Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6pdv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): SER 1.A N HIS 3.A ND1 no hydrogen 3.269 N/A GLY 5.A N ASN 10.A O GLY 5.A H 2.887 2.060 GLY 7.A N ASN 10.A OD1 GLY 7.A H 2.930 2.126 ASN 10.A ND2 HIS 2.A O ASN 10.A HD22 3.139 2.288 GLU 13.A N GLU 13.A OE1.A GLU 13.A H 2.710 1.882 HIS 14.A N GLY 11.A O HIS 14.A H 2.721 1.871 TRP 15.A N PRO 12.A O TRP 15.A H 3.307 2.465 TRP 15.A NE1 GLY 5.A O TRP 15.A HE1 3.149 2.437 TRP 15.A NE1 ASN 10.A O TRP 15.A HE1 3.050 2.357 LYS 17.A N HIS 14.A O LYS 17.A H 3.213 2.357 PHE 19.A N TRP 15.A O PHE 19.A H 2.967 2.218 ALA 22.A N PHE 19.A O ALA 22.A H.A 2.786 1.932 LYS 23.A N PRO 20.A O LYS 23.A H 3.114 2.257 GLY 24.A N ILE 21.A O.A GLY 24.A H 2.784 2.025 GLY 24.A N ILE 21.A O.B GLY 24.A H 2.749 1.989 ARG 26.A N.A GLU 203.A OE2 ARG 26.A H.A 2.995 2.220 ARG 26.A N.B GLU 203.A OE2 ARG 26.A H.B 2.988 2.218 ARG 26.A NE.A GLY 194.A O ARG 26.A HE.A 3.072 2.331 ARG 26.A NH1.A PRO 136.A O ARG 26.A HH12.A 3.409 2.682 ARG 26.A NH2.A PRO 136.A O ARG 26.A HH22.A 3.197 2.400 ARG 26.A NH2.A GLY 194.A O ARG 26.A HH21.A 3.087 2.348 ARG 26.A NH2.A VAL 205.A O ARG 26.A HH21.A 2.992 2.342 GLN 27.A NE2 LEU 201.A O GLN 27.A HE22 3.126 2.274 GLN 27.A NE2 GLU 203.A OE2 GLN 27.A HE21 3.061 2.221 SER 28.A N SER 195.A OG SER 28.A H 2.994 2.302 ILE 32.A N THR 107.A O ILE 32.A H 2.792 1.942 THR 34.A N ASP 109.A OD1 THR 34.A H.A 2.884 2.062 HIS 35.A N ASP 33.A OD2.A HIS 35.A H 2.952 2.265 THR 36.A N ASP 33.A O.A THR 36.A H 3.064 2.251 THR 36.A N ASP 33.A O.B THR 36.A H 3.067 2.254 ALA 37.A N ASP 33.A O.A ALA 37.A H 3.036 2.267 ALA 37.A N ASP 33.A O.B ALA 37.A H 3.041 2.272 LYS 38.A N ILE 254.A O LYS 38.A H 3.169 2.390 ASP 40.A N ALA 256.A O ASP 40.A H 2.958 2.139 SER 42.A N ASP 40.A OD1 SER 42.A H 2.810 2.063 LEU 43.A N ASP 40.A O LEU 43.A H 3.065 2.209 SER 47.A N LYS 79.A O.A SER 47.A H 2.817 2.000 SER 47.A N LYS 79.A O.B SER 47.A H 2.920 2.083 SER 49.A N VAL 77.A O SER 49.A H 2.861 2.015 ALA 53.A N TYR 50.A O ALA 53.A H 3.129 2.290 SER 55.A OG PHE 174.A O SER 55.A HG 2.610 1.879 LEU 56.A N GLU 68.A O LEU 56.A H 2.709 1.888 ARG 57.A NE GLU 68.A OE1 ARG 57.A HE 2.771 1.967 ARG 57.A NH2 GLU 68.A OE1 ARG 57.A HH21 3.205 2.554 ARG 57.A NH2 GLU 68.A OE2 ARG 57.A HH21 2.781 1.936 ILE 58.A N ALA 172.A O ILE 58.A H 2.923 2.097 LEU 59.A N ASN 66.A O LEU 59.A H 2.909 2.140 ASN 60.A N LYS 170.A O ASN 60.A