Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4yjq_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LEU 2.A N ILE 71.A O LEU 2.A H 2.907 1.955 ASP 3.A N TYR 23.A OH ASP 3.A H 2.918 1.932 ARG 4.A NE GLU 75.A OE1 ARG 4.A HE 2.914 1.964 ARG 4.A NE GLU 75.A OE2 ARG 4.A HE 3.514 2.685 ARG 4.A NH1 ARG 4.A O ARG 4.A HH11 3.236 2.279 ARG 4.A NH2 GLU 75.A OE2 ARG 4.A HH21 3.011 2.021 LYS 5.A N ASP 3.A OD1 LYS 5.A H 3.020 2.104 LEU 6.A N ASP 3.A O LEU 6.A H 2.938 1.976 LEU 7.A N ARG 4.A O LEU 7.A H 3.171 2.169 THR 8.A N TYR 22.A O THR 8.A H 3.015 2.039 GLU 10.A N LYS 20.A O GLU 10.A H 2.845 1.852 LEU 14.A N VAL 18.A O LEU 14.A H 2.922 1.984 THR 17.A N ILE 36.A O THR 17.A H 3.206 2.362 LYS 19.A N VAL 34.A O LYS 19.A H 2.936 1.997 GLY 21.A N VAL 32.A O GLY 21.A H 2.849 1.896 TYR 22.A N THR 8.A O TYR 22.A H 2.868 1.945 TYR 22.A OH GLU 10.A OE2 TYR 22.A HH 2.617 1.840 TYR 23.A N LYS 30.A O TYR 23.A H 2.870 1.868 GLN 24.A N LEU 6.A O GLN 24.A H 2.934 1.977 MET 25.A N VAL 28.A O MET 25.A H 2.914 1.990 LYS 30.A N TYR 23.A O LYS 30.A H 2.842 1.851 LYS 30.A NZ GLU 82.A OE2.B LYS 30.A HZ1 2.698 1.793 VAL 32.A N GLY 21.A O VAL 32.A H 2.867 1.867 ALA 33.A N MET 81.A O ALA 33.A H 2.908 1.973 VAL 34.A N LYS 19.A O VAL 34.A H 2.811 1.897 LYS 35.A N LEU 79.A O LYS 35.A H 2.947 2.004 ILE 36.A N THR 17.A O ILE 36.A H 2.678 1.724 LEU 37.A N TRP 77.A O LEU 37.A H 2.798 1.804 ASN 39.A ND2 ALA 74.A O ASN 39.A HD21 2.861 1.856 ASN 42.A N GLU 40.A O ASN 42.A H 2.818 1.993 ASN 42.A ND2 LYS 38.A O ASN 42.A HD22 2.875 1.937 ALA 45.A N ASP 43.A OD1 ALA 45.A H 2.903 2.056 LEU 46.A N ASP 43.A OD1 LEU 46.A H 3.422 2.501 LYS 47.A N ASP 43.A O LYS 47.A H 3.086 2.087 ASP 48.A N PRO 44.A O ASP 48.A H 2.886 1.921 GLU 49.A N ALA 45.A O GLU 49.A H 3.002 2.098 LEU 50.A N LEU 46.A O LEU 50.A H 3.143 2.269 LEU 51.A N LYS 47.A O LEU 51.A H 2.889 1.915 ALA 52.A N ASP 48.A O ALA 52.A H 2.919 1.969 GLU 53.A N GLU 49.A O GLU 53.A H 2.882 1.949 ALA 54.A N LEU 50.A O ALA 54.A H 2.943 1.956 ASN 55.A N LEU 51.A O ASN 55.A H 2.901 1.945 VAL 56.A N ALA 52.A O VAL 56.A H 3.039 2.097 MET 57.A N GLU 53.A O MET 57.A H 2.827 1.818 GLN 58.A N ALA 54.A O GLN 58.A H 2.947 2.020 GLN 59.A N VAL 56.A O GLN 59.A H 2.919 1.959 GLN 59.A NE2 ASN 55.A O GLN 59.A HE22 2.964 1.956 LEU 60.A N MET 57.A O LEU 60.A H 3.168 2.156 ASP 61.A