Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 7gub_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 5.A N GLU 2.A O LYS 5.A H 3.059 2.362 GLU 6.A N GLU 2.A O GLU 6.A H 3.138 2.321 PHE 7.A N MET 3.A O PHE 7.A H 2.781 2.090 GLU 8.A N GLU 4.A O GLU 8.A H 3.327 2.493 GLN 9.A N LYS 5.A O GLN 9.A H 2.887 2.049 ILE 10.A N GLU 6.A O ILE 10.A H 3.135 2.314 ASP 11.A N PHE 7.A O ASP 11.A H 2.894 2.060 LYS 12.A N GLU 8.A O LYS 12.A H 2.949 2.088 SER 13.A N GLN 9.A O SER 13.A H 3.091 2.250 GLY 14.A N ASP 11.A O GLY 14.A H 3.064 2.266 SER 15.A N ILE 10.A O SER 15.A H 3.056 2.255 TRP 16.A NE1 ASP 11.A OD1 TRP 16.A HE1 3.267 2.477 ALA 18.A N SER 15.A O ALA 18.A H 2.780 2.013 ILE 19.A N SER 15.A O ILE 19.A H 3.203 2.397 TYR 20.A N TRP 16.A O TYR 20.A H 3.160 2.301 TYR 20.A OH ILE 261.A O TYR 20.A HH 2.765 1.978 GLN 21.A N ALA 17.A O GLN 21.A H 3.302 2.545 ASP 22.A N ALA 18.A O ASP 22.A H 2.899 2.130 ILE 23.A N ILE 19.A O ILE 23.A H 3.216 2.468 ILE 23.A N TYR 20.A O ILE 23.A H 3.174 2.584 ARG 24.A N TYR 20.A O ARG 24.A H 3.111 2.273 ARG 24.A NH1 TYR 20.A OH ARG 24.A HH11 3.042 2.263 HIS 25.A N GLN 21.A O HIS 25.A H 3.115 2.422 HIS 25.A ND1 GLU 26.A OE2 no hydrogen 3.014 N/A GLU 26.A N ASP 22.A O GLU 26.A H 3.077 2.305 ARG 33.A N ASP 53.A OD2 ARG 33.A H 2.682 1.928 VAL 34.A N ASP 53.A OD1 VAL 34.A H 3.007 2.180 LYS 36.A N ARG 33.A O LYS 36.A H 3.008 2.310 LEU 37.A N VAL 34.A O LEU 37.A H 3.267 2.448 ASN 40.A N LEU 37.A O ASN 40.A H 3.204 2.368 ASN 40.A ND2 VAL 34.A O ASN 40.A HD22 3.036 2.222 LYS 41.A N PRO 38.A O LYS 41.A H 3.130 2.296 ARG 43.A N ASN 40.A O ARG 43.A H 3.107 2.279 ARG 43.A NH1 ASN 64.A O ARG 43.A HH12 3.518 2.756 ARG 43.A NH1 TYR 66.A O ARG 43.A HH11 3.023 2.258 ASN 44.A N LYS 41.A O ASN 44.A H 3.431 2.589 ASN 44.A ND2 ALA 35.A O ASN 44.A HD21 2.981 2.350 ARG 45.A N GLN 85.A OE1 ARG 45.A H 3.136 2.293 ARG 45.A NE GLY 86.A O ARG 45.A HE 3.295 2.479 ARG 45.A NH2 GLY 86.A O ARG 45.A HH21 3.484 2.735 ARG 45.A NH2 PRO 87.A O ARG 45.A HH21 2.944 2.345 TYR 46.A OH SER 216.A OG TYR 46.A HH 3.202 2.374 ARG 47.A NH1 LYS 41.A O ARG 47.A HH12 3.536 2.930 ASP 48.A N ASP 48.A OD1 ASP 48.A H 2.577 1.880 ASP 53.A N PRO 31.A O ASP 53.A H 2.959 2.124 HIS 54.A NE2 LYS 255.A O HIS 54.A HE2 2.818 2.099 SER 55.A OG PHE 256.A O SER 55.A HG 2.714 2.008 ARG 56.A NH1 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH12 2.847 2.049 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD1 ARG 56.A HH22 3.104 2.393 ARG 56.A NH2 ASP 65.A OD2 ARG 56.A HH22 3.263 2.485 ILE 57.A N ALA 69.A O ILE 57.A