Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 4ywp_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.934 2.092 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 3.174 2.461 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD21 3.103 2.373 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.778 1.938 HIS 12.A NE2 LYS 6.A O HIS 12.A HE2 2.869 2.192 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.369 2.554 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.047 2.357 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.114 2.467 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.144 2.296 LYS 15.A NZ HIS 12.A ND1 LYS 15.A HZ1 2.787 1.929 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.906 2.147 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.894 2.038 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.172 2.316 GLY 22.A N ILE 19.A O GLY 22.A H 2.725 1.957 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.973 2.136 ARG 24.A NE GLY 192.A O ARG 24.A HE 2.990 2.244 ARG 24.A NH1 PRO 134.A O ARG 24.A HH12 3.420 2.780 ARG 24.A NH2 PRO 134.A O ARG 24.A HH22 3.154 2.447 ARG 24.A NH2 GLY 192.A O ARG 24.A HH21 2.960 2.218 ARG 24.A NH2 VAL 203.A O ARG 24.A HH21 3.025 2.435 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE22 3.155 2.300 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE21 3.051 2.207 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.886 2.161 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.548 3.175 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.778 1.926 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.835 2.009 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD1 THR 32.A HG1 3.387 2.604 THR 32.A OG1 ASP 107.A OD2 THR 32.A HG1 2.685 2.122 HIS 33.A N ASP 31.A OD2 HIS 33.A H 3.048 2.392 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.178 2.513 THR 34.A N ASP 31.A OD2 THR 34.A H 3.045 2.302 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 3.040 2.285 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.275 2.547 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.935 2.103 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.889 2.097 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.085 2.246 SER 45.A N LYS 77.A O SER 45.A H 2.894 2.043 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.924 2.077 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD1 GLN 50.A HE21 2.889 2.062 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.096 2.256 LEU 54.A N THR 66.A O LEU 54.A H 2.768 1.949 ARG 55.A N THR 66.A OG1 ARG 55.A H 3.130 2.415 ARG 55.A NH2 SER 169.A OG ARG 55.A HH21 2.870 2.030 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.973 2.146 LEU 57.A N GLN 64.A O LEU 57.A H 2.871 2.126 ASN 58.A N LYS 168.A O ASN 58.A H 2.919 2.077 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD21 3.225 2.408 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD22 3.076 2.223 ASN 59.A N SER 62.A O ASN 59.A H 3.209 2.441 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.725 1.885 HIS 61.A N ASN 59.A OD1 HIS 61.A H 2.912 2.071 SER 62.A N ASN 59.A OD1 SER 62.A H 2.809 2.070 GLN 64.A N LEU 57.A O GLN 64.A H 2.904 2.201 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.868 2.080 THR 66.A N ARG 55.A O THR 66.A H 2.852 2.022 PHE 67.A N LEU 88.A O PHE 67.A H 2.832 2.099 ASP 68.A N THR 52.A O ASP 68.A H 2.988 2.166 SER 70.A N ASP 68.A OD1 SER 70.A H 3.036 2.199 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.942 2.147 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.827 1.990 LYS 77.A N SER 45.A O LYS 77.A H 2.956 2.128 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.153 2.402 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.846 2.006 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.001 2.205 TYR 85.A OH ASP 135.A O TYR 85.A HH 3.037 2.293 ARG 86.A N TRP 120.A O ARG 86.A H 2.838 2.048 ARG 86.A NE ASP 72.A OD1 ARG 86.A HE 2.746 1.926 ARG 86.A NH1 ASP 69.A O ARG 86.A HH11 3.081 2.308 ARG 86.A NH2 ASP 72.A OD1 ARG 86.A HH21 3.139 2.458 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.877 2.019 LEU 88.A N VAL 118.A O LEU 88.A H 2.918 2.064 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.972 2.202 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.035 2.268 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.785 1.925 PHE 92.A N SER 62.A OG PHE 92.A H 3.177 2.403 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.868 2.091 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.771 1.925 HIS 93.A NE2 HIS 116.A ND1 no hydrogen 3.099 N/A TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.839 1.997 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.776 2.096 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.052 2.326 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.371 2.529 GLN 100.A NE2 ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE21 2.842 2.082 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.954 2.217 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.865 2.115 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.881 2.190 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.779 1.927 THR 105.A OG1 ASP 29.A OD1 THR 105.A HG1 2.679 1.925 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.068 2.278 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.872 2.038 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.800 1.991 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.858 2.025 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.276 2.536 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.868 2.091 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.781 1.933 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.890 2.037 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.714 1.890 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.934 2.088 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.845 1.989 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.949 2.189 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.035 2.268 TRP 120.A N ARG 86.A O TRP 120.A H 2.997 2.244 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.691 1.957 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.766 1.959 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD21 3.047 2.197 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.967 2.122 THR 122.A OG1 THR 84.A O THR 122.A HG1 3.374 2.606 LYS 123.A N ASN 121.A OD1 LYS 123.A H 3.120 2.271 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.028 2.171 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.160 2.396 ASP 126.A N TYR 124.A O ASP 126.A H 2.900 2.204 LYS 129.A N ASP 126.A O LYS 129.A H 3.175 2.555 LYS 129.A N ASP 126.A OD1 LYS 129.A H 2.939 2.182 ALA 130.A N ASP 126.A O ALA 130.A H 2.990 2.181 VAL 131.A N VAL 