Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8bpv_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): THR 10.A N ASP 8.A OD1 THR 10.A H 3.317 2.520 THR 10.A OG1 ASP 8.A OD1 THR 10.A HG1 2.804 2.106 GLN 11.A N ASP 8.A O GLN 11.A H 3.326 2.477 GLU 13.A N TYR 36.A OH GLU 13.A H 2.901 2.052 HIS 16.A N GLU 13.A O HIS 16.A H 2.954 2.185 LEU 17.A N GLU 14.A O LEU 17.A H 3.088 2.259 LYS 18.A N ARG 35.A O LYS 18.A H 2.785 1.925 LEU 20.A N MET 33.A O LEU 20.A H 2.827 2.007 GLN 21.A N MET 33.A O GLN 21.A H 3.081 2.308 GLN 22.A NE2 SER 30.A OG GLN 22.A HE22 3.040 2.270 LEU 23.A N VAL 31.A O LEU 23.A H 2.904 2.081 GLY 24.A N VAL 31.A O GLY 24.A H 3.336 2.561 GLY 26.A N GLY 29.A O GLY 26.A H 2.884 2.094 GLY 29.A N GLY 26.A O GLY 29.A H 2.832 1.985 SER 30.A N LYS 51.A O SER 30.A H 2.916 2.094 VAL 31.A N GLY 24.A O VAL 31.A H 2.923 2.084 GLU 32.A N VAL 49.A O GLU 32.A H 2.878 2.061 MET 33.A N GLN 21.A O MET 33.A H 2.790 2.004 CYS 34.A N VAL 47.A O CYS 34.A H 2.965 2.115 ARG 35.A N LYS 18.A O ARG 35.A H 2.789 1.996 ARG 35.A NH1 THR 43.A O ARG 35.A HH11 3.332 2.478 TYR 36.A N GLU 45.A O TYR 36.A H 2.853 2.012 ASP 37.A N HIS 16.A O ASP 37.A H 3.021 2.187 GLN 40.A N ASP 37.A O GLN 40.A H 3.077 2.388 GLN 40.A NE2 ASP 37.A O GLN 40.A HE21 2.823 2.096 ASP 41.A N ASP 37.A OD1 ASP 41.A H 3.129 2.311 ASN 42.A N ASP 37.A OD2 ASN 42.A H 2.747 2.042 THR 43.A N ASP 41.A OD1 THR 43.A H 3.301 2.614 THR 43.A OG1.A ASP 41.A OD1 THR 43.A HG1.A 2.418 1.771 VAL 47.A N CYS 34.A O VAL 47.A H 2.847 2.018 ALA 48.A N MET 97.A O ALA 48.A H 2.840 2.049 VAL 49.A N GLU 32.A O VAL 49.A H 2.853 2.042 LYS 50.A N LEU 95.A O LYS 50.A H 2.860 2.047 LYS 50.A NZ GLU 66.A OE2 LYS 50.A HZ3 2.663 1.777 LYS 50.A NZ ASP 162.A OD2.A LYS 50.A HZ2 2.738 2.009 LYS 51.A N SER 30.A O LYS 51.A H 2.831 1.998 LYS 51.A NZ GLU 32.A OE2 LYS 51.A HZ2 2.421 1.726 THR 56.A N HIS 54.A O THR 56.A H 3.027 2.320 HIS 59.A N THR 56.A OG1 HIS 59.A H 3.104 2.259 HIS 59.A ND1 HIS 54.A O HIS 59.A HD1 2.944 2.231 LEU 60.A N THR 56.A O LEU 60.A H 2.920 2.092 ARG 61.A N GLU 57.A O ARG 61.A H 2.998 2.157 ASP 62.A N GLU 58.A O ASP 62.A H 2.916 2.083 PHE 63.A N HIS 59.A O PHE 63.A H 2.807 2.016 GLU 64.A N LEU 60.A O GLU 64.A H 2.909 2.089 ARG 65.A N ARG 61.A