Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8rt3_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): LYS 1.A N THR 40.A OG1 LYS 1.A H3.A 2.924 2.063 LYS 1.A NZ.A GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1.A 2.890 2.096 LYS 1.A NZ.B GLU 7.A OE2 LYS 1.A HZ1.B 2.800 1.969 PHE 3.A N PHE 38.A O PHE 3.A H 2.908 2.094 GLY 4.A N GLU 7.A OE1 GLY 4.A H 3.011 2.195 ARG 5.A NH1 TRP 123.A O ARG 5.A HH11 2.853 2.008 ARG 5.A NH1 ARG 125.A O ARG 5.A HH12 2.861 2.064 ARG 5.A NH2 ARG 125.A O ARG 5.A HH22 3.085 2.369 LEU 8.A N GLY 4.A O LEU 8.A H 2.864 2.031 ALA 9.A N ARG 5.A O ALA 9.A H 2.924 2.077 ALA 10.A N CYS 6.A O ALA 10.A H 2.945 2.131 ALA 11.A N GLU 7.A O ALA 11.A H 3.073 2.260 MET 12.A N LEU 8.A O MET 12.A H 2.841 1.994 LYS 13.A N ALA 9.A O LYS 13.A H 2.931 2.099 LYS 13.A NZ LEU 129.A O.A LYS 13.A HZ3 3.272 2.557 ARG 14.A N ALA 10.A O ARG 14.A H 2.933 2.091 HIS 15.A N ALA 11.A O HIS 15.A H 3.075 2.287 GLY 16.A N LYS 13.A O GLY 16.A H 2.945 2.097 LEU 17.A N.A MET 12.A O LEU 17.A H.A 3.002 2.172 LEU 17.A N.B MET 12.A O LEU 17.A H.B 2.986 2.141 TYR 20.A N LEU 17.A O.A TYR 20.A H 3.043 2.208 TYR 20.A N LEU 17.A O.B TYR 20.A H 3.012 2.159 ARG 21.A NE.B SER 100.A OG.A ARG 21.A HE.B 2.836 2.188 ARG 21.A NE.B SER 100.A OG.B ARG 21.A HE.B 3.080 2.432 ARG 21.A NH2.B SER 100.A OG.A ARG 21.A HH21.B 2.895 2.253 ARG 21.A NH2.B SER 100.A OG.B ARG 21.A HH21.B 3.107 2.453 GLY 22.A N ASN 19.A O GLY 22.A H 2.950 2.148 TYR 23.A N TYR 20.A O TYR 23.A H 3.038 2.179 LEU 25.A N ASP 18.A OD1.B LEU 25.A H 3.085 2.350 ASN 27.A N SER 24.A O ASN 27.A H 2.955 2.292 ASN 27.A ND2 SER 24.A OG ASN 27.A HD22 2.972 2.325 TRP 28.A NE1 TYR 23.A O TRP 28.A HE1 3.125 2.472 VAL 29.A N LEU 25.A O VAL 29.A H 3.032 2.211 CYS 30.A N GLY 26.A O CYS 30.A H 2.906 2.054 ALA 31.A N ASN 27.A O ALA 31.A H 2.959 2.145 ALA 32.A N TRP 28.A O ALA 32.A H 2.987 2.159 LYS 33.A N VAL 29.A O LYS 33.A H.A 2.908 2.084 LYS 33.A NZ.A ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2.A 2.941 2.070 LYS 33.A NZ.B ASN 37.A OD1 LYS 33.A HZ2.B 2.745 2.109 PHE 34.A N CYS 30.A O PHE 34.A H 3.127 2.299 GLU 35.A N ALA 31.A O GLU 35.A H 2.788 1.995 SER 36.A N ALA 32.A O SER 36.A H 2.959 2.132 SER 36.A OG ILE 55.A O SER 36.A HG 2.839 2.059 ASN 37.A N LYS 33.A O ASN 37.A H 2.825 2.092 ASN 39.A N SER 36.A O ASN 39.A H.A 3.114 2.310 THR 40.A N LYS 1.A O THR 40.A H 2.811 1.971 THR 40.A OG1 LEU 84.A O THR 40.A HG1 3.029 2.303 GLN 41.A N ASN 39.A OD1.A GLN 41.A H 3.050 2.203 GLN 41.A N ASN 39.A OD1.B GLN 41.A H 2.867 2.040 ALA 42.A N ASN 39.A O ALA 42.A H 3.242 2.389 ASN 44.A N ASP 52.A O ASN 44.A H 3.004 2.239 ASN 44.A ND2 GLN 57.A OE1 ASN 44.A HD22 2.737 1.884 ARG 45.A NE.