H 2.901 2.082 ASN 60.A ND2 ILE 165.A O ASN 60.A HD22 3.006 2.174 ASN 60.A ND2 ASN 228.A O ASN 60.A HD21 3.166 2.313 ASN 61.A N ALA 64.A O ASN 61.A H 3.123 2.351 GLY 62.A N ASN 60.A OD1 GLY 62.A H 2.826 2.020 HIS 63.A N ASN 61.A OD1 HIS 63.A H 2.960 2.106 ALA 64.A N ASN 61.A OD1 ALA 64.A H 3.048 2.231 ASN 66.A N LEU 59.A O ASN 66.A H 2.836 2.044 VAL 67.A N PHE 92.A O VAL 67.A H 2.904 2.095 GLU 68.A N ARG 57.A O GLU 68.A H 2.847 2.002 PHE 69.A N ILE 90.A O PHE 69.A H 2.953 2.189 ASP 70.A N THR 54.A O ASP 70.A H 2.819 2.014 SER 72.A N ASP 70.A OD1 SER 72.A H 2.939 2.084 LYS 75.A NZ THR 54.A OG1 LYS 75.A HZ3 3.047 2.265 LYS 75.A NZ ASP 70.A OD2 LYS 75.A HZ2 2.994 2.227 VAL 77.A N SER 49.A O VAL 77.A H 2.916 2.106 LEU 78.A N TYR 87.A O LEU 78.A H 2.762 1.948 LYS 79.A N.A SER 47.A O LYS 79.A H.A 2.972 2.158 LYS 79.A N.B SER 47.A O LYS 79.A H.B 2.935 2.107 GLY 81.A N PRO 45.A O GLY 81.A H 2.946 2.138 LEU 83.A N GLY 80.A O LEU 83.A H 2.803 1.958 TYR 87.A N LEU 78.A O TYR 87.A H 3.045 2.242 ARG 88.A N TRP 122.A O ARG 88.A H 2.762 1.968 ARG 88.A NE ASP 74.A OD1 ARG 88.A HE 2.571 1.750 ARG 88.A NH1 ASP 71.A O ARG 88.A HH11 2.970 2.197 ARG 88.A NH2 ASP 74.A OD1 ARG 88.A HH21 2.973 2.310 LEU 89.A N ALA 76.A O LEU 89.A H 2.684 1.828 ILE 90.A N VAL 120.A O ILE 90.A H 2.929 2.077 PHE 92.A N VAL 67.A O PHE 92.A H 2.968 2.213 HIS 93.A N HIS 118.A O HIS 93.A H 3.037 2.254 HIS 93.A ND1 GLN 91.A OE1 HIS 93.A HD1 2.837 1.981 HIS 95.A N GLU 116.A O HIS 95.A H 2.810 2.001 HIS 95.A ND1 ASN 242.A O HIS 95.A HD1 2.802 1.962 HIS 95.A NE2 HIS 118.A ND1 no hydrogen 3.046 N/A TRP 96.A N ASN 242.A OD1 TRP 96.A H 2.779 1.953 TRP 96.A NE1 MET 239.A O TRP 96.A HE1 2.757 2.117 SER 98.A N ASP 241.A OD1 SER 98.A H 2.950 2.213 SER 98.A OG ASP 241.A OD2 SER 98.A HG 2.706 2.045 GLN 102.A N LEU 99.A O GLN 102.A H 3.256 2.437 GLN 102.A NE2 ASP 241.A OD1 GLN 102.A HE21 2.897 2.039 GLN 102.A NE2 ASP 241.A OD2 GLN 102.A HE21 3.476 2.871 SER 104.A N TYR 113.A O SER 104.A H 2.978 2.224 SER 104.A OG HIS 106.A O SER 104.A HG 2.815 2.167 GLU 105.A N GLU 116.A OE1 GLU 105.A H 2.785 2.050 HIS 106.A N GLU 116.A OE1 HIS 106.A H 2.765 2.053 HIS 106.A ND1 GLU 116.A OE2 HIS 106.A HD1 2.740 1.887 HIS 106.A NE2 TYR 192.A OH HIS 106.A HE2 2.634 1.798 THR 107.A OG1 ASP 31.A OD1 THR 107.A HG1 2.675 1.940 VAL 108.A N LYS 111.A O VAL 108.A H 3.111 2.310 ASP 109.A N ILE 32.A O ASP 109.A H 2.930 2.100 LYS 110.A N ASP 31.A OD1 