Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 3zka_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A NZ ASP 21.A O LYS 1.A HZ1 2.683 1.791 LYS 3.A N ASP 52.A OD2 LYS 3.A H 2.965 1.957 LYS 3.A NZ GLU 50.A O LYS 3.A HZ3 3.081 2.210 VAL 4.A N ASP 24.A O VAL 4.A H 2.795 1.789 VAL 5.A N LEU 53.A O VAL 5.A H 2.926 1.994 ALA 6.A N HIS 26.A O ALA 6.A H 2.851 1.893 THR 7.A N PHE 55.A O THR 7.A H 3.036 2.233 ILE 10.A N ASN 8.A OD1 ILE 10.A H 2.900 2.301 ILE 11.A N ASN 8.A OD1 ILE 11.A H 3.025 2.031 ALA 12.A N ASN 8.A O ALA 12.A H 2.909 1.917 ASP 13.A N SER 9.A O ASP 13.A H 2.900 1.970 ILE 14.A N ILE 10.A O ILE 14.A H 3.085 2.098 THR 15.A N ILE 11.A O THR 15.A H 2.924 1.938 THR 15.A OG1 ILE 11.A O THR 15.A HG1 2.764 1.938 LYS 16.A N ALA 12.A O LYS 16.A H 2.887 1.947 ASN 17.A N ASP 13.A O ASN 17.A H 3.109 2.201 ASN 17.A ND2 ASP 13.A O ASN 17.A HD21 2.888 1.887 ILE 18.A N ILE 14.A O ILE 18.A H 3.260 2.511 ILE 18.A N THR 15.A O ILE 18.A H 3.130 2.281 ALA 19.A N THR 15.A O ALA 19.A H 2.825 1.837 GLY 20.A N LYS 16.A O GLY 20.A H 2.794 1.832 LYS 22.A N ALA 19.A O LYS 22.A H 3.109 2.114 ASP 24.A N LEU 2.A O ASP 24.A H 2.823 1.811 HIS 26.A N VAL 4.A O HIS 26.A H 2.916 1.966 HIS 26.A NE2 ASP 44.A OD1 HIS 26.A HE2 2.814 1.835 ILE 28.A N ALA 6.A O ILE 28.A H 2.967 2.050 VAL 29.A N THR 7.A O VAL 29.A H 2.929 1.940 GLY 32.A N SER 250.A OG GLY 32.A H 2.861 1.884 GLN 33.A N PRO 30.A O GLN 33.A H 2.939 2.107 ASP 34.A N GLN 33.A OE1 ASP 34.A H 3.095 2.302 HIS 36.A N ASP 34.A OD1 HIS 36.A H 3.051 2.045 HIS 36.A ND1 LEU 61.A O HIS 36.A HD1 2.781 1.820 LEU 41.A N ASP 44.A OD2 LEU 41.A H 2.928 1.927 ASP 44.A N LEU 41.A O ASP 44.A H 2.850 2.130 VAL 45.A N LEU 41.A O VAL 45.A H 3.181 2.244 LYS 46.A N PRO 42.A O LYS 46.A H 2.977 1.991 LYS 47.A N GLU 43.A O LYS 47.A H 2.925 1.925 THR 48.A N ASP 44.A O THR 48.A H 2.953 1.999 THR 48.A OG1 ASP 44.A O THR 48.A HG1 2.813 1.909 SER 49.A N VAL 45.A O SER 49.A H 3.023 2.039 GLU 50.A N LYS 46.A O GLU 50.A H 3.126 2.254 ALA 51.A N THR 48.A O ALA 51.A H 3.197 2.268 ASP 52.A N LYS 3.A O ASP 52.A H 2.778 1.895 LEU 53.A N LYS 3.A O LEU 53.A H 3.166 2.249 ILE 54.A N ASP 83.A O ILE 54.A H 2.875 1.944 PHE 55.A N VAL 5.A O PHE 55.A H 2.812 1.853 TYR 56.A N PHE 85.A O TYR 56.A H 3.172 2.196 ASN 57.A N GLU 62.A OE2 ASN 57.A H 2.900 1.889 ASN 57.A ND2 GLY 58.A O ASN 57.A HD21 2.995 2.010 ASN 57.A ND2 PRO 107.A O ASN 57.A HD22 3.072 2.185 GLY 58.A N GLU 62.A OE1 GLY 58.A H 3.210 2.274 LEU 61.A N GLY 58.A O LEU 61.A H 3.073 