Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8uho_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLY 2.A N ASN 214.A OD1 GLY 2.A H 3.042 2.250 ARG 4.A N GLN 299.A OE1 ARG 4.A H 2.750 1.917 PHE 8.A N SER 113.A OG PHE 8.A H 2.778 1.940 SER 10.A OG GLU 14.A OE2 SER 10.A HG 2.545 1.747 VAL 13.A N SER 10.A O VAL 13.A H 2.920 2.246 GLU 14.A N SER 10.A O GLU 14.A H 2.890 2.078 GLY 15.A N GLY 11.A O GLY 15.A H 3.287 2.484 CYS 16.A N VAL 13.A O CYS 16.A H 2.911 2.069 CYS 16.A SG LYS 12.A O CYS 16.A HG 3.467 2.418 MET 17.A N GLU 14.A O MET 17.A H 3.272 2.417 VAL 18.A N GLY 29.A O VAL 18.A H 2.959 2.126 GLN 19.A N GLN 69.A O GLN 19.A H 3.036 2.180 VAL 20.A N LEU 27.A O VAL 20.A H 2.790 1.934 THR 21.A N LEU 67.A O THR 21.A H 2.849 2.072 CYS 22.A N THR 25.A O CYS 22.A H 2.935 2.133 THR 25.A N CYS 22.A O THR 25.A H 3.028 2.220 LEU 27.A N VAL 20.A O LEU 27.A H 2.873 2.048 ASN 28.A N CYS 145.A O ASN 28.A H 2.989 2.142 ASN 28.A ND2 CYS 117.A O ASN 28.A HD21 2.946 2.256 ASN 28.A ND2 GLY 143.A O ASN 28.A HD21 3.163 2.594 ASN 28.A ND2 CYS 145.A O ASN 28.A HD22 2.997 2.271 GLY 29.A N VAL 18.A O GLY 29.A H 2.846 2.006 LEU 30.A N TYR 37.A O LEU 30.A H 2.762 1.940 TRP 31.A N CYS 16.A O TRP 31.A H 2.679 1.829 LEU 32.A N VAL 35.A O LEU 32.A H 2.907 2.095 ASP 33.A N THR 98.A OG1 ASP 33.A H 2.939 2.115 VAL 35.A N LEU 32.A O VAL 35.A H 3.007 2.190 VAL 36.A N LEU 89.A O VAL 36.A H 2.804 1.981 TYR 37.A N LEU 30.A O TYR 37.A H 2.764 1.943 CYS 38.A N LEU 87.A O CYS 38.A H 3.097 2.314 ARG 40.A N CYS 85.A O ARG 40.A H 3.026 2.183 ARG 40.A NE ASP 187.A OD2 ARG 40.A HE 2.720 1.867 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD1 ARG 40.A HH21 2.970 2.113 ARG 40.A NH2 ASP 187.A OD2 ARG 40.A HH21 3.567 2.964 VAL 42.A N PRO 39.A O VAL 42.A H 3.257 2.398 ILE 43.A N ARG 40.A O ILE 43.A H 3.162 2.302 CYS 44.A N HIS 41.A O CYS 44.A H 3.011 2.159 ASP 48.A N THR 45.A O ASP 48.A H 2.975 2.215 TYR 54.A OH ASP 187.A O TYR 54.A HH 2.755 1.935 ASP 56.A N ASN 53.A OD1 ASP 56.A H 3.219 2.385 LEU 57.A N ASN 53.A O LEU 57.A H 2.848 2.017 LEU 58.A N TYR 54.A O LEU 58.A H 2.862 2.031 ILE 59.A N GLU 55.A O ILE 59.A H 3.163 2.339 ARG 60.A N LEU 57.A O ARG 60.A H 3.243 2.508 ARG 60.A NE ASP 56.A OD2 ARG 60.A HE 2.803 2.014 ARG 60.A NH2 ASP 56.A OD2 ARG 60.A HH21 2.870 2.122 LYS 61.A N LEU 58.A O LYS 61.A H 2.974 2.125 SER 62.A N ASN 65.A OD1 SER 62.A H 2.754 1.905 ASN 65.A N SER 62.A O ASN 65.A H 2.845 2.046 PHE 66.A N ASN 63.A O PHE 