LYS 110.A H 2.878 2.069 LYS 111.A N VAL 108.A O LYS 111.A H 2.805 1.971 TYR 113.A N SER 104.A OG TYR 113.A H 2.953 2.146 ALA 115.A N LEU 146.A O ALA 115.A H 3.282 2.574 GLU 116.A N HIS 95.A O GLU 116.A H 2.818 2.042 LEU 117.A N ILE 144.A O LEU 117.A H 2.767 1.926 HIS 118.A N HIS 93.A O HIS 118.A H 2.808 1.953 HIS 118.A NE2 GLU 116.A OE2 HIS 118.A HE2 2.797 1.965 LEU 119.A N LEU 142.A O LEU 119.A H 2.910 2.068 VAL 120.A N GLN 91.A O VAL 120.A H 2.845 1.990 HIS 121.A N ALA 140.A O HIS 121.A H 2.938 2.189 HIS 121.A ND1 ALA 140.A O HIS 121.A HD1 2.961 2.209 HIS 121.A NE2 TYR 50.A OH no hydrogen 2.663 N/A TRP 122.A N ARG 88.A O TRP 122.A H 2.855 2.093 TRP 122.A NE1 ASP 71.A OD2 TRP 122.A HE1 2.761 2.005 ASN 123.A N GLY 138.A O ASN 123.A H 2.764 1.953 ASN 123.A ND2 ASP 137.A O ASN 123.A HD22 3.148 2.308 THR 124.A N THR 86.A O THR 124.A H 2.897 2.061 THR 124.A OG1 THR 86.A O THR 124.A HG1 3.377 2.579 LYS 125.A N ASN 123.A OD1 LYS 125.A H 3.152 2.302 TYR 126.A N ASN 123.A O TYR 126.A H 3.110 2.253 TYR 126.A OH ASP 137.A OD1 TYR 126.A HH 2.634 1.799 GLY 127.A N THR 124.A O GLY 127.A H 3.095 2.295 ASP 128.A N TYR 126.A O ASP 128.A H 2.951 2.276 LYS 131.A N.A ASP 128.A OD1 LYS 131.A H.A 2.747 1.957 LYS 131.A N.B ASP 128.A O LYS 131.A H.B 3.182 2.624 LYS 131.A N.B ASP 128.A OD1 LYS 131.A H.B 2.753 1.970 ALA 132.A N ASP 128.A O ALA 132.A H.A 2.933 2.149 VAL 133.A N PHE 129.A O VAL 133.A H 2.990 2.203 GLN 134.A N LYS 131.A O.A GLN 134.A H 3.085 2.280 GLN 134.A N LYS 131.A O.B GLN 134.A H 3.260 2.464 GLN 134.A NE2.A GLY 130.A O GLN 134.A HE21.A 2.806 1.955 GLN 135.A N ALA 132.A O GLN 135.A H 2.955 2.139 GLN 135.A NE2 LYS 131.A O.A GLN 135.A HE21 3.248 2.432 GLN 135.A NE2 LYS 131.A O.B GLN 135.A HE21 3.150 2.328 GLY 138.A N GLN 135.A O GLY 138.A H 3.005 2.280 LEU 139.A N CYS 204.A O LEU 139.A H 2.798 1.993 ALA 140.A N HIS 121.A O ALA 140.A H 2.888 2.086 VAL 141.A N THR 206.A O VAL 141.A H 3.113 2.327 LEU 142.A N LEU 119.A O LEU 142.A H 2.977 2.159 GLY 143.A N ILE 208.A O GLY 143.A H 2.787 1.958 ILE 144.A N LEU 117.A O ILE 144.A H 2.878 2.108 LEU 146.A N ALA 115.A O LEU 146.A H 2.784 1.949 LYS 147.A N ILE 214.A O LYS 147.A H 2.856 2.042 GLY 149.A N VAL 216.A O GLY 149.A H 2.828 2.000 LYS 152.A N GLN 220.A OE1 LYS 152.A H 2.916 2.078 LYS 152.A NZ LEU 183.A O LYS 152.A HZ3 3.277 2.388 LEU 155.A N LYS 152.A O LEU 155.A H 3.110 2.301 GLN 156.A N PRO 153.A O GLN 156.A H 3.012 2.168 