O ARG 65.A H 3.187 2.383 GLU 66.A N ASP 62.A O GLU 66.A H 2.959 2.141 ILE 67.A N PHE 63.A O ILE 67.A H 2.844 2.019 GLU 68.A N GLU 64.A O GLU 68.A H 2.976 2.151 ILE 69.A N ARG 65.A O ILE 69.A H 2.959 2.118 LEU 70.A N GLU 66.A O LEU 70.A H 2.953 2.110 LYS 71.A N ILE 67.A O LYS 71.A H 2.879 2.038 SER 72.A N GLU 68.A O SER 72.A H 3.111 2.395 SER 72.A N ILE 69.A O SER 72.A H 3.030 2.365 LEU 73.A N LEU 70.A O LEU 73.A H 3.001 2.152 GLN 74.A N TYR 134.A OH GLN 74.A H 2.847 1.992 ASN 77.A N HIS 75.A ND1 ASN 77.A H 2.927 2.077 ASN 77.A ND2 VAL 158.A O ASN 77.A HD22 3.203 2.408 ILE 78.A N HIS 75.A O ILE 78.A H 3.170 2.330 VAL 79.A N ILE 160.A O VAL 79.A H 2.985 2.142 LYS 80.A N GLU 98.A OE2 LYS 80.A H 3.004 2.233 LYS 82.A N ILE 96.A O LYS 82.A H 2.845 2.006 GLY 83.A N ILE 96.A O GLY 83.A H 3.135 2.328 CYS 85.A N LYS 94.A O CYS 85.A H 2.862 2.052 CYS 85.A SG PHE 12.A O CYS 85.A HG 3.326 2.344 ALA 88.A N GLU 14.A OE1 ALA 88.A H 2.940 2.220 GLY 89.A N GLU 14.A OE2 GLY 89.A H 2.950 2.097 ARG 90.A N TYR 86.A O ARG 90.A H 3.092 2.442 ARG 91.A N SER 87.A O ARG 91.A H 3.057 2.348 ARG 91.A NE ALA 88.A O ARG 91.A HE 3.044 2.531 ARG 91.A NH2 ALA 88.A O ARG 91.A HH21 3.009 2.345 LYS 94.A N CYS 85.A O LYS 94.A H 2.998 2.302 LEU 95.A N LYS 50.A O LEU 95.A H 2.979 2.151 ILE 96.A N GLY 83.A O ILE 96.A H 2.871 2.025 MET 97.A N ALA 48.A O MET 97.A H 2.825 2.017 GLU 98.A N LYS 80.A O GLU 98.A H 2.915 2.112 TYR 102.A N VAL 152.A O TYR 102.A H 3.055 2.268 LEU 105.A N ILE 150.A O LEU 105.A H 2.741 1.928 ARG 106.A N THR 147.A O ARG 106.A H 3.227 2.519 ASP 107.A N SER 104.A OG ASP 107.A H 3.164 2.323 TYR 108.A N SER 104.A O TYR 108.A H 2.854 2.004 LEU 109.A N LEU 105.A O LEU 109.A H 2.903 2.056 LYS 111.A N ASP 107.A O LYS 111.A H 2.682 1.893 HIS 112.A N TYR 108.A O HIS 112.A H 2.817 2.103 HIS 112.A ND1 GLU 114.A OE2 HIS 112.A HD1 2.785 1.975 LYS 113.A NZ LEU 109.A O LYS 113.A HZ1 3.011 2.181 LYS 113.A NZ TYR 216.A O LYS 113.A HZ3 2.784 2.098 GLU 114.A N GLU 114.A OE1 GLU 114.A H 2.871 2.097 ARG 115.A N HIS 112.A O ARG 115.A H 2.987 2.136 ARG 115.A NE GLU 114.A OE2 ARG 115.A HE 2.718 1.921 ARG 115.A NH1 GLU 155.A OE2 ARG 115.A HH11 2.980 2.316 ARG 115.A NH2 GLU 114.A OE2 ARG 115.A HH21 3.142 2.480 ILE 116.A N LYS 