Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6pak_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 2.A NE2 ASN 76.A OD1 GLN 2.A HE22 2.870 2.043 SER 3.A N GLY 80.A O SER 3.A H 2.864 2.021 TYR 6.A OH VAL 204.A O TYR 6.A HH 2.630 1.794 ILE 8.A N PRO 5.A O ILE 8.A H 3.020 2.276 GLN 10.A N TYR 6.A O GLN 10.A H 2.870 2.080 GLN 10.A NE2 ASN 182.A O GLN 10.A HE22 2.986 2.127 GLN 10.A NE2 ASN 185.A OD1 GLN 10.A HE21 2.699 1.965 ILE 11.A N GLY 7.A O ILE 11.A H 3.358 2.563 LYS 12.A N SER 9.A O LYS 12.A H 2.814 2.033 ALA 13.A N ILE 8.A O ALA 13.A H 3.279 2.454 LEU 16.A N ALA 13.A O LEU 16.A H 2.912 2.299 HIS 17.A N ALA 13.A O HIS 17.A H 3.120 2.299 HIS 17.A NE2 VAL 84.A O HIS 17.A HE2 2.820 1.966 SER 18.A N PRO 14.A O SER 18.A H 2.856 2.036 SER 18.A OG PRO 14.A O SER 18.A HG 3.284 2.698 GLN 19.A N ALA 15.A O GLN 19.A H 3.172 2.433 GLN 19.A NE2 ALA 15.A O GLN 19.A HE21 3.523 3.010 GLY 20.A N HIS 17.A O GLY 20.A H 2.841 2.019 TYR 21.A N LEU 16.A O TYR 21.A H 2.885 2.034 VAL 26.A N GLY 23.A O VAL 26.A H 3.244 2.480 LYS 27.A N ASP 120.A OD2 LYS 27.A H 2.900 2.046 VAL 28.A N SER 89.A O VAL 28.A H 2.861 2.009 ALA 29.A N VAL 121.A O ALA 29.A H 2.786 1.950 VAL 30.A N TYR 91.A O VAL 30.A H 2.956 2.102 ILE 31.A N ASN 123.A O ILE 31.A H 3.085 2.275 ASP 32.A N VAL 93.A O ASP 32.A H 3.053 2.260 SER 33.A N ASP 32.A OD1 SER 33.A H 2.835 2.122 SER 33.A OG ASP 60.A OD1 SER 33.A HG 2.773 2.136 ILE 35.A N PRO 57.A O ILE 35.A H 3.088 2.299 ASP 36.A N THR 66.A OG1 ASP 36.A H 2.979 2.133 SER 37.A N TYR 58.A O SER 37.A H 3.375 2.625 SER 38.A N ASP 36.A OD1 SER 38.A H 3.135 2.453 SER 38.A OG ASP 36.A OD1 SER 38.A HG 2.499 1.697 HIS 39.A N ASP 36.A O HIS 39.A H 2.999 2.146 HIS 39.A NE2 THR 214.A O HIS 39.A HE2 2.979 2.132 ASP 41.A N HIS 39.A ND1 ASP 41.A H 3.020 2.166 LEU 42.A N HIS 39.A O LEU 42.A H 3.180 2.359 ARG 45.A N LEU 90.A O ARG 45.A H 2.864 2.037 ALA 48.A N ALA 92.A O ALA 48.A H 2.798 2.020 SER 49.A OG GLU 54.A O SER 49.A HG 2.590 1.799 PHE 50.A N LYS 94.A O PHE 50.A H 2.836 1.997 VAL 51.A N SER 49.A OG VAL 51.A H 3.331 2.511 GLU 54.A N VAL 51.A O GLU 54.A H 3.090 2.330 TYR 58.A N ASN 56.A OD1 TYR 58.A H 2.771 1.957 SER 62.A N ASP 60.A OD1 SER 62.A H 3.070 2.405 SER 63.A N ASP 60.A OD1 SER 63.A H 2.765 1.950 SER 63.A OG SER 62.A O SER 63.A HG 2.575 1.914 HIS 64.A N SER 62.A OG HIS 64.A H 3.234 2.421 HIS 64.A ND1 ASP 32.A OD1 HIS 64.A HD1 2.544 1.706 HIS 64.A ND1 ASP 32.A OD2 HIS 64.A HD1 3.000 2.373 GLY 65.A N SER 33.A OG GLY 65.A H 