Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4gdj_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N ILE 315.A O LYS 5.A H 2.744 1.902 TRP 7.A N TYR 275.A OH TRP 7.A H 3.095 2.325 VAL 8.A N CYS 313.A O VAL 8.A H 2.826 2.033 THR 10.A N THR 311.A O THR 10.A H 2.970 2.137 ILE 15.A N ASN 53.A O ILE 15.A H 2.992 2.141 LEU 16.A N GLY 37.A O LEU 16.A H 2.836 1.988 ARG 18.A N ILE 34.A O ARG 18.A H 2.880 2.052 ARG 18.A NH2 GLU 42.A OE2 ARG 18.A HH21 1.975 1.236 ARG 19.A NH1 ARG 65.A O ARG 19.A HH11 2.755 1.997 TYR 21.A N PHE 32.A O TYR 21.A H 2.941 2.167 SER 23.A N PHE 30.A O SER 23.A H 2.951 2.159 ASP 25.A N SER 28.A O ASP 25.A H 2.955 2.190 THR 27.A N ASP 25.A OD1 THR 27.A H 2.864 2.078 SER 28.A N ASP 25.A OD1 SER 28.A H 2.874 2.046 PHE 30.A N SER 23.A O PHE 30.A H 2.832 1.998 LYS 31.A N THR 47.A O LYS 31.A H 2.787 1.959 LYS 31.A NZ SER 51.A O LYS 31.A HZ1 2.670 1.822 LYS 31.A NZ ASN 53.A OD1 LYS 31.A HZ2 3.462 2.860 PHE 32.A N TYR 21.A O PHE 32.A H 2.928 2.117 PHE 33.A N TYR 45.A O PHE 33.A H 2.959 2.157 ILE 34.A N ARG 18.A O ILE 34.A H 2.931 2.130 ALA 35.A N SER 43.A O ALA 35.A H 2.841 2.007 TYR 36.A N LEU 16.A O TYR 36.A H 3.208 2.424 SER 39.A N LEU 14.A O SER 39.A H 2.939 2.081 SER 43.A N ALA 35.A O SER 43.A H 3.231 2.468 LEU 44.A N LEU 62.A O LEU 44.A H 2.747 1.972 TYR 45.A N PHE 33.A O TYR 45.A H 2.783 1.938 LYS 46.A N GLU 59.A O LYS 46.A H 2.966 2.255 THR 47.A N LYS 31.A O THR 47.A H 2.821 2.059 THR 47.A OG1 ASN 53.A OD1 THR 47.A HG1 2.933 2.232 ILE 49.A N CYS 29.A O ILE 49.A H 3.069 2.264 SER 51.A N PRO 48.A O SER 51.A H 2.892 2.036 THR 54.A N SER 58.A OG THR 54.A H 3.103 2.505 THR 54.A N THR 57A.A OG1 THR 54.A H 2.966 2.313 THR 54.A OG1 THR 57A.A OG1 THR 54.A HG1 2.649 1.916 LEU 55.A N ASP 13.A O LEU 55.A H 3.275 2.521 SER 58.A N THR 54.A O SER 58.A H 2.740 2.082 GLU 59.A N LYS 46.A O GLU 59.A H 2.753 1.928 ILE 61.A N LEU 44.A O ILE 61.A H 2.878 2.073 GLY 64.A N GLU 42.A O GLY 64.A H 2.981 2.174 ARG 65.A N SER 81.A O ARG 65.A H 3.002 2.217 ARG 65.A NH1 GLY 83.A O ARG 65.A HH12 2.550 1.739 ARG 65.A NH2 GLY 83.A O ARG 65.A HH22 3.236 2.643 SER 67.A N ASN 114.A OD1 SER 67.A H 2.996 2.215 SER 68.A N LEU 79.A O SER 68.A H 3.109 2.323 CYS 70.A N THR 77.A O CYS 70.A H 2.900 2.092 ASP 72.A N LYS 75.A O ASP 72.A H 3.251 2.430 LEU 74.A N ASP 72.A OD1 LEU 74.A H 2.727 1.885 LYS 75.A N ASP 72.A OD1 LYS 75.A H 2.959 2.141 THR 77.A N CYS 70.A O THR 77.A H 2.790 1.940 VAL 78.A N LYS 93.A O VAL 78.A H 2.892 2.071 LEU 79.A N SER 68.A O LEU 79.A H 2.931 2.078 