GLN 156.A NE2 ASP 160.A OD1 GLN 156.A HE21 3.165 2.500 GLN 156.A NE2 ASP 160.A OD2 GLN 156.A HE21 3.241 2.423 VAL 159.A N LEU 155.A O VAL 159.A H 3.047 2.232 ASP 160.A N GLN 156.A O ASP 160.A H 2.850 2.072 VAL 161.A N VAL 158.A O VAL 161.A H 3.149 2.403 LEU 162.A N VAL 159.A O LEU 162.A H 3.299 2.460 SER 164.A N VAL 161.A O SER 164.A H 2.870 2.064 SER 164.A OG VAL 161.A O SER 164.A HG 2.657 1.974 ILE 165.A N LEU 162.A O ILE 165.A H 3.042 2.228 LYS 168.A N ASN 230.A O LYS 168.A H 2.938 2.113 GLY 169.A N ASN 60.A O GLY 169.A H 2.720 1.883 LYS 170.A N THR 167.A O LYS 170.A H 3.199 2.357 LYS 170.A NZ GLU 232.A OE1 LYS 170.A HZ1 3.373 2.685 ALA 172.A N ILE 58.A O ALA 172.A H 2.897 2.132 PHE 174.A N LEU 56.A O PHE 174.A H 3.071 2.223 THR 175.A OG1 ASN 176.A OD1 THR 175.A HG1 3.196 2.566 PHE 177.A N SER 55.A OG PHE 177.A H 2.859 2.002 ARG 180.A N ASP 178.A OD1 ARG 180.A H 2.921 2.116 ARG 180.A NE ASP 178.A OD1 ARG 180.A HE 3.003 2.157 ARG 180.A NE ASP 178.A OD2 ARG 180.A HE 3.186 2.508 ARG 180.A NH2 ASP 178.A OD2 ARG 180.A HH21 2.977 2.256 GLY 181.A N ASP 178.A O GLY 181.A H 3.148 2.300 LEU 182.A N PRO 179.A O LEU 182.A H 3.118 2.267 LEU 183.A N ARG 180.A O LEU 183.A H 3.256 2.402 SER 186.A N GLU 212.A OE1.A SER 186.A H 2.871 2.061 SER 186.A N GLU 212.A OE1.B SER 186.A H 2.901 2.091 ASP 188.A N SER 186.A OG ASP 188.A H 3.089 2.231 TYR 189.A N SER 257.A OG TYR 189.A H 2.921 2.089 TYR 189.A OH LYS 44.A O TYR 189.A HH 2.854 2.047 TRP 190.A N VAL 209.A O TRP 190.A H 2.843 2.021 THR 191.A N LYS 255.A O THR 191.A H 2.860 2.090 THR 191.A OG1 TRP 207.A O THR 191.A HG1 2.766 2.059 TYR 192.A N TRP 207.A O TYR 192.A H 3.243 2.495 TYR 192.A OH SER 28.A OG TYR 192.A HH 2.841 2.205 GLY 194.A N VAL 205.A O GLY 194.A H 2.794 1.936 SER 195.A N SER 28.A OG SER 195.A H 2.989 2.165 SER 195.A OG LEU 196.A O SER 195.A HG 2.733 2.039 LEU 196.A N LEU 202.A O LEU 196.A H 3.004 2.211 THR 197.A OG1 GLU 105.A OE1 THR 197.A HG1 2.644 2.022 LEU 201.A N THR 198.A O LEU 201.A H 2.837 2.084 VAL 205.A N GLY 194.A O VAL 205.A H 3.221 2.385 THR 206.A N LEU 139.A O THR 206.A H 2.897 2.060 TRP 207.A N TYR 192.A O TRP 207.A H 2.940 2.119 TRP 207.A NE1 SER 195.A O TRP 207.A HE1 2.893 2.099 ILE 208.A N VAL 141.A O ILE 208.A H 2.939 2.110 VAL 209.A N TRP 190.A O VAL 209.A H 2.828 1.990 LEU 210.A N GLY 143.A O LEU 210.A H 2.888 2.050 LYS 211.A N ASP 188.A O LYS 211.A H 2.969 2.141 ILE 214.A N PHE 145.A O ILE 