2.882 2.032 THR 66.A N ASP 60.A OD2 THR 66.A H 2.874 2.046 HIS 67.A N SER 63.A O HIS 67.A H 3.058 2.217 HIS 67.A NE2 GLY 216.A O HIS 67.A HE2 2.924 2.219 VAL 68.A N HIS 64.A O VAL 68.A H 2.961 2.110 ALA 69.A N GLY 65.A O ALA 69.A H 2.759 1.935 GLY 70.A N THR 66.A O GLY 70.A H 3.015 2.249 THR 71.A N HIS 67.A O THR 71.A H 3.250 2.458 ILE 72.A N VAL 68.A O ILE 72.A H 3.239 2.467 ALA 73.A N ALA 69.A O ALA 73.A H 2.922 2.172 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 2.985 2.162 LEU 75.A N ASP 41.A O LEU 75.A H 2.930 2.111 ASN 77.A N GLN 2.A OE1 ASN 77.A H 2.877 2.042 ASN 77.A ND2 ASP 41.A OD1 ASN 77.A HD21 2.793 2.081 ILE 79.A N ASN 77.A OD1 ILE 79.A H 3.209 2.356 VAL 81.A N ASP 41.A OD2 VAL 81.A H 2.898 2.162 GLY 83.A N ALA 74.A O GLY 83.A H 2.931 2.087 VAL 84.A N THR 71.A O VAL 84.A H 2.978 2.152 ALA 85.A N ILE 72.A O ALA 85.A H 2.790 1.936 SER 87.A N THR 22.A O SER 87.A H 2.845 2.024 ALA 88.A N ALA 85.A O ALA 88.A H 2.997 2.138 SER 89.A N VAL 26.A O SER 89.A H 2.947 2.169 TYR 91.A N VAL 28.A O TYR 91.A H 2.998 2.273 ALA 92.A N GLY 46.A O ALA 92.A H 2.942 2.132 VAL 93.A N VAL 30.A O VAL 93.A H 3.085 2.245 LYS 94.A N ALA 48.A O LYS 94.A H 2.879 2.145 LYS 94.A NZ GLU 54.A OE1 LYS 94.A HZ2 3.561 2.685 LYS 94.A NZ ASN 56.A O LYS 94.A HZ1 2.933 2.276 LYS 94.A NZ GLN 59.A O LYS 94.A HZ3 2.597 1.746 VAL 95.A N ASP 32.A O VAL 95.A H 2.825 2.009 LEU 96.A N ASP 32.A O LEU 96.A H 3.186 2.418 ASP 97.A N SER 101.A O ASP 97.A H 2.845 2.058 SER 98.A N GLU 54.A OE2 SER 98.A H 3.095 2.274 SER 98.A OG GLU 54.A OE1 SER 98.A HG 3.068 2.315 SER 98.A OG GLU 54.A OE2 SER 98.A HG 3.099 2.332 THR 99.A N ASP 97.A OD1 THR 99.A H 3.038 2.259 THR 99.A OG1 ASP 97.A OD1 THR 99.A HG1 2.738 1.908 GLY 100.A N ASP 97.A O GLY 100.A H 2.848 2.024 SER 101.A OG THR 99.A OG1 SER 101.A HG 2.596 1.840 TYR 104.A OH SER 130.A O TYR 104.A HH 2.545 1.706 ILE 107.A N GLN 103.A O ILE 107.A H 3.207 2.379 ILE 108.A N TYR 104.A O ILE 108.A H 2.945 2.132 ASN 109.A N SER 105.A O ASN 109.A H 3.150 2.319 GLY 110.A N TRP 106.A O GLY 110.A H 3.009 2.182 ILE 111.A N ILE 107.A O ILE 111.A H 2.888 2.082 GLU 112.A N ILE 108.A O GLU 112.A H 2.874 2.027 TRP 113.A N ASN 109.A O TRP 113.A H 2.846 2.017 ALA 114.A N GLY 110.A O ALA 114.A H 2.954 2.164 ILE 115.A N ILE 111.A O ILE 115.A H 2.920 2.122 SER 116.A N GLU 112.A O SER 116.A H 2.860 2.008 SER 116.A OG GLU 112.A O SER 116.A HG 2.826 2.037 ASN 117.A N TRP 113.A O ASN 117.A H 3.066 2.374 ASN 117.A ND2 TRP 113.A O ASN 117.A HD22 