Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 5p1j_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N SER 151.A O SER 1.A H3 2.843 2.009 SER 1.A N ASP 153.A OD2 SER 1.A H2 2.778 1.899 GLY 3.A N PHE 171.A O GLY 3.A H 2.965 2.171 SER 4.A N GLY 97.A O SER 4.A H 2.970 2.152 SER 4.A OG ASN 170.A OD1 SER 4.A HG 2.637 1.846 ALA 5.A N TYR 169.A O ALA 5.A H 2.929 2.089 THR 7.A N GLY 167.A O THR 7.A H 2.832 2.013 THR 7.A OG1 ILE 18.A O THR 7.A HG1 3.483 2.877 THR 7.A OG1 THR 19.A OG1 THR 7.A HG1 2.866 2.208 THR 8.A N ILE 18.A O THR 8.A H 2.907 2.112 ILE 10.A N ALA 16.A O ILE 10.A H 2.889 2.089 LEU 13.A N ASP 11.A OD2 LEU 13.A H 3.015 2.243 ASP 14.A N ASP 11.A O ASP 14.A H 3.269 2.417 ASP 15.A N ASP 11.A OD2 ASP 15.A H 3.041 2.191 TYR 17.A OH GLY 162.A O TYR 17.A HH 2.667 1.865 ILE 18.A N THR 8.A O ILE 18.A H 2.872 2.045 THR 19.A N LEU 32.A O THR 19.A H 2.869 2.081 VAL 21.A N LEU 30.A O VAL 21.A H 2.803 2.026 GLN 22.A N SER 95.A O GLN 22.A H 2.921 2.103 GLN 22.A NE2 THR 29.A OG1 GLN 22.A HE21 3.030 2.199 ILE 23.A N GLN 28.A O ILE 23.A H 2.817 1.994 GLY 24.A N THR 93.A O GLY 24.A H 2.810 1.973 THR 25.A N SER 64.A OG THR 25.A H 3.018 2.219 THR 25.A OG1 THR 66.A OG1 THR 25.A HG1 2.772 2.116 GLN 28.A N ILE 23.A O GLN 28.A H 2.796 1.980 GLN 28.A NE2 THR 60.A O GLN 28.A HE22 2.987 2.134 LEU 30.A N VAL 21.A O LEU 30.A H 2.934 2.120 ASN 31.A N ASP 123.A OD2 ASN 31.A H 2.795 1.937 LEU 32.A N THR 19.A O LEU 32.A H 2.933 2.098 ASP 33.A N GLY 124.A O ASP 33.A H 2.916 2.082 ASP 35.A N LEU 126.A O ASP 35.A H 2.870 2.046 THR 36.A N THR 220.A OG1 THR 36.A H 2.890 2.092 THR 36.A OG1 ALA 218.A O THR 36.A HG1 2.766 2.214 GLY 37.A N ASP 35.A OD1 GLY 37.A H 2.933 2.115 SER 38.A N ASP 35.A O SER 38.A H 3.282 2.428 SER 38.A OG ASP 35.A OD2 SER 38.A HG 2.567 1.934 SER 39.A OG PHE 130.A O SER 39.A HG 2.686 1.901 TRP 42.A N LEU 125.A O TRP 42.A H 2.954 2.246 VAL 43.A N GLU 107.A O VAL 43.A H 2.895 2.113 PHE 44.A N ASP 123.A O PHE 44.A H 2.932 2.106 SER 45.A N THR 48.A OG1 SER 45.A H 2.869 2.059 SER 45.A OG SER 108.A OG SER 45.A HG 2.688 1.883 SER 46.A N TYR 59.A O SER 46.A H 2.927 2.194 GLU 47.A N SER 45.A OG GLU 47.A H 2.992 2.195 THR 48.A N SER 45.A O THR 48.A H 3.101 2.262 THR 48.A OG1 ALA 109.A O THR 48.A HG1 2.734 2.037 THR 49.A N LYS 110.A O THR 49.A H 2.943 2.087 THR 49.A OG1 LYS 110.A O THR 49.A HG1 2.863 2.034 GLU 52.A N THR 49.A O GLU 52.A H 2.823 1.995 VAL 53.A N ALA 50.A O VAL 53.A H 3.108 2.255 ASP 54.A N GLN 56.A OE1 ASP 54.A H 2.758 1.942 GLN 56.A N GLN 56.A OE1 GLN 56.A H 2.847 2.084 GLN 56.A NE2 THR 117.A O GLN 56.A HE22 3.011 2.176 GLN 56.A NE2 ASP 119.A O GLN 56.A HE21 2.923 2.143 THR 57.A N ASP 123.A OD1 THR 