VAL 80.A N MET 91.A O VAL 80.A H 2.935 2.151 SER 81.A N SER 66.A O SER 81.A H 3.084 2.288 ASN 82.A N PHE 89.A O ASN 82.A H 2.921 2.127 ASN 87.A N ARG 84.A O ASN 87.A H 2.917 2.176 SER 88.A N ASP 85.A O SER 88.A H 3.034 2.221 PHE 89.A N ASN 82.A O PHE 89.A H 2.807 1.988 ILE 90.A N PHE 102.A O ILE 90.A H 2.830 2.005 MET 91.A N VAL 80.A O MET 91.A H 2.963 2.177 ILE 92.A N ASP 100.A O ILE 92.A H 2.973 2.205 LYS 93.A N VAL 78.A O LYS 93.A H 2.753 1.925 LYS 93.A NZ GLU 96.A O LYS 93.A HZ3 3.437 2.862 TYR 94.A N GLU 97.A O TYR 94.A H 2.885 2.096 TYR 94.A OH ASP 72.A OD2 TYR 94.A HH 2.559 1.998 GLY 95.A N TRP 76.A O GLY 95.A H 2.934 2.130 GLU 97.A N TYR 94.A O GLU 97.A H 3.202 2.348 THR 99.A N ILE 92.A O THR 99.A H 2.792 1.964 THR 99.A OG1 GLY 147.A O THR 99.A HG1 2.720 2.218 THR 101.A N ASP 100.A OD1 THR 101.A H 2.879 2.218 PHE 102.A N ILE 90.A O PHE 102.A H 3.072 2.307 ALA 104.A N SER 88.A O ALA 104.A H 2.953 2.173 SER 105.A N ASP 130.A OD2 SER 105.A H 2.823 2.042 ARG 106.A N ASP 130.A OD2 ARG 106.A H 2.836 2.119 GLY 108.A N ASP 130.A OD1 GLY 108.A H 2.803 2.073 ARG 111.A N SER 129.A O ARG 111.A H 2.869 2.106 ARG 111.A NE GLU 163.A OE1 ARG 111.A HE 2.763 1.968 ARG 111.A NH1 GLY 131.A O ARG 111.A HH12 2.678 1.958 ARG 111.A NH2 ASP 130.A O ARG 111.A HH22 3.247 2.532 ARG 111.A NH2 GLU 163.A OE1 ARG 111.A HH21 3.548 2.926 ARG 111.A NH2 GLU 163.A OE2 ARG 111.A HH21 2.718 1.913 LEU 112.A N SER 66.A OG LEU 112.A H 2.930 2.080 ASN 114.A N SER 67.A O ASN 114.A H 2.854 2.143 SER 115.A OG THR 166.A OG1 SER 115.A HG 2.768 1.987 CYS 117.A N ALA 69.A O CYS 117.A H 3.190 2.471 ILE 118.A N PHE 125.A O ILE 118.A H 3.054 2.210 VAL 120.A N SER 123.A O VAL 120.A H 2.739 1.929 SER 123.A N VAL 120.A O SER 123.A H 3.105 2.269 SER 123.A OG GLU 143.A OE2 SER 123.A HG 3.533 2.917 CYS 124.A N LEU 144.A O CYS 124.A H 2.781 1.948 PHE 125.A N ILE 118.A O PHE 125.A H 2.742 1.963 VAL 126.A N TYR 142.A O VAL 126.A H 3.027 2.238 VAL 128.A N ARG 140.A O VAL 128.A H 2.791 1.962 SER 129.A N ARG 111.A O SER 129.A H 2.954 2.104 ASP 130.A N VAL 138.A O ASP 130.A H 2.819 2.109 GLY 131.A N ASP 130.A OD1 GLY 131.A H 2.641 2.008 GLN 136.A N ASN 133.A O GLN 136.A H 2.857 2.004 VAL 138.A N ASP 130.A O VAL 138.A H 2.950 2.095 HIS 139.A ND1 SER 129.A OG HIS 139.A HD1 2.733 1.966 HIS 139.A NE2 SER 137.A OG HIS 139.A HE2 2.757 2.079 ARG 140.A N VAL 128.A O ARG 140.A H 2.909 2.079 ARG 140.A NE GLN 154.A OE1 ARG 140.A HE 2.908 2.095 ARG 140.A NH1 TYR 142.A OH ARG 140.A HH11 3.223 2.429 ARG 140.A NH2 GLN 154.A OE1 