2.936 2.094 ASN 118.A N ILE 115.A O ASN 118.A H 3.090 2.240 MET 119.A N ALA 114.A O MET 119.A H 3.109 2.255 ASP 120.A N LYS 27.A O ASP 120.A H 2.825 2.074 VAL 121.A N LYS 27.A O VAL 121.A H 2.997 2.241 ILE 122.A N VAL 148.A O ILE 122.A H 2.726 1.881 ASN 123.A N ALA 29.A O ASN 123.A H 2.917 2.063 ASN 123.A ND2 SER 125.A OG ASN 123.A HD21 2.908 2.098 MET 124.A N ALA 150.A O MET 124.A H 2.846 2.013 SER 125.A OG CYS 222.A O SER 125.A HG 2.758 2.296 GLY 128.A N TYR 168.A O GLY 128.A H 2.980 2.256 LYS 136.A N SER 132.A O LYS 136.A H 2.868 2.030 LYS 136.A NZ ASP 140.A OD2 LYS 136.A HZ2 2.875 2.071 THR 137.A N THR 133.A O THR 137.A H 2.822 1.997 VAL 138.A N ALA 134.A O VAL 138.A H 3.129 2.337 VAL 139.A N LEU 135.A O VAL 139.A H 2.947 2.109 ASP 140.A N LYS 136.A O ASP 140.A H 2.876 2.016 LYS 141.A N THR 137.A O LYS 141.A H 3.028 2.206 LYS 141.A NZ GLU 112.A OE1 LYS 141.A HZ1 3.021 2.166 LYS 141.A NZ GLU 112.A OE2 LYS 141.A HZ1 3.495 2.886 ALA 142.A N VAL 138.A O ALA 142.A H 2.995 2.192 VAL 143.A N VAL 139.A O VAL 143.A H 3.051 2.244 SER 144.A N ASP 140.A O SER 144.A H 2.768 1.912 SER 144.A OG ASP 140.A O SER 144.A HG 3.391 2.909 SER 144.A OG LYS 141.A O SER 144.A HG 2.925 2.129 SER 145.A N LYS 141.A O SER 145.A H 2.943 2.281 SER 145.A N ALA 142.A O SER 145.A H 3.016 2.382 SER 145.A OG LYS 141.A O SER 145.A HG 2.659 1.864 GLY 146.A N VAL 143.A O GLY 146.A H 2.936 2.093 ILE 147.A N ALA 142.A O ILE 147.A H 3.187 2.337 VAL 148.A N ASP 120.A O VAL 148.A H 3.074 2.257 ALA 150.A N ILE 122.A O ALA 150.A H 2.907 2.068 ALA 151.A N ILE 176.A O ALA 151.A H 2.800 1.967 ALA 152.A N MET 124.A O ALA 152.A H 3.090 2.302 ALA 153.A N VAL 178.A O ALA 153.A H 2.934 2.079 GLY 154.A N THR 221.A OG1 GLY 154.A H 3.175 2.399 GLU 156.A N SER 192.A OG GLU 156.A H 3.005 2.162 GLY 157.A N PHE 190.A O GLY 157.A H 2.930 2.081 SER 164.A OG GLU 196.A OE1 SER 164.A HG 2.927 2.091 SER 164.A OG GLU 196.A OE2 SER 164.A HG 3.509 2.883 THR 165.A N ALA 193.A O THR 165.A H 3.022 2.188 VAL 166.A N SER 164.A OG VAL 166.A H 3.037 2.187 GLY 167.A N ALA 153.A O GLY 167.A H 2.865 2.045 TYR 168.A N GLY 128.A O TYR 168.A H 2.829 1.984 LYS 171.A N GLY 167.A O LYS 171.A H 2.755 2.105 TYR 172.A N PRO 169.A O TYR 172.A H 3.094 2.291 SER 174.A OG ASP 140.A OD1 SER 174.A HG 2.744 2.117 THR 175.A N TYR 172.A O THR 175.A H 3.230 2.386 THR 175.A OG1 PRO 169.A O THR 175.A HG1 2.663 1.959 ILE 176.A N VAL 149.A O ILE 176.A H 2.964 2.110 ALA 177.A N ASP 198.A OD2 ALA 177.A H 2.971 2.144 VAL 