2.221 ASN 66.A ND2 TYR 38.A O ASN 66.A HD22 3.064 2.090 ASN 66.A ND2 GLU 39.A OE2 ASN 66.A HD21 3.187 2.266 ALA 67.A N GLY 64.A O ALA 67.A H 3.035 2.029 TRP 68.A N ASN 66.A OD1 TRP 68.A H 3.239 2.420 TRP 68.A NE1 PRO 35.A O TRP 68.A HE1 3.223 2.281 PHE 69.A N GLU 62.A O PHE 69.A H 3.164 2.163 LYS 71.A N ALA 67.A O LYS 71.A H 3.096 2.105 LYS 71.A NZ ASN 66.A O LYS 71.A HZ2 2.665 1.790 LEU 72.A N TRP 68.A O LEU 72.A H 3.088 2.170 VAL 73.A N PHE 69.A O VAL 73.A H 2.997 2.000 GLU 74.A N THR 70.A O GLU 74.A H 2.991 2.044 ASN 75.A N LYS 71.A O ASN 75.A H 3.031 2.039 ALA 76.A N LEU 72.A O ALA 76.A H 3.072 2.200 LYS 77.A N GLU 74.A O LYS 77.A H 3.277 2.313 LYS 78.A N VAL 73.A O LYS 78.A H 3.129 2.122 LYS 78.A NZ SER 49.A O LYS 78.A HZ2 3.554 2.838 THR 79.A N ASP 83.A OD2 THR 79.A H 2.913 1.913 ASN 81.A N TYR 84.A O ASN 81.A H 2.845 1.889 LYS 82.A N THR 79.A O LYS 82.A H 3.220 2.274 ASP 83.A N THR 79.A O ASP 83.A H 2.855 1.862 TYR 84.A N THR 79.A O TYR 84.A H 3.311 2.365 PHE 85.A N ILE 54.A O PHE 85.A H 2.963 2.061 VAL 87.A N TYR 56.A O VAL 87.A H 2.884 1.909 SER 88.A OG ASN 57.A O SER 88.A HG 2.637 1.719 ASP 89.A N ALA 86.A O ASP 89.A H 3.213 2.201 VAL 91.A N SER 88.A O VAL 91.A H 3.008 1.998 ILE 94.A N TYR 179.A OH ILE 94.A H 3.044 2.042 LEU 96.A N LYS 104.A O LEU 96.A H 2.808 1.809 GLY 98.A N TYR 95.A O GLY 98.A H 2.913 2.001 GLN 99.A N LEU 96.A O GLN 99.A H 3.190 2.216 GLN 99.A NE2 GLU 97.A O GLN 99.A HE21 3.489 2.773 GLY 103.A N GLU 105.A OE1 GLY 103.A H 2.854 2.078 LYS 104.A N GLU 101.A O LYS 104.A H 3.079 2.086 GLU 105.A N GLU 105.A OE1 GLU 105.A H 2.722 1.766 ASP 106.A N ILE 94.A O ASP 106.A H 2.764 1.757 HIS 108.A N ASP 106.A OD1 HIS 108.A H 2.982 1.985 HIS 108.A ND1 ASP 106.A OD1 HIS 108.A HD1 2.779 1.820 ALA 109.A N PRO 107.A O ALA 109.A H 2.859 2.005 TRP 110.A NE1 THR 248.A O TRP 110.A HE1 3.049 2.275 ASN 112.A N ALA 109.A O ASN 112.A H 3.412 2.415 ASN 112.A ND2 TYR 179.A O ASN 112.A HD21 2.922 1.921 LEU 113.A N TYR 184.A OH LEU 113.A H 3.234 2.221 ASN 115.A N ASN 112.A O ASN 115.A H 3.218 2.509 ASN 115.A N ASN 112.A OD1 ASN 115.A H 2.983 2.029 ASN 115.A ND2 ALA 109.A O ASN 115.A HD21 2.907 1.979 GLY 116.A N ASN 112.A O GLY 116.A H 3.251 2.294 ILE 117.A N LEU 113.A O ILE 117.A H 2.933 1.992 ILE 118.A N GLU 114.A O ILE 118.A H 3.090 2.170 PHE 119.A N ASN 115.A O PHE 119.A H 2.802 1.834 ALA 120.A N GLY 116.A O ALA 120.A H 2.987 1.997 LYS 121.A N ILE 117.A O LYS 121.A H 2.851 1.874 ASN 122.A N ILE 118.A O ASN 122.A H 2.961 1.998 