113.A O ILE 116.A H 3.269 2.418 LYS 120.A N ASP 117.A OD1 LYS 120.A H 3.089 2.249 LYS 120.A NZ GLN 123.A OE1 LYS 120.A HZ3 2.732 2.165 LYS 120.A NZ ASN 156.A OD1 LYS 120.A HZ1 2.370 1.792 LEU 121.A N ASP 117.A O LEU 121.A H 3.030 2.223 LEU 122.A N HIS 118.A O LEU 122.A H 2.921 2.119 GLN 123.A N ILE 119.A O GLN 123.A H 2.981 2.184 TYR 124.A N LYS 120.A O TYR 124.A H 2.866 2.035 TYR 124.A OH GLU 155.A O TYR 124.A HH 2.720 1.883 THR 125.A N LEU 121.A O THR 125.A H 2.917 2.097 THR 125.A OG1 LEU 121.A O THR 125.A HG1 2.748 1.910 SER 126.A N LEU 122.A O SER 126.A H 2.961 2.109 GLN 127.A N GLN 123.A O GLN 127.A H 3.031 2.189 GLN 127.A NE2 ASN 156.A O GLN 127.A HE22 2.898 2.053 ILE 128.A N TYR 124.A O ILE 128.A H 2.896 2.059 CYS 129.A N THR 125.A O CYS 129.A H 2.957 2.127 CYS 129.A SG THR 125.A O CYS 129.A HG 3.414 2.410 LYS 130.A N SER 126.A O LYS 130.A H 2.967 2.161 LYS 130.A NZ ASP 290.A OD2 LYS 130.A HZ3 2.709 1.879 GLY 131.A N GLN 127.A O GLY 131.A H 2.967 2.113 MET 132.A N ILE 128.A O MET 132.A H 2.974 2.193 GLU 133.A N CYS 129.A O GLU 133.A H 2.766 1.950 TYR 134.A N LYS 130.A O TYR 134.A H 3.112 2.291 LEU 135.A N GLY 131.A O LEU 135.A H 3.002 2.182 GLY 136.A N MET 132.A O GLY 136.A H 3.012 2.227 THR 137.A N GLU 133.A O THR 137.A H 3.216 2.499 THR 137.A N TYR 134.A O THR 137.A H 3.013 2.381 THR 137.A OG1 TYR 134.A O THR 137.A HG1 2.743 1.919 LYS 138.A N LEU 135.A O LYS 138.A H 2.953 2.221 ARG 139.A N GLY 136.A O ARG 139.A H 3.043 2.219 ARG 139.A NH1 GLU 174.A OE1 ARG 139.A HH12 3.528 2.713 ARG 139.A NH1 GLU 174.A OE2 ARG 139.A HH12 3.349 2.588 ARG 139.A NH2 PRO 170.A O ARG 139.A HH21 3.066 2.217 ARG 139.A NH2 GLU 174.A OE2 ARG 139.A HH22 3.350 2.592 TYR 140.A N LEU 135.A O TYR 140.A H 3.181 2.330 TYR 140.A OH SER 72.A OG TYR 140.A HH 2.694 1.860 ILE 141.A N LYS 167.A O ILE 141.A H 2.815 1.968 HIS 142.A N ASP 202.A OD2 HIS 142.A H 2.773 1.947 HIS 142.A NE2 GLY 161.A O.B HIS 142.A HE2 3.219 2.363 HIS 142.A NE2 ASP 162.A O.A HIS 142.A HE2 2.542 1.928 ARG 143.A N ASP 202.A OD1 ARG 143.A H 2.969 2.117 ARG 143.A NH1 LEU 165.A O ARG 143.A HH11 3.107 2.334 ASP 144.A N HIS 142.A ND1 ASP 144.A H 3.015 2.219 THR 147.A N GLU 212.A OE2 THR 147.A H 3.011 2.183 ARG 148.A NH2 ASP 144.A OD1 ARG 