178.A N ALA 151.A O VAL 178.A H 2.982 2.256 GLY 179.A N VAL 199.A O GLY 179.A H 2.895 2.058 ALA 180.A N SER 191.A OG ALA 180.A H 3.149 2.311 VAL 181.A N ALA 201.A O VAL 181.A H 3.113 2.295 ASN 182.A N GLN 186.A O ASN 182.A H 2.903 2.134 ASN 182.A ND2 GLN 186.A OE1 ASN 182.A HD21 2.757 1.910 SER 184.A N ASN 182.A OD1 SER 184.A H 2.925 2.228 ASN 185.A N ASN 182.A O ASN 185.A H 2.974 2.152 GLN 186.A N ASN 182.A OD1 GLN 186.A H 2.883 2.063 ARG 187.A N TYR 264.A OH ARG 187.A H 3.310 2.461 ARG 187.A NE SER 191.A O ARG 187.A HE 3.260 2.698 ARG 187.A NH2 SER 189.A O ARG 187.A HH22 3.476 2.949 ARG 187.A NH2 SER 191.A O ARG 187.A HH21 2.699 1.993 ALA 188.A N ALA 180.A O ALA 188.A H 2.941 2.087 SER 191.A N ALA 188.A O SER 191.A H 3.008 2.176 SER 191.A OG SER 192.A O SER 191.A HG 3.464 2.634 SER 192.A N GLY 154.A O SER 192.A H 2.928 2.080 SER 192.A OG THR 165.A OG1 SER 192.A HG 3.369 2.726 ALA 193.A N THR 165.A OG1 ALA 193.A H 2.984 2.173 GLY 194.A N PHE 262.A O GLY 194.A H 2.935 2.192 GLU 196.A N GLU 196.A OE1 GLU 196.A H 2.698 1.883 LEU 197.A N GLY 194.A O LEU 197.A H 3.080 2.230 ASP 198.A N ALA 177.A O ASP 198.A H 3.077 2.259 VAL 199.A N ALA 177.A O VAL 199.A H 3.241 2.415 MET 200.A N GLY 267.A O MET 200.A H 2.787 1.970 ALA 201.A N GLY 179.A O ALA 201.A H 3.003 2.211 GLY 203.A N VAL 181.A O GLY 203.A H 2.943 2.111 SER 205.A N ASN 219.A OD1 SER 205.A H 2.539 1.729 ILE 206.A N TYR 218.A O ILE 206.A H 2.916 2.066 SER 208.A N GLY 216.A O SER 208.A H 2.990 2.174 SER 208.A OG HIS 67.A O SER 208.A HG 2.686 1.902 THR 209.A OG1 THR 66.A O THR 209.A HG1 2.949 2.281 LEU 210.A N THR 214.A O LEU 210.A H 2.807 1.989 GLY 212.A N ASP 36.A OD2 GLY 212.A H 2.969 2.150 THR 214.A N LEU 210.A O THR 214.A H 3.324 2.561 GLY 216.A N SER 208.A O GLY 216.A H 3.042 2.241 TYR 218.A N ILE 206.A O TYR 218.A H 3.211 2.436 TYR 218.A OH SER 63.A OG TYR 218.A HH 2.793 1.980 GLY 220.A N GLY 203.A O GLY 220.A H 2.932 2.099 THR 221.A N ASN 155.A OD1 THR 221.A H 2.879 2.049 THR 221.A OG1 ASN 155.A OD1 THR 221.A HG1 2.872 2.038 CYS 222.A SG SER 125.A O no hydrogen 3.665 N/A MET 223.A N GLY 220.A O MET 223.A H 2.943 2.173 ALA 224.A N GLY 220.A O ALA 224.A H 3.321 2.614 THR 225.A N THR 221.A O THR 225.A H 3.021 2.201 THR 225.A OG1 THR 221.A O THR 225.A HG1 2.909 2.106 HIS 227.A N ALA 224.A O HIS 227.A H 2.894 2.213 HIS 227.A ND1 MET 223.A O no hydrogen 2.878 N/A VAL 228.A N THR 225.A O VAL 228.A H 2.838 2.176 ALA 229.A N THR 225.A O ALA 229.A H 2.996 2.172 GLY 230.A N