Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8sd9_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 4.A N ASN 9.A O GLY 4.A H 2.933 2.099 GLY 6.A N ASN 9.A OD1 GLY 6.A H 2.838 2.095 ASN 9.A ND2 HIS 2.A O ASN 9.A HD22 3.283 2.515 GLU 12.A N.A GLU 12.A OE1.A GLU 12.A H.A 2.762 1.938 HIS 13.A N GLY 10.A O HIS 13.A H.B 2.775 1.933 TRP 14.A N PRO 11.A O TRP 14.A H 3.235 2.407 TRP 14.A NE1 GLY 4.A O TRP 14.A HE1 3.090 2.348 LYS 16.A N HIS 13.A O LYS 16.A H 3.146 2.306 ASP 17.A N TRP 14.A O ASP 17.A H 3.175 2.555 PHE 18.A N TRP 14.A O PHE 18.A H 2.782 1.969 ALA 21.A N PHE 18.A O ALA 21.A H.A 2.929 2.182 LYS 22.A N PRO 19.A O LYS 22.A H 3.217 2.308 GLY 23.A N ILE 20.A O.A GLY 23.A H 2.750 1.980 GLY 23.A N ILE 20.A O.B GLY 23.A H 2.747 1.978 ARG 25.A N GLU 202.A OE2 ARG 25.A H 3.075 2.184 ARG 25.A NE GLY 193.A O ARG 25.A HE 3.053 2.326 ARG 25.A NH1 PRO 135.A O ARG 25.A HH12 3.442 2.679 ARG 25.A NH2 PRO 135.A O ARG 25.A HH22 3.299 2.487 ARG 25.A NH2 GLY 193.A O ARG 25.A HH21 3.075 2.361 ARG 25.A NH2 VAL 204.A O ARG 25.A HH21 2.976 2.336 GLN 26.A NE2 LEU 200.A O GLN 26.A HE22 3.111 2.475 GLN 26.A NE2 GLU 202.A OE2 GLN 26.A HE21 3.033 2.299 SER 27.A N SER 194.A OG SER 27.A H 3.002 2.313 ILE 31.A N THR 106.A O ILE 31.A H 2.720 1.863 THR 33.A N ASP 108.A OD1 THR 33.A H.A 2.837 2.009 THR 33.A OG1 ASP 108.A OD1 THR 33.A HG1 3.274 2.448 HIS 34.A N ASP 32.A OD1.A HIS 34.A H 3.083 2.310 HIS 34.A N ASP 32.A OD2.B HIS 34.A H 3.048 2.289 THR 35.A N ASP 32.A O.A THR 35.A H 3.293 2.578 THR 35.A N ASP 32.A O.B THR 35.A H 3.308 2.595 ALA 36.A N ASP 32.A O.A ALA 36.A H 3.099 2.410 ALA 36.A N ASP 32.A O.B ALA 36.A H 3.100 2.411 LYS 37.A N ILE 253.A O LYS 37.A H 3.012 2.195 ASP 39.A N ALA 255.A O ASP 39.A H 3.047 2.216 SER 41.A N ASP 39.A OD1 SER 41.A H 2.965 2.169 SER 41.A OG ASP 39.A OD1 SER 41.A HG 2.817 1.995 LEU 42.A N ASP 39.A O LEU 42.A H 3.140 2.288 SER 46.A N LYS 78.A O SER 46.A H 2.883 2.085 SER 48.A N VAL 76.A O SER 48.A H 3.020 2.160 ALA 52.A N TYR 49.A O ALA 52.A H 3.196 2.354 SER 54.A OG PHE 173.A O SER 54.A HG 2.794 1.998 LEU 55.A N GLU 67.A O LEU 55.A H 2.848 1.990 ARG 56.A NE GLU 67.A OE1 ARG 56.A HE 3.086 2.282 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE1 ARG 56.A HH21 3.249 2.536 ARG 56.A NH2 GLU 67.A OE2 ARG 56.A HH21 3.410 2.584 ILE 57.A N ALA 171.A O ILE 57.A H 