21 3.497 2.844 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.946 2.294 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.984 2.284 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.894 2.157 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.888 2.035 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.490 1.738 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.096 2.315 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.806 1.960 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.735 1.925 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.861 2.024 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.975 2.185 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.775 1.925 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.804 1.951 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.609 1.794 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.858 2.020 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.935 2.098 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.908 2.169 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.073 2.327 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.965 2.200 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.904 2.125 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.822 1.985 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD21 3.146 2.306 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.974 2.126 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 no hydrogen 3.009 N/A TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.016 2.167 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.059 2.204 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.962 2.261 LYS 129.A N ASP 126.A OD2 LYS 129.A H 2.840 2.020 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD1 LYS 129.A HZ3 2.996 2.134 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.938 2.155 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.121 2.349 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.302 2.489 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 2.968 2.168 ASP 135.A N ASP 135.A OD1 ASP 135.A H 2.686 2.072 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.201 2.492 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.828 2.056 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.886 2.078 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.203 2.449 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.897 2.062 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.821 1.995 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.874 2.080 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.779 1.944 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.862 2.033 LYS 145.A NZ VAL 146.A O LYS 145.A HZ2 3.435 2.629 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.761 1.979 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.032 2.187 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ3 3.440 2.561 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.900 2.060 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.146 2.298 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 2.943 2.178 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE21 3.505 2.714 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.141 2.317 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.931 2.118 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.350 2.519 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 3.204 2.451 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.917 2.263 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.003 2.215 LYS 164.A NZ LYS 224.A O LYS 164.A HZ1 3.319 2.769 LYS 166.A N ASN 228.A O no hydrogen 3.129 N/A GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.851 2.027 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.076 2.235 LYS 168.A NZ GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ1 3.103 2.469 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.865 2.121 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 3.031 2.232 PHE 175.A N SER 53.A OG PHE 175.A H 2.851 2.019 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.843 2.016 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.006 2.161 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.134 2.478 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1 ARG 178.A HH12 3.565 2.962 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.642 1.841 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.052 2.204 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.063 2.226 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.325 2.484 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.983 2.178 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.037 2.178 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.824 2.009 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.938 2.150 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.838 2.074 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.259 2.499 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.846 1.988 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 3.026 2.235 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.663 1.863 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.827 2.060 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 2.943 2.302 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.152 2.321 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.926 2.088 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.916 2.123 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.929 2.101 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 3.009 2.193 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.803 1.954 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.959 2.128 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H.B 2.981 2.153 LYS 209.A NZ.B ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ1.B 3.201 2.447 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.849 2.122 SER 213.A OG.A SER 148.A O no hydrogen 3.048 N/A VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.805 1.977 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.062 2.247 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.044 2.209 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE22 3.126 2.282 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.721 1.931 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.233 2.395 SER 220.A N SER 216.A O SER 220.A H 3.083 2.300 SER 220.A OG GLU 217.A O SER 220.A HG 2.834 2.127 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.111 2.376 PHE 222.A N VAL 219.A O PHE 222.A H 3.108 2.456 ARG 223.A N SER 220.A O ARG 223.A H 3.124 2.352 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.888 2.144 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.472 2.851 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.717 1.861 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.272 2.434 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.356 2.513 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.798 2.007 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.728 1.910 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD21 3.068 2.240 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.123 2.310 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.617 1.916 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.871 2.014 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD21 2.962 2.121 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 2.968 2.116 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.686 1.831 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.729 1.903 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.867 2.076 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.345 2.755 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.232 2.568 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.781 1.980 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE21 2.839 1.994 ARG 250.A N LEU 247.A O ARG 250.A H 3.252 2.601 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.999 2.143 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.106 2.407 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.884 2.047 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.803 2.004 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.951 2.250 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H.A 2.994 2.151 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.848 2.047 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.883 2.039