66.A H 3.176 2.320 LEU 67.A N THR 21.A O LEU 67.A H 2.892 2.036 GLN 69.A N GLN 19.A O GLN 69.A H 2.940 2.124 ALA 70.A N VAL 73.A O ALA 70.A H 2.773 2.041 VAL 73.A N ALA 70.A O VAL 73.A H 3.021 2.177 LEU 75.A N VAL 68.A O LEU 75.A H 2.908 2.112 ILE 78.A N LYS 90.A O ILE 78.A H 2.802 1.990 HIS 80.A ND1 ASN 63.A OD1 HIS 80.A HD1 2.759 1.965 SER 81.A N LYS 88.A O SER 81.A H 2.954 2.167 GLN 83.A N VAL 86.A O GLN 83.A H 2.890 2.046 ASN 84.A ND2 GLU 178.A O ASN 84.A HD22 2.798 1.944 CYS 85.A N GLY 179.A O CYS 85.A H 2.958 2.126 VAL 86.A N GLN 83.A O VAL 86.A H 3.014 2.164 LEU 87.A N CYS 38.A O LEU 87.A H 2.788 1.952 LYS 88.A N SER 81.A O LYS 88.A H 2.781 1.924 LEU 89.A N VAL 36.A O LEU 89.A H 2.841 1.992 LYS 90.A N GLY 79.A O LYS 90.A H 2.759 1.999 VAL 91.A N ASP 34.A O VAL 91.A H 3.042 2.205 ASP 92.A N ARG 76.A O ASP 92.A H 3.062 2.353 ASN 95.A N ASP 33.A O ASN 95.A H 2.744 1.940 ASN 95.A ND2 GLY 15.A O ASN 95.A HD21 2.970 2.114 ASN 95.A ND2 TRP 31.A O ASN 95.A HD22 2.871 2.016 LYS 97.A N ASN 95.A OD1 LYS 97.A H 2.961 2.107 THR 98.A N ASN 95.A O THR 98.A H 3.089 2.254 THR 98.A OG1 ASN 95.A O THR 98.A HG1 2.734 1.897 TYR 101.A OH ASP 33.A OD2 TYR 101.A HH 3.193 2.366 LYS 102.A N VAL 157.A O LYS 102.A H 2.716 1.920 VAL 104.A N PHE 159.A O VAL 104.A H 2.957 2.116 ARG 105.A NH1 ASP 176.A OD2 ARG 105.A HH11 2.853 2.049 ARG 105.A NH1 ASN 180.A O ARG 105.A HH12 3.110 2.366 ARG 105.A NH1 PHE 181.A O ARG 105.A HH12 3.429 2.773 ARG 105.A NH2 PHE 181.A O ARG 105.A HH22 2.840 2.005 ILE 106.A N TYR 182.A OH ILE 106.A H 3.096 2.290 GLY 109.A N MET 130.A O GLY 109.A H 2.743 1.884 GLN 110.A N GLN 107.A O GLN 110.A H 3.007 2.177 THR 111.A N GLN 110.A OE1 THR 111.A H 3.057 2.344 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD1 THR 111.A HG1 3.332 2.768 THR 111.A OG1 ASP 295.A OD2 THR 111.A HG1 2.654 1.869 PHE 112.A N CYS 128.A O PHE 112.A H 2.923 2.121 SER 113.A N PHE 150.A O SER 113.A H 2.819 1.970 SER 113.A OG GLN 127.A OE1 SER 113.A HG 2.680 2.081 VAL 114.A N TYR 126.A O VAL 114.A H 2.676 1.828 LEU 115.A N VAL 148.A O LEU 115.A H 3.135 2.319 ALA 116.A N GLY 124.A O ALA 116.A H 2.811 2.093 CYS 117.A N SER 147.A OG CYS 117.A H 2.935 2.119 CYS 117.A SG LEU 115.A O CYS 117.A HG 3.558 2.375 TYR 118.A N SER 121.A O TYR 118.A H 2.973 2.144 GLY 120.A N ASN 28.A OD1 GLY 120.A H 2.837 2.023 SER 121.A N TYR 118.A O SER 121.A H 2.929 2.083 SER 123.A N ALA 116.A O SER 123.A H 2.730 1.871 TYR 126.A N VAL 114.A O TYR 126.A H 