2.898 2.020 LEU 58.A N ASN 65.A O LEU 58.A H 2.912 2.146 ASN 59.A N LYS 169.A O ASN 59.A H 2.980 2.129 ASN 59.A ND2 ILE 164.A O ASN 59.A HD22 3.125 2.303 ASN 59.A ND2 ASN 227.A O ASN 59.A HD21 3.265 2.418 ASN 60.A N ALA 63.A O ASN 60.A H 3.192 2.390 GLY 61.A N ASN 59.A OD1 GLY 61.A H 2.871 2.045 HIS 62.A N.A ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.A 2.935 2.083 HIS 62.A N.B ASN 60.A OD1 HIS 62.A H.B 2.921 2.075 ALA 63.A N ASN 60.A OD1 ALA 63.A H.A 2.962 2.215 ASN 65.A N LEU 58.A O ASN 65.A H 2.879 2.096 VAL 66.A N PHE 91.A O VAL 66.A H 2.906 2.102 GLU 67.A N ARG 56.A O GLU 67.A H 2.902 2.053 PHE 68.A N ILE 89.A O PHE 68.A H 3.025 2.240 ASP 69.A N THR 53.A O ASP 69.A H 2.915 2.083 SER 71.A N ASP 69.A OD1 SER 71.A H 3.025 2.176 SER 71.A OG ASP 69.A OD1 SER 71.A HG 2.669 1.862 LYS 74.A N GLN 72.A O LYS 74.A H 2.844 2.168 LYS 74.A NZ ASP 69.A OD2 LYS 74.A HZ3 2.925 2.130 VAL 76.A N SER 48.A O VAL 76.A H 3.037 2.248 LEU 77.A N TYR 86.A O LEU 77.A H 2.882 2.053 LYS 78.A N SER 46.A O LYS 78.A H 2.984 2.171 GLY 80.A N PRO 44.A O GLY 80.A H 3.115 2.291 LEU 82.A N GLY 79.A O LEU 82.A H 2.851 2.016 TYR 86.A N LEU 77.A O TYR 86.A H 3.086 2.258 TYR 86.A OH ASP 136.A O TYR 86.A HH 2.941 2.270 ARG 87.A N TRP 121.A O ARG 87.A H 2.872 2.039 ARG 87.A NE ASP 73.A OD1 ARG 87.A HE 2.642 1.940 ARG 87.A NH1 ASP 70.A O ARG 87.A HH11 2.819 2.009 ARG 87.A NH2 ASP 73.A OD1 ARG 87.A HH21 2.869 2.168 LEU 88.A N ALA 75.A O LEU 88.A H 2.902 2.012 ILE 89.A N VAL 119.A O ILE 89.A H 2.964 2.092 PHE 91.A N VAL 66.A O PHE 91.A H 2.980 2.225 HIS 92.A N HIS 117.A O HIS 92.A H 3.060 2.285 HIS 92.A ND1 GLN 90.A OE1 HIS 92.A HD1 2.850 1.993 HIS 94.A N GLU 115.A O HIS 94.A H 2.926 2.128 HIS 94.A ND1 ASN 241.A O HIS 94.A HD1 2.759 1.905 TRP 95.A N ASN 241.A OD1 TRP 95.A H 2.846 2.019 TRP 95.A NE1 MET 238.A O TRP 95.A HE1 2.862 2.170 SER 97.A N ASP 240.A OD1 SER 97.A H 3.000 2.261 SER 97.A OG ASP 240.A OD2 SER 97.A HG 2.816 2.163 GLN 101.A N LEU 98.A O GLN 101.A H 3.286 2.443 GLN 101.A NE2 ASP 240.A OD1 GLN 101.A HE21 2.793 1.957 SER 103.A N TYR 112.A O SER 103.A H 2.942 2.172 SER 103.A OG HIS 105.A O SER 103.A HG 2.805 2.227 GLU 104.A N GLU 115.A OE1 GLU 104.A H 2.835 2.137 HIS 105.A N GLU 115.A OE1 HIS 105.A H 2.807 2.064 HIS 105.A ND1 GLU 115.A OE2 HIS 105.A HD1 2.802 1.953 HIS 105.A NE2 TYR 191.A OH HIS 105.A