Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3v3i_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.845 1.993 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.703 2.034 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.504 2.871 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.778 1.927 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 3.076 2.382 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.473 2.626 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.084 2.323 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.206 2.376 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ2 2.873 2.019 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.083 2.412 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.839 2.110 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.831 1.974 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.179 2.321 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.774 2.081 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 no hydrogen 2.896 N/A ARG 24.A NH2 GLU 201.A O no hydrogen 2.815 N/A GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.120 2.262 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.035 2.181 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.852 2.083 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.839 1.990 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.967 2.126 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.346 2.565 HIS 33.A N ASP 31.A OD2 no hydrogen 3.093 N/A THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.167 2.528 THR 34.A N ASP 31.A OD2 THR 34.A H 3.187 2.465 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.924 2.125 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.146 2.377 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 3.004 2.177 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H.B 2.985 2.157 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.328 2.542 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.858 2.038 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.840 1.981 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.032 2.220 THR 52.A OG1 GLN 50.A O THR 52.A HG1 2.988 2.239 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.758 1.961 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1.A ARG 55.A HE 2.759 2.042 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1.A ARG 55.A HH21 3.019 2.389 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.953 2.132 LEU 57.A N GLN 64.A O LEU 57.A H 2.977 2.219 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.980 2.144 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.194 2.360 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.273 2.447 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.062 2.251 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.905 2.116 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 3.043 2.190 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.873 2.095 GLN 64.A N LEU 57.A O GLN 64.A H 2.938 2.168 GLN 64.A NE2 GLU 66.A OE2.B GLN 64.A HE22 2.805 1.981 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.907 2.081 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H.B 2.964 2.123 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.863 2.085 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.864 2.025 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 3.055 2.207 GLN 71.A N ASP 68.A O GLN 71.A H 3.299 2.444 GLN 71.A NE2 ASP 68.A OD2 GLN 71.A HE21 3.167 2.314 ALA 74.A N GLN 71.A O ALA 74.A H 3.243 2.418 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.888 2.116 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.825 2.000 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.911 2.083 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.034 2.214 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.784 1.949 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.004 2.194 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 3.160 2.447 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.811 2.025 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.871 2.188 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 3.267 2.435 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.968 2.113 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.992 2.234 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.074 2.305 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.930 2.073 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.877 2.092 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.889 2.043 HIS 93.A NE2 HIS 116.A ND1 no hydrogen 3.115 N/A TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.847 2.021 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.812 2.082 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 2.968 2.311 GLY 99.A N HIS 97.A ND1 GLY 99.A H 3.060 2.280 GLN 100.A N HIS 97.A O GLN 100.A H 3.379 2.531 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22 2.961 2.131 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22 3.454 2.844 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.934 2.228 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.776 2.020 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.880 2.216 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.733 1.890 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.694 1.885 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.424 2.621 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.612 1.916 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.253 2.469 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.828 1.977 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.688 1.927 LYS 108.A NZ ASP 29.A OD2 LYS 108.A HZ3 2.842 1.988 LYS 109.A N VAL 106.A O no hydrogen 2.848 N/A ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.177 2.511 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.892 2.134 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.799 1.948 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.821 1.973 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.782 1.947 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.951 2.106 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.951 2.091 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.891 2.148 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 2.969 2.190 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.964 2.221 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD1 TRP 120.A HE1 2.635 1.872 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.783 1.944 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.071 2.221 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.991 2.138 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.217 2.369 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.085 2.251 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.148 2.320 LYS 129.A N ASP 126.A O LYS 129.A H 3.193 2.605 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.952 2.135 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD1 LYS 129.A HZ2 3.503 2.899 LYS 129.A NZ ASP 126.A OD2 LYS 129.A HZ2 2.810 1.926 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.992 2.163 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.100 2.309 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.166 2.333 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.004 2.181 ASP 135.A N ASP 135.A OD1 ASP 135.A H 2.734 2.124 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.199 2.494 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.856 2.057 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.804 1.994 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.187 2.385 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.915 2.094 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.792 1.987 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.936 2.195 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.943 2.129 LYS 145.A N ILE 212.A O no hydrogen 2.955 N/A GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.696 1.898 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.107 2.283 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ3 3.267 2.379 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.016 2.191 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.215 2.361 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE22 3.046 2.252 LYS 155.A NZ THR 173.A O no hydrogen 2.460 N/A VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.116 2.307 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.984 2.150 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.338 2.597 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.315 2.477 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 3.138 2.423 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.789 2.227 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 2.989 2.227 LYS 164.A NZ LYS 224.A O no hydrogen 3.184 N/A LYS 166.A N ASN 228.A O no hydrogen 2.910 N/A GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.799 1.963 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.048 2.201 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.942 2.167 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.940 2.089 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.986 2.225 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.955 2.108 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.193 2.538 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1 ARG 178.A HH12 3.392 2.813 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1 ARG 178.A HH22 3.305 2.706 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.664 1.901 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.134 2.305 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.019 2.174 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.242 2.389 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.972 2.181 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.080 2.225 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.842 2.016 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.902 2.108 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.791 2.032 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.206 2.457 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.790 1.934 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.949 2.153 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.695 1.900 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.927 2.175 CYS 202.A SG LEU 200.A O CYS 202.A HG 3.647 2.489 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.169 2.328 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.924 2.112 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.848 2.024 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 3.032 2.255 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 3.028 2.205 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.876 2.038 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.932 2.098 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.894 2.066 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.925 2.133 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.863 2.041 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.088 2.252 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.045 2.275 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 2.963 2.105 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.756 2.050 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.104 2.288 SER 220.A N SER 216.A O SER 220.A H 2.992 2.181 SER 220.A OG GLU 217.A O SER 220.A HG 2.812 2.132 LYS 221.A N GLU 217.A O no hydrogen 3.165 N/A LYS 221.A N GLN 218.A O no hydrogen 3.253 N/A LYS 221.A NZ ASP 158.A OD1 no hydrogen 3.012 N/A PHE 222.A N VAL 219.A O PHE 222.A H 2.954 2.305 ARG 223.A N SER 220.A O ARG 223.A H 3.166 2.469 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.769 1.989 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.944 2.090 LYS 224.A N LYS 221.A O no hydrogen 3.295 N/A LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.287 2.464 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.843 2.060 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.876 2.054 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.035 2.196 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.965 2.352 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.593 1.797 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.711 1.856 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.259 2.575 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD22 2.716 1.863 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 2.928 2.088 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.695 1.842 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.802 1.993 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.848 2.130 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.261 2.620 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.274 2.615 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.804 2.004 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 3.000 2.175 ARG 250.A N LEU 247.A O ARG 250.A H 3.349 2.550 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.988 2.131 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.116 2.425 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.897 2.079 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.789 1.991 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.970 2.292 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.971 2.125 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.912 2.115 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.832 2.008