Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ydk_L.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 5.A N ARG 24.A O THR 5.A H 2.757 1.907 GLN 6.A N GLN 100.A OE1 GLN 6.A H 2.927 2.074 GLN 6.A NE2 TYR 86.A O GLN 6.A HE21 2.860 2.003 SER 7.A N THR 22.A O SER 7.A H 2.885 2.074 LEU 11.A N TRP 103.A O LEU 11.A H 3.089 2.319 ALA 13.A N ASP 105.A O ALA 13.A H 2.996 2.223 SER 14.A N ASP 17.A OD2 SER 14.A H 2.757 1.901 GLY 16.A N VAL 78.A O GLY 16.A H 2.856 2.057 ASP 17.A N SER 14.A O ASP 17.A H 3.064 2.217 VAL 19.A N ILE 75.A O VAL 19.A H 3.081 2.293 ILE 21.A N LEU 73.A O ILE 21.A H 2.844 2.013 THR 22.A N SER 7.A O THR 22.A H 2.889 2.031 CYS 23.A N PHE 71.A O CYS 23.A H 2.812 1.992 ARG 24.A N THR 5.A O ARG 24.A H 2.736 1.908 ALA 25.A N THR 69.A O ALA 25.A H 2.945 2.131 SER 26.A N GLN 3.A O SER 26.A H 2.983 2.260 GLN 27.A NE2 ASP 1.A OD1 GLN 27.A HE22 3.223 2.587 ILE 29.A N GLY 68.A O ILE 29.A H 2.897 2.056 ALA 30.A N ASP 28.A OD1 ALA 30.A H 3.276 2.436 ASN 31.A N ASN 31.A OD1 ASN 31.A H 2.666 2.027 TYR 32.A N ILE 29.A O TYR 32.A H 2.896 2.060 LEU 33.A N ASN 31.A O LEU 33.A H 2.773 2.066 ASN 34.A N GLN 89.A O ASN 34.A H 2.767 1.938 ASN 34.A ND2 GLN 89.A OE1 ASN 34.A HD21 2.996 2.140 TRP 35.A N ILE 48.A O TRP 35.A H 2.798 1.981 TYR 36.A N PHE 87.A O TYR 36.A H 2.790 1.963 TYR 36.A OH GLN 89.A OE1 TYR 36.A HH 2.671 1.872 GLN 37.A N LYS 45.A O GLN 37.A H 2.775 1.948 GLN 37.A NE2 GLU 81.A O GLN 37.A HE22 3.679 3.204 GLN 37.A NE2 TYR 86.A OH GLN 37.A HE21 2.916 2.122 LYS 38.A N ASN 85.A O LYS 38.A H 2.756 1.954 LYS 38.A NZ LYS 39.A O LYS 38.A HZ3 2.850 2.148 LYS 38.A NZ THR 42.A O LYS 38.A HZ3 2.779 2.094 LYS 39.A NZ GLU 81.A O LYS 39.A HZ1 2.918 2.156 THR 42.A N LYS 39.A O THR 42.A H 3.232 2.387 LYS 45.A N GLN 37.A O LYS 45.A H 2.761 1.957 LEU 47.A N TRP 35.A O LEU 47.A H 2.808 1.968 ILE 48.A N TRP 35.A O ILE 48.A H 3.305 2.483 PHE 49.A N ASN 53.A O PHE 49.A H 2.937 2.119 GLY 50.A N ASN 34.A OD1 GLY 50.A H 3.315 2.548 ALA 51.A N LEU 33.A O ALA 51.A H 2.754 1.955 ASN 53.A N PHE 49.A O ASN 53.A H 3.009 2.225 ASN 53.A ND2 PHE 49.A O ASN 53.A HD21 3.140 2.368 HIS 55.A N LEU 47.A O HIS 55.A H 2.973 2.117 VAL 58.A N HIS 55.A O VAL 58.A H 3.058 2.222 ARG 61.A N SER 59.A OG ARG 61.A H 3.210 2.356 ARG 61.A NH1 THR 76.A O ARG 61.A HH11 3.423 2.580 ARG 61.A NH1 ASP 82.A OD2 ARG 61.A HH12 2.457 1.669 ARG 61.A NH2 ASP 82.A OD1 ARG 61.A HH22 3.066 2.209 PHE 62.A N SER 59.A O PHE 62.A H 3.076 2.219 SER 63.A N THR 74.A O SER 63.A H 3.073 2.283 SER 65.A N SER 72.A O SER 65.A H 3.063 2.282 GLY 68.A N ALA 30.A O GLY 68.A H 2.814 1.957 PHE 71.A N CYS 23.A O PHE 71.A H 2.858 2.047 SER 72.A N SER 65.A O SER 72.A H 2.996 2.185 LEU 73.A N ILE 21.A O LEU 73.A H 2.718 1.905 THR 74.A N SER 63.A O THR 74.A H 2.918 2.070 ILE 75.A N VAL 19.A O ILE 75.A H 2.937 2.105 THR 76.A N ARG 61.A O THR 