HE2 2.629 1.808 THR 106.A OG1 ASP 30.A OD1 THR 106.A HG1 2.547 1.781 VAL 107.A N LYS 110.A O VAL 107.A H 3.149 2.363 ASP 108.A N ILE 31.A O ASP 108.A H 2.754 1.904 LYS 109.A N ASP 30.A OD1 LYS 109.A H 2.803 1.965 LYS 110.A N VAL 107.A O LYS 110.A H 2.880 2.036 LYS 110.A NZ LYS 111.A O LYS 110.A HZ2 3.394 2.649 TYR 112.A N SER 103.A OG TYR 112.A H 2.968 2.119 ALA 113.A N LEU 145.A O ALA 113.A H 3.114 2.485 GLU 115.A N HIS 94.A O GLU 115.A H 2.886 2.115 LEU 116.A N ILE 143.A O LEU 116.A H 2.796 1.948 HIS 117.A N HIS 92.A O HIS 117.A H 2.885 2.034 HIS 117.A NE2 GLU 115.A OE2 HIS 117.A HE2 2.707 1.879 LEU 118.A N LEU 141.A O LEU 118.A H 2.934 2.092 VAL 119.A N GLN 90.A O VAL 119.A H 2.910 2.053 HIS 120.A N ALA 139.A O HIS 120.A H 2.871 2.112 HIS 120.A ND1 ALA 139.A O HIS 120.A HD1 3.210 2.458 HIS 120.A NE2 TYR 49.A OH no hydrogen 2.656 N/A TRP 121.A N ARG 87.A O TRP 121.A H 3.053 2.289 TRP 121.A NE1 ASP 70.A OD2 TRP 121.A HE1 2.831 2.088 ASN 122.A N GLY 137.A O ASN 122.A H 2.820 1.998 ASN 122.A ND2 ASP 136.A O ASN 122.A HD22 3.272 2.433 THR 123.A N THR 85.A O THR 123.A H 3.028 2.174 THR 123.A OG1 THR 85.A O THR 123.A HG1 3.241 2.454 LYS 124.A N ASN 122.A OD1 LYS 124.A H 3.183 2.328 TYR 125.A N ASN 122.A O TYR 125.A H 3.082 2.223 TYR 125.A OH ASP 136.A OD1 TYR 125.A HH 2.602 1.826 GLY 126.A N THR 123.A O GLY 126.A H 3.233 2.395 ASP 127.A N TYR 125.A O ASP 127.A H 2.937 2.265 LYS 130.A N ASP 127.A OD1 LYS 130.A H 2.803 2.036 LYS 130.A NZ ASP 127.A OD2 LYS 130.A HZ3 3.497 2.858 ALA 131.A N ASP 127.A O ALA 131.A H 3.113 2.312 VAL 132.A N PHE 128.A O VAL 132.A H 3.187 2.424 GLN 133.A N LYS 130.A O GLN 133.A H 3.116 2.315 GLN 133.A NE2 GLY 129.A O GLN 133.A HE21 3.102 2.431 GLN 134.A N ALA 131.A O GLN 134.A H 3.034 2.223 ASP 136.A N ASP 136.A OD1 ASP 136.A H 2.656 2.055 GLY 137.A N GLN 134.A O GLY 137.A H 3.143 2.377 LEU 138.A N CYS 203.A O LEU 138.A H 2.857 2.032 ALA 139.A N HIS 120.A O ALA 139.A H 2.906 2.086 VAL 140.A N THR 205.A O VAL 140.A H 3.168 2.379 LEU 141.A N LEU 118.A O LEU 141.A H 2.966 2.141 GLY 142.A N ILE 207.A O GLY 142.A H 2.819 1.990 ILE 143.A N LEU 116.A O ILE 143.A H 2.935 2.134 LEU 145.A N ALA 114.A O LEU 145.A H 3.017 2.173 LYS 146.A N ILE 213.A O LYS 146.A H 2.972 2.150 GLY 148.A N VAL 215.A O GLY 148.A H 2.682 1.843 LYS 151.A N GLN 219.A OE1 LYS 151.A H 3.036 2.210 