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HE.A 2.726 1.913 ARG 45.A NE.B GLY 49.A O ARG 45.A HE.B 2.817 2.042 ARG 45.A NH2.A THR 51.A OG1 ARG 45.A HH21.A 3.004 2.307 ARG 45.A NH2.B GLY 49.A O ARG 45.A HH22.B 2.826 2.067 ASN 46.A N SER 50.A O ASN 46.A H 2.789 1.931 ASN 46.A OD1.B SER 50.A OG no hydrogen 2.815 N/A ASN 46.A OD1.B ASP 52.A OD1 no hydrogen 3.015 N/A GLY 49.A N ASN 46.A O GLY 49.A H 3.003 2.152 SER 50.A N ASP 48.A OD1 SER 50.A H 2.927 2.091 SER 50.A OG ASP 48.A OD1 SER 50.A HG 2.633 1.957 THR 51.A N SER 60.A OG THR 51.A H 3.004 2.174 ASP 52.A N ASN 44.A O ASP 52.A H 2.852 2.003 TYR 53.A N ILE 58.A O TYR 53.A H 2.836 2.106 TYR 53.A OH ASP 66.A OD2 TYR 53.A HH 2.651 1.841 GLY 54.A N ALA 42.A O GLY 54.A H 2.861 2.018 GLN 57.A N GLY 54.A O GLN 57.A H 2.987 2.177 GLN 57.A NE2 ALA 42.A O GLN 57.A HE22 3.086 2.436 GLN 57.A NE2 ASP 52.A O GLN 57.A HE22 3.648 3.136 GLN 57.A NE2 GLY 54.A O GLN 57.A HE21 2.964 2.108 ILE 58.A N TYR 53.A O ILE 58.A H 2.989 2.204 ASN 59.A ND2.A SER 50.A OG ASN 59.A HD21.A 2.997 2.190 ASN 59.A ND2.A ASP 52.A OD1 ASN 59.A HD22.A 2.632 1.774 SER 60.A N THR 51.A O SER 60.A H 2.923 2.143 SER 60.A OG THR 69.A OG1 SER 60.A HG 2.794 1.958 ARG 61.A N ASN 59.A OD1.A ARG 61.A H.A 2.714 1.891 ARG 61.A NE.B ASN 59.A OD1.A ARG 61.A HE.B 2.758 2.179 ARG 61.A NH1.A ARG 61.A O ARG 61.A HH11.A 2.996 2.341 ARG 61.A NH2.B ASN 46.A OD1.B ARG 61.A HH21.B 3.252 2.410 TRP 62.A N ASN 59.A OD1.B TRP 62.A H 3.238 2.479 TRP 63.A N ASN 59.A O TRP 63.A H 3.119 2.320 ASN 65.A N ILE 78.A O ASN 65.A H 2.955 2.117 GLY 67.A N ASN 65.A OD1 GLY 67.A H 3.190 2.407 ARG 68.A N ASP 66.A OD1 ARG 68.A H.B 3.038 2.186 ARG 68.A NH2.A GLY 49.A O ARG 68.A HH21.A 3.031 2.175 ARG 68.A NH2.B THR 51.A OG1 ARG 68.A HH21.B 2.958 2.101 THR 69.A OG1 ASP 66.A OD1 THR 69.A HG1 2.802 1.979 SER 72.A N THR 69.A O SER 72.A H 3.046 2.269 SER 72.A OG THR 69.A O SER 72.A HG 2.829 2.330 ARG 73.A N ARG 61.A O ARG 73.A H.A 2.998 2.156 ARG 73.A NH1.B SER 72.A O ARG 73.A HH12.B 3.311 2.581 LEU 75.A N TRP 62.A O LEU 75.A H 2.855 2.029 CYS 76.A N TRP 63.A O CYS 76.A H 2.923 2.106 ASN 77.A N ASN 74.A O ASN 77.A H.B 2.963 2.161 ILE 78.A N ASN 74.A OD1 ILE 78.A H 3.000 2.193 CYS 80.A N ASN 65.A O CYS 80.A H 2.836 2.016 