Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4y3w_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.893 2.303 SER 1.A OG SER 151.A O SER 1.A HG 3.153 2.316 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.975 2.173 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.940 2.116 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.612 1.849 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.936 2.094 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.915 2.106 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.409 2.818 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.809 2.145 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.880 2.075 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.876 2.077 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.038 2.273 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.297 2.444 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.087 2.233 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.673 1.847 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.854 2.032 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.855 2.079 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.795 2.033 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.890 2.071 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.017 2.179 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.801 1.973 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.789 1.951 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.084 2.281 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.779 2.117 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.753 1.934 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 2.923 2.072 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.907 2.098 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.786 1.927 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.911 2.072 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.892 2.048 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.885 2.052 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.877 2.087 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.759 2.194 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.822 2.013 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.312 2.464 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.640 1.860 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.956 2.257 TRP 42.A NE1 TYR 79.A OH TRP 42.A HE1 2.949 2.232 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.874 2.090 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 3.009 2.189 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.892 2.065 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.619 1.787 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.878 2.118 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 3.091 2.291 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.018 2.179 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.695 2.015 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 3.098 2.251 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.976 2.141 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.817 1.986 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.183 2.330 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.744 1.920 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.919 2.165 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.013 2.170 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 3.060 2.291 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.884 2.094 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.883 2.037 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.727 1.956 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.837 1.996 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.049 2.218 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.961 2.116 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.681 1.873 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.279 2.684 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.797 1.986 THR 65.A OG1 THR 25.A O THR 65.A HG1 3.335 2.503 THR 66.A OG1 SER 64.A OG THR 66.A HG1 3.286 2.708 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.624 1.912 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.235 2.405 LYS 68.A N.A THR 91.A O LYS 68.A H.A 2.963 2.179 LYS 68.A N.B THR 91.A O LYS 68.A H.B 2.965 2.172 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.872 2.029 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.152 2.303 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.872 2.046 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.091 2.318 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.162 2.382 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.258 2.470 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.864 2.027 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.985 2.293 SER 84.A N SER 113.A OG SER 84.A H 2.943 2.122 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.047 2.264 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.992 2.204 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.100 2.314 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.077 2.444 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.886 2.029 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.504 1.710 THR 91.A N LYS 68.A O.A THR 91.A H 2.812 2.006 THR 91.A N LYS 68.A O.B THR 91.A H 2.807 2.003 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.963 2.195 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.705 1.960 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.921 2.081 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.741 1.918 SER 95.A OG THR 100.A OG1 SER 95.A HG 2.707 2.073 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.891 2.090 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.974 2.121 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.819 1.964 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.998 2.360 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.091 2.268 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.263 2.471 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.662 1.819 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.872 2.026 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.780 2.035 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.975 2.139 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.749 1.961 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.088 2.247 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.945 2.142 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.875 2.072 SER 113.A OG SER 115.A OG SER 113.A HG 3.018 2.447 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 3.003 2.262 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.195 2.356 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.669 1.916 GLU 118.A N.A SER 114.A O GLU 118.A H.A 2.870 2.138 GLU 118.A N.B SER 114.A O GLU 118.A H.B 2.885 2.137 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H.B 3.059 2.327 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.109 2.255 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.884 2.041 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.878 2.139 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 3.010 2.183 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.042 2.358 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.805 1.994 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.887 2.033 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.017 2.169 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.031 2.171 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.987 2.139 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 2.949 2.091 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.051 2.293 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.085 2.331 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.437 2.616 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.775 1.954 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.973 2.142 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.780 1.948 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.837 2.181 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.934 2.084 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.939 2.087 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.876 2.024 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.015 2.189 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.957 2.107 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.947 2.114 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.775 1.941 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.928 2.182 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.944 2.199 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.139 2.371 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.994 2.206 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.754 2.068 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.066 2.261 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.819 2.030 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.846 2.046 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.884 2.126 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.281 2.586 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.871 2.036 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.774 1.948 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.890 2.101 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.865 2.060 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.145 2.375 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.757 1.909 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.778 1.941 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.935 2.120 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.409 2.806 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.662 1.822 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.058 2.223 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.937 2.121 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.856 2.012 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.779 2.025 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.842 2.041 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.370 2.516 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.854 2.046 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.846 1.997 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.797 1.965 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.666 1.942 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.826 2.064 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.717 1.904 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.172 2.383 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.717 1.890 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.102 2.347 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.946 2.173 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.837 1.989 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H.A 2.901 2.081 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.747 1.892 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.070 2.290 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.938 2.113 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.860 2.045 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 3.044 2.278 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 3.004 2.178 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 3.005 2.151 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.877 2.062 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.698 2.155 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.855 2.093 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.192 2.336 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.645 2.015 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.633 1.870 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.038 2.179 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.890 2.051 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.956 2.151 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.045 2.217 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.899 2.073 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.083 2.274 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.051 2.274 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.715 1.892 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.036 2.191 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.855 2.021 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.946 2.157 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 2.988 2.143 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 3.014 2.174 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.062 2.210 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 2.990 2.182 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.829 1.973 SER 247.A OG SER 245.A OG SER 247.A HG 3.029 2.421 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.045 2.216 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.831 2.025 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.055 2.300 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.761 1.937 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.856 2.020 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.872 2.106 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.863 2.013 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.890 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.903 2.050 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.880 2.076 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.894 2.040 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.968 2.186 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.823 2.039 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.942 2.115 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.773 1.995 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.079 2.359 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.861 2.095 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.953 2.102 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.729 1.878 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.965 2.208 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.939 2.092 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.296 2.443 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 3.003 2.188 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.833 2.033 ILE 283.A N SER 289.A O.A ILE 283.A H 2.847 2.056 ILE 283.A N SER 289.A O.B ILE 283.A H 2.831 2.039 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.943 2.100 SER 289.A N.A SER 287.A OG SER 289.A H.A 3.020 2.172 SER 289.A N.B SER 287.A OG SER 289.A H.B 3.016 2.167 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H.A 2.764 1.907 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.886 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.840 2.036 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.021 2.181 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.712 2.079 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.879 2.051 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.058 2.226 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.813 1.988 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.794 1.980 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.544 1.739 ALA 298.A N.A SER 296.A OG ALA 298.A H.A 3.074 2.229 ALA 298.A N.B SER 296.A OG ALA 298.A H.B 3.076 2.225 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H.B 2.877 2.094 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.771 1.943 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.896 2.113 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.763 1.994 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.787 1.984 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.079 2.353 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.967 2.293 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.966 2.122 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.815 1.983 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ2 2.817 1.998 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.123 2.322 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.989 2.161 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.816 1.989 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.048 2.211 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.788 1.958 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.824 1.990 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.984 2.184 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.901 2.048 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.757 2.003 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.182 2.403 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.096 2.359 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.055 2.206 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.800 1.980 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.919 2.107 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.918 2.118 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.775 1.941 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.822 2.068 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.149 2.559 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.814 1.974