Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 6yd5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 5.A N ASP 89.A OD2 THR 5.A H 2.832 2.005 LYS 7.A N MET 90.A O LYS 7.A H 2.993 2.197 LYS 7.A NZ GLU 31.A OE1 LYS 7.A HZ3 2.860 2.120 LYS 7.A NZ ALA 84.A O LYS 7.A HZ2 2.861 2.110 LYS 7.A NZ GLN 86.A O LYS 7.A HZ1 2.879 2.195 VAL 8.A N GLU 31.A O VAL 8.A H 2.827 2.006 ILE 9.A N PHE 92.A O ILE 9.A H 2.754 1.917 GLY 10.A N ILE 33.A O GLY 10.A H 2.896 2.117 VAL 11.A N THR 94.A O VAL 11.A H 2.984 2.210 GLY 12.A N ILE 35.A O GLY 12.A H 3.009 2.190 ASN 16.A N GLY 12.A O ASN 16.A H 3.015 2.199 ASN 16.A ND2 GLY 10.A O ASN 16.A HD21 3.617 3.099 ASN 16.A ND2 GLY 12.A O ASN 16.A HD22 2.831 2.163 ASN 16.A ND2 ILE 35.A O ASN 16.A HD21 2.935 2.186 ASN 17.A N GLY 13.A O ASN 17.A H.A 2.885 2.076 ALA 18.A N GLY 14.A O ALA 18.A H 3.069 2.237 VAL 19.A N GLY 15.A O VAL 19.A H 3.122 2.317 ASN 20.A N ASN 16.A O ASN 20.A H 2.898 2.070 ARG 21.A N ASN 17.A O ARG 21.A H 3.008 2.164 ARG 21.A NE ASP 179.A OD2 ARG 21.A HE 2.492 1.653 ARG 21.A NH2 ASP 179.A OD1 ARG 21.A HH21 3.278 2.440 MET 22.A N ALA 18.A O MET 22.A H 2.912 2.104 ILE 23.A N VAL 19.A O ILE 23.A H 2.841 2.041 ASP 24.A N ASN 20.A O ASP 24.A H 3.072 2.283 HIS 25.A N MET 22.A O HIS 25.A H 2.916 2.202 GLU 31.A N LEU 6.A O GLU 31.A H 3.109 2.256 PHE 32.A N GLU 48.A OE2 PHE 32.A H 3.038 2.189 ILE 33.A N VAL 8.A O ILE 33.A H 2.875 2.055 ALA 34.A N SER 49.A O ALA 34.A H 2.909 2.070 ILE 35.A N GLY 10.A O ILE 35.A H 2.863 2.088 ASN 36.A N ILE 51.A O ASN 36.A H 3.191 2.401 ASP 38.A N ASN 36.A OD1 ASP 38.A H 3.340 2.494 GLY 39.A N GLY 60.A O GLY 39.A H 2.888 2.029 ALA 41.A N ASP 38.A OD1 ALA 41.A H 3.136 2.299 LEU 42.A N ASP 38.A O LEU 42.A H 2.977 2.127 ASN 43.A N GLY 39.A O ASN 43.A H 3.025 2.228 LEU 44.A N ALA 41.A O LEU 44.A H 2.884 2.122 SER 45.A N LEU 42.A O SER 45.A H 2.920 2.078 LYS 46.A N ASN 20.A OD1 LYS 46.A H 3.025 2.187 LYS 46.A NZ ASP 24.A OD2 LYS 46.A HZ1 3.337 2.474 ALA 47.A N SER 45.A OG ALA 47.A H 2.971 2.115 GLU 48.A N GLU 48.A OE1 GLU 48.A H 2.678 1.838 SER 49.A OG GLU 31.A OE2 SER 49.A HG 3.427 2.752 LYS 50.A NZ LEU 42.A O LYS 50.A HZ3 3.447 2.655 LYS 50.A NZ ASN 43.A O LYS 50.A HZ3 3.253 2.703 LYS 50.A NZ SER 45.A O LYS 50.A HZ1 3.179 2.618 ILE 51.A N ALA 34.A O ILE 51.A