Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6km5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 3.A N ASN 8.A O GLY 3.A H 2.960 1.988 GLY 5.A N ASN 8.A OD1 GLY 5.A H 2.790 1.951 ASN 8.A N GLY 5.A O ASN 8.A H 3.376 2.518 ASN 8.A ND2 HIS 1.A O ASN 8.A HD22 3.088 2.242 GLU 11.A N.A GLU 11.A OE1.A GLU 11.A H.A 2.808 1.829 HIS 12.A N GLY 9.A O HIS 12.A H 2.778 1.802 TRP 13.A N PRO 10.A O TRP 13.A H 3.308 2.330 TRP 13.A NE1 GLY 3.A O TRP 13.A HE1 3.036 2.313 TRP 13.A NE1 ASN 8.A O TRP 13.A HE1 3.125 2.477 LYS 15.A N HIS 12.A O LYS 15.A H 3.134 2.172 PHE 17.A N TRP 13.A O PHE 17.A H 2.898 2.031 ALA 20.A N PHE 17.A O ALA 20.A H 2.855 1.862 LYS 21.A N PRO 18.A O LYS 21.A H 3.119 2.120 GLY 22.A N ILE 19.A O.A GLY 22.A H 2.708 1.849 GLY 22.A N ILE 19.A O.B GLY 22.A H 2.781 1.939 ARG 24.A N GLU 201.A OE2 ARG 24.A H 2.867 1.931 ARG 24.A NH2 GLU 201.A O ARG 24.A HH21 3.008 2.260 GLN 25.A NE2 LEU 199.A O GLN 25.A HE21 3.092 2.241 GLN 25.A NE2 GLU 201.A OE2 GLN 25.A HE22 3.044 2.205 SER 26.A N SER 193.A OG SER 26.A H 2.868 2.014 SER 26.A OG SER 193.A O SER 26.A HG 3.563 3.190 ILE 30.A N THR 105.A O ILE 30.A H 2.796 1.792 THR 32.A N ASP 107.A OD1 THR 32.A H 2.795 1.837 HIS 33.A N ASP 31.A OD1 HIS 33.A H 2.862 1.945 HIS 33.A ND1 ASP 31.A OD1 HIS 33.A HD1 2.914 2.190 THR 34.A N ASP 31.A O THR 34.A H 3.161 2.216 ALA 35.A N ASP 31.A O ALA 35.A H 2.998 2.078 LYS 36.A N ILE 252.A O LYS 36.A H 3.345 2.461 ASP 38.A N ALA 254.A O ASP 38.A H 2.942 1.968 SER 40.A N ASP 38.A OD1 SER 40.A H 2.868 1.975 LEU 41.A N ASP 38.A O LEU 41.A H 3.133 2.187 LYS 42.A N GLY 79.A O LYS 42.A H 3.519 2.538 SER 45.A N LYS 77.A O.A SER 45.A H 2.884 1.901 SER 45.A N LYS 77.A O.B SER 45.A H 2.884 1.902 SER 47.A N VAL 75.A O SER 47.A H 2.857 1.869 GLN 50.A NE2 ASP 49.A OD2.B GLN 50.A HE22 3.292 2.527 ALA 51.A N TYR 48.A O ALA 51.A H 3.100 2.117 LEU 54.A N GLU 66.A O LEU 54.A H 2.802 1.804 ARG 55.A NE GLU 66.A OE1 ARG 55.A HE 2.788 1.853 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE1 ARG 55.A HH21 3.253 2.570 ARG 55.A NH2 GLU 66.A OE2 ARG 55.A HH21 2.909 2.082 ILE 56.A N ALA 170.A O ILE 56.A H 2.916 1.952 LEU 57.A N ASN 64.A O LEU 57.A H 2.939 2.034 ASN 58.A N LYS 168.A O.A ASN 58.A H 2.903 1.912 ASN 58.A N LYS 168.A O.B ASN 58.A H 2.903 1.912 ASN 58.A ND2 ILE 163.A O ASN 58.A HD22 3.043 2.107 ASN 58.A ND2 ASN 226.A O ASN 58.A HD21 3.208 2.231 ASN 59.A N ALA 62.A O ASN 59.A H 3.076 2.112 ASN 59.A ND2 ASN 64.A OD1 ASN 59.A HD22 3.603 3.002 