Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8sd7_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.971 2.133 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.886 2.118 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.044 2.274 GLU 12.A N.A GLU 12.A OE1.A GLU 12.A H.A 2.766 1.937 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H.A 2.806 1.957 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.238 2.387 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.108 2.385 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.160 2.321 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.086 2.379 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.857 2.036 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H.A 3.030 2.205 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.290 2.452 GLY 23.A N ILE 20.A O.A GLY 23.A H 2.786 2.108 GLY 23.A N ILE 20.A O.B GLY 23.A H 2.784 2.108 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 3.019 2.178 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 3.043 2.285 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.506 2.791 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.264 2.476 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 3.155 2.454 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 3.047 2.385 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE22 3.110 2.258 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE21 3.105 2.252 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 2.901 2.160 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.798 1.938 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H.A 2.902 2.073 THR 33.A OG1 ASP 108.A OD1 THR 33.A HG1 3.399 2.580 HIS 34.A N ASP 32.A OD1.A HIS 34.A H 3.087 2.302 THR 35.A N ASP 32.A O.A THR 35.A H 3.255 2.496 THR 35.A N ASP 32.A O.B THR 35.A H 3.232 2.465 ALA 36.A N ASP 32.A O.A ALA 36.A H 3.099 2.403 ALA 36.A N ASP 32.A O.B ALA 36.A H 3.120 2.429 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 3.015 2.195 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 3.032 2.197 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 3.000 2.212 SER 41.A OG ASP 39.A OD1 SER 41.A HG 2.712 1.872 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.105 2.255 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.911 2.073 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 2.992 2.136 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.228 2.379 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.714 2.015 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.766 1.933 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 2.893 2.075 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 3.241 2.537 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 3.293 2.474 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.945 2.112 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.930 2.176 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.968 2.129 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.119 2.295 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.298 2.454 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.216 2.438 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.858 2.044 HIS 62.A N.A ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.A 2.970 2.117 HIS 62.A N.B ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.B 2.942 2.104 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H.A 3.008 2.218 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.866 2.077 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.894 2.076 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.860 2.011 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 2.903 2.100 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.928 2.097 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 3.026 2.186 SER 71.A OG ASP 69.A OD1 SER 71.A HG 2.678 1.885 LYS 74.A N GLN 72.A O LYS 74.A H 2.930 2.322 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ2 3.120 2.234 VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 2.993 2.207 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.836 2.013 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.935 2.101 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.113 2.312 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.956 2.118 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.069 2.241 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 2.909 2.242 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.815 2.029 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1 ARG 87.A HE 2.448 1.651 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.981 2.232 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 87.A HH21 2.995 2.364 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.893 2.037 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.965 2.113 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.992 2.245 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.082 2.303 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.834 1.976 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.925 2.126 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.835 1.984 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.825 1.991 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.867 2.188 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.047 2.308 SER 97.A OG ASP 240.A OD2 SER 97.A HG 2.767 2.158 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.274 2.436 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE21 2.849 2.030 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD2 GLN 101.A HE21 3.476 2.897 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 3.043 2.319 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.874 2.299 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.831 2.105 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.830 2.083 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.785 1.943 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.663 1.843 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.656 1.887 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.123 2.323 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.866 2.025 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.843 2.014 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.873 2.048 LYS 110.A NZ LYS 111.A O LYS 110.A HZ1 3.173 2.525 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 3.001 2.158 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.091 2.469 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.926 2.153 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.790 1.944 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.865 2.012 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.665 1.833 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.903 2.064 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.877 2.021 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.948 2.207 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.142 2.392 HIS 120.A NE2 TYR 49.A OH no hydrogen 2.715 N/A TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 2.916 2.164 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.751 2.001 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.790 1.977 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.219 2.369 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 2.989 2.140 THR 123.A OG1 THR 85.A O THR 123.A HG1 3.208 2.413 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.180 2.330 LYS 124.A NZ ASP 136.A OD2 LYS 124.A HZ3 3.153 2.424 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.063 