N TYR 117.A OH ASP 61.A H 2.954 1.998 TYR 64.A N ASN 62.A OD1 TYR 64.A H 2.866 1.873 ILE 65.A N ASN 62.A O ILE 65.A H 3.253 2.292 VAL 66.A N ILE 143.A O VAL 66.A H 2.953 1.950 ARG 67.A NH1 ASP 61.A OD1 ARG 67.A HH12 2.634 1.752 ILE 69.A N VAL 80.A O ILE 69.A H 2.812 1.896 GLY 70.A N VAL 80.A O GLY 70.A H 3.172 2.210 CYS 72.A N MET 78.A O CYS 72.A H 2.834 1.889 ALA 74.A N SER 76.A O ALA 74.A H 3.021 2.023 GLU 75.A N GLU 75.A OE1 GLU 75.A H 2.820 1.937 TRP 77.A N LEU 37.A O TRP 77.A H 2.811 1.840 MET 78.A N CYS 72.A O MET 78.A H 2.835 1.965 LEU 79.A N LYS 35.A O LEU 79.A H 2.917 1.951 VAL 80.A N GLY 70.A O VAL 80.A H 2.814 1.812 MET 81.A N ALA 33.A O MET 81.A H 2.877 1.869 GLU 82.A N.A ARG 67.A O GLU 82.A H.A 2.933 1.941 GLU 82.A N.B ARG 67.A O GLU 82.A H.B 2.928 1.927 MET 83.A N THR 31.A O MET 83.A H.A 3.063 2.057 LEU 86.A N LEU 135.A O LEU 86.A H 2.938 2.088 GLY 87.A N ALA 84.A O GLY 87.A H 3.175 2.265 LEU 89.A N VAL 133.A O LEU 89.A H 2.816 1.939 TYR 92.A N PRO 88.A O TYR 92.A H 3.008 2.026 TYR 92.A OH GLN 138.A OE1 TYR 92.A HH 2.564 1.697 LEU 93.A N LEU 89.A O LEU 93.A H 2.964 1.980 GLN 94.A N ASN 90.A O GLN 94.A H 3.063 2.120 GLN 94.A NE2 GLY 200.A O GLN 94.A HE22 2.791 1.797 GLN 95.A N LYS 91.A O GLN 95.A H 3.148 2.251 ASN 96.A N LEU 93.A O ASN 96.A H 3.396 2.592 ASN 96.A ND2 TYR 92.A O ASN 96.A HD22 2.911 1.919 ARG 97.A NE GLN 94.A O ARG 97.A HE 3.051 2.070 ARG 97.A NH2 GLN 94.A O ARG 97.A HH21 3.565 2.787 ASN 103.A ND2 GLN 138.A O ASN 103.A HD21 2.896 1.896 ILE 104.A N LYS 100.A O ILE 104.A H 3.007 2.092 ILE 105.A N ASP 101.A O ILE 105.A H 2.857 1.859 GLU 106.A N LYS 102.A O GLU 106.A H 2.949 2.000 LEU 107.A N ASN 103.A O LEU 107.A H 3.058 2.104 VAL 108.A N ILE 104.A O VAL 108.A H 2.944 1.941 HIS 109.A N ILE 105.A O HIS 109.A H 2.795 1.821 HIS 109.A NE2 GLU 254.A OE2 HIS 109.A HE2 2.678 1.679 GLN 110.A N GLU 106.A O GLN 110.A H 2.989 2.053 GLN 110.A NE2 HIS 139.A O GLN 110.A HE21 2.960 1.950 VAL 111.A N LEU 107.A O VAL 111.A H 3.079 2.125 SER 112.A N VAL 108.A O SER 112.A H 2.869 1.925 SER 112.A OG HIS 109.A O SER 112.A HG 2.690 1.708 MET 113.A N HIS 109.A O MET 113.A H 2.893 2.017 GLY 114.A N GLN 110.A O GLY 114.A H 2.993 2.013 MET 115.A N VAL 111.A O MET 115.A H 2.867 1.899 LYS 116.A N SER 112.A O LYS 116.A H 2.811 1.908 LYS 116.A NZ GLU 120.A OE2 LYS 116.A