57.A H 2.891 2.109 TYR 59.A N PHE 44.A O TYR 59.A H 2.941 2.093 TYR 59.A OH ASP 92.A OD1 TYR 59.A HH 2.711 1.924 THR 60.A N GLN 28.A OE1 THR 60.A H 2.824 1.992 LYS 63.A N THR 60.A O LYS 63.A H 3.054 2.233 SER 64.A N PRO 61.A O SER 64.A H 2.951 2.105 SER 64.A OG ASP 92.A OD1 SER 64.A HG 2.784 1.987 SER 64.A OG ASP 92.A OD2 SER 64.A HG 3.323 2.691 THR 65.A N THR 25.A O THR 65.A H 2.842 2.033 THR 66.A N SER 64.A OG THR 66.A H 3.409 2.623 THR 66.A OG1 ASP 92.A OD2 THR 66.A HG1 2.653 1.913 ALA 67.A N SER 64.A O ALA 67.A H 3.319 2.486 LYS 68.A N THR 91.A O LYS 68.A H 2.977 2.181 LEU 70.A N VAL 89.A O LEU 70.A H 2.849 2.003 ALA 73.A N LEU 70.A O ALA 73.A H 3.113 2.262 THR 74.A N SER 137.A O THR 74.A H 2.876 2.054 TRP 75.A N GLY 87.A O TRP 75.A H 3.015 2.236 TRP 75.A NE1 SER 108.A O TRP 75.A HE1 3.188 2.426 SER 76.A N THR 135.A OG1 SER 76.A H 3.331 2.552 ILE 77.A N SER 85.A O ILE 77.A H 2.928 2.096 TYR 79.A N SER 83.A O TYR 79.A H 2.825 1.986 GLY 82.A N TYR 79.A O GLY 82.A H 2.854 2.005 SER 83.A N ASP 81.A OD1 SER 83.A H 3.032 2.179 SER 83.A OG ASP 81.A OD1 SER 83.A HG 2.743 1.950 SER 85.A N ILE 77.A O SER 85.A H 3.142 2.362 SER 86.A N LYS 111.A O SER 86.A H 2.974 2.181 GLY 87.A N TRP 75.A O GLY 87.A H 3.038 2.249 ASP 88.A N SER 108.A O ASP 88.A H 3.101 2.459 TYR 90.A N VAL 106.A O TYR 90.A H 2.922 2.066 TYR 90.A OH GLU 47.A OE2 TYR 90.A HH 2.693 1.881 THR 91.A N LYS 68.A O THR 91.A H 2.838 2.042 ASP 92.A N GLN 104.A O ASP 92.A H 2.978 2.223 THR 93.A N ASP 92.A OD2 THR 93.A H 2.736 2.003 VAL 94.A N VAL 101.A O VAL 94.A H 2.905 2.065 SER 95.A N GLN 22.A O SER 95.A H 2.827 2.008 VAL 96.A N LEU 99.A O VAL 96.A H 2.858 2.061 LEU 99.A N VAL 96.A O LEU 99.A H 2.959 2.104 THR 100.A OG1 SER 95.A OG THR 100.A HG1 2.695 1.861 VAL 101.A N VAL 94.A O VAL 101.A H 2.795 1.939 GLN 104.A N ASP 92.A O GLN 104.A H 2.999 2.328 GLN 104.A NE2 ALA 105.A O GLN 104.A HE21 3.127 2.302 GLN 104.A NE2 LYS 142.A O GLN 104.A HE22 3.218 2.443 VAL 106.A N TYR 90.A O VAL 106.A H 2.709 1.859 GLU 107.A N LEU 41.A O GLU 107.A H 2.878 2.032 SER 108.A N ASP 88.A O SER 108.A H 2.803 2.057 ALA 109.A N VAL 43.A O ALA 109.A H 2.992 2.142 LYS 110.A N SER 86.A O LYS 110.A H 2.759 1.986 LYS 111.A N SER 86.A O LYS 111.A H 3.145 2.305 VAL 112.A N GLU 52.A OE1 VAL 112.A H 2.970 2.158 SER 113.A N SER 84.A O SER 113.A H 2.819 2.052 SER 113.A OG SER 84.A O SER 113.A HG 3.274 2.543 PHE 116.A N SER 113.A O PHE 116.A H 2.962 2.272 THR 117.A N SER 113.A O THR 117.A H 3.282 2.457 THR 117.A OG1 GLU 52.A O THR 117.A HG1 2.688 1.883 GLU 118.A N SER 114.A O GLU 118.A H 2.842 2.050 ASP 119.A N PHE 116.A O ASP 119.A H 3.062 2.269 THR 121.A N ASP 119.A OD1 THR 121.A H 3.161 2.341 