ARG 140.A HH21 3.167 2.440 ILE 141.A N LYS 153.A O ILE 141.A H 2.945 2.175 TYR 142.A N VAL 126.A O TYR 142.A H 2.851 2.004 GLU 143.A N ARG 151.A O GLU 143.A H 2.887 2.032 LEU 144.A N CYS 124.A O LEU 144.A H 2.665 1.832 GLN 145.A N THR 148.A O GLN 145.A H 3.041 2.225 THR 148.A N GLN 145.A O THR 148.A H 3.019 2.188 VAL 149.A N ASP 100.A OD2 VAL 149.A H 2.866 2.017 GLN 150.A N GLU 143.A O GLN 150.A H 2.759 1.901 GLN 150.A NE2 THR 148.A O GLN 150.A HE21 3.117 2.261 ARG 151.A NE GLU 143.A OE1 ARG 151.A HE 2.692 1.883 ARG 151.A NH2 GLU 143.A OE1 ARG 151.A HH21 2.917 2.207 LYS 153.A N ILE 141.A O LYS 153.A H 2.920 2.141 LYS 153.A NZ LEU 196.A O LYS 153.A HZ2 2.944 2.376 LEU 155.A N HIS 139.A O LEU 155.A H 2.796 1.941 THR 158.A N ASN 156.A OD1 THR 158.A H 3.218 2.370 THR 158.A OG1 ASN 156.A OD1 THR 158.A HG1 2.713 1.961 ILE 160.A N THR 157.A O ILE 160.A H 2.926 2.073 ASN 161.A ND2 SER 137.A OG ASN 161.A HD21 2.855 2.021 ASN 161.A ND2 GLU 163.A OE2 ASN 161.A HD22 2.984 2.183 GLU 163.A N THR 179.A O GLU 163.A H 2.920 2.085 THR 166.A N THR 177.A O THR 166.A H 2.906 2.099 THR 166.A OG1 SER 115.A OG THR 166.A HG1 2.768 1.983 CYS 167.A SG SER 165.A OG no hydrogen 3.371 N/A TYR 168.A N LYS 175.A O TYR 168.A H 2.968 2.187 THR 169.A N GLN 290.A OE1 THR 169.A H 2.749 1.931 THR 169.A OG1 LEU 173.A O THR 169.A HG1 2.754 1.992 ILE 170.A N LEU 173.A O ILE 170.A H 3.186 2.469 ASN 171.A N GLN 296.A OE1 ASN 171.A H 2.897 2.083 LEU 173.A N ILE 170.A O LEU 173.A H 3.134 2.308 ILE 174.A N PHE 192.A O ILE 174.A H 2.795 1.936 LYS 175.A N TYR 168.A O LYS 175.A H 2.947 2.095 LYS 175.A NZ ASP 238.A O LYS 175.A HZ3 2.941 2.077 LYS 175.A NZ GLU 239.A OE2 LYS 175.A HZ2 2.877 2.230 CYS 176.A N LEU 190.A O CYS 176.A H 2.868 2.048 THR 177.A N THR 166.A O THR 177.A H 2.776 1.966 GLY 178.A N PRO 188.A O GLY 178.A H 2.888 2.038 THR 179.A N GLU 163.A O THR 179.A H 2.834 2.033 ASN 180.A ND2 ASN 183.A OD1 ASN 180.A HD22 2.865 2.176 LEU 181.A N ASN 161.A OD1 LEU 181.A H 2.838 1.985 TRP 182.A N ASN 180.A OD1 TRP 182.A H 2.848 2.041 ASN 183.A N ASN 180.A OD1 ASN 183.A H 3.000 2.187 ASN 183.A ND2 GLY 159.A O ASN 183.A HD22 3.133 2.278 ALA 185.A N ALA 224.A O ALA 185.A H 2.855 2.045 LYS 186.A N ASP 184.A OD1 LYS 186.A H 2.911 2.095 LYS 186.A NZ PRO 203.A O LYS 186.A HZ3 3.012 2.190 LYS 186.A NZ ASN 205.A O LYS 186.A HZ1 3.022 2.265 LYS 186.A NZ LYS 222.A O LYS 186.A HZ2 2.817 2.042 ARG 187.A NH1 ILE 232.A O ARG 187.A HH12 2.774 2.024 ARG 187.A NH2 THR 209.A O ARG 187.A HH21 3.473 2.810 ARG 187.A NH2 ILE 