HZ3 2.678 1.692 TYR 117.A N MET 113.A O TYR 117.A H 3.121 2.134 LEU 118.A N GLY 114.A O LEU 118.A H 2.925 1.971 GLU 119.A N MET 115.A O GLU 119.A H 2.806 1.802 GLU 120.A N LYS 116.A O GLU 120.A H 2.936 1.966 SER 121.A N TYR 117.A O SER 121.A H 2.893 1.978 SER 121.A OG TYR 117.A O SER 121.A HG 2.818 2.000 ASN 122.A N GLU 119.A O ASN 122.A H 2.960 2.025 PHE 123.A N LEU 118.A O PHE 123.A H 3.135 2.125 VAL 124.A N LYS 150.A O VAL 124.A H 2.910 1.937 HIS 125.A N ASP 185.A OD2 HIS 125.A H 2.805 1.806 HIS 125.A NE2 SER 144.A O HIS 125.A HE2 2.838 1.887 ARG 126.A N ASP 185.A OD1 ARG 126.A H 3.040 2.029 ARG 126.A NH1 LEU 148.A O ARG 126.A HH11 2.904 1.969 ASP 127.A N HIS 125.A ND1 ASP 127.A H 2.930 1.969 ALA 130.A N GLU 195.A OE1 ALA 130.A H 2.924 1.927 ARG 131.A NH2 ASP 127.A OD1 ARG 131.A HH21 2.832 1.976 ASN 132.A N ALA 129.A O ASN 132.A H 2.865 1.909 ASN 132.A ND2 ASP 127.A O ASN 132.A HD22 2.841 1.835 VAL 133.A N ALA 130.A O VAL 133.A H 3.144 2.136 LEU 134.A N LYS 142.A O LEU 134.A H 2.820 1.847 LEU 135.A N GLY 87.A O LEU 135.A H 2.862 1.898 VAL 136.A N TYR 140.A O VAL 136.A H 2.764 1.790 THR 137.A N TYR 140.A O THR 137.A H 3.468 2.515 GLN 138.A NE2 ASN 103.A OD1 GLN 138.A HE22 2.932 2.098 HIS 139.A N THR 137.A OG1 HIS 139.A H 2.982 2.052 HIS 139.A ND1 GLU 106.A OE1 HIS 139.A HD1 2.634 1.631 TYR 140.A N THR 137.A O TYR 140.A H 3.196 2.222 ALA 141.A N GLN 110.A OE1 ALA 141.A H 2.890 1.939 LYS 142.A N LEU 134.A O LYS 142.A H 2.876 1.957 LYS 142.A NZ PRO 63.A O LYS 142.A HZ3 3.256 2.607 ILE 143.A N TYR 64.A O ILE 143.A H 2.814 1.837 SER 144.A N ASN 132.A O SER 144.A H 2.859 1.982 SER 144.A OG ASN 132.A O SER 144.A HG 2.661 1.762 PHE 146.A N GLU 53.A OE2 PHE 146.A H 2.886 1.942 GLY 147.A N ASP 145.A OD1 GLY 147.A H 3.245 2.238 SER 149.A N.A PHE 146.A O SER 149.A H.A 3.122 2.118 SER 149.A N.B PHE 146.A O SER 149.A H.B 3.072 2.081 SER 149.A OG.A HIS 125.A O SER 149.A HG.A 2.877 1.958 SER 149.A OG.B VAL 124.A O SER 149.A HG.B 2.890 1.931 LYS 150.A N VAL 124.A O LYS 150.A H.A 2.998 2.067 LEU 152.A N ASN 122.A O LEU 152.A H 2.887 1.879 ARG 153.A NE ASP 155.A OD1 ARG 153.A HE 2.871 1.945 ARG 153.A NH2 ASP 155.A OD1 ARG 153.A HH21 3.409 2.686 ARG 153.A NH2 ASP 155.A OD2 ARG 153.A HH21 3.074 2.061 GLU 156.A N ARG 153.A O GLU 156.A H 3.386 2.377 LYS 158.A NZ ALA 159.A O LYS 158.A