ASN 122.A ND2 VAL 87.A O ASN 122.A HD21 2.923 1.989 ASN 122.A ND2 ASP 89.A O ASN 122.A HD22 2.782 1.797 ILE 123.A N PHE 119.A O ILE 123.A H 2.888 1.932 ALA 124.A N ALA 120.A O ALA 124.A H 2.846 1.838 LYS 125.A N LYS 121.A O LYS 125.A H 3.001 2.029 GLN 126.A N ASN 122.A O GLN 126.A H 3.162 2.197 LEU 127.A N ILE 123.A O LEU 127.A H 2.936 1.931 SER 128.A N ALA 124.A O SER 128.A H 2.972 1.987 SER 128.A OG ALA 124.A O SER 128.A HG 2.893 1.982 ALA 129.A N LYS 125.A O ALA 129.A H 3.073 2.186 LYS 130.A N GLN 126.A O LYS 130.A H 3.142 2.199 LYS 130.A NZ LYS 82.A O LYS 130.A HZ3 2.727 1.776 ASP 131.A N LEU 127.A O ASP 131.A H 2.856 1.994 ASN 134.A N ASP 131.A O ASN 134.A H 3.143 2.183 ASN 134.A ND2 ASP 131.A OD2 ASN 134.A HD21 2.852 1.862 LYS 135.A N PRO 132.A O LYS 135.A H 3.174 2.172 TYR 138.A N ASN 134.A O TYR 138.A H 2.950 1.981 GLU 139.A N LYS 135.A O GLU 139.A H 3.045 2.105 LYS 140.A N GLU 136.A O LYS 140.A H 3.000 2.029 ASN 141.A N PHE 137.A O ASN 141.A H 3.050 2.047 ASN 141.A ND2 ILE 18.A O ASN 141.A HD21 2.810 1.820 LEU 142.A N TYR 138.A O LEU 142.A H 2.825 1.852 LYS 143.A N GLU 139.A O LYS 143.A H 3.010 2.045 LYS 143.A NZ ASP 147.A OD1 LYS 143.A HZ2 2.903 2.118 LYS 143.A NZ ASP 147.A OD2 LYS 143.A HZ1 2.997 2.243 GLU 144.A N LYS 140.A O GLU 144.A H 3.089 2.117 TYR 145.A N ASN 141.A O TYR 145.A H 2.824 1.853 THR 146.A N LEU 142.A O THR 146.A H 2.887 1.881 THR 146.A OG1 LEU 142.A O THR 146.A HG1 2.869 2.048 ASP 147.A N LYS 143.A O ASP 147.A H 2.994 2.032 LYS 148.A N GLU 144.A O LYS 148.A H 3.175 2.227 LEU 149.A N TYR 145.A O LEU 149.A H 3.023 2.058 ASP 150.A N THR 146.A O ASP 150.A H 2.847 1.860 LYS 151.A N ASP 147.A O LYS 151.A H 2.956 1.970 LEU 152.A N LYS 148.A O LEU 152.A H 3.294 2.309 ASP 153.A N LEU 149.A O ASP 153.A H 2.911 1.976 LYS 154.A N ASP 150.A O LYS 154.A H 2.947 1.969 GLU 155.A N LYS 151.A O GLU 155.A H 3.042 2.056 SER 156.A N LEU 152.A O SER 156.A H 3.046 2.090 SER 156.A OG LEU 152.A O SER 156.A HG 2.844 1.950 LYS 157.A N ASP 153.A O LYS 157.A H 3.016 2.016 LYS 157.A NZ ASP 153.A OD2 LYS 157.A HZ3 2.850 1.906 ASP 158.A N LYS 154.A O ASP 158.A H 3.069 2.068 LYS 159.A N GLU 155.A O LYS 159.A H 3.057 2.125 PHE 160.A N SER 156.A O PHE 160.A H 2.935 1.946 ASN 161.A N LYS 157.A O ASN 161.A H 2.926 1.958 LYS 162.A N LYS 159.A O LYS 162.A H 3.113 2.218 ILE 163.A N PHE 160.A O ILE 163.A H 3.134 2.206 GLU 166.A N GLU 166.A OE1 GLU 166.A H 2.841 1.894 LYS 167.A N PRO 164.A O LYS 167.A H 2.986 2.042 LYS 167.A NZ LYS 278.A