Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km2_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.950 1.981 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.873 1.975 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 2.969 2.142 GLU 11.A N GLU 11.A OE1 GLU 11.A H 2.731 1.776 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.802 1.821 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.277 2.302 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.079 2.364 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.141 2.481 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.154 2.176 ASP 16.A N.A TRP 13.A O ASP 16.A H.A 3.237 2.583 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.892 2.024 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.863 1.870 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.142 2.150 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.572 1.677 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.947 2.086 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.862 1.929 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 3.003 2.291 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.095 2.241 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.004 2.161 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.854 2.005 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.811 1.813 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.834 1.899 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.826 1.889 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.128 2.165 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.976 2.050 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.377 2.489 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.940 1.957 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.884 1.968 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.144 2.190 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.413 2.458 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.878 1.897 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.875 1.897 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.864 1.881 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.191 2.408 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.063 2.070 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.803 1.823 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.757 1.818 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.280 2.622 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.861 2.021 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.937 1.960 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.923 1.998 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.930 1.938 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.929 1.937 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.069 2.136 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.192 2.215 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.093 2.149 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.587 2.991 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.830 1.867 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.883 1.911 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.903 2.014 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.955 1.997 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.855 1.923 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.860 1.911 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.847 1.837 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.953 2.006 ASP 68.A N.A THR 52.A O.A ASP 68.A H.A 2.867 1.900 ASP 68.A N.A THR 52.A O.B ASP 68.A H.A 2.919 1.937 ASP 68.A N.B THR 52.A O.A ASP 68.A H.B 2.796 1.808 ASP 68.A N.B THR 52.A O.B ASP 68.A H.B 2.860 1.866 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 2.912 1.938 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.980 2.231 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.A LYS 73.A HZ3 2.881 1.992 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1.B LYS 73.A HZ3 3.241 2.414 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.A LYS 73.A HZ1 2.745 1.908 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.963 2.024 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.838 1.846 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.923 1.964 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.958 1.970 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.128 2.248 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.849 1.882 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 3.005 2.084 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.844 1.885 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.850 1.878 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.469 1.500 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.607 1.722 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.899 2.024 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 3.228 2.533 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.154 2.417 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.822 1.986 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 2.891 2.211 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.961 2.218 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.571 1.757 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.822 1.812 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.925 1.919 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.955 2.036 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.060 2.117 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.771 1.913 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.889 1.926 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.768 1.935 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.811 1.819 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.835 2.201 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.392 2.542 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.032 2.136 GLN 100.A N.A LEU 97.A O GLN 100.A H.A 3.211 2.337 GLN 100.A N.B LEU 97.A O GLN 100.A H.B 3.287 2.278 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD1 GLN 100.A HE22.B 2.918 2.079 GLN 100.A NE2.B ASP 239.A OD2 GLN 100.A HE22.B 3.474 2.822 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.941 2.061 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.829 1.976 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.828 2.063 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.749 1.901 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.463 2.496 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.084 2.142 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.812 1.843 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.778 1.845 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.864 1.906 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.307 2.459 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.877 1.961 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.791 1.785 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.817 1.808 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.683 1.849 LEU 117.A N LEU 140.A O.A LEU 117.A H 2.895 1.888 LEU 117.A N LEU 140.A O.B LEU 117.A H 2.912 1.928 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.860 1.865 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.953 2.142 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 2.991 2.225 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.870 1.956 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.955 2.029 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.723 1.968 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.785 1.822 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.097 2.128 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.945 1.938 LYS 123.A N.B ASN 121.A OD1 LYS 123.A H.B 3.195 2.469 LYS 123.A NZ.B ASP 135.A OD2 LYS 123.A HZ2.B 2.971 2.141 