232.A O ARG 187.A HH22 2.795 2.048 LEU 189.A N VAL 201.A O LEU 189.A H 2.939 2.106 LEU 190.A N CYS 176.A O LEU 190.A H 2.886 2.075 ARG 191.A N GLN 199.A O ARG 191.A H 2.839 2.009 ARG 191.A NE ASP 238.A OD2 ARG 191.A HE 2.675 1.819 ARG 191.A NH1 GLN 199.A OE1 ARG 191.A HH11 3.152 2.318 ARG 191.A NH1 GLU 266.A OE2 ARG 191.A HH12 2.811 2.027 ARG 191.A NH2 ASP 238.A OD1 ARG 191.A HH21 2.867 2.009 ARG 191.A NH2 ASP 238.A OD2 ARG 191.A HH21 3.397 2.795 ARG 191.A NH2 GLU 266.A OE2 ARG 191.A HH22 2.930 2.190 PHE 192.A N ILE 174.A O PHE 192.A H 2.822 2.012 THR 193.A N ASN 197.A O THR 193.A H 2.898 2.135 LYS 194.A NZ ASP 195.A OD1 LYS 194.A HZ3 2.730 2.086 ASP 195.A N THR 193.A OG1 ASP 195.A H 3.162 2.368 LEU 196.A N THR 193.A O LEU 196.A H 2.753 1.927 GLN 199.A N ARG 191.A O GLN 199.A H 2.877 2.093 VAL 201.A N LEU 189.A O VAL 201.A H 2.906 2.125 CYS 204.A N ILE 265.A O CYS 204.A H 2.922 2.072 CYS 204.A SG GLU 202.A O no hydrogen 3.590 N/A ASN 205.A ND2 ALA 207.A O ASN 205.A HD22 3.632 3.058 ASP 210.A N ALA 185.A O ASP 210.A H 2.997 2.158 PHE 211.A N ASP 210.A OD1 PHE 211.A H 2.882 2.252 ARG 213.A NH1 ASP 210.A O ARG 213.A HH11 2.968 2.127 ARG 213.A NH1 THR 247.A OG1 ARG 213.A HH12 3.014 2.293 ARG 213.A NH2 THR 247.A O ARG 213.A HH22 2.957 2.268 ARG 213.A NH2 THR 247.A OG1 ARG 213.A HH22 3.099 2.402 THR 217.A N GLY 206.A O THR 217.A H 2.864 2.052 ALA 224.A N ASP 184.A OD1 ALA 224.A H 2.803 2.077 LYS 227.A NZ ARG 213.A O LYS 227.A HZ3 3.012 2.159 GLY 228.A N GLN 225.A O GLY 228.A H 2.984 2.232 GLY 230.A N LEU 181.A O GLY 230.A H 2.881 2.047 ILE 232.A N ASP 210.A OD1 ILE 232.A H 2.968 2.165 GLN 233.A NE2 PRO 113.A O GLN 233.A HE22 2.919 2.246 GLN 233.A NE2 ASN 114.A O GLN 233.A HE22 3.649 2.981 GLN 233.A NE2 TYR 164.A O GLN 233.A HE21 3.066 2.428 ILE 236.A N THR 177.A OG1 ILE 236.A H 2.778 1.962 LEU 237.A N TRP 243.A O LEU 237.A H 2.889 2.150 ASP 238.A N TYR 168.A OH ASP 238.A H 3.092 2.389 ALA 242.A N ILE 261.A O ALA 242.A H 2.980 2.153 TRP 243.A N LEU 237.A O TRP 243.A H 3.102 2.334 TRP 243.A NE1 VAL 4.A O TRP 243.A HE1 2.943 2.098 THR 244.A N GLU 259.A O THR 244.A H 2.857 2.060 LYS 246.A N VAL 257.A O LYS 246.A H 3.062 2.319 LYS 248.A N ASN 254.A O LYS 248.A H 3.226 2.389 LYS 248.A NZ GLU 276.A OE2 LYS 248.A HZ2 2.947 2.139 GLU 250.A N GLU 250.A OE1 GLU 250.A H 2.713 1.898 LEU 251.A N THR 249.A OG1 LEU 251.A H 3.009 2.184 ASN 254.A N SER 252.A OG ASN 254.A H 3.028 2.184 GLY 255.A N LYS 281.A O GLY 255.A H 2.956 2.153 PHE 256.A N LEU 277.A O PHE 256.A H 2.968 2.233 