GLY 60.A N ASN 58.A OD1 GLY 60.A H 2.808 1.845 HIS 61.A N.A ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.A 2.878 1.916 HIS 61.A N.B ASN 59.A OD1 HIS 61.A H.B 2.878 1.962 ALA 62.A N ASN 59.A OD1 ALA 62.A H 2.957 1.985 ASN 64.A N LEU 57.A O ASN 64.A H 2.848 1.919 VAL 65.A N PHE 90.A O VAL 65.A H 2.844 1.895 GLU 66.A N ARG 55.A O GLU 66.A H 2.842 1.833 PHE 67.A N ILE 88.A O PHE 67.A H 2.987 2.032 ASP 68.A N.A THR 52.A O ASP 68.A H.A 2.825 1.853 ASP 68.A N.B THR 52.A O ASP 68.A H.B 2.941 1.975 SER 70.A N ASP 68.A OD1.A SER 70.A H 2.985 2.016 SER 70.A N ASP 68.A OD1.B SER 70.A H 3.482 2.567 LYS 73.A N GLN 71.A O LYS 73.A H 2.958 2.230 LYS 73.A NZ THR 52.A OG1 LYS 73.A HZ3 3.023 2.141 LYS 73.A NZ ASP 68.A OD2.A LYS 73.A HZ1 2.843 1.979 VAL 75.A N SER 47.A O VAL 75.A H 2.950 1.990 LEU 76.A N TYR 85.A O LEU 76.A H 2.846 1.854 LYS 77.A N.A SER 45.A O LYS 77.A H.A 2.938 1.963 LYS 77.A N.B SER 45.A O LYS 77.A H.B 2.941 1.954 GLY 79.A N PRO 43.A O GLY 79.A H 3.117 2.224 LEU 81.A N GLY 78.A O LEU 81.A H 2.869 1.900 TYR 85.A N LEU 76.A O TYR 85.A H 2.986 2.052 ARG 86.A N.A TRP 120.A O ARG 86.A H.A 2.853 1.892 ARG 86.A N.B TRP 120.A O ARG 86.A H.B 2.853 1.889 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.A 2.444 1.482 ARG 86.A NE.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.A 2.654 1.773 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HE.B 2.749 1.878 ARG 86.A NE.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HE.B 3.044 2.300 ARG 86.A NH1.A ASP 69.A O ARG 86.A HH11.A 3.054 2.290 ARG 86.A NH1.B ASP 69.A O ARG 86.A HH11.B 2.881 2.031 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.A 3.173 2.598 ARG 86.A NH2.A ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.A 2.826 2.135 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.A ARG 86.A HH21.B 2.831 2.117 ARG 86.A NH2.B ASP 72.A OD1.B ARG 86.A HH21.B 2.578 1.782 LEU 87.A N ALA 74.A O LEU 87.A H 2.847 1.837 ILE 88.A N VAL 118.A O ILE 88.A H 2.925 1.918 PHE 90.A N VAL 65.A O PHE 90.A H 2.963 2.046 HIS 91.A N HIS 116.A O HIS 91.A H 3.062 2.120 HIS 91.A ND1 GLN 89.A OE1 HIS 91.A HD1 2.776 1.918 HIS 93.A N GLU 114.A O HIS 93.A H 2.894 1.930 HIS 93.A ND1 ASN 240.A O HIS 93.A HD1 2.771 1.936 TRP 94.A N ASN 240.A OD1 TRP 94.A H 2.816 1.823 TRP 94.A NE1 MET 237.A O TRP 94.A HE1 2.861 2.227 GLY 95.A N ALA 112.A O GLY 95.A H 3.406 2.553 SER 96.A N ASP 239.A OD1 SER 96.A H 3.011 2.113 GLN 100.A N LEU 97.A O GLN 100.A H 3.242 2.277 SER 102.A N TYR 111.A O SER 102.A H 2.955 2.068 GLU 103.A N GLU 114.A OE1 GLU 103.A H 2.832 1.979 HIS 104.A N GLU 114.A OE1 HIS 104.A H 2.813 2.030 HIS 104.