Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydk_H.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 3.A N SER 25.A O GLN 3.A H 2.857 2.033 SER 5.A N GLU 23.A O SER 5.A H 3.066 2.277 GLU 6.A N GLU 6.A OE1 GLU 6.A H 2.919 2.206 SER 7.A N SER 21.A O SER 7.A H 3.018 2.249 GLY 10.A N LEU 124.A O GLY 10.A H 2.979 2.311 VAL 12.A N ILE 126.A O VAL 12.A H 2.986 2.260 LYS 13.A NZ ALA 129.A O LYS 13.A HZ3 3.424 2.857 GLY 15.A N LEU 86C.A O GLY 15.A H 2.678 1.828 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.846 2.070 LEU 18.A N MET 83.A O LEU 18.A H 2.843 2.040 LEU 20.A N LEU 81.A O LEU 20.A H 2.884 2.072 SER 21.A N SER 7.A O SER 21.A H 2.975 2.138 CYS 22.A N VAL 79.A O CYS 22.A H 2.755 1.993 GLU 23.A N SER 5.A O GLU 23.A H 2.956 2.140 ALA 24.A N ASP 77.A O ALA 24.A H 2.876 2.016 SER 25.A N GLN 3.A O SER 25.A H 2.981 2.242 ASN 31.A N THR 28.A O ASN 31.A H 3.078 2.233 TYR 32.A N PHE 29.A O TYR 32.A H 3.271 2.418 MET 34.A N THR 51.A O MET 34.A H 2.991 2.201 GLY 35.A N VAL 97.A O GLY 35.A H 2.948 2.135 TRP 36.A N SER 49.A O TRP 36.A H 2.662 1.865 VAL 37.A N TYR 95.A O VAL 37.A H 2.930 2.111 ARG 38.A N GLU 46.A O ARG 38.A H 3.053 2.224 ARG 38.A NE GLU 46.A OE1 ARG 38.A HE 2.858 2.069 ARG 38.A NH1 ASP 90.A OD1 ARG 38.A HH12 2.890 2.039 ARG 38.A NH1 TYR 94.A OH ARG 38.A HH11 2.990 2.182 ARG 38.A NH2 GLU 46.A OE1 ARG 38.A HH21 2.927 2.179 GLN 39.A N VAL 93.A O GLN 39.A H 2.925 2.140 GLN 39.A NE2 LYS 43.A O GLN 39.A HE21 2.865 2.066 LYS 43.A N ALA 40.A O LYS 43.A H 3.013 2.182 GLU 46.A N ARG 38.A O GLU 46.A H 2.821 2.080 VAL 48.A N TRP 36.A O VAL 48.A H 3.087 2.306 SER 49.A N TRP 36.A O SER 49.A H 3.214 2.397 VAL 50.A N TYR 59.A O VAL 50.A H 3.043 2.252 THR 51.A N MET 34.A O THR 51.A H 2.665 1.832 SER 52.A N SER 57.A O SER 52.A H 3.153 2.353 SER 52.A OG SER 57.A O SER 52.A HG 3.412 2.574 GLY 55.A N SER 52.A O GLY 55.A H 3.030 2.376 TYR 59.A N VAL 50.A O TYR 59.A H 2.913 2.100 GLY 61.A N VAL 48.A O GLY 61.A H 2.853 2.016 GLU 62.A N GLU 62.A OE1 GLU 62.A H 2.489 1.777 VAL 64.A N GLY 61.A O VAL 64.A H 3.117 2.287 ARG 67.A N VAL 64.A O ARG 67.A H 3.288 2.483 ARG 67.A NE VAL 64.A O ARG 67.A HE 2.885 2.056 ARG 67.A NH1 ASP 90.A OD2 ARG 67.A HH12 2.807 1.973 ARG 67.A NH1 ARG 85B.A O ARG 67.A HH11 3.108 2.279 ARG 67.A NH2 PHE 63.A O ARG 67.A HH21 3.152 2.383 ARG 67.A NH2 ASP 90.A OD1 ARG 67.A HH22 3.455 2.637 THR 69.A N GLU 82.A O THR 69.A H 2.767 1.956 SER 71.A N TYR 80.A O SER 71.A H 3.269 2.489 ARG 72.A NH1 TYR 32.A O ARG 72.A HH12 3.016 2.276 ARG 72.A NH1 SER 52.A O ARG 72.A HH11 2.893 2.319 ARG 72.A NH2 TYR 32.A O ARG 72.A HH22 3.027 2.290 ASP 73.A N THR 78.A O ASP 73.A H 2.765 1.928 PHE 75.A N ASP 73.A OD1 PHE 75.A H 2.999 2.231 ILE 76.A N ASP 73.A O ILE 76.A H 3.315 2.530 