H 2.810 2.006 ILE 53.A N ASN 36.A O ILE 53.A H 2.973 2.169 LEU 57.A N GLY 54.A O LEU 57.A H 2.893 2.256 THR 58.A N GLY 54.A O THR 58.A H 2.831 2.010 THR 58.A OG1 LEU 61.A O THR 58.A HG1 2.750 2.063 ARG 59.A N GLU 55.A O ARG 59.A H 2.883 2.224 GLY 60.A N THR 58.A OG1 GLY 60.A H 3.177 2.456 LEU 61.A N THR 58.A O LEU 61.A H 3.187 2.335 ASN 66.A N ALA 63.A O ASN 66.A H 3.056 2.231 GLU 68.A N ASN 66.A OD1 GLU 68.A H.A 3.054 2.343 ILE 69.A N ASN 66.A O ILE 69.A H 2.964 2.283 GLY 70.A N ASN 66.A O GLY 70.A H 3.365 2.572 LYS 71.A N PRO 67.A O LYS 71.A H 2.885 2.070 LYS 71.A NZ GLU 75.A OE2 LYS 71.A HZ3 2.612 1.875 LYS 72.A N GLU 68.A O LYS 72.A H 3.028 2.173 ALA 73.A N ILE 69.A O ALA 73.A H 2.835 2.010 ALA 74.A N GLY 70.A O ALA 74.A H 3.084 2.270 GLU 75.A N LYS 71.A O GLU 75.A H 3.026 2.214 GLU 76.A N LYS 72.A O GLU 76.A H 2.808 1.981 SER 77.A N ALA 73.A O SER 77.A H 3.258 2.607 SER 77.A N ALA 74.A O SER 77.A H 3.196 2.502 SER 77.A OG ALA 73.A O SER 77.A HG 3.488 2.869 ARG 78.A N GLU 75.A O ARG 78.A H 3.187 2.342 ARG 78.A NH1 GLU 82.A OE2 ARG 78.A HH11 2.633 1.879 ARG 78.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 78.A HH12 3.338 2.590 ARG 78.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 78.A HH22 3.461 2.704 ARG 78.A NH2 GLU 115.A OE2 ARG 78.A HH22 3.220 2.435 ILE 81.A N SER 77.A O ILE 81.A H 3.051 2.246 GLU 82.A N ARG 78.A O GLU 82.A H 2.844 1.997 ASP 83.A N GLU 79.A O ASP 83.A H 2.970 2.134 ALA 84.A N GLN 80.A O ALA 84.A H 3.181 2.431 ILE 85.A N ILE 81.A O ILE 85.A H 3.112 2.364 ILE 85.A N GLU 82.A O ILE 85.A H 3.160 2.534 GLN 86.A N GLU 82.A O GLN 86.A H.B 3.072 2.400 ALA 88.A N ILE 85.A O ALA 88.A H 2.950 2.129 ASP 89.A N THR 5.A O ASP 89.A H 2.846 2.047 MET 90.A N THR 5.A O MET 90.A H 3.165 2.384 VAL 91.A N LEU 119.A O VAL 91.A H 2.789 1.967 PHE 92.A N LYS 7.A O PHE 92.A H 2.877 2.054 VAL 93.A N VAL 121.A O VAL 93.A H 2.811 1.996 THR 94.A N ILE 9.A O THR 94.A H 2.876 2.028 THR 94.A OG1 VAL 123.A O THR 94.A HG1 2.950 2.240 SER 95.A N VAL 123.A O SER 95.A H 3.291 2.548 SER 95.A OG VAL 11.A O SER 95.A HG 2.843 2.008 MET 97.A N THR 125.A O MET 97.A H 2.986 2.176 GLY 98.A N THR 103.A OG1 GLY 98.A H 2.845 2.026 THR 103.A OG1 GLY 99.A O THR 103.A HG1 2.642 2.130 GLY 104.A N GLY 100.A O GLY 104.A H 3.357 2.580 ALA 