2.997 2.219 CYS 128.A N PHE 112.A O CYS 128.A H 2.727 1.889 MET 130.A N GLN 110.A O MET 130.A H 3.035 2.228 ARG 131.A N THR 135.A O ARG 131.A H 2.881 2.030 ARG 131.A NE ASP 197.A OD1 ARG 131.A HE 3.349 2.502 ARG 131.A NE ASP 197.A OD2 ARG 131.A HE 3.028 2.343 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD1 ARG 131.A HH12 2.912 2.056 ARG 131.A NH1 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH12 3.304 2.660 ARG 131.A NH1 GLU 290.A OE2 ARG 131.A HH11 2.985 2.183 ARG 131.A NH2 THR 198.A O ARG 131.A HH21 2.896 2.200 ARG 131.A NH2 ASP 289.A OD2 ARG 131.A HH22 2.766 1.960 ASN 133.A ND2 GLY 195.A O ASN 133.A HD22 2.945 2.090 PHE 134.A N ARG 131.A O PHE 134.A H 2.872 2.034 THR 135.A N ASN 133.A OD1 THR 135.A H 3.227 2.429 THR 135.A OG1 ASN 133.A OD1 THR 135.A HG1 2.640 1.818 ILE 136.A N HIS 172.A O ILE 136.A H 2.860 2.055 GLY 138.A N HIS 172.A ND1 GLY 138.A H 3.086 2.338 SER 139.A N TYR 126.A OH SER 139.A H 2.869 2.011 LEU 141.A N TYR 118.A OH LEU 141.A H 2.821 2.003 SER 144.A N LEU 141.A O SER 144.A H 3.130 2.440 SER 144.A OG LEU 141.A O SER 144.A HG 2.602 1.897 CYS 145.A SG HIS 163.A O no hydrogen 3.838 N/A CYS 145.A SG HIS 164.A O no hydrogen 3.239 N/A GLY 146.A N HIS 163.A O GLY 146.A H 3.043 2.221 SER 147.A N SER 144.A O SER 147.A H 3.075 2.228 SER 147.A OG SER 144.A O SER 147.A HG 2.755 2.031 GLY 149.A N TYR 161.A O GLY 149.A H 2.827 2.023 PHE 150.A N SER 113.A O PHE 150.A H 2.745 2.029 ASN 151.A N SER 158.A O ASN 151.A H 2.995 2.178 ASN 151.A ND2 THR 111.A O ASN 151.A HD21 3.199 2.404 ASP 153.A N CYS 156.A O ASP 153.A H 2.974 2.138 CYS 156.A N ASP 153.A O CYS 156.A H 2.893 2.052 VAL 157.A N LYS 100.A O VAL 157.A H 2.814 1.980 SER 158.A N ASN 151.A O SER 158.A H 2.837 2.024 PHE 159.A N LYS 102.A O PHE 159.A H 2.795 2.016 CYS 160.A N GLY 149.A O CYS 160.A H 3.057 2.216 TYR 161.A OH HIS 163.A ND1 TYR 161.A HH 3.051 2.359 MET 162.A N THR 175.A O MET 162.A H 2.777 2.015 HIS 163.A N SER 147.A O HIS 163.A H 2.907 2.109 HIS 164.A N ALA 173.A O HIS 164.A H 3.214 2.394 HIS 164.A NE2 THR 175.A OG1 HIS 164.A HE2 3.027 2.405 MET 165.A N ALA 173.A O MET 165.A H 2.997 2.255 LEU 167.A N VAL 171.A O LEU 167.A H 2.843 1.996 GLY 170.A N LEU 167.A O GLY 170.A H 2.815 2.031 HIS 172.A N ILE 136.A O HIS 172.A H 2.842 2.053 HIS 172.A NE2 GLU 166.A OE1 HIS 172.A HE2 2.821 2.071 ALA 173.A N MET 165.A O ALA 173.A H 2.958 2.119 THR 175.A N MET 162.A O THR 175.A H 2.995 2.200 THR 175.A OG1 ASP 176.A O THR 175.A HG1 