THR 78.A N ASP 73.A O THR 78.A H 3.167 2.346 THR 78.A OG1 ILE 76.A O THR 78.A HG1 2.966 2.143 VAL 79.A N CYS 22.A O VAL 79.A H 2.966 2.149 TYR 80.A N SER 71.A O TYR 80.A H 2.724 1.880 LEU 81.A N LEU 20.A O LEU 81.A H 2.902 2.077 GLU 82.A N THR 69.A O GLU 82.A H 2.659 1.875 MET 83.A N LEU 18.A O no hydrogen 2.863 N/A THR 87.A N ASP 90.A OD2 no hydrogen 2.730 N/A THR 87.A OG1 ASP 90.A OD2 THR 87.A HG1 3.058 2.251 GLU 89.A N GLU 89.A OE1 GLU 89.A H 2.758 2.039 ASP 90.A N THR 87.A O ASP 90.A H 2.896 2.063 THR 91.A N VAL 88.A O THR 91.A H 3.149 2.302 THR 91.A OG1 VAL 88.A O THR 91.A HG1 3.134 2.545 ALA 92.A N VAL 125.A O ALA 92.A H 3.069 2.314 VAL 93.A N GLN 39.A O VAL 93.A H 3.041 2.217 TYR 94.A N THR 123.A O TYR 94.A H 2.846 1.994 TYR 95.A N VAL 37.A O TYR 95.A H 2.615 1.763 CYS 96.A N GLU 6.A OE2 CYS 96.A H 2.718 1.873 VAL 97.A N GLY 35.A O VAL 97.A H 2.972 2.129 ARG 98.A N SER 118.A O ARG 98.A H 3.003 2.207 ARG 98.A NE ASP 117.A OD1 ARG 98.A HE 3.180 2.355 ARG 98.A NE ASP 117.A OD2 ARG 98.A HE 3.047 2.356 ARG 98.A NH2 ASP 117.A OD2 ARG 98.A HH21 2.808 2.083 VAL 99.A N ALA 33.A O VAL 99.A H 3.056 2.226 THR 100.A N TYR 115K.A O THR 100.A H 2.905 2.049 TYR 102.A N GLY 113I.A O TYR 102.A H 2.922 2.091 TRP 119.A NE1 PHE 116L.A O TRP 119.A HE1 2.941 2.243 GLY 120.A N CYS 96.A O GLY 120.A H 2.825 2.006 GLY 122.A N GLU 6.A OE1 GLY 122.A H 3.010 2.229 GLY 122.A N GLU 6.A OE2 GLY 122.A H 3.168 2.435 THR 123.A N TYR 94.A O THR 123.A H 2.906 2.116 VAL 125.A N ALA 92.A O VAL 125.A H 2.930 2.071 ILE 126.A N GLY 10.A O ILE 126.A H 2.878 2.026 VAL 127.A N THR 91.A OG1 VAL 127.A H 2.871 2.031 SER 128.A N VAL 12.A O SER 128.A H 3.017 2.302 ALA 130.A N SER 128.A OG ALA 130.A H 2.893 2.047 LYS 133.A N PHE 162.A O LYS 133.A H 2.750 1.918 SER 136.A N LYS 159.A O SER 136.A H 2.910 2.099 PHE 138.A N LEU 157.A O PHE 138.A H 2.982 2.154 LEU 140.A N GLY 155.A O LEU 140.A H 2.677 1.828 SER 146.A N SER 143.A O no hydrogen 2.901 N/A SER 146.A OG SER 143.A O no hydrogen 2.262 N/A GLY 150.A N THR 147.A O GLY 150.A H 3.350 2.514 ALA 152.A N VAL 200.A O ALA 152.A H 2.742 1.901 LEU 154.A N VAL 198.A O LEU 154.A H 3.110 2.274 GLY 155.A N LEU 140.A O GLY 155.A H 3.028 2.293 CYS 156.A N SER 196.A O CYS 156.A H 2.786 1.993 LEU 157.A N PHE 138.A O LEU 157.A H 2.727 1.880 VAL 158.A N LEU 194.A O VAL 158.A H 2.620 1.850 LYS 159.A N SER 136.A O LYS 159.A H 2.866 2.011 LYS 159.A NZ ASP 160.A OD1 LYS 159.A HZ3 3.185 2.306 LYS 159.A NZ GLN 187.A OE1 LYS 159.A HZ1 2.813 2.110 TYR 161.A N TYR 192.A O TYR 161.A H 3.103 2.295 PHE 162.A N LYS 133.A O PHE 162.A H 2.976 2.152 THR 167.A N ASN 215.A O THR 167.A H 2.987 2.187 SER 169.A N ASN 213.A O SER 169.A H 3.192 2.383 TRP 170.A NE1 SER 196.A OG TRP 170.A HE1 3.032 2.192 ASN 