105.A N THR 101.A O ALA 105.A H 2.673 1.827 ALA 106.A N GLY 102.A O ALA 106.A H 2.930 2.108 VAL 109.A N ALA 105.A O VAL 109.A H 2.957 2.122 ALA 110.A N ALA 106.A O ALA 110.A H 2.966 2.125 LYS 111.A N PRO 107.A O LYS 111.A H 2.970 2.144 ILE 112.A N VAL 108.A O ILE 112.A H 2.971 2.149 ALA 113.A N VAL 109.A O ALA 113.A H 3.048 2.225 LYS 114.A N ALA 110.A O LYS 114.A H 2.983 2.160 LYS 114.A NZ ASN 212.A OD1 LYS 114.A HZ1 2.856 2.064 GLU 115.A N LYS 111.A O GLU 115.A H 2.885 2.054 MET 116.A N ILE 112.A O MET 116.A H 3.200 2.516 MET 116.A N ALA 113.A O MET 116.A H 3.227 2.529 GLY 117.A N LYS 114.A O GLY 117.A H 2.984 2.136 ALA 118.A N ALA 113.A O ALA 118.A H 3.260 2.460 LEU 119.A N ASP 89.A O LEU 119.A H 2.966 2.163 THR 120.A N ASP 151.A OD2 THR 120.A H 2.952 2.125 THR 120.A OG1 ALA 118.A O THR 120.A HG1 2.992 2.196 VAL 121.A N VAL 91.A O VAL 121.A H 2.865 2.022 GLY 122.A N THR 152.A O GLY 122.A H 2.901 2.089 VAL 123.A N VAL 93.A O VAL 123.A H 2.913 2.090 VAL 124.A N ILE 154.A O VAL 124.A H 2.969 2.146 THR 125.A N SER 95.A O THR 125.A H 3.195 2.446 ARG 126.A N ILE 156.A O ARG 126.A H 3.042 2.285 ARG 126.A NE GLU 243.A OE1 ARG 126.A HE 2.616 1.804 ARG 126.A NH2 GLU 243.A OE1 ARG 126.A HH21 3.384 2.801 ARG 126.A NH2 GLU 243.A OE2 ARG 126.A HH21 2.723 1.871 PHE 128.A N GLU 131.A OE2 PHE 128.A H 3.021 2.296 SER 129.A N ASP 159.A OD1 SER 129.A H 2.804 1.971 SER 129.A OG ASP 159.A OD2 SER 129.A HG 2.546 1.798 GLU 131.A N PHE 128.A O GLU 131.A H 3.018 2.189 GLY 132.A N SER 129.A O GLY 132.A H 3.001 2.168 GLN 136.A N GLY 132.A O GLN 136.A H 3.175 2.378 GLN 136.A NE2 PRO 127.A O GLN 136.A HE22 3.047 2.213 THR 137.A N ARG 133.A O THR 137.A H 2.864 2.053 THR 137.A OG1 ARG 133.A O THR 137.A HG1 3.146 2.373 GLN 138.A N LYS 134.A O GLN 138.A H 2.953 2.103 GLN 138.A NE2 ALA 65.A O GLN 138.A HE22 3.038 2.367 GLN 138.A NE2 GLY 98.A O GLN 138.A HE21 2.975 2.203 ALA 139.A N ARG 135.A O ALA 139.A H 2.858 2.038 ALA 140.A N GLN 136.A O ALA 140.A H 2.869 2.111 ALA 141.A N THR 137.A O ALA 141.A H 3.171 2.367 GLY 142.A N GLN 138.A O GLY 142.A H 3.230 2.423 VAL 143.A N ALA 139.A O VAL 143.A H 2.893 2.093 GLU 144.A N ALA 140.A O GLU 144.A H 3.065 2.227 ALA 145.A N ALA 141.A O ALA 145.A H 2.976 2.145 MET 146.A N GLY 142.A O MET 146.A H 2.819 1.997 LYS 147.A N