THR 121.A OG1 ASP 119.A OD1 THR 121.A HG1 2.844 2.015 ILE 122.A N ASP 119.A O ILE 122.A H 3.478 2.627 ASP 123.A N ASN 31.A O ASP 123.A H 2.894 2.048 LEU 125.A N TRP 42.A O LEU 125.A H 2.904 2.194 LEU 126.A N ASP 33.A O LEU 126.A H 2.989 2.162 GLY 127.A N ASP 40.A O GLY 127.A H 3.034 2.379 LEU 128.A N ASP 35.A O LEU 128.A H 2.830 2.017 ALA 129.A N SER 38.A O ALA 129.A H 2.878 2.019 PHE 130.A N GLY 193.A O PHE 130.A H 3.063 2.212 LEU 133.A N PHE 130.A O LEU 133.A H 3.045 2.185 ASN 134.A N SER 131.A O ASN 134.A H 2.968 2.117 ASN 134.A ND2 SER 39.A O ASN 134.A HD22 3.000 2.149 ASN 134.A ND2 GLU 107.A OE1 ASN 134.A HD21 3.023 2.276 THR 135.A N ASP 40.A OD1 THR 135.A H 3.025 2.265 THR 135.A N ASP 40.A OD2 THR 135.A H 3.433 2.617 THR 135.A OG1 ASP 40.A OD2 THR 135.A HG1 2.734 1.910 VAL 136.A N ASN 134.A OD1 VAL 136.A H 2.974 2.150 SER 137.A N THR 74.A O SER 137.A H 2.864 2.033 GLN 140.A NE2 THR 132.A O GLN 140.A HE22 2.970 2.314 GLN 140.A NE2 ASN 134.A O GLN 140.A HE21 2.955 2.117 GLN 141.A N ASN 134.A OD1 GLN 141.A H 2.886 2.032 GLN 141.A NE2 THR 139.A O GLN 141.A HE21 2.929 2.076 THR 143.A N SER 131.A OG THR 143.A H 3.011 2.187 ASP 146.A N THR 143.A OG1 ASP 146.A H 2.960 2.114 ASN 147.A N THR 143.A O ASN 147.A H 2.934 2.094 ASN 147.A ND2 GLN 104.A OE1 ASN 147.A HD22 2.794 1.968 ALA 148.A N PHE 144.A O ALA 148.A H 2.939 2.172 LYS 149.A N PHE 145.A O LYS 149.A H 2.896 2.291 SER 151.A N ALA 148.A O SER 151.A H 2.911 2.166 LEU 152.A N LYS 149.A O LEU 152.A H 3.118 2.364 ASP 153.A N SER 1.A O ASP 153.A H 2.971 2.192 SER 154.A N GLY 172.A O SER 154.A H 3.137 2.543 VAL 156.A N SER 154.A O VAL 156.A H 2.800 2.120 PHE 157.A N PHE 317.A O PHE 157.A H 3.050 2.241 THR 158.A N ASN 170.A O THR 158.A H 2.827 2.040 ALA 159.A N VAL 315.A O ALA 159.A H 2.868 2.060 ASP 160.A N THR 168.A O ASP 160.A H 2.894 2.136 HIS 164.A N ASP 14.A OD1 HIS 164.A H 3.207 2.553 HIS 164.A N ASP 14.A OD2 HIS 164.A H 2.806 1.958 GLY 167.A N THR 7.A O GLY 167.A H 2.779 1.945 THR 168.A N ASP 160.A O THR 168.A H 2.889 2.100 TYR 169.A N ALA 5.A O TYR 169.A H 2.886 2.071 ASN 170.A N THR 158.A O ASN 170.A H 3.124 2.362 PHE 171.A N GLY 3.A O PHE 171.A H 2.793 1.944 GLY 172.A N VAL 156.A O GLY 172.A H 2.815 1.978 THR 177.A N ASP 175.A OD2 THR 177.A H 2.894 2.071 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD1 THR 177.A HG1 3.407 2.839 THR 177.A OG1 ASP 175.A OD2 THR 177.A HG1 2.678 1.842 ALA 178.A N ASP 175.A O ALA 178.A H 3.032 2.197 THR 180.A N SER 329.A O THR 180.A H 2.912 2.095 THR 184.A N PHE 327.A O THR 184.A H 2.906 2.063 THR 186.A N LEU 325.A O THR 186.A H 2.788 2.046 SER 189.A N GLU 196.A O SER 189.A H 2.839 2.057 LYS 191.A N SER 189.A OG