O LYS 167.A HZ1 3.171 2.226 LYS 168.A N ALA 165.A O LYS 168.A H 3.057 2.056 LYS 168.A NZ PHE 160.A O LYS 168.A HZ3 3.390 2.531 LYS 168.A NZ GLY 185.A O LYS 168.A HZ2 3.510 2.862 ILE 170.A N PRO 187.A O ILE 170.A H 2.863 1.900 THR 172.A N ALA 189.A O THR 172.A H 3.262 2.354 THR 172.A OG1 GLU 174.A O THR 172.A HG1 2.774 1.881 SER 173.A N GLU 223.A OE1 SER 173.A H 2.913 1.930 SER 173.A OG GLU 223.A OE1 SER 173.A HG 2.897 2.118 GLU 174.A N GLU 223.A OE2 GLU 174.A H 2.861 1.854 GLY 175.A N TRP 192.A O GLY 175.A H 2.973 2.124 ALA 176.A N GLU 174.A O ALA 176.A H 2.755 1.942 LYS 178.A NZ GLY 175.A O LYS 178.A HZ1 3.077 2.376 LYS 178.A NZ GLU 193.A OE1 LYS 178.A HZ3 2.846 2.019 TYR 179.A OH ASP 106.A O TYR 179.A HH 2.746 1.914 SER 181.A N PHE 177.A O SER 181.A H 2.804 1.823 SER 181.A OG VAL 186.A O SER 181.A HG 2.716 1.969 LYS 182.A N LYS 178.A O LYS 182.A H 3.048 2.098 ALA 183.A N TYR 179.A O ALA 183.A H 3.087 2.122 TYR 184.A N PHE 180.A O TYR 184.A H 2.925 1.950 TYR 184.A OH ASP 153.A OD1 TYR 184.A HH 2.824 1.876 GLY 185.A N SER 181.A O GLY 185.A H 2.943 2.179 VAL 186.A N SER 181.A O VAL 186.A H 3.301 2.481 SER 188.A OG SER 181.A OG SER 188.A HG 2.583 1.673 ALA 189.A N ILE 170.A O ALA 189.A H 3.012 2.046 ILE 191.A N THR 172.A O ILE 191.A H 3.410 2.614 ILE 191.A N SER 173.A O ILE 191.A H 2.826 2.036 TRP 192.A N SER 173.A O TRP 192.A H 2.919 1.956 ILE 194.A N GLU 193.A OE1 ILE 194.A H 2.784 1.851 THR 196.A N GLU 193.A O THR 196.A H 3.237 2.432 THR 196.A OG1 GLU 193.A O THR 196.A HG1 2.740 2.169 GLU 197.A N GLU 197.A OE1 GLU 197.A H 2.653 1.781 GLY 200.A N GLN 204.A OE1 GLY 200.A H 2.757 1.873 THR 201.A N GLN 204.A OE1 THR 201.A H 3.024 2.085 GLN 204.A N THR 201.A OG1 GLN 204.A H 3.171 2.168 GLN 204.A NE2 GLU 198.A O GLN 204.A HE22 2.978 2.028 ILE 205.A N THR 201.A O ILE 205.A H 3.011 2.038 LYS 206.A N PRO 202.A O LYS 206.A H 2.886 1.879 THR 207.A N GLU 203.A O THR 207.A H 2.949 1.969 THR 207.A OG1 GLU 203.A O THR 207.A HG1 3.015 2.121 LEU 208.A N GLN 204.A O LEU 208.A H 3.088 2.144 VAL 209.A N ILE 205.A O VAL 209.A H 2.958 1.953 GLU 210.A N LYS 206.A O GLU 210.A H 2.974 1.982 LYS 211.A N THR 207.A O LYS 211.A H 3.187 2.243 LEU 212.A N LEU 208.A O LEU 212.A H 2.884 1.891 ARG 213.A N VAL 209.A O ARG 213.A H 3.002 2.049 ARG 213.A NH2 ASP 237.A O ARG 213.A HH21 2.830 1.848 GLN 214.A N LYS 211.A O GLN 214.A H 3.140 2.196 THR 215.A N LEU 212.A O THR 215.A H 2.975 1.978 THR 215.A OG1 LEU 212.A O THR 215.A HG1 2.914 1.928 VAL 217.A N THR 215.A