VAL 143.A O LYS 147.A H 2.866 2.026 LYS 147.A NZ GLU 144.A OE1 LYS 147.A HZ2 2.841 1.957 LYS 147.A NZ GLU 144.A OE2 LYS 147.A HZ2 3.520 2.837 ALA 148.A N GLU 144.A O ALA 148.A H 3.230 2.448 ALA 149.A N MET 146.A O ALA 149.A H 2.873 2.051 VAL 150.A N MET 146.A O VAL 150.A H 3.007 2.410 ASP 151.A N THR 120.A O ASP 151.A H 2.793 2.057 THR 152.A N THR 120.A O THR 152.A H 3.340 2.547 THR 152.A OG1 MET 210.A O THR 152.A HG1 3.170 2.426 LEU 153.A N GLY 214.A O LEU 153.A H 2.771 2.039 ILE 154.A N GLY 122.A O ILE 154.A H 2.803 1.957 ILE 156.A N VAL 124.A O ILE 156.A H 2.774 1.937 ASN 158.A N ARG 126.A O ASN 158.A H 2.930 2.091 ARG 160.A N PRO 157.A O ARG 160.A H.A 2.912 2.090 ARG 160.A NH1.A LEU 242.A O ARG 160.A HH12.A 2.215 1.563 LEU 161.A N ASN 158.A O LEU 161.A H 2.885 2.101 LEU 162.A N ASP 159.A O LEU 162.A H 3.006 2.264 ASP 163.A N ARG 160.A O ASP 163.A H 2.944 2.116 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.213 2.359 ASP 166.A N THR 169.A OG1 ASP 166.A H 3.011 2.258 SER 168.A N ASP 166.A OD1 SER 168.A H 2.838 2.048 THR 169.A N ASP 166.A O THR 169.A H 3.327 2.522 ALA 174.A N PRO 170.A O ALA 174.A H 3.142 2.336 PHE 175.A N MET 171.A O PHE 175.A H 2.959 2.134 LYS 176.A N MET 172.A O LYS 176.A H 3.103 2.353 GLU 177.A N ALA 174.A O GLU 177.A H 2.995 2.314 ASP 179.A N PHE 175.A O ASP 179.A H 2.928 2.097 ASN 180.A N LYS 176.A O ASN 180.A H.B 3.129 2.460 ASN 180.A N GLU 177.A O ASN 180.A H.B 3.239 2.560 VAL 181.A N ALA 178.A O VAL 181.A H 3.113 2.371 ARG 183.A N ASP 179.A O ARG 183.A H 2.988 2.144 ARG 183.A NH1 ASN 180.A OD1.A ARG 183.A HH11 3.284 2.472 GLN 184.A N ASN 180.A O GLN 184.A H 2.925 2.069 GLN 184.A NE2 ASN 180.A OD1.A GLN 184.A HE21 2.771 1.932 GLY 185.A N VAL 181.A O GLY 185.A H 3.289 2.471 VAL 186.A N LEU 182.A O VAL 186.A H 2.976 2.134 GLN 187.A N ARG 183.A O GLN 187.A H 2.853 1.998 GLN 187.A NE2 GLN 187.A O GLN 187.A HE21 3.355 2.778 GLN 187.A NE2 ASP 191.A OD1.A GLN 187.A HE21 2.936 2.193 GLY 188.A N GLN 184.A O GLY 188.A H 2.863 2.069 ILE 189.A N GLY 185.A O ILE 189.A H 3.263 2.429 SER 190.A N VAL 186.A O SER 190.A H 3.021 2.171 ASP 191.A N GLN 187.A O ASP 191.A H.A 2.891 2.056 LEU 192.A N GLY 188.A O LEU 192.A H 2.958 2.136 ILE 193.A N ILE 189.A O ILE 193.A H 2.934 2.162 ALA 194.A N SER 190.A O ALA 194.A H 