2.876 2.086 ASP 176.A N ASN 180.A O ASP 176.A H 2.974 2.173 GLU 178.A N ASP 176.A OD1 GLU 178.A H 2.887 2.239 GLY 179.A N ASP 176.A O GLY 179.A H 2.966 2.131 ASN 180.A N ASP 176.A OD1 ASN 180.A H 2.987 2.171 TYR 182.A N GLY 174.A O TYR 182.A H 3.030 2.221 TYR 182.A OH CYS 160.A O TYR 182.A HH 2.602 1.842 VAL 186.A N GLN 192.A OE1 VAL 186.A H 2.945 2.146 ARG 188.A NE LEU 50.A O ARG 188.A HE 3.276 2.429 ARG 188.A NH2 ASN 51.A OD1 ARG 188.A HH21 2.771 2.221 GLN 189.A N MET 49.A O GLN 189.A H 2.877 2.031 GLN 192.A NE2 VAL 186.A O GLN 192.A HE22 2.997 2.170 GLN 192.A NE2 THR 190.A O GLN 192.A HE21 3.563 2.802 THR 198.A OG1 GLU 240.A OE2 THR 198.A HG1 2.409 1.619 THR 199.A N ASN 238.A O THR 199.A H 2.982 2.191 ILE 200.A N ASP 289.A OD2 ILE 200.A H 2.928 2.088 THR 201.A OG1 GLU 240.A O THR 201.A HG1 2.570 1.933 ASN 203.A N ILE 200.A O ASN 203.A H 2.988 2.371 ASN 203.A ND2 GLY 109.A O ASN 203.A HD21 2.981 2.141 ASN 203.A ND2 ASP 289.A O ASN 203.A HD22 2.920 2.101 VAL 204.A N ILE 200.A O VAL 204.A H 3.129 2.329 LEU 205.A N THR 201.A O LEU 205.A H 3.037 2.218 ALA 206.A N VAL 202.A O ALA 206.A H 3.076 2.264 TRP 207.A N ASN 203.A O TRP 207.A H 3.021 2.215 LEU 208.A N VAL 204.A O LEU 208.A H 2.935 2.145 TYR 209.A N LEU 205.A O TYR 209.A H 3.079 2.275 TYR 209.A OH ILE 259.A O TYR 209.A HH 2.752 1.922 ALA 210.A N ALA 206.A O ALA 210.A H 2.953 2.166 ALA 211.A N TRP 207.A O ALA 211.A H 2.960 2.187 VAL 212.A N LEU 208.A O VAL 212.A H 3.060 2.245 ILE 213.A N TYR 209.A O ILE 213.A H 2.818 1.966 ASN 214.A N ALA 210.A O ASN 214.A H 2.922 2.196 ASN 214.A ND2 ALA 210.A O ASN 214.A HD22 2.961 2.122 GLY 215.A N VAL 212.A O GLY 215.A H 2.836 1.997 ASP 216.A N ALA 211.A O ASP 216.A H 2.907 2.057 TRP 218.A NE1 THR 280.A O TRP 218.A HE1 3.165 2.377 LEU 220.A N ARG 217.A O LEU 220.A H 3.162 2.308 ASN 221.A ND2 ALA 266.A O ASN 221.A HD21 3.459 2.742 PHE 223.A N ASN 221.A OD1 PHE 223.A H 2.925 2.125 THR 224.A OG1 ASP 263.A OD1 THR 224.A HG1 2.834 2.243 THR 225.A OG1 THR 226.A O THR 225.A HG1 2.861 2.022 ASP 229.A N THR 226.A OG1 ASP 229.A H 3.039 2.193 PHE 230.A N THR 226.A O PHE 230.A H 3.058 2.213 ASN 231.A N LEU 227.A O ASN 231.A H 3.056 2.236 ASN 231.A ND2 LEU 242.A O ASN 231.A HD21 2.832 1.984 LEU 232.A N ASN 228.A O LEU 232.A H 2.930 2.106 VAL 233.A N ASP 229.A O VAL 233.A H 3.146 2.340 ALA 234.A N PHE 230.A O ALA 234.A H 2.763 1.915 MET 235.A N ASN 231.A O MET 235.A H 3.078 2.235 LYS 236.A N VAL 233.A O LYS 236.A H 2.973 