H 2.944 2.121 LEU 59.A N ASP 65.A O LEU 59.A H 2.974 2.138 HIS 60.A N GLU 101.A OE1 HIS 60.A H 2.940 2.104 GLN 61.A N LEU 59.A O GLN 61.A H 2.925 2.298 GLN 61.A NE2 ASN 64.A O GLN 61.A HE21 2.878 2.370 ASN 64.A ND2 ASN 40.A OD1 ASN 64.A HD21 2.866 2.023 TYR 66.A N ASN 64.A OD1 TYR 66.A H 2.973 2.148 TYR 66.A OH ASN 44.A OD1 TYR 66.A HH 2.709 1.931 ASN 68.A ND2 ASN 44.A OD1 ASN 68.A HD22 3.010 2.209 ASN 68.A ND2 VAL 49.A O ASN 68.A HD21 3.017 2.201 SER 70.A N LEU 83.A O SER 70.A H 2.898 2.076 LEU 71.A N SER 55.A O LEU 71.A H 2.998 2.163 ILE 72.A N TYR 81.A O ILE 72.A H 2.829 2.065 MET 74.A N ARG 79.A O MET 74.A H 2.933 2.092 GLN 78.A N MET 74.A O GLN 78.A H 3.126 2.543 GLN 78.A N GLU 75.A O GLN 78.A H 3.291 2.554 ARG 79.A NE ASP 229.A OD2 ARG 79.A HE 2.725 1.873 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 79.A HH21 3.113 2.261 ARG 79.A NH2 ASP 229.A OD2 ARG 79.A HH21 3.250 2.584 TYR 81.A N ILE 72.A O TYR 81.A H 2.995 2.164 TYR 81.A OH ASP 229.A OD2 TYR 81.A HH 2.891 2.085 ILE 82.A N VAL 211.A O ILE 82.A H 2.893 2.039 LEU 83.A N SER 70.A O LEU 83.A H 2.949 2.173 THR 84.A N VAL 213.A O THR 84.A H 3.172 2.370 THR 84.A OG1 ASN 68.A O THR 84.A HG1 2.808 2.015 GLN 85.A NE2 ARG 43.A O GLN 85.A HE22 2.875 2.208 GLY 86.A N SER 216.A O GLY 86.A H 3.139 2.409 LEU 88.A N THR 91.A OG1 LEU 88.A H 2.881 2.054 ASN 90.A ND2 ASN 42.A O ASN 90.A HD22 2.726 1.877 THR 91.A N LEU 88.A O THR 91.A H 3.024 2.197 VAL 92.A N PRO 89.A O VAL 92.A H 3.331 2.495 PHE 95.A N THR 91.A O PHE 95.A H 2.950 2.133 TRP 96.A N VAL 92.A O TRP 96.A H 3.265 2.437 TRP 96.A NE1 TYR 124.A O TRP 96.A HE1 3.065 2.261 GLU 97.A N GLY 93.A O GLU 97.A H 3.170 2.365 MET 98.A N HIS 94.A O MET 98.A H 2.855 2.040 VAL 99.A N PHE 95.A O VAL 99.A H 2.994 2.210 TRP 100.A N TRP 96.A O TRP 100.A H 3.014 2.162 GLU 101.A N GLU 97.A O GLU 101.A H 2.930 2.092 GLN 102.A N MET 98.A O GLN 102.A H 3.102 2.261 LYS 103.A N TRP 100.A O LYS 103.A H 2.830 1.997 SER 104.A N VAL 99.A O SER 104.A H 3.327 2.519 SER 104.A OG PRO 210.A O SER 104.A HG 2.565 1.828 ARG 105.A NH1 SER 201.A O ARG 105.A HH12 3.302 2.757 ARG 105.A NH2 GLU 170.A OE1 ARG 105.A HH21 2.751 2.023 VAL 107.A N LEU 172.A O VAL 107.A H 2.810 1.984 VAL 108.A N VAL 212.A O VAL 108.A H 2.892 2.064 MET 109.A N PHE 174.A O MET 109.A H 2.746 1.959 LEU 110.A N HIS 214.A O LEU 110.A H 3.142 2.350 ASN 111.A ND2 ARG 112.A O ASN 111.A HD22 2.955 2.262 ARG 112.A N GLU 115.A OE2 ARG 112.A H 2.936 2.096 ARG 112.A NH1 THR 177.A O ARG 112.A HH11 3.172 2.478 ARG 112.A NH1 TRP 179.A O ARG 112.A HH12 2.794 