3.038 2.277 ALA 194.A N ASP 191.A O ALA 194.A H 3.211 2.622 VAL 195.A N ASP 191.A O VAL 195.A H 3.006 2.243 GLY 197.A N ASN 200.A OD1 GLY 197.A H 2.720 1.877 VAL 199.A N THR 288.A O VAL 199.A H 3.184 2.368 ASP 202.A N ASP 205.A OD2 ASP 202.A H 2.896 2.123 ALA 204.A N ASP 202.A OD1 ALA 204.A H 2.973 2.330 ASP 205.A N ASP 202.A O ASP 205.A H 2.906 2.297 VAL 206.A N ASP 202.A O VAL 206.A H 3.247 2.457 LYS 207.A N PHE 203.A O LYS 207.A H 2.897 2.076 THR 208.A N ALA 204.A O THR 208.A H 3.012 2.213 ILE 209.A N ASP 205.A O ILE 209.A H 3.070 2.245 MET 210.A N VAL 206.A O MET 210.A H 2.876 2.158 SER 211.A N LYS 207.A O SER 211.A H.B 2.854 2.044 SER 211.A OG.B LYS 207.A O SER 211.A HG.B 2.841 2.204 ASN 212.A N ASP 151.A OD1 ASN 212.A H 2.869 2.119 GLN 213.A N ASP 151.A O GLN 213.A H 2.893 2.058 GLN 213.A NE2 SER 211.A O GLN 213.A HE21 3.388 2.735 GLY 214.A N ASP 151.A O GLY 214.A H 3.257 2.609 ALA 216.A N LEU 153.A O ALA 216.A H 2.982 2.282 LEU 217.A N ALA 304.A O LEU 217.A H 2.825 2.044 GLY 219.A N VAL 302.A O GLY 219.A H 2.924 2.097 GLY 221.A N VAL 300.A O GLY 221.A H 2.711 1.904 SER 223.A N ILE 298.A O SER 223.A H.B 3.098 2.292 SER 223.A OG.B GLU 231.A OE1 SER 223.A HG.B 2.865 2.135 GLY 225.A N ASP 296.A OD2.B GLY 225.A H 2.591 1.767 ARG 228.A N GLY 225.A O ARG 228.A H 3.312 2.609 ARG 228.A NE GLU 266.A OE1 ARG 228.A HE 3.101 2.250 ARG 228.A NH1 ASP 296.A O ARG 228.A HH11 2.994 2.189 ARG 228.A NH2 SER 261.A OG ARG 228.A HH22 3.041 2.272 ARG 228.A NH2 GLU 266.A OE2 ARG 228.A HH21 2.687 1.880 GLU 231.A N ASN 227.A O GLU 231.A H 2.949 2.109 ALA 232.A N ARG 228.A O ALA 232.A H 2.879 2.042 ALA 233.A N ALA 229.A O ALA 233.A H 3.042 2.202 LYS 234.A N VAL 230.A O LYS 234.A H 2.915 2.071 LYS 235.A N GLU 231.A O LYS 235.A H 2.985 2.163 LYS 235.A NZ VAL 222.A O LYS 235.A HZ2 2.922 2.151 ALA 236.A N ALA 232.A O ALA 236.A H 2.916 2.150 ILE 237.A N ALA 233.A O ILE 237.A H 3.287 2.588 SER 238.A N LYS 235.A O SER 238.A H 3.337 2.491 SER 238.A OG LYS 234.A O SER 238.A HG 2.712 2.007 LEU 241.A N SER 239.A OG LEU 241.A H 3.112 2.269 GLU 243.A N VAL 155.A O GLU 243.A H 3.188 2.398 VAL 247.A N SER 245.A OG VAL 247.A H 3.220 2.369 GLY 248.A N ALA 277.A O GLY 248.A H 3.210 2.365 ALA 249.A N ILE 246.A O ALA 249.A H 3.148 2.350 GLN 250.A N THR 305.A O GLN 