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 3.044 2.047 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.147 2.227 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.863 2.029 LYS 129.A N.A ASP 126.A O.A LYS 129.A H.A 2.951 2.322 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.A 2.737 1.872 LYS 129.A N.A ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.A 2.984 2.024 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H.B 2.901 1.984 LYS 129.A N.B ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H.B 3.177 2.173 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.852 1.880 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.152 2.208 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 3.027 2.105 GLN 132.A N LYS 129.A O.A GLN 132.A H 3.307 2.403 GLN 132.A N LYS 129.A O.B GLN 132.A H 2.921 2.021 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.065 2.214 GLN 133.A N.A ALA 130.A O GLN 133.A H.A 2.970 1.991 GLN 133.A N.B ALA 130.A O GLN 133.A H.B 3.035 2.161 GLY 136.A N GLN 133.A O.A GLY 136.A H 3.214 2.367 GLY 136.A N GLN 133.A O.B GLY 136.A H 2.929 2.092 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.838 1.912 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.864 1.889 ILE 139.A N THR 204.A O ILE 139.A H 3.140 2.203 LEU 140.A N.A LEU 117.A O LEU 140.A H.A 2.927 1.937 LEU 140.A N.B LEU 117.A O LEU 140.A H.B 2.971 2.078 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.796 1.807 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.882 1.951 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.932 1.954 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.910 1.921 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.767 1.772 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 2.995 2.001 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.197 2.239 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.993 2.047 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.087 2.094 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.185 2.491 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.855 1.945 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.124 2.136 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.896 1.984 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.150 2.265 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.258 2.285 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.964 2.089 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.047 2.104 LYS 164.A NZ GLU 234.A OE2 LYS 164.A HZ2 3.544 2.811 LYS 166.A N.A ASN 228.A O LYS 166.A H.A 2.920 1.932 LYS 166.A N.B ASN 228.A O LYS 166.A H.B 2.920 1.933 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.781 1.823 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.108 2.127 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.109 2.125 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.B 3.135 2.367 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.900 1.965 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.972 1.997 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.945 2.030 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.870 1.907 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.885 2.125 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.251 2.612 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.292 2.688 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.123 2.151 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.016 2.039 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.337 2.338 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.A GLU 183.A H 2.998 2.078 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.921 1.982 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.932 1.941 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.040 2.036 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.926 1.948 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.853 1.865 THR 189.A N LYS 253.A O.A THR 189.A H 2.879 1.943 THR 189.A N LYS 253.A O.B THR 189.A H 2.809 1.902 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.259 2.352 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.785 1.775 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.933 1.983 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.573 1.778 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.845 1.979 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.108 2.139 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.872 1.881 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.954 2.022 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.950 2.162 ILE 206.A N ILE 139.A O ILE 206.A H 2.951 1.976 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.833 1.836 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.858 1.872 LYS 209.A N.A ASP 186.A O LYS 209.A H.A 3.071 2.103 LYS 209.A N.B ASP 186.A O LYS 209.A H.B 2.811 1.803 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.866 1.926 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.903 1.915 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.032 2.052 GLU 217.A N GLU 217.A OE1 GLU 217.A H 2.917 2.056 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.156 2.195 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.015 2.158 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.943 2.101 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.078 2.086 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.925 1.959 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.881 1.908 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.197 2.297 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.293 2.345 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.098 2.188 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.844 1.926 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.505 2.850 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.859 2.010 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.147 2.197 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.176 2.217 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.819 1.932 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.891 1.975 PHE 227.A N GLU 235.A O PHE 227.A H 2.887 1.921 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.266 2.437 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 2.987 2.022 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.848 1.931 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.159 2.217 GLU 235.A N ASN 228.A OD1 GLU 235.A H 2.777 1.784 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.795 1.789 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.305 2.481 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.941 1.969 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.966 2.054 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.003 2.156 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.835 1.833 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.771 1.954 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.852 2.104 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.125 2.436 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.352 2.731 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.796 1.862 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.876 2.059 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.954 2.024 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.819 1.851 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.070 2.341 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.887 2.044 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.829 2.024 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.922 2.229 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.507 2.872 LYS 253.A N.A THR 189.A O LYS 253.A H.A 2.963 1.957 LYS 253.A N.B THR 189.A O LYS 253.A H.B 2.969 1.963 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.904 1.902 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.848 1.867