VAL 257.A N LYS 246.A O VAL 257.A H 2.757 1.914 LEU 258.A N TYR 275.A O LEU 258.A H 3.056 2.306 GLU 259.A N THR 244.A O GLU 259.A H 3.040 2.227 GLN 260.A N LEU 273.A O GLN 260.A H 2.838 1.986 GLN 260.A NE2 SER 272.A OG GLN 260.A HE21 2.751 1.948 ILE 261.A N ALA 242.A O ILE 261.A H 2.756 1.927 GLY 264.A N ILE 261.A O GLY 264.A H 3.030 2.175 SER 267.A N GLY 264.A O SER 267.A H 3.200 2.358 SER 272.A N GLN 260.A O SER 272.A H 2.993 2.187 TYR 275.A N LEU 258.A O TYR 275.A H 2.700 1.885 LEU 277.A N PHE 256.A O LEU 277.A H 2.862 2.100 LYS 281.A N PHE 278.A O LYS 281.A H 2.946 2.090 THR 283.A N GLN 253.A O THR 283.A H 2.791 1.946 THR 283.A OG1 GLY 255.A O THR 283.A HG1 3.037 2.496 GLY 284.A N GLU 303.A O GLY 284.A H 2.845 2.150 ARG 285.A N GLU 303.A OE1 ARG 285.A H 2.928 2.077 ARG 285.A NE GLN 233.A OE1 ARG 285.A HE 2.961 2.345 ARG 285.A NH1 ALA 20.A O ARG 285.A HH12 2.835 2.035 ARG 285.A NH1 GLU 303.A OE2 ARG 285.A HH11 2.972 2.149 ARG 285.A NH2 ALA 20.A O ARG 285.A HH22 3.044 2.315 ARG 285.A NH2 GLN 233.A OE1 ARG 285.A HH21 2.671 1.981 SER 286.A N GLN 233.A O SER 286.A H 3.066 2.265 GLY 287.A N TRP 301.A O GLY 287.A H 3.072 2.297 PHE 288.A N THR 166.A OG1 PHE 288.A H 2.790 2.017 PHE 289.A N CYS 299.A O PHE 289.A H 3.010 2.185 GLN 290.A N GLU 116.A OE2 GLN 290.A H 3.031 2.339 GLN 290.A NE2 THR 169.A O GLN 290.A HE22 2.851 1.994 GLN 290.A NE2 ARG 297.A O GLN 290.A HE21 3.025 2.206 LYS 292.A NZ GLN 290.A O LYS 292.A HZ2 3.016 2.160 CYS 295.A SG MET 1.A O no hydrogen 3.750 N/A CYS 295.A SG SER 317.A O no hydrogen 3.977 N/A CYS 295.A SG SER 317.A OG no hydrogen 3.729 N/A CYS 299.A N PHE 289.A O CYS 299.A H 2.920 2.129 PHE 300.A N PHE 312.A O PHE 300.A H 2.784 1.983 TRP 301.A N GLY 287.A O TRP 301.A H 2.810 2.000 LEU 302.A N SER 310.A O LEU 302.A H 2.886 2.184 GLU 303.A N ARG 285.A O GLU 303.A H 2.875 2.036 ILE 304.A N GLU 308.A O ILE 304.A H 2.888 2.058 GLU 305.A N ARG 282.A O GLU 305.A H 3.105 2.271 GLU 308.A N ILE 304.A O GLU 308.A H 2.928 2.112 SER 310.A N LEU 302.A O SER 310.A H 2.893 2.085 THR 311.A N HIS 11.A O THR 311.A H 3.075 2.279 THR 311.A OG1 THR 10.A OG1 THR 311.A HG1 2.951 2.244 PHE 312.A N PHE 300.A O PHE 312.A H 2.864 2.062 CYS 313.A N VAL 8.A O CYS 313.A H 2.859 2.058 GLY 314.A N VAL 298.A O GLY 314.A H 2.844 2.056 ILE 315.A N GLY 6.A O ILE 315.A H 2.728 1.905 SER 317.A OG MET 1.A O SER 317.A HG 2.695 2.108 THR 57A.A N THR 54.A O THR 57A.A H 2.915 2.205 THR 57A.A N THR 54.A OG1 THR 57A.A H 3.196 2.538 THR 57A.A OG1 ALA 52.A O THR 57A.A HG1 2.610 1.928