2.231 LYS 236.A NZ LEU 232.A O LYS 236.A HZ3 3.541 2.770 TYR 237.A N ALA 234.A O TYR 237.A H 2.850 2.021 ASN 238.A N MET 235.A O ASN 238.A H 3.219 2.393 TYR 239.A N ALA 234.A O TYR 239.A H 3.198 2.377 GLU 240.A N THR 199.A O GLU 240.A H 2.916 2.062 LEU 242.A N ASN 231.A OD1 LEU 242.A H 2.735 1.877 THR 243.A N HIS 246.A ND1 THR 243.A H 3.168 2.319 HIS 246.A N THR 243.A OG1 HIS 246.A H 3.258 2.430 VAL 247.A N THR 243.A O VAL 247.A H 3.064 2.269 ASP 248.A N GLN 244.A O ASP 248.A H 2.920 2.105 ILE 249.A N ASP 245.A O ILE 249.A H 3.014 2.232 LEU 250.A N HIS 246.A O LEU 250.A H 3.151 2.424 LEU 250.A N VAL 247.A O LEU 250.A H 3.109 2.462 GLY 251.A N ASP 248.A O GLY 251.A H 3.010 2.173 SER 254.A N LEU 250.A O SER 254.A H 2.901 2.074 SER 254.A OG ILE 259.A O SER 254.A HG 2.629 1.814 ALA 255.A N GLY 251.A O ALA 255.A H 2.897 2.125 GLN 256.A N PRO 252.A O GLN 256.A H 2.914 2.086 THR 257.A N LEU 253.A O THR 257.A H 3.122 2.315 GLY 258.A N SER 254.A O GLY 258.A H 2.818 2.213 ILE 259.A N SER 254.A O ILE 259.A H 3.200 2.614 ILE 259.A N THR 257.A OG1 ILE 259.A H 3.345 2.601 MET 264.A N ALA 260.A O MET 264.A H 3.041 2.226 CYS 265.A N VAL 261.A O CYS 265.A H 2.901 2.089 ALA 266.A N LEU 262.A O ALA 266.A H 3.162 2.402 SER 267.A N ASP 263.A O SER 267.A H 3.194 2.416 LEU 268.A N MET 264.A O LEU 268.A H 2.989 2.177 LYS 269.A N CYS 265.A O LYS 269.A H 2.995 2.172 LYS 269.A NZ THR 225.A OG1 LYS 269.A HZ1 3.032 2.315 GLU 270.A N ALA 266.A O GLU 270.A H 3.206 2.401 LEU 271.A N SER 267.A O LEU 271.A H 2.936 2.122 LEU 272.A N LEU 268.A O LEU 272.A H 2.952 2.137 GLN 273.A N LYS 269.A O GLN 273.A H 3.175 2.434 GLN 273.A NE2 ASN 274.A OD1 GLN 273.A HE21 2.753 1.916 ASN 274.A N GLU 270.A O ASN 274.A H 2.872 2.134 GLY 275.A N LEU 271.A O GLY 275.A H 2.814 2.076 ARG 279.A N MET 276.A O ARG 279.A H 2.999 2.184 ARG 279.A NE MET 276.A O ARG 279.A HE 3.274 2.589 ILE 281.A N SER 284.A O ILE 281.A H 2.795 1.967 SER 284.A N ILE 281.A O SER 284.A H 2.914 2.129 LEU 286.A N SER 284.A OG LEU 286.A H 3.016 2.164 THR 292.A N ASP 295.A OD2 THR 292.A H 3.099 2.256 ASP 295.A N THR 292.A OG1 ASP 295.A H 2.930 2.086 VAL 296.A N THR 292.A O VAL 296.A H 3.005 2.207 VAL 297.A N PRO 293.A O VAL 297.A H 3.125 2.281 ARG 298.A N PHE 294.A O ARG 298.A H 2.963 2.128 GLN 299.A N ASP 295.A O GLN 299.A H 2.951 2.120 GLN 299.A NE2 ARG 4.A O GLN 299.A HE22 2.986 2.189 CYS 300.A N VAL 296.A O CYS 300.A H 2.884 2.051 SER 301.A N VAL 297.A O SER 301.A H 2.998 2.305