HZ3 2.708 1.730 ALA 159.A N TYR 178.A O ALA 159.A H 2.855 1.882 VAL 167.A N TRP 165.A O VAL 167.A H 2.830 2.107 LYS 168.A NZ TYR 204.A O LYS 168.A HZ3 3.180 2.515 LYS 168.A NZ MET 207.A O LYS 168.A HZ1 2.779 1.881 TRP 169.A N PRO 166.A O TRP 169.A H 2.872 1.891 TRP 169.A NE1 GLU 195.A OE1 TRP 169.A HE1 2.855 1.854 TYR 170.A N VAL 167.A O TYR 170.A H 3.009 2.011 TYR 170.A OH ARG 126.A O TYR 170.A HH 2.668 1.740 GLU 173.A N GLU 173.A OE1 GLU 173.A H 2.824 1.892 CYS 174.A N ALA 171.A O CYS 174.A H 2.984 2.221 CYS 174.A SG LYS 179.A O CYS 174.A HG 3.499 2.264 ILE 175.A N ALA 171.A O ILE 175.A H 3.252 2.283 ASN 176.A N PRO 172.A O ASN 176.A H 2.767 1.786 ASN 176.A ND2 TYR 242.A OH ASN 176.A HD21 3.428 2.509 TYR 177.A N GLU 173.A O TYR 177.A H 2.922 1.994 TYR 178.A N CYS 174.A O TYR 178.A H 2.953 2.136 LYS 179.A N GLU 173.A O LYS 179.A H 3.348 2.336 SER 181.A N SER 184.A OG SER 181.A H 3.042 2.039 SER 181.A OG SER 184.A OG SER 181.A HG 3.263 2.543 LYS 183.A NZ ARG 247.A O LYS 183.A HZ3 2.784 1.944 SER 184.A N SER 181.A OG SER 184.A H 3.249 2.332 SER 184.A OG GLU 173.A OE2 SER 184.A HG 2.784 1.834 ASP 185.A N SER 181.A O ASP 185.A H 3.164 2.240 VAL 186.A N SER 182.A O VAL 186.A H 2.974 2.122 TRP 187.A N LYS 183.A O TRP 187.A H 3.164 2.234 SER 188.A N SER 184.A O SER 188.A H 3.167 2.193 SER 188.A OG TRP 169.A O SER 188.A HG 2.694 1.914 PHE 189.A N ASP 185.A O PHE 189.A H 2.804 1.847 GLY 190.A N VAL 186.A O GLY 190.A H 2.986 2.077 VAL 191.A N TRP 187.A O VAL 191.A H 3.233 2.319 LEU 192.A N SER 188.A O LEU 192.A H 2.873 1.904 MET 193.A N PHE 189.A O MET 193.A H 2.813 1.860 TRP 194.A N GLY 190.A O TRP 194.A H 3.024 2.048 TRP 194.A NE1 GLY 223.A O TRP 194.A HE1 3.190 2.337 GLU 195.A N VAL 191.A O GLU 195.A H 2.880 1.927 ALA 196.A N LEU 192.A O ALA 196.A H 2.893 1.925 PHE 197.A N MET 193.A O PHE 197.A H 2.997 2.057 SER 198.A N GLU 195.A O SER 198.A H 3.149 2.237 SER 198.A OG TRP 194.A O SER 198.A HG 2.759 1.929 TYR 199.A OH VAL 99.A O TYR 199.A HH 2.717 1.771 GLY 200.A N GLU 195.A O GLY 200.A H 2.943 1.957 GLN 201.A N SER 198.A O GLN 201.A H 3.116 2.214 MET 207.A N TYR 204.A O MET 207.A H 3.160 2.188 LYS 208.A N GLU 211.A OE1 LYS 208.A H 2.891 1.886 GLU 211.A N LYS 208.A O GLU 211.A H 2.942 2.215 VAL 212.A N LYS 208.A O VAL 212.A H 3.011 2.090 THR 213.A N GLY 209.A O THR 213.A