1.994 ARG 112.A NH2 TRP 179.A O ARG 112.A HH22 3.127 2.439 ARG 112.A NH2 ASP 181.A OD1 ARG 112.A HH21 2.659 2.032 GLU 115.A N SER 118.A O GLU 115.A H 3.033 2.315 LYS 116.A N ASP 181.A OD2 LYS 116.A H 3.107 2.330 SER 118.A N GLU 115.A O SER 118.A H 2.938 2.102 LYS 120.A N VAL 113.A O LYS 120.A H 2.866 2.027 CYS 121.A SG ALA 122.A O CYS 121.A HG 3.351 2.380 ALA 122.A N PRO 87.A O ALA 122.A H 3.003 2.166 GLN 123.A NE2 TRP 125.A O GLN 123.A HE21 2.897 2.059 GLU 129.A N GLU 129.A OE1 GLU 129.A H 2.813 2.013 GLU 130.A N GLU 130.A OE1 GLU 130.A H 2.783 2.021 LYS 131.A N LYS 128.A O LYS 131.A H 2.946 2.111 GLU 132.A N GLU 132.A OE1 GLU 132.A H 2.586 1.775 MET 133.A N LEU 142.A O MET 133.A H 3.006 2.182 PHE 135.A N LEU 140.A O PHE 135.A H 3.059 2.239 THR 138.A OG1 GLY 93.A O THR 138.A HG1 3.143 2.319 ASN 139.A N PHE 135.A O ASN 139.A H 2.864 2.265 LEU 140.A N PHE 135.A O LEU 140.A H 3.403 2.596 LYS 141.A N GLU 161.A O LYS 141.A H 2.965 2.124 LEU 142.A N MET 133.A O LEU 142.A H 2.994 2.176 THR 143.A N GLU 159.A O THR 143.A H 3.049 2.342 ILE 145.A N GLN 157.A O ILE 145.A H 2.937 2.095 SER 146.A N GLN 157.A O SER 146.A H 3.416 2.620 ASP 148.A N VAL 155.A O ASP 148.A H 2.950 2.215 LYS 150.A N TYR 153.A O LYS 150.A H 3.043 2.304 THR 154.A N HIS 175.A O THR 154.A H 2.948 2.136 VAL 155.A N ASP 148.A O VAL 155.A H 3.014 2.173 ARG 156.A N HIS 173.A O ARG 156.A H 3.055 2.250 ARG 156.A NE GLU 147.A OE2 ARG 156.A HE 3.020 2.201 ARG 156.A NH1 HIS 173.A ND1 ARG 156.A HH11 3.195 2.466 ARG 156.A NH1 HIS 175.A ND1 ARG 156.A HH12 3.196 2.349 GLN 157.A N SER 146.A O GLN 157.A H 3.151 2.376 GLN 157.A NE2 SER 146.A OG GLN 157.A HE21 2.853 2.238 LEU 158.A N ILE 171.A O LEU 158.A H 3.002 2.153 GLU 159.A N THR 143.A O GLU 159.A H 2.984 2.192 LEU 160.A N ARG 169.A O LEU 160.A H 3.012 2.235 GLU 161.A N LYS 141.A O GLU 161.A H 2.824 1.980 ASN 162.A N GLU 167.A O ASN 162.A H 2.829 2.026 LEU 163.A N ASN 139.A O LEU 163.A H 3.059 2.291 THR 164.A N ASN 162.A OD1 THR 164.A H 2.626 1.884 THR 165.A N ASN 162.A O THR 165.A H 3.134 2.412 THR 165.A N ASN 162.A OD1 THR 165.A H 3.320 2.604 THR 165.A OG1 GLU 167.A OE2 THR 165.A HG1 3.016 2.240 GLN 166.A N ASN 162.A O GLN 166.A H 2.626 1.875 GLU 167.A N THR 165.A OG1 GLU 167.A H 3.329 2.475 ARG 169.A N LEU 160.A O ARG 169.A H 2.807 2.027 ARG 169.A NH1 TRP 100.A O ARG 169.A HH12 2.921 2.174 ILE 171.A N LEU 158.A O ILE 171.A H 2.983 2.190 LEU 172.A N ARG 105.A O LEU 172.A H 2.954 2.109 HIS 173.A N ARG 156.A O HIS 173.A H 2.958 2.161 PHE 174.A N VAL 107.A O PHE 174.A H 2.791 1.942 HIS 