Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8sd1_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.952 2.120 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.838 2.083 LYS 7.A NZ HIS 8.A NE2 LYS 7.A HZ1 3.155 2.493 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.056 2.280 GLU 12.A N.A GLU 12.A OE1.A GLU 12.A H.A 2.744 1.914 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H.A 2.789 1.937 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.277 2.440 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.057 2.322 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.130 2.287 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.148 2.519 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.817 2.035 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H.A 2.976 2.119 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.187 2.334 GLY 23.A N ILE 20.A O.A GLY 23.A H 2.781 2.029 GLY 23.A N ILE 20.A O.B GLY 23.A H 2.780 2.027 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 2.954 2.114 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 3.059 2.323 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.418 2.716 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.223 2.467 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 3.133 2.434 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 2.989 2.336 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE22 3.114 2.259 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE21 3.051 2.198 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.924 2.205 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.766 1.908 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H.A 2.816 1.988 THR 33.A OG1 ASP 108.A OD1 THR 33.A HG1 3.321 2.505 HIS 34.A N ASP 32.A OD1.A HIS 34.A H 3.090 2.336 THR 35.A N ASP 32.A O.A THR 35.A H 3.272 2.559 THR 35.A N ASP 32.A O.B THR 35.A H 3.233 2.510 THR 35.A N ASP 32.A OD2.B THR 35.A H 3.151 2.525 ALA 36.A N ASP 32.A O.A ALA 36.A H 3.052 2.348 ALA 36.A N ASP 32.A O.B ALA 36.A H 3.068 2.367 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 3.010 2.179 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 2.994 2.155 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 2.815 2.044 SER 41.A OG ASP 39.A OD1 SER 41.A HG 2.600 2.009 SER 41.A OG ASP 39.A OD2 SER 41.A HG 3.201 2.544 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.103 2.248 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.876 2.035 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 2.945 2.087 GLN 51.A NE2 ASP 50.A O GLN 51.A HE21 3.645 3.189 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.140 2.294 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.734 2.005 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.816 1.981 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 2.858 2.032 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 3.236 2.554 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 3.203 2.364 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.965 2.135 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.906 2.160 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.928 2.096 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.146 2.325 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.183 2.336 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.154 2.354 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.828 1.996 HIS 62.A N.A ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.A 2.979 2.127 HIS 62.A N.B ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.B 2.951 2.115 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H.A 3.000 2.220 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.842 2.060 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.882 2.070 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.873 2.028 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.933 2.131 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.902 2.075 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 3.003 2.164 SER 71.A OG ASP 69.A OD1 SER 71.A HG 2.646 1.854 SER 71.A OG ASP 69.A OD2 SER 71.A HG 3.559 2.903 LYS 74.A N GLN 72.A O LYS 74.A H 2.818 2.171 LYS 74.A NZ THR 53.A OG1 LYS 74.A HZ3 3.146 2.355 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ2 3.057 2.244 VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 2.992 2.199 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.794 1.961 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.934 2.112 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.047 2.242 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.916 2.080 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.007 2.185 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 2.905 2.245 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.866 2.068 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1 ARG 87.A HE 2.508 1.691 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.904 2.172 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 87.A HH21 3.070 2.435 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.898 2.044 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.928 2.076 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.991 2.233 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.085 2.314 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.792 1.932 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.887 2.087 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.774 1.923 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.812 1.982 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.809 2.126 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.039 2.303 SER 97.A OG ASP 240.A OD1 SER 97.A HG 3.559 2.738 SER 97.A OG ASP 240.A OD2 SER 97.A HG 2.696 1.992 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.300 2.455 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE21 2.746 1.926 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 2.982 2.237 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.803 2.214 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.831 2.117 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.817 2.078 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.771 1.924 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.617 1.789 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.665 1.889 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.115 2.325 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.817 1.976 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.825 2.011 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.852 2.016 LYS 110.A NZ LYS 111.A O LYS 110.A HZ2 3.562 2.675 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 2.972 2.131 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.082 2.439 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.928 2.146 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.800 1.951 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.860 2.005 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.666 1.828 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.913 2.072 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.868 2.011 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.936 2.182 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.144 2.388 TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.967 2.206 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.770 2.019 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.799 1.981 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.227 2.386 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 2.948 2.098 THR 123.A OG1 THR 85.A O THR 123.A HG1 3.252 2.465 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.141 2.293 LYS 124.