Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4rfd_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.857 2.025 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.815 2.096 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.358 2.563 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD21 3.222 2.465 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.747 1.903 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 2.906 2.239 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.070 2.354 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.135 2.477 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.154 2.309 ASP 16.A N TRP 13.A O ASP 16.A H 3.178 2.477 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.847 2.055 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.894 2.039 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.204 2.345 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.836 2.063 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.942 2.101 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 2.972 2.250 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.350 2.664 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.171 2.438 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 2.984 2.275 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.037 2.417 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.092 2.241 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 3.138 2.283 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.796 1.951 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H.A 2.821 1.994 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.294 2.472 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD2 THR 32.A HG1 2.677 2.100 HIS 33.A N ASP 31.A OD2.B HIS 33.A H 2.994 2.334 THR 34.A N ASP 31.A O.A THR 34.A H 3.045 2.306 THR 34.A N ASP 31.A O.B THR 34.A H 3.168 2.449 THR 34.A N ASP 31.A OD2.B THR 34.A H 3.105 2.405 ALA 35.A N ASP 31.A O.A ALA 35.A H 3.036 2.318 ALA 35.A N ASP 31.A O.B ALA 35.A H 3.019 2.296 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.110 2.330 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.932 2.107 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.962 2.149 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 2.923 2.066 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.819 1.986 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.930 2.075 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.011 2.154 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.786 1.966 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.784 1.970 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.320 2.681 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.802 1.958 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.921 2.094 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.866 2.096 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.900 2.064 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD21 3.125 2.293 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD22 3.195 2.348 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.133 2.324 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.851 2.020 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.904 2.056 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.906 2.098 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.858 2.073 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.894 2.072 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.859 2.009 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.978 2.178 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.894 2.066 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 2.947 2.098 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 3.292 2.480 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2 LYS 73.A HZ2 2.714 1.838 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.986 2.180 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.778 1.947 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.911 2.073 LYS 77.A NZ THR 84.A OG1 LYS 77.A HZ3 2.675 1.974 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.017 2.231 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.859 2.025 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.038 2.219 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 3.053 2.398 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.834 2.046 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.622 1.773 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 2.974 2.198 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 3.164 2.507 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.850 1.995 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.939 2.096 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.980 2.222 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.054 2.277 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.842 1.981 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.914 2.115 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.788 1.958 HIS 93.A NE2 HIS 116.A ND1 no hydrogen 3.077 N/A TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.793 1.951 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.876 2.210 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.090 2.356 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.239 2.402 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE21 2.801 1.949 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.973 2.264 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.881 2.128 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.858 2.128 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.763 1.918 HIS 104.A NE2 TYR 190.A OH HIS 104.A HE2 2.639 1.820 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.710 1.949 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.051 2.269 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.882 2.043 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.753 1.964 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.846 2.012 LYS 109.A NZ.B ASP 107.A O LYS 109.A HZ3.B 2.868 2.018 ALA 112.A N LEU 144.A O ALA 112.A H 3.044 2.434 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.903 2.128 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.771 1.927 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.827 1.970 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.704 1.870 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.898 2.048 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.836 1.984 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.951 2.210 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 2.955 2.190 HIS 119.A NE2 TYR 48.A OH HIS 119.A HE2 2.734 1.976 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.948 2.196 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.748 1.997 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.751 1.927 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD21 3.206 2.380 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.921 2.069 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.260 2.481 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.166 2.312 LYS 123.A NZ ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ1 3.192 2.425 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.002 2.144 TYR 124.A OH ASP 135.A OD1 TYR 124.A HH 2.646 1.849 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.205 2.401 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.934 2.232 LYS 129.A N ASP 126.A OD2 LYS 129.A H 2.873 2.094 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 3.022 2.216 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.096 2.332 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.090 2.274 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.000 2.190 GLN 133.A NE2 LYS 129.A O GLN 133.A HE21 3.192 2.380 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.068 2.297 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.827 1.998 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.871 2.057 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.188 2.424 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.930 2.112 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.816 1.983 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.875 2.095 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.928 2.086 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.948 2.111 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.763 1.928 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.032 2.194 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ1 3.062 2.177 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.004 2.195 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.091 2.241 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 3.053 2.359 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE21 3.348 2.544 LYS 155.A NZ ASN 174.A O LYS 155.A HZ1 3.179 2.502 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.034 2.418 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.193 2.377 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.979 2.217 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.229 2.463 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.326 2.488 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.907 2.081 SER 162.A OG VAL 159.A O SER 162.A HG 2.677 1.845 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.099 2.296 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ1 3.458 2.728 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.874 2.036 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.797 1.977 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.119 2.278 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ1.A 3.053 2.309 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ1.B 3.225 2.502 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.919 2.150 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.988 2.135 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.959 2.149 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.103 2.275 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.187 2.467 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.877 2.058 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.201 2.367 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.020 2.174 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.397 2.539 GLU 183.A N GLU 210.A OE1.B GLU 183.A H 3.336 2.526 SER 184.A N GLU 210.A OE2.A SER 184.A H 2.854 2.030 SER 184.A N GLU 210.A OE2.B SER 184.A H 2.874 2.056 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.115 2.258 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.888 2.053 TYR 187.A OH LYS 42.A O TYR 187.A HH 2.853 2.037 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.832 1.997 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.794 1.994 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.771 2.002 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.220 2.464 TYR 190.A OH SER 26.A OG TYR 190.A HH 2.778 2.076 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.776 1.917 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.972 2.190 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.630 1.813 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.790 2.025 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.241 2.396 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.908 2.061 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.961 2.151 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.935 2.118 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 3.001 2.151 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.824 1.988 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.930 2.107 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.979 2.137 LYS 209.A NZ ASP 186.A OD2 LYS 209.A HZ1 3.387 2.689 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H.B 2.862 2.072 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.884 2.063 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.072 2.250 GLU 217.A N GLU 217.A OE1.A GLU 217.A H 2.713 1.942 GLU 217.A N GLU 217.A OE1.B GLU 217.A H 2.818 2.049 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.167 2.368 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE22 3.020 2.176 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.876 2.044 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.162 2.335 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.871 2.071 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.157 2.413 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.211 2.573 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.229 2.461 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.858 2.060 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.478 2.821 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.838 1.982 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.258 2.425 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.217 2.386 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.777 1.983 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD22 2.953 2.104 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.925 2.122 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD22 3.503 2.791 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD21 3.031 2.203 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.760 1.938 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.141 2.354 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.757 1.905 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.835 1.982 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD21 2.843 1.992 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 2.995 2.150 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.773 1.929 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.776 1.974 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.784 2.042 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.233 2.539 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.344 2.718 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.803 1.984 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O.A GLN 245.A HE21 2.795 1.956 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O.B GLN 245.A HE21 2.799 1.960 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.868 2.014 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 2.993 2.263 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.908 2.058 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.815 2.026 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.960 2.285 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.522 2.874 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.962 2.125 LYS 253.A NZ ASP 38.A OD2 LYS 253.A HZ1 3.180 2.504 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.803 1.956 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.913 2.077