175.A N THR 154.A O HIS 175.A H 3.045 2.192 TYR 176.A N MET 109.A O TYR 176.A H 2.744 1.925 THR 177.A N TYR 152.A O THR 177.A H 3.385 2.551 ALA 189.A N SER 187.A OG ALA 189.A H 3.018 2.170 SER 190.A OG TYR 176.A OH SER 190.A HG 2.995 2.332 LEU 192.A N PRO 188.A O LEU 192.A H 2.815 1.970 ASN 193.A N ALA 189.A O ASN 193.A H 3.011 2.153 PHE 194.A N SER 190.A O PHE 194.A H 2.923 2.134 LEU 195.A N PHE 191.A O LEU 195.A H 3.085 2.275 PHE 196.A N LEU 192.A O PHE 196.A H 3.022 2.204 LYS 197.A N ASN 193.A O LYS 197.A H 3.073 2.258 VAL 198.A N PHE 194.A O VAL 198.A H 3.034 2.258 ARG 199.A N LEU 195.A O ARG 199.A H 2.829 1.997 ARG 199.A NE ASP 229.A OD1 ARG 199.A HE 2.842 2.101 ARG 199.A NH2 ASP 229.A OD1 ARG 199.A HH21 2.749 1.985 GLU 200.A N PHE 196.A O GLU 200.A H 2.726 1.888 SER 201.A N VAL 198.A O SER 201.A H 3.111 2.306 SER 201.A OG VAL 198.A O SER 201.A HG 2.762 1.936 GLY 202.A N ARG 199.A O GLY 202.A H 3.074 2.215 SER 203.A N SER 201.A OG SER 203.A H 3.050 2.235 SER 203.A OG SER 201.A OG SER 203.A HG 2.713 1.931 SER 205.A N GLY 202.A O SER 205.A H 2.953 2.102 GLU 207.A N GLU 207.A OE1 GLU 207.A H 2.787 2.040 HIS 208.A N SER 205.A O HIS 208.A H 3.119 2.278 GLY 209.A N LYS 103.A O GLY 209.A H 2.789 2.065 VAL 212.A N GLY 106.A O VAL 212.A H 3.458 2.605 VAL 213.A N ILE 82.A O VAL 213.A H 2.914 2.076 HIS 214.A N VAL 108.A O HIS 214.A H 3.087 2.345 HIS 214.A ND1 CYS 215.A O HIS 214.A HD1 3.057 2.198 HIS 214.A NE2 TYR 124.A OH no hydrogen 2.711 N/A SER 216.A OG LYS 120.A O SER 216.A HG 2.815 1.988 ARG 221.A NH1 LEU 110.A O ARG 221.A HH11 3.142 2.380 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH12 3.456 2.855 ARG 221.A NH1 GLU 115.A OE2 ARG 221.A HH12 2.800 1.947 ARG 221.A NH2 GLU 115.A OE1 ARG 221.A HH22 2.898 2.153 THR 224.A N GLY 220.A O THR 224.A H 3.089 2.330 PHE 225.A N ARG 221.A O PHE 225.A H 3.117 2.358 CYS 226.A N SER 222.A O CYS 226.A H 3.459 2.629 LEU 227.A N GLY 223.A O LEU 227.A H 3.040 2.186 ALA 228.A N THR 224.A O ALA 228.A H 3.178 2.342 ASP 229.A N PHE 225.A O ASP 229.A H 3.136 2.281 THR 230.A N CYS 226.A O THR 230.A H 3.119 2.263 THR 230.A OG1 TYR 81.A OH THR 230.A HG1 2.650 1.881 THR 230.A OG1 CYS 226.A O THR 230.A HG1 3.395 2.926 CYS 231.A N LEU 227.A O CYS 231.A H 3.027 2.196 LEU 232.A N ALA 228.A O LEU 232.A H 2.944 2.102 LEU 233.A N ASP 229.A O LEU 233.A H 2.917 2.068 LEU 234.A N THR 230.A O LEU 234.A H 2.887 2.088 MET 235.A N CYS 231.A O MET 235.A H 3.098 2.342 ASP 236.A N LEU 232.A O ASP 236.A H 3.167 2.384 LYS 237.A N LEU 234.A O LYS 237.A H 3.170 2.471 ARG 