76.A H 2.908 2.062 VAL 78.A N ASP 17.A O VAL 78.A H 2.867 2.022 GLN 79.A N ASP 82.A OD2 GLN 79.A H 2.762 1.904 GLN 79.A NE2 ASN 77.A O GLN 79.A HE22 3.093 2.246 ASP 82.A N GLN 79.A O ASP 82.A H 2.902 2.064 PHE 83.A N HIS 80.A O PHE 83.A H 3.354 2.514 ASN 85.A N LYS 38.A O ASN 85.A H 2.913 2.063 TYR 86.A N THR 102.A O TYR 86.A H 2.771 1.975 PHE 87.A N TYR 36.A O PHE 87.A H 2.927 2.093 CYS 88.A N GLN 6.A OE1 CYS 88.A H 3.056 2.242 GLN 89.A N ASN 34.A O GLN 89.A H 2.814 2.210 GLN 89.A NE2 GLN 90.A O GLN 89.A HE21 3.211 2.579 GLN 90.A N SER 97.A O GLN 90.A H 2.951 2.245 GLN 90.A NE2 VAL 95.A O GLN 90.A HE21 3.350 2.624 GLN 90.A NE2 SER 97.A OG GLN 90.A HE22 2.937 2.120 SER 91.A N TYR 32.A O SER 91.A H 3.025 2.210 PHE 92.A N GLN 90.A OE1 PHE 92.A H 2.797 2.162 GLN 93.A N GLN 90.A OE1 GLN 93.A H 3.286 2.470 GLN 93.A NE2 ASP 1.A OD1 GLN 93.A HE22 2.929 2.100 SER 97.A N GLN 90.A O SER 97.A H 3.190 2.420 GLY 99.A N CYS 88.A O GLY 99.A H 2.795 1.963 GLN 100.A N GLN 100.A OE1 GLN 100.A H 2.649 1.852 GLN 100.A NE2 GLN 6.A O GLN 100.A HE21 2.839 2.021 GLY 101.A N GLN 6.A OE1 GLY 101.A H 2.990 2.271 THR 102.A N TYR 86.A O THR 102.A H 2.814 2.043 VAL 104.A N ALA 84.A O VAL 104.A H 2.826 1.994 ASP 105.A N LEU 11.A O ASP 105.A H 3.082 2.286 ILE 106.A N GLN 166.A OE1 ILE 106.A H 2.964 2.106 ARG 107.A N ALA 13.A O ARG 107.A H 2.952 2.108 ARG 107.A NH1 SER 14.A OG ARG 107.A HH11 2.960 2.245 ARG 107.A NH1 ASP 17.A OD2 ARG 107.A HH12 2.777 1.954 ARG 108.A NE THR 109.A O ARG 108.A HE 2.711 1.855 ARG 108.A NH1 ASP 170.A O ARG 108.A HH11 2.816 1.974 ARG 108.A NH2 THR 109.A O ARG 108.A HH21 3.421 2.791 ALA 111.A N TYR 140.A O ALA 111.A H 2.865 2.073 SER 114.A N ASN 137.A O SER 114.A H 3.124 2.320 PHE 116.A N LEU 135.A O PHE 116.A H 2.902 2.102 PHE 118.A N VAL 133.A O PHE 118.A H 2.705 1.873 GLN 124.A N SER 121.A O GLN 124.A H 3.006 2.360 GLN 124.A N SER 121.A OG GLN 124.A H 3.200 2.439 GLN 124.A NE2 SER 131.A OG GLN 124.A HE21 2.710 1.857 LEU 125.A N SER 121.A O LEU 125.A H 2.990 2.147 LYS 126.A N ASP 122.A O LYS 126.A H 3.046 2.353 SER 127.A N GLN 124.A O SER 127.A H 2.687 1.873 SER 127.A OG GLN 124.A O SER 127.A HG 2.554 1.721 GLY 128.A N LEU 125.A O GLY 128.A H 3.107 2.278 ALA 130.A N LEU 181.A O ALA 130.A H 2.860 2.032 SER 131.A N GLN 124.A OE1 SER 131.A H 3.173 2.407 VAL 132.A N LEU 179.A O VAL 132.A H 2.690 1.849 VAL 133.A N PHE 118.A O VAL 133.A H 3.152 2.366 CYS 134.A N SER 177.A O CYS 134.A H 2.802 1.968 CYS 134.A SG PHE 116.A O no hydrogen 3.579 N/A LEU 135.A N PHE 116.A O LEU 135.A H 2.731 1.913 LEU 136.A N LEU 175.A O LEU 136.A H 2.757 1.900 ASN 137.A N SER 114.A O ASN 137.A H 2.896 2.086 ASN 138.A N SER 174.A OG ASN 138.A H 2.957 2.114 PHE 139.A N TYR 173.A O PHE 139.A H 2.746 1.941 TYR 140.A N ALA 111.A O TYR 140.A H 2.793 1.981 LYS 145.A N THR 197.A O LYS 145.A H 3.069 2.227 GLN 