LYS 191.A H 3.299 2.448 GLY 193.A N THR 190.A O GLY 193.A H 2.880 2.051 TRP 195.A NE1 LEU 128.A O TRP 195.A HE1 2.864 2.022 TRP 197.A N GLY 216.A O TRP 197.A H 2.858 2.028 THR 198.A OG1 ASP 215.A OD2 THR 198.A HG1 2.546 1.831 SER 199.A N ILE 214.A O SER 199.A H 2.867 2.105 SER 199.A OG GLY 265.A O SER 199.A HG 2.752 1.937 THR 200.A N GLY 265.A O THR 200.A H 3.212 2.425 THR 200.A OG1 GLY 267.A O THR 200.A HG1 2.757 1.928 TYR 202.A N LYS 210.A O TYR 202.A H 3.070 2.313 ALA 203.A N THR 263.A O ALA 203.A H 2.939 2.162 GLY 205.A N SER 261.A O GLY 205.A H 2.782 1.931 GLY 207.A N VAL 204.A O GLY 207.A H 2.871 2.046 LYS 210.A N TYR 202.A O LYS 210.A H 2.751 1.898 THR 212.A N THR 200.A O THR 212.A H 3.045 2.266 ILE 214.A N SER 199.A O ILE 214.A H 2.915 2.100 GLY 216.A N TRP 197.A O GLY 216.A H 2.871 2.054 ILE 217.A N ASN 303.A O ILE 217.A H 2.973 2.208 ALA 218.A N TRP 195.A O ALA 218.A H 2.985 2.157 ASP 219.A N PHE 305.A O ASP 219.A H 2.986 2.133 THR 220.A N THR 36.A OG1 THR 220.A H 2.874 2.057 THR 220.A OG1 PHE 34.A O THR 220.A HG1 2.765 2.217 GLY 221.A N ASP 219.A OD2 GLY 221.A H 2.891 2.146 THR 222.A N ASP 219.A O THR 222.A H 3.247 2.391 THR 222.A OG1 ASP 219.A OD1 THR 222.A HG1 2.771 2.151 THR 223.A OG1 ASP 15.A O THR 223.A HG1 2.617 1.916 LEU 225.A N GLY 293.A O LEU 225.A H 3.052 2.193 TYR 226.A N ILE 304.A O TYR 226.A H 2.892 2.050 LEU 227.A N GLN 295.A O LEU 227.A H 2.990 2.200 VAL 232.A N PRO 228.A O VAL 232.A H 3.053 2.220 SER 233.A N ALA 229.A O SER 233.A H 2.891 2.055 ALA 234.A N THR 230.A O ALA 234.A H 3.099 2.264 TYR 235.A N VAL 231.A O TYR 235.A H 3.051 2.274 TYR 235.A OH PRO 260.A O TYR 235.A HH 2.718 1.886 TRP 236.A N VAL 232.A O TRP 236.A H 3.029 2.188 TRP 236.A NE1 ILE 294.A O TRP 236.A HE1 2.876 2.051 ALA 237.A N SER 233.A O ALA 237.A H 2.954 2.179 GLN 238.A N TYR 235.A O GLN 238.A H 3.012 2.168 VAL 239.A N TRP 236.A O VAL 239.A H 2.995 2.155 ALA 242.A N VAL 239.A O ALA 242.A H 3.091 2.238 LYS 243.A N VAL 252.A O LYS 243.A H 2.988 2.172 SER 245.A N GLY 250.A O SER 245.A H 2.855 1.996 VAL 248.A N SER 245.A OG VAL 248.A H 3.022 2.196 GLY 249.A N SER 245.A O GLY 249.A H 2.865 2.035 GLY 250.A N SER 245.A O GLY 250.A H 3.107 2.362 TYR 251.A N GLN 295.A OE1 TYR 251.A H 2.780 1.964 VAL 252.A N LYS 243.A O VAL 252.A H 2.856 2.023 PHE 253.A N CYS 290.A O PHE 253.A H 2.872 2.104 CYS 255.A N SER 288.A O CYS 255.A H 2.875 2.025 CYS 255.A SG SER 287.A O no hydrogen 3.947 N/A ALA 257.A N PRO 254.A O ALA 257.A H 2.884 2.036 PHE 262.A N ILE 273.A O PHE 262.A H 2.924 2.123 THR 263.A N ALA 203.A O THR 263.A H 2.877 2.025 PHE 264.A N ILE 271.A O PHE 264.A H 2.927 2.138 GLY 265.A N GLY 201.A O GLY 265.A H 2.882 2.100 