Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5jes_B.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): TRP 3.A NE1 HIS 1.A ND1 TRP 3.A HE1 3.173 2.414 GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.870 2.042 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.848 2.079 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.205 2.452 GLU 12.A N GLU 12.A OE1 GLU 12.A H 2.735 1.895 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H 2.753 1.906 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.287 2.458 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.097 2.375 TRP 14.A NE1 ASN 9.A O TRP 14.A HE1 3.131 2.467 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.127 2.285 LYS 16.A NZ HIS 13.A ND1 LYS 16.A HZ1 2.974 2.154 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.181 2.535 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.846 2.088 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H 2.865 2.011 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.136 2.277 GLY 23.A N ILE 20.A O GLY 23.A H 2.762 2.000 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 2.970 2.139 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 2.946 2.210 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.363 2.698 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.178 2.463 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 2.945 2.220 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 3.004 2.405 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE22 3.140 2.287 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE21 3.058 2.210 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.874 2.149 SER 27.A OG TYR 191.A OH SER 27.A HG 2.784 2.105 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.776 1.922 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H 2.817 1.989 HIS 34.A N ASP 32.A OD1 HIS 34.A H 3.029 2.351 THR 35.A N ASP 32.A O THR 35.A H 3.119 2.395 THR 35.A N ASP 32.A OD1 THR 35.A H 3.231 2.545 ALA 36.A N ASP 32.A O ALA 36.A H 3.062 2.320 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 3.287 2.593 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 2.907 2.076 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 2.866 2.068 SER 41.A OG ASP 39.A OD1 SER 41.A HG 2.614 1.805 SER 41.A OG ASP 39.A OD2 SER 41.A HG 3.227 2.566 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.048 2.200 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.839 1.999 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 2.860 2.008 TYR 49.A OH HIS 120.A NE2 TYR 49.A HH 2.745 1.938 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.053 2.197 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.694 2.049 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.791 1.969 ARG 56.A NE GLU 67.A OE2 ARG 56.A HE 2.767 1.946 ARG 56.A NH1 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH11 2.849 2.018 ARG 56.A NH1 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH11 3.222 2.557 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.910 2.079 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.886 2.109 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.913 2.070 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.087 2.258 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.147 2.301 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.080 2.280 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.819 2.005 HIS 62.A N ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.B 2.927 2.080 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H 2.931 2.143 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.839 2.052 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.871 2.066 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.818 1.964 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.934 2.105 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.841 2.006 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 3.019 2.187 SER 71.A OG ASP 69.A OD1 SER 71.A HG 2.706 1.926 LYS 74.A NZ.A THR 53.A OG1 no hydrogen 3.101 N/A LYS 74.A NZ.A ASP 69.A OD2 no hydrogen 3.371 N/A LYS 74.A NZ.B GLN 72.A OE1 no hydrogen 2.806 N/A VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 3.009 2.212 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.781 1.948 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.975 2.153 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.077 2.307 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.871 2.036 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 2.966 2.159 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 2.981 2.336 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.825 2.012 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1.A ARG 87.A HE 2.841 2.031 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.986 2.176 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1.A ARG 87.A HH21 3.032 2.307 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.835 1.980 ILE 89.A N THR 119.A O ILE 89.A H 2.939 2.091 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.955 2.189 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.056 2.279 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.770 1.910 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.881 2.083 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.731 1.885 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.822 1.989 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.788 2.114 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.029 2.304 SER 97.A OG ASP 240.A OD1 SER 97.A HG 3.547 2.721 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.351 2.509 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE21 2.800 1.990 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD2 GLN 101.A HE21 3.378 2.760 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 2.987 2.262 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.766 2.227 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.852 2.148 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.775 2.070 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.750 1.903 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.682 1.904 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.074 2.284 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.843 2.005 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.779 1.972 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.845 2.014 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 2.895 2.098 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.085 2.474 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.880 2.110 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.770 1.925 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.834 1.977 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.657 1.829 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.923 2.080 THR 119.A N GLN 90.A O THR 119.A H 2.867 2.009 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.925 2.191 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.047 2.280 TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.929 2.163 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.796 2.018 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.750 1.924 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.091 2.248 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 2.953 2.103 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.102 2.252 LYS 124.