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 104.A HD1 2.739 1.890 THR 105.A N VAL 28.A O THR 105.A H 3.481 2.511 VAL 106.A N LYS 109.A O VAL 106.A H 3.066 2.120 ASP 107.A N ILE 30.A O ASP 107.A H 2.808 1.840 LYS 108.A N ASP 29.A OD1 LYS 108.A H 2.760 1.830 LYS 109.A N VAL 106.A O LYS 109.A H 2.875 1.915 ALA 113.A N LEU 144.A O ALA 113.A H 3.367 2.539 GLU 114.A N HIS 93.A O GLU 114.A H 2.883 1.954 LEU 115.A N ILE 142.A O LEU 115.A H 2.806 1.799 HIS 116.A N HIS 91.A O HIS 116.A H 2.831 1.820 HIS 116.A NE2 GLU 114.A OE2 HIS 116.A HE2 2.682 1.847 LEU 117.A N LEU 140.A O LEU 117.A H 2.891 1.888 VAL 118.A N GLN 89.A O VAL 118.A H 2.862 1.868 HIS 119.A N ALA 138.A O HIS 119.A H 2.944 2.122 HIS 119.A ND1 ALA 138.A O HIS 119.A HD1 3.027 2.259 TRP 120.A N ARG 86.A O.A TRP 120.A H 2.923 2.001 TRP 120.A N ARG 86.A O.B TRP 120.A H 2.921 1.999 TRP 120.A NE1 ASP 69.A OD2 TRP 120.A HE1 2.767 2.018 ASN 121.A N GLY 136.A O ASN 121.A H 2.797 1.829 ASN 121.A ND2 ASP 135.A O ASN 121.A HD22 3.104 2.130 THR 122.A N THR 84.A O THR 122.A H 2.937 1.931 TYR 124.A N ASN 121.A O TYR 124.A H 2.998 2.000 GLY 125.A N THR 122.A O GLY 125.A H 3.147 2.218 ASP 126.A N.A TYR 124.A O ASP 126.A H.A 2.843 1.989 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.A LYS 129.A H 2.801 1.924 LYS 129.A N ASP 126.A OD1.B LYS 129.A H 3.016 2.038 ALA 130.A N ASP 126.A O.A ALA 130.A H 2.868 1.898 ALA 130.A N ASP 126.A O.B ALA 130.A H 3.137 2.186 VAL 131.A N PHE 127.A O VAL 131.A H 2.998 2.066 GLN 132.A N LYS 129.A O GLN 132.A H 3.124 2.222 GLN 132.A NE2 GLY 128.A O GLN 132.A HE22 3.097 2.246 GLN 133.A N ALA 130.A O GLN 133.A H 3.006 2.069 GLY 136.A N GLN 133.A O GLY 136.A H 3.083 2.235 LEU 137.A N CYS 202.A O LEU 137.A H 2.851 1.920 ALA 138.A N HIS 119.A O ALA 138.A H 2.860 1.883 VAL 139.A N THR 204.A O VAL 139.A H 3.130 2.187 LEU 140.A N LEU 117.A O LEU 140.A H 2.949 1.991 GLY 141.A N ILE 206.A O GLY 141.A H 2.814 1.824 ILE 142.A N LEU 115.A O ILE 142.A H 2.893 1.968 LEU 144.A N ALA 113.A O LEU 144.A H 2.934 1.955 LYS 145.A N ILE 212.A O LYS 145.A H 2.925 1.932 GLY 147.A N VAL 214.A O GLY 147.A H 2.782 1.789 LYS 150.A N GLN 218.A OE1 LYS 150.A H 3.017 2.016 LYS 150.A NZ LEU 181.A O LYS 150.A HZ2 3.213 2.255 LEU 153.A N LYS 150.A O LEU 153.A H 2.981 2.042 GLN 154.A N PRO 151.A O GLN 154.A H 3.048 2.058 GLN 154.A