171.A N ILE 211.A O ASN 171.A H 2.648 1.808 ASN 171.A ND2 THR 209.A O ASN 171.A HD21 3.481 2.841 SER 172.A N ASN 213.A OD1 SER 172.A H 2.698 1.950 GLY 173.A N TRP 170.A O GLY 173.A H 3.127 2.385 ALA 174.A N ASN 171.A O ALA 174.A H 3.000 2.154 LEU 175.A N TRP 170.A O LEU 175.A H 3.142 2.329 VAL 179.A N THR 176.A O VAL 179.A H 3.196 2.361 HIS 180.A N VAL 197.A O HIS 180.A H 2.767 1.925 PHE 182.A N SER 195.A O PHE 182.A H 2.983 2.135 VAL 185.A N SER 193.A O VAL 185.A H 2.925 2.098 GLN 187.A N LEU 191.A O GLN 187.A H 2.866 2.027 GLN 187.A NE2 ASP 160.A OD1 GLN 187.A HE22 2.876 2.107 GLN 187.A NE2 LEU 191.A O GLN 187.A HE21 3.143 2.313 GLY 190.A N GLN 187.A O GLY 190.A H 2.831 1.988 LEU 191.A N SER 189.A OG LEU 191.A H 3.248 2.408 TYR 192.A N TYR 161.A O TYR 192.A H 2.792 1.938 SER 193.A N VAL 185.A O SER 193.A H 2.986 2.205 LEU 194.A N VAL 158.A O LEU 194.A H 2.651 1.821 SER 196.A N CYS 156.A O SER 196.A H 3.022 2.201 SER 196.A OG THR 181.A OG1 SER 196.A HG 2.945 2.326 VAL 197.A N HIS 180.A O VAL 197.A H 2.880 2.042 VAL 198.A N LEU 154.A O VAL 198.A H 2.801 1.977 VAL 200.A N ALA 152.A O VAL 200.A H 2.819 1.987 SER 202.A N GLY 150.A O SER 202.A H 3.085 2.239 SER 202.A OG THR 147.A O SER 202.A HG 2.917 2.188 SER 204.A N PRO 201.A O SER 204.A H 2.839 2.000 LEU 205.A N SER 202.A O LEU 205.A H 3.345 2.559 THR 207.A N SER 204.A O THR 207.A H 3.229 2.414 GLN 208.A N SER 204.A O GLN 208.A H 2.692 1.877 GLN 208.A NE2 THR 209.A O GLN 208.A HE21 2.764 1.932 ILE 211.A N ASN 171.A OD1 ILE 211.A H 2.801 1.951 CYS 212.A N LYS 225.A O CYS 212.A H 3.072 2.263 CYS 212.A SG LYS 225.A O no hydrogen 3.830 N/A ASN 213.A N SER 169.A O ASN 213.A H 2.693 1.855 ASN 213.A ND2 ASP 224.A OD1 ASN 213.A HD21 3.344 2.595 VAL 214.A N VAL 223.A O VAL 214.A H 2.704 1.924 ASN 215.A N THR 167.A O ASN 215.A H 2.935 2.133 HIS 216.A N THR 221.A O HIS 216.A H 2.713 1.860 HIS 216.A ND1 SER 219.A OG HIS 216.A HD1 2.572 1.733 HIS 216.A NE2 PRO 163.A O HIS 216.A HE2 2.800 1.962 SER 219.A OG THR 221.A OG1 SER 219.A HG 2.674 2.067 ASN 220.A N LYS 217.A O ASN 220.A H 2.825 2.033 THR 221.A N HIS 216.A O THR 221.A H 2.861 2.078 LYS 222.A NZ ASP 224.A OD1 LYS 222.A HZ2 2.697 1.833 VAL 223.A N VAL 214.A O VAL 223.A H 2.745 1.898 LYS 225.A N CYS 212.A O LYS 225.A H 3.102 2.281 LYS 226.A NZ GLU 228.A OE1 LYS 226.A HZ3 2.817 2.123 VAL 227.A N TYR 210.A O VAL 227.A H 2.720 1.868 ASN 84A.A N ARG 67.A O ASN 84A.A H 3.181 2.461 ASN 84A.A ND2 ARG 67.A O ASN 84A.A HD21 2.977 2.179 LEU 86C.A N GLY 16.A O LEU 86C.A H 3.231 2.372 TYR 109E.A N SER 106B.A O TYR 109E.A H 3.028 2.234 ASN 114J.A ND2 TYR 110F.A OH ASN 114J.A HD21 3.201 2.501 ASN 114J.A ND2 ARG 111G.A O ASN 114J.A HD22 3.083 2.292 TYR 115K.A N THR 100.A O TYR 115K.A H 2.756 1.981