148.A HH21 2.922 2.186 ASN 149.A N ALA 146.A O ASN 149.A H 2.877 2.039 ASN 149.A ND2 ASP 144.A O ASN 149.A HD22 2.710 1.899 ILE 150.A N THR 147.A O ILE 150.A H 3.261 2.417 LEU 151.A N LYS 159.A O LEU 151.A H 2.813 1.954 VAL 152.A N GLY 103.A O VAL 152.A H 2.769 2.031 GLU 153.A N ARG 157.A O GLU 153.A H 2.905 2.128 GLU 155.A N GLU 155.A OE1 GLU 155.A H 2.685 1.852 ASN 156.A N ASN 154.A OD1 ASN 156.A H 2.649 1.844 ARG 157.A N ASN 154.A O ARG 157.A H 3.176 2.324 ARG 157.A NE ASP 76.A O ARG 157.A HE 2.903 2.083 ARG 157.A NH2 ASP 76.A O ARG 157.A HH21 3.154 2.423 VAL 158.A N GLN 127.A OE1 VAL 158.A H 2.871 2.061 LYS 159.A N LEU 151.A O LYS 159.A H 2.850 2.040 LYS 159.A NZ GLU 98.A OE1 LYS 159.A HZ2 3.446 2.743 LYS 159.A NZ GLU 98.A OE2 LYS 159.A HZ2 2.717 1.835 ILE 160.A N ASN 77.A O ILE 160.A H 2.764 1.946 GLY 161.A N.A ASN 149.A O GLY 161.A H.A 2.866 2.153 GLY 161.A N.B ASN 149.A O GLY 161.A H.B 2.882 2.086 GLY 164.A N ASP 162.A OD1.A GLY 164.A H 3.031 2.182 THR 166.A N PHE 163.A O THR 166.A H 3.102 2.249 THR 166.A OG1 PHE 163.A O THR 166.A HG1 3.356 2.844 LYS 167.A N ILE 141.A O LYS 167.A H 2.947 2.142 LYS 167.A NZ GLU 178.A OE2 LYS 167.A HZ2 2.923 2.137 LEU 169.A N ARG 139.A O LEU 169.A H 2.860 2.005 ASP 172.A N ASP 172.A OD1 ASP 172.A H 2.506 1.822 VAL 176.A N SER 195.A O VAL 176.A H 3.016 2.233 TRP 186.A N PRO 183.A O TRP 186.A H 2.962 2.111 TRP 186.A NE1 GLU 212.A OE2 TRP 186.A HE1 2.928 2.103 TYR 187.A N ILE 184.A O TYR 187.A H 3.113 2.269 GLU 190.A N GLU 190.A OE1 GLU 190.A H 2.745 1.934 SER 191.A N ALA 188.A O SER 191.A H 2.949 2.296 SER 191.A OG LYS 196.A O SER 191.A HG 2.811 2.107 LEU 192.A N ALA 188.A O LEU 192.A H 3.071 2.262 THR 193.A N PRO 189.A O THR 193.A H 2.862 2.100 THR 193.A OG1 PRO 189.A O THR 193.A HG1 3.141 2.337 GLU 194.A N GLU 190.A O GLU 194.A H 2.949 2.201 SER 195.A N SER 191.A O SER 195.A H 3.037 2.316 LYS 196.A N GLU 190.A O LYS 196.A H 3.415 2.557 SER 198.A N SER 201.A OG SER 198.A H 2.876 2.054 SER 201.A N SER 198.A OG SER 201.A H 3.098 2.341 ASP 202.A N SER 198.A O ASP 202.A H 3.013 2.206 VAL 203.A N VAL 199.A O VAL 203.A H 2.927 2.190 TRP 204.A N ALA 200.A O TRP 204.A H 3.066 2.261 SER 205.A N SER 201.A O SER 205.A H 3.125 2.291 SER 205.A OG TRP 186.A O