Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.949 1.970 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.861 1.945 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.011 2.177 GLU 11.A N GLU 11.A OE1 GLU 11.A H 2.748 1.788 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.787 1.803 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.281 2.312 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.080 2.359 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.147 2.166 ASP 16.A N.B TRP 13.A O ASP 16.A H.B 3.234 2.549 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.899 2.008 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.868 1.870 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.136 2.142 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.616 1.741 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.953 2.113 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.868 1.917 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 2.997 2.272 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.093 2.242 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 2.997 2.159 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.861 2.024 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.788 1.786 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.831 1.901 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.819 1.869 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.120 2.161 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.982 2.063 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.359 2.472 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.941 1.972 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.880 1.959 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.125 2.162 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.451 2.483 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.874 1.883 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.876 1.885 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.859 1.876 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.158 2.429 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.073 2.080 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.790 1.817 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.787 1.857 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.302 2.644 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.874 2.036 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.924 1.960 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.937 2.030 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.925 1.938 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.930 1.944 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.072 2.153 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.205 2.226 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.097 2.146 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.570 2.985 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.823 1.847 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.933 1.949 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.902 1.971 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.969 2.000 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.861 1.938 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.847 1.904 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.820 1.811 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.955 2.009 ASP 68.A N.A THR 52.A O.A ASP 68.A H.A 2.846 1.881 ASP 68.A N.A THR 52.A O.B ASP 68.A H.A 2.863 1.894 ASP 68.A N.B THR 52.A O.A ASP 68.A H.B 2.898 1.942 ASP 68.A N.B THR 52.A O.B ASP 68.A H.B 2.909 1.942 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 3.502 2.547 SER 70.A N ASP 68.A OD1.B SER 70.A H 2.897 1.909 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.963 2.214 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.A LYS 73.A HZ3 2.902 2.083 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.B LYS 73.A HZ3 3.273 2.456 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.B LYS 73.A HZ1 2.827 2.038 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.979 2.044 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.831 1.851 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.933 1.969 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.963 1.988 LYS 77.A NZ.B SER 45.A OG LYS 77.A HZ3.B 2.854 1.995 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.124 2.229 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.852 1.872 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.014 2.081 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.846 1.902 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.843 1.884 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.673 1.772 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.398 1.428 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 3.266 2.557 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 2.826 1.973 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.114 2.384 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.835 1.987 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.A 3.011 2.336 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.623 1.809 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.839 2.116 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.836 1.828 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.915 1.911 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.952 2.050 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.048 2.118 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.767 1.910 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.883 1.933 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.766 1.933 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.819 1.833 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.848 2.214 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.399 2.561 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.034 2.145 GLN 100.A N.A LEU 97.A O GLN 100.A H.A 3.244 2.339 GLN 100.A N.B LEU 97.A O GLN 100.A H.B 3.231 2.223 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.B 2.910 2.137 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22.B 3.465 2.784 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.943 2.064 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.829 1.957 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.835 2.074 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.757 1.910 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.486 2.533 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.087 2.158 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.813 1.853 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.771 1.824 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.857 1.888 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.318 2.473 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.887 1.979 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.804 1.802 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.818 1.810 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.677 1.845 LEU 117.A N LEU 140.A O.A LEU 117.A H 2.901 1.901 LEU 117.A N LEU 140.A O.B LEU 117.A H 2.885 1.903 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.858 1.857 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.954 2.121 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 2.993 2.227 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.881 1.994 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.967 2.057 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.743 1.985 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.814 1.859 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.108 2.139 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.955 1.951 LYS 123.A N.A ASN 121.A OD1 LYS 123.A H.A 3.127 2.420 LYS 123.A N.B ASN 121.A OD1 LYS 123.A H.B 3.146 2.269 LYS 123.A NZ.B ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ2.B 2.899 2.082 