250.A H 2.853 2.136 GLN 250.A N GLY 306.A O GLN 250.A H 2.998 2.404 GLY 251.A N THR 305.A O GLY 251.A H 2.956 2.156 VAL 252.A N ASN 283.A O VAL 252.A H 2.835 2.000 LEU 253.A N ILE 303.A O LEU 253.A H 2.788 2.000 MET 254.A N ILE 285.A O MET 254.A H 2.900 2.073 ASN 255.A N THR 301.A O ASN 255.A H 3.006 2.190 ASN 255.A ND2 THR 257.A OG1 ASN 255.A HD21 2.906 2.272 ILE 256.A N GLY 287.A O ILE 256.A H 3.079 2.292 THR 257.A N VAL 299.A O THR 257.A H 2.817 1.971 GLY 258.A N VAL 289.A O GLY 258.A H 3.161 2.358 LEU 262.A N GLY 259.A O LEU 262.A H 3.058 2.199 SER 263.A N GLU 266.A OE2 SER 263.A H 2.860 2.059 GLU 266.A N SER 263.A OG GLU 266.A H 2.982 2.172 ALA 267.A N SER 263.A O ALA 267.A H 3.140 2.308 GLN 268.A N LEU 264.A O GLN 268.A H 3.042 2.223 GLU 269.A N PHE 265.A O GLU 269.A H.A 2.960 2.151 ALA 270.A N GLU 266.A O ALA 270.A H 3.009 2.199 ALA 271.A N ALA 267.A O ALA 271.A H 3.088 2.231 ASP 272.A N GLN 268.A O ASP 272.A H 2.896 2.074 ILE 273.A N GLU 269.A O ILE 273.A H 3.109 2.315 VAL 274.A N ALA 270.A O VAL 274.A H 3.322 2.571 VAL 274.A N ALA 271.A O VAL 274.A H 3.133 2.545 GLN 275.A N ALA 271.A O GLN 275.A H 2.841 1.996 ASP 276.A N ASP 272.A O ASP 276.A H 2.959 2.119 ALA 277.A N VAL 274.A O ALA 277.A H 3.223 2.421 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 3.223 2.413 ASP 279.A N ALA 249.A O ASP 279.A H 2.780 1.950 ASP 281.A N ASP 279.A OD2 ASP 281.A H 3.283 2.430 VAL 282.A N ASP 279.A O VAL 282.A H 3.039 2.296 ASN 283.A N GLN 250.A O ASN 283.A H 2.896 2.063 ILE 285.A N VAL 252.A O ILE 285.A H 2.817 1.983 GLY 287.A N MET 254.A O GLY 287.A H 2.776 1.966 THR 288.A N VAL 199.A O THR 288.A H 3.256 2.447 VAL 289.A N ILE 256.A O VAL 289.A H 2.930 2.109 ASN 291.A N GLY 258.A O ASN 291.A H 2.813 1.994 GLU 293.A N ASN 291.A OD1 GLU 293.A H 3.089 2.345 LEU 294.A N ASN 291.A O LEU 294.A H 2.779 1.987 ILE 298.A N SER 223.A O ILE 298.A H 2.935 2.138 VAL 299.A N THR 257.A O VAL 299.A H 2.813 1.979 VAL 300.A N GLY 221.A O VAL 300.A H 2.805 1.983 THR 301.A N ASN 255.A O THR 301.A H 2.994 2.156 VAL 302.A N GLY 219.A O VAL 302.A H 2.905 2.092 ILE 303.A N LEU 253.A O ILE 303.A H 2.761 1.913 ALA 304.A N LEU 217.A O ALA 304.A H 2.938 2.129 THR 305.A N GLY 251.A O THR 305.A H 2.876 2.060 THR 305.A OG1 ILE 209.A O THR 305.A HG1 2.749 1.909