NE2 ASP 158.A OD2 GLN 154.A HE22 3.305 2.644 LYS 155.A NZ.B THR 173.A O LYS 155.A HZ2.B 2.813 1.875 VAL 157.A N LEU 153.A O VAL 157.A H 3.151 2.162 ASP 158.A N GLN 154.A O ASP 158.A H 2.886 1.961 VAL 159.A N VAL 156.A O VAL 159.A H 3.116 2.242 LEU 160.A N VAL 157.A O LEU 160.A H 3.259 2.295 SER 162.A N VAL 159.A O SER 162.A H 2.932 2.057 ILE 163.A N LEU 160.A O ILE 163.A H 3.043 2.079 LYS 166.A N ASN 228.A O LYS 166.A H 2.906 1.926 GLY 167.A N ASN 58.A O GLY 167.A H 2.715 1.761 LYS 168.A N.A THR 165.A O LYS 168.A H.A 3.103 2.110 LYS 168.A N.B THR 165.A O LYS 168.A H.B 3.103 2.109 LYS 168.A NZ.A GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.A 3.516 2.833 LYS 168.A NZ.B GLU 230.A OE1 LYS 168.A HZ2.B 2.921 2.149 ALA 170.A N ILE 56.A O ALA 170.A H 2.878 1.944 PHE 172.A N LEU 54.A O PHE 172.A H 2.954 1.985 ARG 178.A N ASP 176.A OD1 ARG 178.A H 2.942 2.018 ARG 178.A NE ASP 176.A OD1 ARG 178.A HE 2.827 1.871 ARG 178.A NH1 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH12 2.924 2.172 ARG 178.A NH2 ASP 49.A OD1.B ARG 178.A HH22 3.391 2.780 ARG 178.A NH2 ASP 176.A OD2 ARG 178.A HH21 3.174 2.551 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 3.154 2.179 LEU 180.A N PRO 177.A O LEU 180.A H 3.027 2.051 LEU 181.A N ARG 178.A O LEU 181.A H 3.334 2.335 GLU 183.A N GLU 210.A OE2.B GLU 183.A H 3.063 2.139 SER 184.A N GLU 210.A OE1.A SER 184.A H 2.932 1.964 SER 184.A N GLU 210.A OE1.B SER 184.A H 2.889 1.936 ASP 186.A N SER 184.A OG ASP 186.A H 3.038 2.036 TYR 187.A N SER 255.A OG TYR 187.A H 2.932 1.952 TRP 188.A N VAL 207.A O TRP 188.A H 2.858 1.867 THR 189.A N LYS 253.A O THR 189.A H 2.846 1.913 TYR 190.A N TRP 205.A O TYR 190.A H 3.283 2.390 GLY 192.A N VAL 203.A O GLY 192.A H 2.779 1.768 LEU 194.A N LEU 200.A O LEU 194.A H 2.923 1.975 THR 195.A OG1 GLU 103.A OE1 THR 195.A HG1 2.567 1.771 LEU 199.A N THR 196.A O LEU 199.A H 2.832 1.974 CYS 202.A N LEU 200.A O CYS 202.A H 3.088 2.338 VAL 203.A N GLY 192.A O VAL 203.A H 3.118 2.140 THR 204.A N LEU 137.A O THR 204.A H 2.868 1.871 TRP 205.A N TYR 190.A O TRP 205.A H 2.961 2.019 TRP 205.A NE1 SER 193.A O TRP 205.A HE1 2.995 2.209 ILE 206.A N VAL 139.A O ILE 206.A H 2.930 1.957 VAL 207.A N TRP 188.A O VAL 207.A H 2.829 1.834 LEU 208.A N GLY 141.A O LEU 208.A H 2.877 1.885 LYS 209.A N ASP 186.A O LYS 209.A H 2.960 1.956 ILE 212.A N PHE 143.A O ILE 212.A H 2.858 1.916 VAL 214.A N LYS 145.A O VAL 214.A H 2.896 1.909 SER 215.A N GLN 218.A OE1 SER 215.A H 3.032 2.053 