Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8r1i_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.906 2.067 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.901 2.161 ASN 9.A N GLY 6.A O ASN 9.A H 3.304 2.525 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.256 2.528 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H 2.744 1.895 HIS 13.A NE2 LYS 7.A O HIS 13.A HE2 3.017 2.407 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.050 2.339 TRP 14.A NE1 ASN 9.A O TRP 14.A HE1 3.048 2.395 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.119 2.284 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.163 2.540 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.874 2.137 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H 2.850 1.998 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.132 2.272 GLY 23.A N ILE 20.A O GLY 23.A H 2.796 2.037 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H.A 3.008 2.177 ARG 25.A NE.A GLY 193.A O ARG 25.A HE.A 2.935 2.167 ARG 25.A NH1.A PRO 135.A O ARG 25.A HH12.A 3.432 2.784 ARG 25.A NH2.A PRO 135.A O ARG 25.A HH22.A 3.074 2.329 ARG 25.A NH2.A GLY 193.A O ARG 25.A HH21.A 3.045 2.324 ARG 25.A NH2.A VAL 204.A O ARG 25.A HH21.A 3.063 2.430 ARG 25.A NH2.B GLU 202.A O ARG 25.A HH21.B 3.015 2.228 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE22 3.088 2.232 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE21 3.055 2.209 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.861 2.135 SER 27.A OG SER 194.A O SER 27.A HG 3.561 3.168 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.765 1.914 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H 2.824 2.016 THR 33.A OG1 ASP 108.A OD1 THR 33.A HG1 3.351 2.534 HIS 34.A N ASP 32.A OD1 HIS 34.A H 2.856 2.113 THR 35.A N ASP 32.A O THR 35.A H 3.083 2.241 ALA 36.A N ASP 32.A O ALA 36.A H 3.014 2.208 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 3.281 2.520 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 2.936 2.127 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 3.159 2.378 SER 41.A OG ASP 39.A OD1 SER 41.A HG 2.674 1.856 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 2.936 2.078 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.842 2.005 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 2.965 2.111 GLN 51.A NE2 ASP 50.A OD2.B GLN 51.A HE21 2.928 2.099 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.076 2.226 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.604 1.937 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.824 2.015 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 2.834 2.016 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 3.318 2.664 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 2.827 1.988 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.972 2.149 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.905 2.151 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.916 2.075 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.092 2.266 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.139 2.288 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.099 2.296 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.817 1.979 HIS 62.A N ASN 60.A OD1 HIS 62.A H 2.930 2.097 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H 2.913 2.073 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.853 2.061 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.871 2.065 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.832 1.986 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.946 2.151 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.849 2.015 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 2.994 2.139 SER 71.A OG ASP 69.A OD1 SER 71.A HG 2.734 1.948 LYS 74.A N GLN 72.A O LYS 74.A H 2.821 2.217 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ3 3.004 2.126 LYS 74.A NZ GLN 72.A OE1 LYS 74.A HZ2 3.149 2.497 VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 2.943 2.145 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.797 1.971 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.919 2.088 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.095 2.317 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.949 2.115 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.055 2.250 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 3.110 2.463 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.807 2.013 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1 ARG 87.A HE 2.469 1.623 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.903 2.133 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 87.A HH21 3.033 2.400 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.870 2.015 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.929 2.080 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.951 2.187 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.043 2.265 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.726 1.874 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.885 2.094 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.708 1.869 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.819 1.984 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.820 2.158 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.060 2.324 SER 97.A OG ASP 240.A OD2 SER 97.A HG 2.631 1.984 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.262 2.448 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 2.956 2.218 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.822 2.286 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.897 2.191 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.825 2.124 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.764 1.918 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.642 1.812 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.647 1.857 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.097 2.316 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.792 1.957 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.792 1.985 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.833 2.003 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 2.889 2.083 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.893 2.136 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.784 1.934 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.818 1.961 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.659 1.824 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.926 2.078 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.826 1.970 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.927 2.177 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.065 2.304 HIS 120.A NE2 TYR 49.A OH no hydrogen 2.669 N/A TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.950 2.198 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.751 1.971 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.793 1.967 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.150 2.309 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 3.026 2.177 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.158 2.309 LYS 124.