PRO 226.A O GLY 230.A H 2.891 2.042 ALA 231.A N HIS 227.A O ALA 231.A H 2.989 2.205 ALA 232.A N VAL 228.A O ALA 232.A H 2.915 2.109 ALA 233.A N ALA 229.A O ALA 233.A H 3.125 2.363 LEU 234.A N GLY 230.A O LEU 234.A H 3.003 2.172 ILE 235.A N ALA 231.A O ILE 235.A H 2.961 2.109 LEU 236.A N ALA 232.A O LEU 236.A H 2.959 2.142 SER 237.A N ALA 233.A O SER 237.A H 2.888 2.085 LYS 238.A N LEU 234.A O LYS 238.A H 3.149 2.433 LYS 238.A N ILE 235.A O LYS 238.A H 3.069 2.411 LYS 238.A NZ GLN 19.A OE1 LYS 238.A HZ1 2.655 1.771 LYS 238.A NZ ALA 275.A O LYS 238.A HZ2 3.238 2.645 HIS 239.A N ILE 235.A O HIS 239.A H 2.666 1.894 HIS 239.A NE2 ALA 275.A O HIS 239.A HE2 2.859 2.009 TRP 242.A N HIS 239.A O TRP 242.A H 3.063 2.214 THR 243.A N GLN 246.A OE1 THR 243.A H 2.711 1.885 ASN 244.A ND2 VAL 143.A O ASN 244.A HD21 2.895 2.188 ASN 244.A ND2 ILE 147.A O ASN 244.A HD22 3.086 2.254 GLN 246.A N THR 243.A OG1 GLN 246.A H 2.995 2.149 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 2.875 2.027 ARG 248.A N ASN 244.A O ARG 248.A H 3.016 2.197 ARG 248.A NE GLU 252.A OE2 ARG 248.A HE 2.796 1.938 ARG 248.A NH1 PRO 173.A O ARG 248.A HH12 2.629 1.815 ARG 248.A NH2 PRO 173.A O ARG 248.A HH22 3.104 2.453 ARG 248.A NH2 ASP 198.A OD1 ARG 248.A HH21 3.457 2.662 ASP 249.A N ALA 245.A O ASP 249.A H 2.855 2.011 ARG 250.A N GLN 246.A O ARG 250.A H 2.900 2.064 ARG 250.A NE ALA 274.A O ARG 250.A HE 2.659 1.856 ARG 250.A NH2 ALA 274.A O ARG 250.A HH21 3.078 2.428 LEU 251.A N VAL 247.A O LEU 251.A H 3.083 2.245 GLU 252.A N ARG 248.A O GLU 252.A H 2.976 2.146 SER 253.A N ASP 249.A O SER 253.A H 2.775 1.957 SER 253.A OG ASP 249.A O SER 253.A HG 2.746 2.013 THR 254.A N ARG 250.A O THR 254.A H 3.033 2.210 THR 254.A OG1 ARG 250.A O THR 254.A HG1 2.663 1.959 ALA 255.A N GLU 252.A O ALA 255.A H 3.392 2.549 THR 256.A N LEU 268.A O THR 256.A H 2.737 1.946 PHE 262.A N ASN 260.A OD1 PHE 262.A H 2.997 2.197 TYR 263.A N ASN 260.A O TYR 263.A H 2.950 2.146 TYR 264.A N ASN 260.A O TYR 264.A H 2.981 2.316 GLY 265.A N SER 261.A O GLY 265.A H 2.656 1.933 LYS 266.A N ASP 198.A O LYS 266.A H 2.758 1.910 GLY 267.A N TYR 264.A O GLY 267.A H 2.839 2.178 LEU 268.A N THR 256.A O LEU 268.A H 2.981 2.240 ILE 269.A N MET 200.A O ILE 269.A H 3.194 2.394 VAL 271.A N ILE 11.A O VAL 271.A H 2.971 2.161 ALA 273.A N ASN 270.A OD1 ALA 273.A H 3.169 2.335 ALA 274.A N ASN 270.A O ALA 274.A H 2.933 2.090 ALA 275.A N VAL 271.A O ALA 275.A H 3.100 2.354 GLN 276.A N ALA 273.A O GLN 276.A H 3.302 2.460