GLN 218.A N SER 215.A OG GLN 218.A H 3.140 2.173 GLN 218.A NE2 LYS 150.A O GLN 218.A HE21 3.017 2.159 GLN 218.A NE2 GLN 154.A OE1 GLN 218.A HE22 2.943 2.105 VAL 219.A N SER 215.A O VAL 219.A H 3.081 2.095 LEU 220.A N SER 216.A O.A LEU 220.A H 2.957 1.988 LEU 220.A N SER 216.A O.B LEU 220.A H 2.870 1.897 LYS 221.A N GLU 217.A O LYS 221.A H 3.210 2.314 PHE 222.A N GLN 218.A O PHE 222.A H 3.356 2.414 ARG 223.A N VAL 219.A O ARG 223.A H 3.098 2.180 ARG 223.A NE GLY 95.A O ARG 223.A HE 2.825 1.897 ARG 223.A NH1 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH12 3.547 2.902 ARG 223.A NH2 ASP 98.A OD1 ARG 223.A HH22 2.880 2.035 LYS 224.A N LYS 221.A O LYS 224.A H 3.192 2.244 LEU 225.A N PHE 222.A O LEU 225.A H 3.172 2.212 ASN 226.A N LYS 164.A O ASN 226.A H 2.832 1.930 ASN 226.A ND2 GLU 234.A OE2 ASN 226.A HD21 2.904 1.991 PHE 227.A N GLU 235.A O.A PHE 227.A H 2.868 1.906 PHE 227.A N GLU 235.A O.B PHE 227.A H 2.870 1.907 ASN 228.A ND2 ASN 226.A OD1 ASN 228.A HD21 3.346 2.540 ASN 228.A ND2 GLY 229.A O ASN 228.A HD22 3.044 2.077 GLY 229.A N GLU 232.A OE1 GLY 229.A H 2.770 1.814 GLU 232.A N GLY 229.A O GLU 232.A H 3.119 2.190 GLU 235.A N.A ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.A 2.789 1.798 GLU 235.A N.B ASN 228.A OD1 GLU 235.A H.B 2.789 1.808 MET 237.A N LEU 225.A O MET 237.A H 2.803 1.795 ASN 240.A N TRP 94.A O ASN 240.A H 3.302 2.473 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.A ASN 240.A HD22 2.971 1.996 ASN 240.A ND2 HIS 61.A O.B ASN 240.A HD22 2.953 2.038 TRP 241.A NE1 ASP 239.A OD1 TRP 241.A HE1 3.012 2.168 ARG 242.A N GLU 103.A OE2 ARG 242.A H 2.801 1.797 ARG 242.A NH1 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH12 2.759 1.937 ARG 242.A NH1 SER 26.A O ARG 242.A HH11 2.833 2.081 ARG 242.A NH2 ALA 20.A O ARG 242.A HH22 3.163 2.508 ARG 242.A NH2 GLN 25.A OE1 ARG 242.A HH22 3.296 2.647 GLN 245.A N PRO 27.A O GLN 245.A H 2.794 1.845 GLN 245.A NE2 PRO 243.A O GLN 245.A HE22 2.869 2.037 LYS 248.A NZ GLY 22.A O LYS 248.A HZ1 2.961 2.018 ARG 250.A NE LEU 247.A O ARG 250.A HE 2.835 1.866 ARG 250.A NH1 GLN 25.A O ARG 250.A HH12 3.063 2.334 ARG 250.A NH1 PRO 191.A O ARG 250.A HH11 2.901 2.057 ARG 250.A NH2 GLN 25.A O ARG 250.A HH22 2.826 2.026 ARG 250.A NH2 PRO 246.A O ARG 250.A HH21 2.927 2.243 ARG 250.A NH2 LEU 247.A O ARG 250.A HH21 3.503 2.857 LYS 253.A N THR 189.A O LYS 253.A H 2.982 1.975 ALA 254.A N LYS 36.A O ALA 254.A H 2.872 1.873 SER 255.A N TYR 187.A O SER 255.A H 2.844 1.860