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 124.A HZ1 3.024 2.393 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.060 2.201 TYR 125.A OH ASP 136.A OD1 TYR 125.A HH 2.575 1.781 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.078 2.260 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.878 2.184 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.911 2.124 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 2.989 2.198 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.027 2.261 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.120 2.313 GLN 133.A NE2 GLY 129.A O GLN 133.A HE21 3.115 2.264 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 3.002 2.187 GLN 134.A NE2 LYS 130.A O GLN 134.A HE21 3.192 2.376 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.116 2.380 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.864 2.057 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.901 2.087 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.155 2.380 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.943 2.124 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.779 1.951 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.871 2.091 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.906 2.056 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.950 2.115 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.726 1.897 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 3.057 2.212 LYS 151.A NZ LEU 182.A O LYS 151.A HZ1 3.125 2.236 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 2.978 2.163 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.137 2.289 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE21 3.008 2.367 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD2 GLN 155.A HE21 3.273 2.438 LYS 156.A NZ ASN 175.A O LYS 156.A HZ1 2.986 2.154 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 2.967 2.357 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.162 2.348 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.915 2.137 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.195 2.448 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H 3.276 2.437 SER 163.A N VAL 160.A O SER 163.A H 2.969 2.159 SER 163.A OG VAL 160.A O SER 163.A HG 2.705 1.880 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.010 2.187 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.886 2.058 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.791 1.958 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H.A 3.129 2.280 LYS 169.A NZ.A GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ3.A 3.192 2.536 LYS 169.A NZ.B THR 166.A OG1 LYS 169.A HZ1.B 2.562 1.779 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.927 2.151 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 2.985 2.142 THR 174.A N ASP 172.A OD2 THR 174.A H 3.008 2.185 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.890 2.037 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 2.932 2.111 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.013 2.199 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.161 2.439 ARG 179.A NH1 ASP 50.A OD1.B ARG 179.A HH12 3.093 2.449 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.897 2.120 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.218 2.367 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 3.027 2.178 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.402 2.544 GLU 184.A N GLU 211.A OE2.C GLU 184.A H 3.055 2.269 SER 185.A N GLU 211.A OE1.A SER 185.A H 2.996 2.173 SER 185.A N GLU 211.A OE1.B SER 185.A H 2.978 2.163 SER 185.A N GLU 211.A OE1.C SER 185.A H 2.874 2.083 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.101 2.242 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.960 2.133 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 2.973 2.175 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.804 1.979 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.828 2.063 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.767 1.993 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.212 2.468 TYR 191.A OH SER 27.A OG TYR 191.A HH 2.831 2.126 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.807 1.948 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.761 1.941 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 2.936 2.156 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.607 1.794 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.781 2.022 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.214 2.368 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.893 2.049 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.914 2.089 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.936 2.128 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 3.006 2.178 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.818 1.979 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.881 2.049 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 2.953 2.121 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.848 2.047 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.871 2.042 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.109 2.285 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.744 1.970 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.171 2.371 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE22 3.010 2.159 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE21 2.950 2.119 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H 3.090 2.265 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.832 2.015 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 3.258 2.529 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H 3.127 2.466 PHE 223.A N GLN 219.A O PHE 223.A H 3.388 2.608 ARG 224.A N VAL 220.A O ARG 224.A H 3.191 2.441 ARG 224.A N LEU 221.A O ARG 224.A H 3.119 2.515 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.868 2.079 ARG 224.A NH1 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH12 3.456 2.797 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.836 1.982 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.195 2.362 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.213 2.370 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.830 2.064 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.906 2.090 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.984 2.149 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.766 1.987 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.215 2.383 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H.A 2.780 1.935 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.802 1.955 ASN 241.A N TRP 95.A O ASN 241.A H 3.290 2.610 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O ASN 241.A HD22 2.882 2.035 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 2.982 2.146 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.797 1.951 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.741 1.916 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.846 2.103 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.191 2.511 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.372 2.741 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.837 2.019 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE21 2.824 1.988 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.814 1.954 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.023 2.298 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.884 2.039 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.804 2.005 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.895 2.214 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.503 2.859 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 2.991 2.145 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.874 2.033 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.883 2.048 SER 256.A OG TYR 188.A O SER 256.A HG 3.362 2.870