VAL 266.A N ALA 269.A O VAL 266.A H 2.961 2.135 ALA 269.A N VAL 266.A O ALA 269.A H 2.756 1.975 ARG 270.A NH1 GLY 267.A O ARG 270.A HH12 3.061 2.365 ARG 270.A NH1 ALA 269.A O ARG 270.A HH11 2.899 2.124 ILE 271.A N PHE 264.A O ILE 271.A H 2.912 2.062 ILE 273.A N PHE 262.A O ILE 273.A H 2.741 1.889 TYR 277.A N PRO 274.A O TYR 277.A H 2.946 2.184 ILE 278.A N GLY 275.A O ILE 278.A H 2.943 2.103 ASP 279.A N ASP 276.A O ASP 279.A H 3.283 2.430 PHE 280.A N PHE 291.A O PHE 280.A H 2.983 2.185 GLY 281.A N ASP 279.A OD2 GLY 281.A H 2.862 2.029 ILE 283.A N SER 289.A O ILE 283.A H 2.847 2.067 SER 287.A N SER 284.A O SER 287.A H 2.949 2.099 SER 289.A N SER 287.A OG SER 289.A H 2.967 2.111 CYS 290.A N PHE 253.A O CYS 290.A H 2.773 1.919 CYS 290.A SG ASP 279.A OD2 no hydrogen 3.900 N/A PHE 291.A N GLY 281.A O PHE 291.A H 2.811 2.011 GLY 292.A N TYR 251.A O GLY 292.A H 3.019 2.166 GLY 293.A N ILE 278.A O GLY 293.A H 2.717 2.039 GLN 295.A N LEU 225.A O GLN 295.A H 2.893 2.070 GLN 295.A NE2 TYR 251.A O GLN 295.A HE22 3.036 2.207 GLN 295.A NE2 GLY 292.A O GLN 295.A HE21 2.836 2.020 SER 297.A N LEU 227.A O SER 297.A H 2.828 2.012 SER 297.A OG ASN 303.A OD1 SER 297.A HG 2.590 1.782 ALA 298.A N SER 296.A OG ALA 298.A H 3.036 2.182 ILE 300.A N SER 297.A O ILE 300.A H 2.847 1.997 ASN 303.A ND2 ASP 215.A O ASN 303.A HD22 2.835 2.009 ILE 304.A N TYR 226.A O ILE 304.A H 2.871 2.075 PHE 305.A N ILE 217.A O PHE 305.A H 2.772 2.017 ASP 307.A N THR 222.A O ASP 307.A H 2.771 1.958 VAL 308.A N THR 223.A O VAL 308.A H 3.072 2.320 ALA 309.A N GLY 306.A O ALA 309.A H 2.983 2.346 LEU 310.A N GLY 306.A O LEU 310.A H 2.957 2.119 LYS 311.A N ASP 307.A O LYS 311.A H 2.809 1.962 LYS 311.A NZ ASP 14.A OD2 LYS 311.A HZ3 2.804 1.944 ALA 312.A N ALA 309.A O ALA 312.A H 3.140 2.344 ALA 313.A N LEU 310.A O ALA 313.A H 2.959 2.138 PHE 314.A N ALA 328.A O PHE 314.A H 2.835 2.018 VAL 315.A N ALA 159.A O VAL 315.A H 3.040 2.214 VAL 316.A N GLY 326.A O VAL 316.A H 2.786 1.957 PHE 317.A N PHE 157.A O PHE 317.A H 2.792 1.949 ASN 318.A N THR 324.A O ASN 318.A H 2.956 2.132 ASN 318.A ND2 THR 324.A OG1 ASN 318.A HD22 2.916 2.067 GLY 319.A N PRO 155.A O GLY 319.A H 2.746 2.006 ALA 320.A N ASN 318.A OD1 ALA 320.A H 3.078 2.278 THR 324.A N ASN 318.A O THR 324.A H 3.104 2.368 LEU 325.A N THR 186.A O LEU 325.A H 3.045 2.197 GLY 326.A N VAL 316.A O GLY 326.A H 2.827 2.010 PHE 327.A N THR 184.A O PHE 327.A H 2.931 2.114 ALA 328.A N PHE 314.A O ALA 328.A H 2.915 2.105 LYS 330.A NZ ASP 160.A OD2 LYS 330.A HZ2 2.759 1.926 LYS 330.A NZ LEU 161.A O LYS 330.A HZ1 2.802 2.050 LYS 330.A NZ LYS 311.A O LYS 330.A HZ1 3.147 2.559 LYS 330.A NZ ALA 313.A O LYS 330.A HZ3 2.802 1.945