127.A O VAL 131.A H 2.917 2.143 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.126 2.331 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.021 2.215 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.094 2.320 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.859 2.075 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.879 2.079 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.138 2.376 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.962 2.153 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.836 2.002 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.890 2.100 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.911 2.060 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.955 2.126 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.774 1.948 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.073 2.246 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 3.028 2.219 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.116 2.291 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD1 GLN 154.A HE21 3.153 2.537 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE21 3.262 2.441 LYS 155.A NZ ASN 174.A O LYS 155.A HZ2 3.027 2.446 VAL 156.A N LEU 153.A O VAL 156.A H 3.007 2.403 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.126 2.293 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.944 2.166 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.140 2.321 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.315 2.472 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.920 2.106 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 2.999 2.148 GLU 166.A N ASN 228.A O GLU 166.A H 3.006 2.180 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.878 2.025 LYS 168.A N THR 165.A O LYS 168.A H 3.094 2.242 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.903 2.127 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 3.039 2.192 THR 173.A N ASP 171.A OD2 THR 173.A H 3.205 2.479 THR 173.A OG1 ASP 171.A OD2 THR 173.A HG1 3.107 2.375 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.967 2.153 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 3.052 2.239 ARG 178.A NE ASP 176.A OD2 ARG 178.A HE 3.136 2.406 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD2 ARG 178.A HH12 2.963 2.339 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 2.906 2.126 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.185 2.334 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.029 2.187 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.374 2.529 GLU 183.A N GLU 210.A OE2 GLU 183.A H 3.009 2.242 SER 184.A N GLU 210.A OE1 SER 184.A H 2.920 2.102 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.019 2.168 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.931 2.108 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.870 2.042 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.855 2.101 THR 189.A OG1 TRP 205.A O THR 189.A HG1 2.742 1.977 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.288 2.551 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.812 1.952 LEU 194.A N ALA 200.A O LEU 194.A H 2.931 2.144 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.617 1.822 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.832 2.055 CYS 202.A SG ALA 200.A O CYS 202.A HG 3.676 2.531 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.270 2.425 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.865 2.033 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.990 2.164 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.901 2.085 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.992 2.143 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.809 1.968 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.902 2.066 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 3.014 2.183 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.887 2.120 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.891 2.066 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 2.998 2.180 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.822 2.057 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.165 2.355 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE22 3.021 2.174 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE21 2.921 2.103 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.101 2.272 LEU 220.A N SER 216.A O LEU 220.A H 2.860 2.057 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.269 2.527 LYS 221.A N GLN 218.A O LYS 221.A H 3.197 2.548 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.263 2.552 ARG 223.A N LEU 220.A O ARG 223.A H 3.173 2.510 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.857 2.074 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.538 2.898 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.819 1.961 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.251 2.407 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.254 2.407 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.779 2.051 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.682 1.844 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD21 3.108 2.264 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 3.258 2.415 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.106 2.283 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.633 1.827 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.742 1.887 ASP 239.A N TRP 94.A O ASP 239.A H 2.886 2.282 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O ASN 240.A HD21 2.949 2.108 ASN 240.A ND2 PHE 92.A O ASN 240.A HD22 3.519 2.927 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.106 2.264 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.827 1.979 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.773 1.954 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.825 2.085 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.232 2.576 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.249 2.591 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.842 2.019 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE21 2.875 2.037 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ2 2.895 2.099 ARG 250.A N LYS 248.A O ARG 250.A H 2.989 2.319 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.793 1.953 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.044 2.324 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.870 2.038 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.843 2.049 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.902 2.212 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.530 2.900 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.996 2.149 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.892 2.054 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.864 2.052