ALA 82.A N PRO 79.A O ALA 82.A H 2.907 2.110 LEU 83.A N CYS 80.A O LEU 83.A H 2.922 2.120 LEU 84.A N SER 81.A O LEU 84.A H 2.963 2.118 SER 85.A OG.B ASP 87.A O SER 85.A HG.B 2.681 1.973 ASP 87.A N SER 85.A OG.A ASP 87.A H 3.024 2.228 THR 89.A N ASP 87.A OD1 THR 89.A H 2.888 2.034 THR 89.A OG1 ASP 87.A OD1 THR 89.A HG1 2.599 1.820 SER 91.A OG LEU 83.A O SER 91.A HG 3.502 3.117 VAL 92.A N ILE 88.A O VAL 92.A H 2.896 2.060 ASN 93.A N THR 89.A O ASN 93.A H 2.897 2.050 CYS 94.A N ALA 90.A O CYS 94.A H 2.979 2.152 ALA 95.A N SER 91.A O ALA 95.A H 2.863 2.017 LYS 96.A N VAL 92.A O LYS 96.A H 2.961 2.156 LYS 96.A NZ HIS 15.A O LYS 96.A HZ1 2.811 2.040 ILE 98.A N CYS 94.A O ILE 98.A H 3.027 2.218 VAL 99.A N ALA 95.A O VAL 99.A H 2.956 2.128 SER 100.A N.A LYS 97.A O SER 100.A H.A 3.285 2.454 SER 100.A N.B LYS 97.A O SER 100.A H.B 3.290 2.571 SER 100.A OG.B LYS 96.A O SER 100.A HG.B 2.580 1.841 ASP 101.A N.B ILE 98.A O ASP 101.A H.B 3.186 2.501 ASN 103.A N.A ASP 101.A OD1.B ASN 103.A H.A 3.402 2.550 MET 105.A N TYR 23.A OH MET 105.A H 3.104 2.269 ASN 106.A N ASN 103.A O.A ASN 106.A H 3.301 2.550 ASN 106.A N ASN 103.A O.B ASN 106.A H 3.052 2.275 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O.A ASN 106.A HD22 2.977 2.166 ASN 106.A ND2 ASN 103.A O.B ASN 106.A HD22 2.898 2.126 ALA 107.A N GLY 104.A O ALA 107.A H 3.276 2.416 TRP 108.A N MET 105.A O TRP 108.A H 2.969 2.115 TRP 108.A NE1 LEU 56.A O TRP 108.A HE1 2.758 2.092 ALA 110.A N GLU 35.A OE2 ALA 110.A H 3.049 2.251 TRP 111.A NE1 ASN 27.A OD1 TRP 111.A HE1 2.851 2.028 ARG 112.A N TRP 108.A O ARG 112.A H.A 2.988 2.176 ARG 112.A NH1.B ASN 106.A O ARG 112.A HH11.B 2.945 2.141 ASN 113.A N VAL 109.A O ASN 113.A H 2.965 2.166 ARG 114.A N ALA 110.A O ARG 114.A H 2.871 2.211 CYS 115.A N TRP 111.A O CYS 115.A H 2.887 2.074 LYS 116.A N TRP 111.A O LYS 116.A H 2.821 1.989 LYS 116.A NZ ASN 106.A OD1 LYS 116.A HZ2 2.960 2.131 THR 118.A N CYS 115.A O THR 118.A H 2.984 2.166 THR 118.A OG1 CYS 115.A O THR 118.A HG1 2.690 1.869 ALA 122.A N ASP 119.A OD1 ALA 122.A H 3.120 2.402 TRP 123.A N VAL 120.A O TRP 123.A H.A 2.967 2.145 ILE 124.A N GLN 121.A O ILE 124.A H 2.968 2.151 ARG 125.A N ALA 122.A O ARG 125.A H 3.374 2.562 ARG 125.A NE GLN 121.A OE1 ARG 125.A HE 2.957 2.213 ARG 125.A NH2 ASP 119.A OD2 ARG 125.A HH22 2.831 1.990 ARG 125.A NH2 GLN 121.A OE1 ARG 125.A HH21 2.857 2.083 CYS 127.A N ILE 124.A O CYS 127.A H 3.200 2.352 CYS 127.A SG ILE 124.A O no hydrogen 3.375 N/A