H 3.005 2.022 ALA 214.A N SER 210.A O ALA 214.A H 3.144 2.175 MET 215.A N GLU 211.A O MET 215.A H 2.911 1.953 LEU 216.A N VAL 212.A O LEU 216.A H 2.949 1.968 GLU 217.A N THR 213.A O GLU 217.A H 3.027 2.060 LYS 218.A N ALA 214.A O LYS 218.A H 3.179 2.229 GLY 219.A N LEU 216.A O GLY 219.A H 2.939 1.948 GLU 220.A N MET 215.A O GLU 220.A H 3.104 2.136 ARG 221.A NE TRP 240.A O ARG 221.A HE 3.104 2.223 ARG 221.A NH1 LEU 216.A O ARG 221.A HH12 3.082 2.165 ARG 221.A NH1 GLU 220.A O ARG 221.A HH11 2.922 1.919 ARG 221.A NH2 TRP 240.A O ARG 221.A HH21 2.963 2.061 CYS 228.A N PRO 225.A O CYS 228.A H 2.924 1.926 MET 232.A N PRO 229.A O MET 232.A H 2.985 2.206 TYR 233.A N PRO 229.A O TYR 233.A H 3.138 2.200 TYR 233.A OH MET 222.A O TYR 233.A HH 2.640 1.921 ASP 234.A N ARG 230.A O ASP 234.A H 2.886 1.926 LEU 235.A N GLU 231.A O LEU 235.A H 3.092 2.196 MET 236.A N MET 232.A O MET 236.A H 2.993 2.053 ASN 237.A N TYR 233.A O ASN 237.A H 3.042 2.089 LEU 238.A N ASP 234.A O LEU 238.A H 3.069 2.136 CYS 239.A N LEU 235.A O CYS 239.A H 2.912 1.936 CYS 239.A SG LEU 235.A O CYS 239.A HG 3.450 2.249 TRP 240.A N MET 236.A O TRP 240.A H 2.960 2.091 THR 241.A N LEU 238.A O THR 241.A H 3.206 2.463 THR 241.A OG1 LEU 238.A O THR 241.A HG1 2.683 2.014 GLU 245.A N ASP 243.A OD1 GLU 245.A H 3.038 2.102 ASN 246.A N ASP 243.A O ASN 246.A H 3.141 2.336 ARG 247.A N VAL 244.A O ARG 247.A H 3.339 2.445 ARG 247.A NE THR 241.A O ARG 247.A HE 2.845 1.901 ARG 247.A NH1 GLU 173.A OE1 ARG 247.A HH12 3.554 2.775 ARG 247.A NH1 GLU 173.A OE2 ARG 247.A HH12 2.794 1.810 ARG 247.A NH1 LYS 183.A O ARG 247.A HH11 2.952 1.959 ARG 247.A NH2 GLU 173.A OE1 ARG 247.A HH22 2.903 1.905 ARG 247.A NH2 THR 241.A O ARG 247.A HH21 3.033 2.180 ARG 247.A NH2 TYR 242.A O ARG 247.A HH21 3.058 2.370 PHE 250.A N GLU 119.A OE2 PHE 250.A H 2.856 1.867 ALA 251.A N GLU 119.A OE1 ALA 251.A H 3.318 2.502 VAL 253.A N GLY 249.A O VAL 253.A H 3.117 2.162 GLU 254.A N PHE 250.A O GLU 254.A H 2.835 1.828 LEU 255.A N ALA 251.A O LEU 255.A H 3.315 2.351 ARG 256.A N ALA 252.A O ARG 256.A H 3.491 2.586 LEU 257.A N GLU 254.A O LEU 257.A H 3.156 2.171 ARG 258.A N LEU 255.A O ARG 258.A H 3.228 2.224 ARG 258.A NE GLU 254.A OE1 ARG 258.A HE 3.348 2.607 ARG 258.A NE GLU 254.A OE2 ARG 258.A HE 2.908 1.908 ARG 258.A NH2 GLU 254.A OE1 ARG 258.A HH21 2.914 2.059