SER 205.A HG 2.688 1.897 PHE 206.A N ASP 202.A O PHE 206.A H 2.805 1.971 GLY 207.A N VAL 203.A O GLY 207.A H 2.994 2.213 VAL 208.A N TRP 204.A O VAL 208.A H 3.303 2.566 VAL 209.A N SER 205.A O VAL 209.A H 2.875 2.060 LEU 210.A N PHE 206.A O LEU 210.A H 2.793 1.972 TYR 211.A N GLY 207.A O TYR 211.A H 3.026 2.198 TYR 211.A OH LYS 221.A O TYR 211.A HH 2.817 1.991 GLU 212.A N VAL 208.A O GLU 212.A H 2.809 1.987 LEU 213.A N VAL 209.A O LEU 213.A H 2.964 2.144 PHE 214.A N LEU 210.A O PHE 214.A H 3.267 2.464 THR 215.A N TYR 211.A O THR 215.A H 2.978 2.247 THR 215.A N GLU 212.A O THR 215.A H 3.247 2.624 TYR 216.A N LEU 213.A O TYR 216.A H 3.214 2.418 GLU 218.A N THR 215.A O GLU 218.A H 2.953 2.161 SER 220.A OG LYS 219.A O SER 220.A HG 2.397 1.625 LYS 221.A N GLU 218.A O LYS 221.A H 3.025 2.199 ALA 225.A N SER 222.A OG ALA 225.A H 3.193 2.351 GLU 226.A N SER 222.A O GLU 226.A H 2.890 2.051 PHE 227.A N PRO 223.A O PHE 227.A H 2.905 2.046 MET 228.A N PRO 224.A O MET 228.A H 2.975 2.135 ARG 229.A N ALA 225.A O ARG 229.A H 3.002 2.183 ARG 229.A NE GLU 226.A OE1.A ARG 229.A HE 2.885 2.085 ARG 229.A NE GLU 226.A OE1.B ARG 229.A HE 3.016 2.357 ARG 229.A NH2 GLU 226.A OE1.B ARG 229.A HH21 2.658 1.892 MET 230.A N GLU 226.A O MET 230.A H 2.969 2.152 ILE 231.A N PHE 227.A O ILE 231.A H 2.814 2.018 GLY 232.A N MET 228.A O GLY 232.A H 2.745 2.019 LYS 235.A N GLY 232.A O LYS 235.A H 3.062 2.202 LYS 235.A NZ ILE 231.A O LYS 235.A HZ1 2.901 2.024 ILE 240.A N GLY 237.A O ILE 240.A H 2.944 2.175 PHE 242.A N GLN 238.A O PHE 242.A H 2.882 2.051 HIS 243.A N MET 239.A O HIS 243.A H 3.062 2.232 LEU 244.A N ILE 240.A O LEU 244.A H 2.865 2.049 ILE 245.A N VAL 241.A O ILE 245.A H 2.966 2.110 GLU 246.A N PHE 242.A O GLU 246.A H 3.088 2.230 LEU 247.A N HIS 243.A O LEU 247.A H.A 2.851 2.005 LEU 248.A N LEU 244.A O LEU 248.A H 2.917 2.084 LYS 249.A N ILE 245.A O LYS 249.A H 2.867 2.040 ASN 250.A N LEU 247.A O ASN 250.A H 3.282 2.535 ASN 250.A ND2 GLU 246.A O ASN 250.A HD22 3.023 2.298 ASN 251.A N LEU 248.A O ASN 251.A H 3.194 2.344 GLY 252.A N LEU 247.A O GLY 252.A H 2.884 2.067 ARG 253.A NE TRP 272.A O ARG 253.A HE 3.068 2.456 ARG 253.A NH1 LEU 248.A O ARG 253.A HH12 2.901 2.058 ARG 253.A NH1 GLY 252.A O ARG 253.A