LEU 154.A N LYS 151.A O LEU 154.A H 3.063 2.242 GLN 155.A N PRO 152.A O GLN 155.A H 3.058 2.208 GLN 155.A NE2 ASP 159.A OD1 GLN 155.A HE21 3.104 2.310 VAL 157.A N LEU 154.A O VAL 157.A H 3.004 2.385 VAL 158.A N LEU 154.A O VAL 158.A H 3.189 2.376 ASP 159.A N GLN 155.A O ASP 159.A H 2.892 2.083 VAL 160.A N VAL 157.A O VAL 160.A H 3.193 2.420 LEU 161.A N VAL 158.A O LEU 161.A H 3.288 2.439 SER 163.A N VAL 160.A O SER 163.A H 2.952 2.167 SER 163.A OG VAL 160.A O SER 163.A HG 2.461 1.628 ILE 164.A N LEU 161.A O ILE 164.A H 3.112 2.284 LYS 165.A NZ LYS 225.A O LYS 165.A HZ2 3.392 2.501 LYS 167.A N ASN 229.A O LYS 167.A H 2.883 2.039 GLY 168.A N ASN 59.A O GLY 168.A H 2.792 1.974 LYS 169.A N THR 166.A O LYS 169.A H 3.146 2.295 LYS 169.A NZ GLU 231.A OE1 LYS 169.A HZ1 3.035 2.261 ALA 171.A N ILE 57.A O ALA 171.A H 2.958 2.186 PHE 173.A N LEU 55.A O PHE 173.A H 2.936 2.093 THR 174.A OG1 ASN 175.A OD1 THR 174.A HG1 3.327 2.714 PHE 176.A N SER 54.A OG PHE 176.A H 2.955 2.111 ARG 179.A N ASP 177.A OD1 ARG 179.A H 3.015 2.239 ARG 179.A NE ASP 177.A OD1 ARG 179.A HE 3.237 2.453 ARG 179.A NE ASP 177.A OD2 ARG 179.A HE 3.254 2.575 ARG 179.A NH2 ASP 177.A OD2 ARG 179.A HH21 2.858 2.019 GLY 180.A N ASP 177.A O GLY 180.A H 3.295 2.450 LEU 181.A N PRO 178.A O LEU 181.A H 2.970 2.120 LEU 182.A N ARG 179.A O LEU 182.A H 3.375 2.528 GLU 184.A N GLU 211.A OE2 GLU 184.A H 3.210 2.396 SER 185.A N GLU 211.A OE1 SER 185.A H 2.932 2.142 ASP 187.A N SER 185.A OG ASP 187.A H 3.205 2.346 TYR 188.A N SER 256.A OG TYR 188.A H 2.937 2.117 TYR 188.A OH LYS 43.A O TYR 188.A HH 2.848 2.053 TRP 189.A N VAL 208.A O TRP 189.A H 2.832 2.004 THR 190.A N LYS 254.A O THR 190.A H 2.827 2.038 THR 190.A OG1 TRP 206.A O THR 190.A HG1 2.788 2.008 TYR 191.A N TRP 206.A O TYR 191.A H 3.299 2.557 TYR 191.A OH SER 27.A OG TYR 191.A HH 2.722 2.040 GLY 193.A N VAL 204.A O GLY 193.A H 2.830 1.976 SER 194.A OG LEU 195.A O SER 194.A HG 2.793 1.959 LEU 195.A N LEU 201.A O LEU 195.A H 3.012 2.235 THR 196.A OG1 GLU 104.A OE1 THR 196.A HG1 2.527 1.709 LEU 200.A N THR 197.A O LEU 200.A H 2.832 2.084 VAL 204.A N GLY 193.A O VAL 204.A H 3.345 2.501 THR 205.A N LEU 138.A O THR 205.A H 2.887 2.046 TRP 206.A N TYR 191.A O TRP 206.A H 2.975 2.164 TRP 206.A NE1 SER 194.A O TRP 206.A HE1 2.996 2.205 ILE 207.A N VAL 140.A O ILE 207.A H 2.960 2.133 