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 124.A HZ1 3.215 2.487 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.099 2.242 TYR 125.A OH ASP 136.A OD1 TYR 125.A HH 2.564 1.762 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.139 2.327 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.955 2.277 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.790 2.027 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 3.033 2.230 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.095 2.329 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.117 2.300 GLN 133.A NE2 GLY 129.A O GLN 133.A HE21 3.179 2.437 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 3.061 2.246 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.143 2.374 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.885 2.057 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.898 2.080 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.151 2.361 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.972 2.170 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.817 1.989 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.884 2.092 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.943 2.104 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.927 2.100 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.768 1.932 SER 149.A OG.B SER 214.A OG.C SER 149.A HG.B 3.001 2.435 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 2.989 2.152 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.055 2.234 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.112 2.261 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE21 2.983 2.263 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD2 GLN 155.A HE21 3.539 2.720 LYS 156.A NZ ASN 175.A O LYS 156.A HZ1 3.561 2.810 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.003 2.387 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.175 2.354 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.910 2.128 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.216 2.462 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H 3.299 2.451 SER 163.A N.A VAL 160.A O SER 163.A H.A 2.878 2.088 SER 163.A N.B VAL 160.A O SER 163.A H.B 2.880 2.081 SER 163.A OG.B VAL 160.A O SER 163.A HG.B 2.769 1.930 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H.A 3.083 2.270 LYS 165.A NZ ASN 227.A OD1 LYS 165.A HZ2 3.254 2.512 LYS 165.A NZ GLU 235.A OE1 LYS 165.A HZ3 3.227 2.400 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.860 2.016 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.769 1.942 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H 3.163 2.313 LYS 169.A NZ GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ1 2.758 1.883 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.928 2.144 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 2.974 2.138 THR 174.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 174.A HG1 3.271 2.686 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.974 2.125 ARG 179.A N ASP 177.A OD2 ARG 179.A H 3.074 2.243 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.199 2.507 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.037 2.193 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD1 ARG 179.A HH21 2.749 1.918 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.349 2.516 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 3.087 2.244 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.368 2.514 GLU 184.A N GLU 211.A OE2 GLU 184.A H 3.168 2.358 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.941 2.143 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.164 2.311 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 3.023 2.199 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 2.740 1.933 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.856 2.040 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.838 2.060 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.763 1.979 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.299 2.556 TYR 191.A OH SER 27.A OG TYR 191.A HH 2.736 2.064 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.803 1.945 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.756 1.925 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 2.980 2.197 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.605 1.791 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.834 2.085 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.226 2.379 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.902 2.065 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.963 2.138 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.991 2.209 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.959 2.124 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.823 1.986 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.903 2.060 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 2.968 2.128 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.906 2.116 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.911 2.092 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.103 2.277 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.897 2.169 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.171 2.360 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE22 2.986 2.132 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE21 2.971 2.151 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H.B 3.172 2.347 LEU 221.A N.A SER 217.A O LEU 221.A H.A 2.761 1.940 LEU 221.A N.B SER 217.A O LEU 221.A H.B 2.831 1.992 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H.A 3.300 2.567 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H.A 3.179 2.512 PHE 223.A N VAL 220.A O PHE 223.A H 2.999 2.406 ARG 224.A N LEU 221.A O.A ARG 224.A H 3.064 2.410 ARG 224.A N LEU 221.A O.B ARG 224.A H 3.015 2.374 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.796 1.987 ARG 224.A NH1 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH12 3.519 2.869 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.832 1.974 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.272 2.426 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.309 2.455 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.824 2.059 ASN 227.A ND2 GLU 235.A OE1 ASN 227.A HD21 3.460 2.629 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.901 2.087 ASN 229.A ND2 ASN 227.A OD1 ASN 229.A HD21 3.575 2.871 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.906 2.092 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.987 2.179 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.163 2.329 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H 2.796 1.956 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.782 1.928 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.A ASN 241.A HD22 2.877 2.021 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.B ASN 241.A HD22 3.089 2.264 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 2.997 2.159 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.795 1.954 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.748 1.931 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.818 2.108 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.281 2.613 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.289 2.646 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.783 1.958 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE21 2.835 1.998 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ2 3.021 2.281 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.845 1.989 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.020 2.283 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.905 2.062 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.849 2.054 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.952 2.266 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.497 2.850 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 3.011 2.157 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.829 2.016 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.908 2.080