147.A N GLU 195.A O GLN 147.A H 2.839 2.048 GLN 147.A NE2 TRP 148.A O GLN 147.A HE22 3.163 2.380 GLN 147.A NE2 GLN 155.A O GLN 147.A HE21 3.271 2.553 TRP 148.A NE1 SER 177.A OG TRP 148.A HE1 2.999 2.163 LYS 149.A N ALA 193.A O LYS 149.A H 2.975 2.144 LYS 149.A NZ GLU 195.A OE2 LYS 149.A HZ2 2.950 2.311 VAL 150.A N ALA 153.A O VAL 150.A H 3.096 2.274 ASP 151.A N VAL 191.A O ASP 151.A H 2.861 2.029 ALA 153.A N VAL 150.A O ALA 153.A H 2.902 2.078 GLN 155.A N TRP 148.A O GLN 155.A H 2.908 2.050 GLN 155.A NE2 ALA 153.A O GLN 155.A HE21 2.682 1.849 ASN 158.A ND2 GLN 155.A OE1 ASN 158.A HD22 3.051 2.233 GLN 160.A N THR 178.A O GLN 160.A H 3.158 2.371 SER 162.A N SER 176.A O SER 162.A H 3.009 2.228 THR 164.A N SER 174.A O THR 164.A H 2.981 2.166 THR 164.A OG1 GLU 165.A O THR 164.A HG1 3.558 2.920 GLN 166.A NE2 ILE 106.A O GLN 166.A HE21 2.792 2.013 GLN 166.A NE2 SER 171.A O GLN 166.A HE22 2.948 2.133 ASP 167.A N THR 172.A O ASP 167.A H 2.886 2.042 LYS 169.A N ASP 167.A OD2 LYS 169.A H 2.932 2.206 ASP 170.A N ASP 167.A OD2 ASP 170.A H 2.920 2.088 SER 171.A N ASP 167.A O SER 171.A H 2.870 2.159 THR 172.A N ASP 170.A OD1 THR 172.A H 2.996 2.203 TYR 173.A N PHE 139.A O TYR 173.A H 2.808 1.955 SER 174.A N THR 164.A OG1 SER 174.A H 2.958 2.157 LEU 175.A N LEU 136.A O LEU 175.A H 2.726 1.906 SER 176.A N SER 162.A O SER 176.A H 3.017 2.189 SER 177.A N CYS 134.A O SER 177.A H 2.926 2.103 SER 177.A OG GLN 160.A O SER 177.A HG 3.544 2.875 THR 178.A N GLN 160.A O THR 178.A H 2.827 1.988 LEU 179.A N VAL 132.A O LEU 179.A H 2.650 1.809 THR 180.A N ASN 158.A O THR 180.A H 3.006 2.164 LEU 181.A N ALA 130.A O LEU 181.A H 2.895 2.052 LYS 183.A N GLY 128.A O LYS 183.A H 2.999 2.204 ASP 185.A N SER 182.A OG ASP 185.A H 3.079 2.226 TYR 186.A N SER 182.A O TYR 186.A H 2.956 2.200 GLU 187.A N LYS 183.A O GLU 187.A H 2.824 1.983 LYS 188.A N ASP 185.A O LYS 188.A H 3.298 2.564 LYS 188.A NZ ASP 185.A OD1 LYS 188.A HZ3 3.276 2.639 HIS 189.A N TYR 186.A O HIS 189.A H 3.361 2.511 HIS 189.A ND1 ASP 151.A OD2 HIS 189.A HD1 2.695 1.889 LYS 190.A N ASP 151.A OD1 LYS 190.A H 3.185 2.362 VAL 191.A N ASP 151.A OD1 VAL 191.A H 3.128 2.308 TYR 192.A N PHE 209.A O TYR 192.A H 2.995 2.146 ALA 193.A N LYS 149.A O ALA 193.A H 2.856 2.012 CYS 194.A N LYS 207.A O CYS 194.A H 2.679 1.831 GLU 195.A N GLN 147.A O GLU 195.A H 2.941 2.088 VAL 196.A N VAL 205.A O VAL 196.A H 2.630 1.787 THR 197.A N LYS 145.A O THR 197.A H 2.912 2.074 HIS 198.A NE2 PRO 141.A O HIS 198.A HE2 2.954 2.111 LEU 201.A N HIS 198.A O LEU 201.A H 2.813 1.972 VAL 205.A N VAL 196.A O VAL 205.A H 2.837 2.083 LYS 207.A N CYS 194.A O LYS 207.A H 3.050 2.215 PHE 209.A N TYR 192.A O PHE 209.A H 3.049 2.277 ARG 211.A N LYS 190.A O ARG 211.A H 2.949 2.159 ARG 211.A NE HIS 189.A O ARG 211.A HE 2.590 1.759 ARG 211.A NH2 HIS 189.A O ARG 211.A HH21 3.052 2.395