VAL 208.A N TRP 189.A O VAL 208.A H 2.857 2.015 LEU 209.A N GLY 142.A O LEU 209.A H 2.954 2.108 LYS 210.A N ASP 187.A O LYS 210.A H 3.034 2.189 ILE 213.A N PHE 144.A O ILE 213.A H 2.892 2.090 VAL 215.A N LYS 146.A O VAL 215.A H 2.953 2.134 SER 216.A N GLN 219.A OE1 SER 216.A H 3.176 2.341 GLU 218.A N GLU 218.A OE1 GLU 218.A H 2.955 2.203 GLN 219.A N SER 216.A OG GLN 219.A H 3.191 2.402 GLN 219.A NE2 LYS 151.A O GLN 219.A HE22 3.022 2.171 GLN 219.A NE2 GLN 155.A OE1 GLN 219.A HE21 2.977 2.162 VAL 220.A N SER 216.A O VAL 220.A H.A 3.229 2.405 LEU 221.A N SER 217.A O LEU 221.A H 2.974 2.172 LYS 222.A N GLU 218.A O LYS 222.A H 3.381 2.629 ARG 224.A N LEU 221.A O ARG 224.A H 3.095 2.467 ARG 224.A NE GLY 96.A O ARG 224.A HE 2.796 1.966 ARG 224.A NH2 ASP 99.A OD1 ARG 224.A HH22 2.835 1.981 LYS 225.A N LYS 222.A O LYS 225.A H 3.262 2.417 LEU 226.A N PHE 223.A O LEU 226.A H 3.331 2.473 ASN 227.A N LYS 165.A O ASN 227.A H 2.905 2.191 PHE 228.A N GLU 236.A O PHE 228.A H 2.863 2.075 ASN 229.A ND2 GLY 230.A O ASN 229.A HD22 2.928 2.106 GLY 230.A N GLU 233.A OE1 GLY 230.A H 2.847 2.037 GLU 233.A N GLY 230.A O GLU 233.A H 3.151 2.313 GLU 236.A N ASN 229.A OD1 GLU 236.A H 2.743 1.912 MET 238.A N LEU 226.A O MET 238.A H 2.763 1.916 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.A ASN 241.A HD22 2.993 2.152 ASN 241.A ND2 HIS 62.A O.B ASN 241.A HD22 3.001 2.154 TRP 242.A NE1 ASP 240.A OD1 TRP 242.A HE1 3.010 2.173 ARG 243.A N GLU 104.A OE2 ARG 243.A H 2.828 1.986 ARG 243.A NH1 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH12 2.861 2.048 ARG 243.A NH1 SER 27.A O ARG 243.A HH11 2.755 2.028 ARG 243.A NH2 ALA 21.A O ARG 243.A HH22 3.304 2.653 ARG 243.A NH2 GLN 26.A OE1 ARG 243.A HH22 3.347 2.686 GLN 246.A N PRO 28.A O GLN 246.A H 2.677 1.859 GLN 246.A NE2 PRO 244.A O GLN 246.A HE21 2.874 2.032 LYS 249.A NZ GLY 23.A O LYS 249.A HZ2 2.841 2.100 ARG 251.A NE LEU 248.A O ARG 251.A HE 2.937 2.089 ARG 251.A NH1 GLN 26.A O ARG 251.A HH12 2.999 2.264 ARG 251.A NH1 PRO 192.A O ARG 251.A HH11 2.916 2.075 ARG 251.A NH2 GLN 26.A O ARG 251.A HH22 2.869 2.090 ARG 251.A NH2 PRO 247.A O ARG 251.A HH21 2.974 2.289 ARG 251.A NH2 LEU 248.A O ARG 251.A HH21 3.553 2.896 LYS 254.A N THR 190.A O LYS 254.A H 2.985 2.143 ALA 255.A N LYS 37.A O ALA 255.A H 2.868 2.053 SER 256.A N TYR 188.A O SER 256.A H 2.923 2.084