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.040 2.037 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.131 2.201 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.875 2.048 LYS 129.A N.A ASP 126.A O.A LYS 129.A H.A 3.064 2.446 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.A 2.812 1.917 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.A 2.966 1.985 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.B 2.878 1.987 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.B 3.042 2.044 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.874 1.902 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.125 2.185 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.002 2.077 GLN 132.A N LYS 129.A O.A GLN 132.A H 3.221 2.296 GLN 132.A N LYS 129.A O.B GLN 132.A H 2.968 2.042 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.070 2.218 GLN 133.A N.A ALA 130.A O GLN 133.A H.A 2.966 1.985 GLN 133.A N.B ALA 130.A O GLN 133.A H.B 3.031 2.147 GLY 136.A N GLN 133.A O.A GLY 136.A H 2.941 2.100 GLY 136.A N GLN 133.A O.B GLY 136.A H 3.233 2.363 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.846 1.921 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.853 1.893 ILE 139.A N THR 204.A O ILE 139.A H 3.138 2.209 LEU 140.A N.A LEU 117.A O LEU 140.A H.A 2.873 1.883 LEU 140.A N.B LEU 117.A O LEU 140.A H.B 3.011 2.170 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.805 1.829 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.888 1.970 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.936 1.956 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.914 1.931 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.787 1.808 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.992 2.000 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.208 2.266 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.980 2.036 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.075 2.080 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.197 2.580 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.859 1.941 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.131 2.154 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.919 1.993 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.134 2.233 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.248 2.272 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.983 2.122 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.034 2.089 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ2 3.559 2.821 LYS 166.A N.A ASN 228.A O LYS 166.A H.A 2.905 1.925 LYS 166.A N.B ASN 228.A O LYS 166.A H.B 2.899 1.918 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.764 1.789 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.101 2.106 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.100 2.103 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.A 3.536 2.866 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.B 2.932 2.179 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.895 1.975 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.960 1.985 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.956 2.032 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.881 1.931 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.894 2.140 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.273 2.647 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.236 2.618 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.127 2.150 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.015 2.029 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.338 2.334 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H 2.987 2.077 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.951 1.965 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.860 1.923 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.038 2.034 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.942 1.963 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.861 1.880 THR 189.A N LYS 253.A O.A THR 189.A H 2.821 1.913 THR 189.A N LYS 253.A O.B THR 189.A H 2.840 1.925 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.254 2.359 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.773 1.766 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.919 1.979 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.565 1.767 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.837 1.971 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.101 2.118 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.867 1.880 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.946 2.005 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.954 2.163 ILE 206.A N ILE 139.A O ILE 206.A H 2.949 1.968 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.820 1.828 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.866 1.890 LYS 209.A N.A ASP 186.A O LYS 209.A H.A 3.060 2.102 LYS 209.A N.B ASP 186.A O LYS 209.A H.B 2.821 1.816 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.861 1.921 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.901 1.926 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.035 2.066 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.132 2.176 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.008 2.154 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.943 2.092 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.065 2.078 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.936 1.963 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.855 1.877 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.205 2.300 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.291 2.350 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.079 2.175 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.852 1.939 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.511 2.858 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.871 2.026 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.173 2.215 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.175 2.207 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.816 1.909 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.880 2.039 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.887 1.920 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.277 2.467 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.988 2.017 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.856 1.913 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.141 2.187 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.779 1.785 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.800 1.798 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.310 2.497 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.929 1.965 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.963 2.092 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.013 2.166 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.838 1.843 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.763 1.947 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.859 2.121 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.131 2.436 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.347 2.730 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.796 1.856 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.873 2.077 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.935 2.014 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.827 1.859 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.050 2.318 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.895 2.053 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.834 2.034 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.923 2.237 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.497 2.858 LYS 253.A N.A THR 189.A O LYS 253.A H.A 2.971 1.967 LYS 253.A N.B THR 189.A O LYS 253.A H.B 2.971 1.967 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.870 1.874 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.847 1.868