214.A H.B 2.749 1.951 SER 215.A OG.B SER 150.A O.A SER 215.A HG.B 3.531 2.861 VAL 216.A N LYS 147.A O VAL 216.A H.A 2.842 2.018 SER 217.A N GLN 220.A OE1 SER 217.A H 3.108 2.287 GLU 219.A N GLU 219.A OE1 GLU 219.A H 2.840 2.098 GLN 220.A N SER 217.A OG GLN 220.A H 3.074 2.276 GLN 220.A NE2 LYS 152.A O GLN 220.A HE22 2.969 2.115 GLN 220.A NE2 GLN 156.A OE1 GLN 220.A HE21 2.941 2.145 VAL 221.A N SER 217.A O VAL 221.A H 3.061 2.226 LEU 222.A N SER 218.A O LEU 222.A H 2.893 2.072 LYS 223.A N GLU 219.A O LYS 223.A H 3.162 2.438 LYS 223.A N GLN 220.A O LYS 223.A H 3.086 2.455 PHE 224.A N GLN 220.A O PHE 224.A H 3.264 2.487 ARG 225.A N VAL 221.A O ARG 225.A H 3.103 2.337 ARG 225.A NE GLY 97.A O ARG 225.A HE 2.829 2.017 ARG 225.A NH1 ASP 100.A OD1 ARG 225.A HH12 3.512 2.855 ARG 225.A NH2 ASP 100.A OD1 ARG 225.A HH22 2.874 2.017 LYS 226.A N LYS 223.A O LYS 226.A H 3.186 2.356 LEU 227.A N PHE 224.A O LEU 227.A H 3.186 2.343 ASN 228.A N LYS 166.A O ASN 228.A H 2.893 2.119 PHE 229.A N GLU 237.A O PHE 229.A H 2.973 2.166 ASN 230.A ND2 GLY 231.A O ASN 230.A HD22 3.048 2.211 GLY 231.A N GLU 234.A OE1 GLY 231.A H 2.787 2.040 GLU 237.A N ASN 230.A OD1 GLU 237.A H 2.843 1.995 MET 239.A N LEU 227.A O MET 239.A H 2.749 1.897 ASN 242.A N TRP 96.A O ASN 242.A H 3.266 2.624 ASN 242.A ND2 HIS 63.A O ASN 242.A HD22 2.935 2.085 TRP 243.A NE1 ASP 241.A OD1 TRP 243.A HE1 3.060 2.211 ARG 244.A N GLU 105.A OE2 ARG 244.A H 2.801 1.946 ARG 244.A NH1 GLN 27.A OE1 ARG 244.A HH12 2.835 2.006 ARG 244.A NH1 SER 28.A O ARG 244.A HH11 2.723 1.993 ARG 244.A NH2 ALA 22.A O ARG 244.A HH22 3.228 2.575 ARG 244.A NH2 GLN 27.A OE1 ARG 244.A HH22 3.363 2.694 GLN 247.A N PRO 29.A O GLN 247.A H 2.749 1.927 GLN 247.A NE2 PRO 245.A O GLN 247.A HE21 2.775 1.948 LYS 250.A NZ LYS 23.A O LYS 250.A HZ2 3.254 2.581 LYS 250.A NZ GLY 24.A O LYS 250.A HZ2 3.537 2.759 LYS 250.A NZ GLU 25.A OE2 LYS 250.A HZ3 3.541 2.740 ARG 252.A NE LEU 249.A O ARG 252.A HE 2.822 1.965 ARG 252.A NH1 GLN 27.A O ARG 252.A HH12 3.007 2.277 ARG 252.A NH1 PRO 193.A O ARG 252.A HH11 2.909 2.060 ARG 252.A NH2 GLN 27.A O ARG 252.A HH22 2.800 1.999 ARG 252.A NH2 PRO 248.A O ARG 252.A HH21 2.868 2.182 ARG 252.A NH2 LEU 249.A O ARG 252.A HH21 3.518 2.881 GLN 253.A NE2.A THR 36.A O GLN 253.A HE22.A 3.214 2.628 LYS 255.A N THR 191.A O LYS 255.A H 3.021 2.170 ALA 256.A N LYS 38.A O ALA 256.A H 2.786 1.951 SER 257.A N TYR 189.A O SER 257.A H 2.839 1.987