238.A N LEU 234.A O ARG 238.A H 3.231 2.617 ARG 238.A NE GLU 76.A OE2 ARG 238.A HE 2.941 2.143 ARG 238.A NH1 SER 243.A OG ARG 238.A HH11 2.904 2.183 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE1 ARG 238.A HH21 2.884 2.093 ARG 238.A NH2 GLU 76.A OE2 ARG 238.A HH21 3.018 2.268 SER 242.A N ASP 240.A OD1 SER 242.A H 3.282 2.565 SER 243.A N ASP 240.A O SER 243.A H 2.956 2.108 SER 243.A OG ASP 240.A O SER 243.A HG 3.121 2.384 VAL 244.A N PRO 241.A O VAL 244.A H 3.424 2.621 LYS 247.A N ASP 245.A OD1 LYS 247.A H 3.069 2.393 LYS 247.A NZ ASP 245.A OD1 LYS 247.A HZ2 3.167 2.328 LYS 248.A N ASP 245.A O LYS 248.A H 2.925 2.284 VAL 249.A N ASP 245.A O VAL 249.A H 3.146 2.345 LEU 250.A N ILE 246.A O LEU 250.A H 3.035 2.178 LEU 251.A N LYS 247.A O LEU 251.A H 3.046 2.220 GLU 252.A N LYS 248.A O GLU 252.A H 2.993 2.214 MET 253.A N VAL 249.A O MET 253.A H 2.854 2.011 ARG 254.A N LEU 250.A O ARG 254.A H 2.806 2.005 ARG 254.A NE LEU 260.A O ARG 254.A HE 3.138 2.461 ARG 254.A NH2 LEU 260.A O ARG 254.A HH21 3.202 2.583 LYS 255.A N GLU 252.A O LYS 255.A H 3.175 2.365 LYS 255.A NZ GLU 252.A OE1 LYS 255.A HZ2 2.688 1.885 PHE 256.A N MET 253.A O PHE 256.A H 2.797 1.946 ARG 257.A NE GLY 218.A O ARG 257.A HE 2.922 2.117 ARG 257.A NH1 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH12 3.280 2.573 ARG 257.A NH1 SER 70.A OG ARG 257.A HH11 2.832 2.031 ARG 257.A NH2 ASN 68.A OD1 ARG 257.A HH22 2.895 2.067 ARG 257.A NH2 ALA 217.A O ARG 257.A HH21 3.306 2.521 ILE 261.A N ILE 219.A O ILE 261.A H 2.816 1.981 GLN 262.A N GLN 266.A OE1 GLN 262.A H 2.615 1.765 GLN 266.A N THR 263.A OG1 GLN 266.A H 3.143 2.318 LEU 267.A N THR 263.A O LEU 267.A H 3.240 2.395 ARG 268.A N ALA 264.A O ARG 268.A H 3.039 2.190 PHE 269.A N ASP 265.A O PHE 269.A H 2.903 2.050 SER 270.A N GLN 266.A O SER 270.A H 2.756 1.979 SER 270.A OG GLN 266.A O SER 270.A HG 3.273 2.514 TYR 271.A N LEU 267.A O TYR 271.A H 3.075 2.248 TYR 271.A OH GLU 6.A OE1 TYR 271.A HH 3.176 2.476 LEU 272.A N ARG 268.A O LEU 272.A H 2.924 2.084 ALA 273.A N PHE 269.A O ALA 273.A H 2.824 2.056 VAL 274.A N SER 270.A O VAL 274.A H 3.076 2.278 ILE 275.A N TYR 271.A O ILE 275.A H 2.977 2.140 GLU 276.A N LEU 272.A O GLU 276.A H 3.178 2.332 GLY 277.A N ALA 273.A O GLY 277.A H 2.925 2.080 ALA 278.A N VAL 274.A O ALA 278.A H 2.710 1.868 LYS 279.A N GLU 276.A O LYS 279.A H 2.996 2.335 PHE 280.A N GLY 277.A O PHE 280.A H 2.768 1.909 ILE 281.A N GLY 277.A O ILE 281.A H 3.172 2.343 MET 282.A N ALA 278.A O MET 282.A H 2.882 2.060 GLY 283.A N PHE 280.A O GLY 283.A H 3.095 2.324