HH11 2.946 2.105 ARG 253.A NH2 TRP 272.A O ARG 253.A HH21 2.764 2.052 ARG 253.A NH2 ASN 274.A OD1 ARG 253.A HH22 2.808 2.074 ARG 256.A NH1 CYS 260.A O ARG 256.A HH11 2.935 2.170 CYS 260.A N PRO 257.A O CYS 260.A H 3.025 2.178 CYS 260.A SG PRO 261.A O CYS 260.A HG 3.471 2.335 TYR 265.A N PRO 261.A O TYR 265.A H 3.031 2.199 TYR 265.A OH LEU 254.A O TYR 265.A HH 2.772 1.970 MET 266.A N ASP 262.A O MET 266.A H 2.801 2.026 ILE 267.A N GLU 263.A O ILE 267.A H 3.242 2.496 MET 268.A N ILE 264.A O MET 268.A H 3.110 2.274 THR 269.A N TYR 265.A O THR 269.A H 2.925 2.123 THR 269.A OG1 TYR 265.A O THR 269.A HG1 3.500 2.724 THR 269.A OG1 MET 266.A O THR 269.A HG1 3.107 2.576 GLU 270.A N MET 266.A O GLU 270.A H 2.966 2.169 CYS 271.A N ILE 267.A O CYS 271.A H 2.981 2.173 TRP 272.A N MET 268.A O TRP 272.A H 2.983 2.281 TRP 272.A N THR 269.A O TRP 272.A H 3.200 2.601 ASN 273.A ND2 GLN 278.A OE1 ASN 273.A HD21 3.159 2.410 ASN 274.A ND2 LEU 248.A O ASN 274.A HD21 3.134 2.313 ASN 275.A N ASN 273.A OD1 ASN 275.A H 2.839 2.021 GLN 278.A N ASN 275.A O GLN 278.A H 2.968 2.177 ARG 279.A N VAL 276.A O ARG 279.A H 3.290 2.453 ARG 279.A NE ASN 273.A O ARG 279.A HE 2.693 1.899 ARG 279.A NH1 GLU 190.A OE2 ARG 279.A HH12 2.781 1.959 ARG 279.A NH1 ALA 200.A O ARG 279.A HH11 3.007 2.191 ARG 279.A NH2 GLU 190.A OE1 ARG 279.A HH22 2.932 2.080 ARG 279.A NH2 GLU 190.A OE2 ARG 279.A HH22 3.547 2.939 ARG 279.A NH2 ASN 273.A O ARG 279.A HH21 2.891 2.164 SER 281.A N ASP 284.A OD2 SER 281.A H 2.982 2.135 ASP 284.A N SER 281.A OG ASP 284.A H 2.903 2.060 LEU 285.A N SER 281.A O LEU 285.A H 2.969 2.164 ALA 286.A N PHE 282.A O ALA 286.A H 2.856 2.014 LEU 287.A N ARG 283.A O LEU 287.A H 3.142 2.291 ARG 288.A N ASP 284.A O ARG 288.A H 2.982 2.169 ARG 288.A NH2 GLU 263.A OE2 ARG 288.A HH21 2.708 1.852 VAL 289.A N LEU 285.A O VAL 289.A H 2.898 2.042 ASP 290.A N ALA 286.A O ASP 290.A H 2.931 2.083 GLN 291.A N LEU 287.A O GLN 291.A H 2.805 1.988 ILE 292.A N ARG 288.A O ILE 292.A H 2.893 2.062 ARG 293.A N VAL 289.A O ARG 293.A H 2.915 2.080 ARG 293.A NH1 ASP 290.A OD1 ARG 293.A HH11 2.801 2.044 ASP 294.A N ASP 290.A O ASP 294.A H 2.809 2.032 ASN 295.A N GLN 291.A O ASN 295.A H 2.776 2.065 MET 296.A N ARG 293.A O MET 296.A H 3.304 2.498