OG1 VAL 217.A H 3.311 2.304 SER 219.A OG GLY 275.A O SER 219.A HG 2.672 2.100 LEU 220.A N PRO 241.A O LEU 220.A H 2.814 1.838 PHE 221.A N VAL 171.A O PHE 221.A H 3.078 2.159 VAL 222.A N ALA 244.A O VAL 222.A H 3.249 2.335 GLU 223.A N GLU 223.A OE1 GLU 223.A H 2.709 1.802 SER 224.A N ILE 246.A O SER 224.A H 2.946 1.993 VAL 226.A N GLU 223.A O VAL 226.A H 3.392 2.382 ARG 229.A N ASP 227.A OD1 ARG 229.A H 3.069 2.060 ARG 229.A NE ASP 227.A OD1 ARG 229.A HE 3.090 2.092 ARG 229.A NE ASP 227.A OD2 ARG 229.A HE 3.282 2.484 ARG 229.A NH2 ASP 227.A OD2 ARG 229.A HH21 2.790 1.823 LYS 232.A N ASP 228.A O LYS 232.A H 2.841 1.850 THR 233.A N ARG 229.A O THR 233.A H 2.952 2.009 THR 233.A OG1 ARG 229.A O THR 233.A HG1 3.130 2.205 VAL 234.A N PRO 230.A O VAL 234.A H 2.965 2.020 SER 235.A N MET 231.A O SER 235.A H 2.758 1.745 SER 235.A OG ILE 240.A O SER 235.A HG 2.560 1.935 GLN 236.A N LYS 232.A O GLN 236.A H 2.944 1.983 ASP 237.A N THR 233.A O ASP 237.A H 2.903 1.935 THR 238.A N VAL 234.A O THR 238.A H 2.953 2.044 ASN 239.A N SER 235.A O ASN 239.A H 2.872 2.152 ILE 240.A N SER 235.A O ILE 240.A H 3.253 2.516 ILE 240.A N THR 238.A OG1 ILE 240.A H 3.250 2.395 TYR 243.A N LEU 220.A O TYR 243.A H 2.809 1.895 ILE 246.A N VAL 222.A O ILE 246.A H 2.865 1.988 PHE 247.A N ASN 268.A OD1 PHE 247.A H 2.842 2.016 ILE 251.A N SER 9.A OG ILE 251.A H 3.332 2.358 ALA 252.A N GLY 258.A O ALA 252.A H 2.800 1.798 GLY 255.A N ASP 259.A OD2 GLY 255.A H 2.878 1.890 LYS 256.A N GLU 253.A O LYS 256.A H 3.047 2.049 TYR 261.A N ASP 13.A OD2 TYR 261.A H 2.819 1.836 TYR 261.A OH TRP 110.A O TYR 261.A HH 2.685 1.768 SER 263.A N SER 260.A OG SER 263.A H 2.919 1.920 MET 264.A N SER 260.A O MET 264.A H 2.833 1.858 MET 265.A N TYR 261.A O MET 265.A H 3.011 2.031 LYS 266.A N TYR 262.A O LYS 266.A H 2.858 1.902 LYS 266.A NZ ASP 270.A OD2 LYS 266.A HZ2 2.943 1.987 TYR 267.A N SER 263.A O TYR 267.A H 2.849 1.869 ASN 268.A N MET 264.A O ASN 268.A H 2.938 1.942 ASN 268.A ND2 PHE 247.A O ASN 268.A HD22 2.812 1.875 LEU 269.A N MET 265.A O LEU 269.A H 2.845 1.853 ASP 270.A N LYS 266.A O ASP 270.A H 2.847 1.872 LYS 271.A N TYR 267.A O LYS 271.A H 2.896 1.894 ILE 272.A N ASN 268.A O ILE 272.A H 2.882 1.917 ALA 273.A N LEU 269.A O ALA 273.A H 2.926 1.924 GLU 274.A N ASP 270.A O GLU 274.A H 2.940 1.963 GLY 275.A N LYS 271.A O GLY 275.A H 2.838 1.844 LEU 276.A N ILE 272.A O LEU 276.A H 2.993 2.025 ALA 277.A N GLU 274.A O ALA 277.A H 3.226 2.347 LYS 278.A N GLY 275.A O LYS 278.A H 3.504 2.527