2.210 TYR 125.A OH ASP 136.A OD1 TYR 125.A HH 2.531 1.737 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.171 2.372 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.985 2.312 LYS 130.A N ASP 127.A O LYS 130.A H 3.201 2.592 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.906 2.142 LYS 130.A NZ ASP 127.A OD2 LYS 130.A HZ3 3.569 2.967 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 3.042 2.229 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.101 2.343 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.105 2.281 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 3.077 2.271 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.203 2.447 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.948 2.130 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.931 2.125 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.198 2.412 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.970 2.149 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.809 1.981 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.919 2.116 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 2.976 2.132 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.951 2.127 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.722 1.887 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 3.075 2.230 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.077 2.252 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.175 2.328 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE21 3.073 2.353 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 2.935 2.310 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.152 2.333 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.911 2.127 VAL 160.A N.A VAL 157.A O VAL 160.A H.A 3.243 2.452 VAL 160.A N.B VAL 157.A O VAL 160.A H.B 3.237 2.440 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H.A 3.302 2.447 SER 163.A N VAL 160.A O.A SER 163.A H 2.946 2.138 SER 163.A N VAL 160.A O.B SER 163.A H 2.951 2.142 SER 163.A OG VAL 160.A O.A SER 163.A HG 2.875 2.046 SER 163.A OG VAL 160.A O.B SER 163.A HG 2.876 2.047 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.154 2.326 LYS 165.A NZ GLU 235.A OE2 LYS 165.A HZ1 3.253 2.487 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.841 1.990 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.737 1.912 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H 3.230 2.387 LYS 169.A NZ GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ1 3.260 2.576 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.914 2.128 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 3.008 2.164 THR 174.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 174.A HG1 3.305 2.714 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.981 2.126 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 2.965 2.131 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.062 2.234 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.148 2.445 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.747 1.925 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.244 2.395 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 3.058 2.205 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.369 2.517 GLU 184.A N GLU 211.A OE2 GLU 184.A H 3.240 2.422 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.950 2.171 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.185 2.325 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.955 2.130 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 2.732 1.929 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.850 2.026 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.824 2.032 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.770 1.980 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.338 2.605 TYR 191.A OH SER 27.A OG TYR 191.A HH 2.833 2.195 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.816 1.957 SER 194.A N SER 27.A OG SER 194.A H 2.966 2.149 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.803 1.963 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 3.016 2.228 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.610 1.789 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.827 2.068 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.266 2.420 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.896 2.053 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.966 2.142 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 3.007 2.221 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.946 2.108 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.877 2.041 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.918 2.078 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 3.012 2.183 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.920 2.127 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.915 2.096 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.167 2.336 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.886 2.112 GLN 219.A N SER 216.A O GLN 219.A H 3.057 2.454 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.226 2.454 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE22 3.022 2.168 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE21 2.878 2.050 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H.B 3.202 2.383 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.925 2.116 LYS 222.A N GLN 219.A O LYS 222.A H 3.279 2.594 PHE 223.A N VAL 220.A O PHE 223.A H 3.000 2.395 ARG 224.A N LEU 221.A O ARG 224.A H 3.167 2.519 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.813 2.013 ARG 224.A NH1 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH12 3.565 2.920 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.844 1.986 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.373 2.528 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.342 2.486 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.895 2.139 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.860 2.060 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.937 2.128 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.835 2.022 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.157 2.323 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H 2.758 1.913 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.778 1.928 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.A ASN 241.A HD22 2.873 2.014 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.B ASN 241.A HD22 3.155 2.336 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 2.988 2.155 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.822 1.977 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.771 1.955 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.850 2.135 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.304 2.622 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.341 2.704 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.818 1.989 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE21 2.817 1.983 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ2 2.926 2.249 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.885 2.051 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 3.107 2.384 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.893 2.052 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.882 2.086 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 3.007 2.311 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.547 2.900 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 3.018 2.170 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.860 2.036 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.946 2.110