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 124.A HZ1 3.125 2.403 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.075 2.217 TYR 125.A OH ASP 136.A OD1 TYR 125.A HH 2.614 1.810 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.057 2.234 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.897 2.198 LYS 130.A N ASP 127.A O LYS 130.A H 3.212 2.609 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.803 2.061 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 2.936 2.136 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.023 2.237 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.112 2.308 GLN 133.A NE2 GLY 129.A O GLN 133.A HE21 2.992 2.136 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 2.998 2.190 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.127 2.394 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.834 2.018 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.859 2.045 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.175 2.402 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.958 2.132 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.798 1.962 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.867 2.078 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.919 2.070 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.912 2.081 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.717 1.888 SER 149.A OG.B SER 214.A OG.A SER 149.A HG.B 3.351 2.678 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 3.007 2.163 LYS 151.A NZ LEU 182.A O LYS 151.A HZ1 3.386 2.496 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.026 2.193 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.125 2.278 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE21 2.986 2.306 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD2 GLN 155.A HE21 3.236 2.442 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 2.975 2.374 VAL 158.A N.A LEU 154.A O VAL 158.A H.A 3.104 2.303 VAL 158.A N.B LEU 154.A O VAL 158.A H.B 3.103 2.297 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H.B 2.876 2.051 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.174 2.394 LEU 161.A N VAL 158.A O.A LEU 161.A H 3.366 2.542 LEU 161.A N VAL 158.A O.B LEU 161.A H 3.196 2.365 SER 163.A N VAL 160.A O SER 163.A H 2.918 2.106 SER 163.A OG VAL 160.A O SER 163.A HG 2.693 1.861 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 2.999 2.176 LYS 165.A NZ GLU 235.A OE2 LYS 165.A HZ1 3.457 2.798 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.905 2.074 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.765 1.923 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H 3.114 2.270 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.883 2.103 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 2.962 2.120 THR 174.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 174.A HG1 3.240 2.716 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.908 2.060 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 2.971 2.153 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.030 2.200 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.204 2.494 ARG 179.A NH1 ASP 50.A OD1.B ARG 179.A HH12 3.171 2.490 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.913 2.131 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.158 2.311 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 2.987 2.148 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.348 2.493 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.857 2.041 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.046 2.188 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.941 2.109 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 2.904 2.083 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.860 2.032 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.836 2.064 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.731 1.941 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.278 2.537 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.786 1.926 SER 194.A N SER 27.A OG SER 194.A H 2.894 2.062 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.764 1.972 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 2.951 2.144 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.584 1.766 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.882 2.100 CYS 203.A N LEU 201.A O CYS 203.A H 3.037 2.409 CYS 203.A SG LEU 201.A O CYS 203.A HG 3.714 2.565 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.257 2.420 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.852 2.012 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.992 2.175 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.930 2.124 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.979 2.138 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.832 1.990 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.903 2.070 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 2.963 2.129 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.837 2.054 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.870 2.035 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.019 2.192 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.791 2.014 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.130 2.322 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE22 2.960 2.108 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE21 2.971 2.144 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H 3.122 2.300 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.870 2.059 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 3.284 2.555 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H 3.157 2.494 ARG 224.A N VAL 220.A O ARG 224.A H 3.191 2.433 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.809 2.034 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.817 1.957 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.206 2.377 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.186 2.346 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.777 1.989 ASN 227.A ND2 GLU 235.A OE2 ASN 227.A HD21 2.877 2.024 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.873 2.057 ASN 229.A ND2 ASN 227.A OD1 ASN 229.A HD21 3.251 2.515 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.983 2.153 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.802 2.012 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.109 2.269 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H 2.740 1.887 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.785 1.930 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O ASN 241.A HD22 2.823 1.976 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 3.014 2.174 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.783 1.942 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.762 1.942 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.809 2.100 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.224 2.556 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.303 2.661 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.738 1.931 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE21 2.829 1.996 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ2 3.097 2.241 LYS 249.A NZ GLU 24.A OE2 LYS 249.A HZ3 3.293 2.460 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.815 1.959 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.025 2.301 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.880 2.038 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.816 2.019 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.885 2.190 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.558 2.934 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 2.959 2.114 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.877 2.030 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.850 2.032