Finding intermodel H-bonds Finding intramodel H-bonds Constraints relaxed by 0.4 angstroms and 20 degrees Models used: #0 8vd5_A.cif H-bonds (donor, acceptor, hydrogen, D..A dist, D-H..A dist): GLN 7.A NE2 VAL 8.A O GLN 7.A HE21 2.808 1.998 ASN 10.A N LYS 253.A O ASN 10.A H 2.960 2.166 MET 15.A N PRO 98.A O MET 15.A H 3.234 2.399 LYS 19.A N THR 23.A O LYS 19.A H 3.047 2.219 GLY 22.A N LYS 19.A O GLY 22.A H 2.908 2.072 THR 23.A N ASP 21.A OD1 THR 23.A H 2.732 1.915 THR 23.A OG1 ASP 21.A OD1 THR 23.A HG1 2.628 1.806 THR 23.A OG1 ASP 21.A OD2 THR 23.A HG1 3.234 2.581 MET 25.A N HIS 17.A O MET 25.A H 2.940 2.084 GLU 38.A N GLU 121.A OE2 GLU 38.A H 2.785 1.974 SER 40.A N ASN 39.A OD1 SER 40.A H 2.645 1.996 SER 40.A OG ASP 128.A OD1 SER 40.A HG 2.704 1.877 LYS 41.A N ASP 128.A OD2 LYS 41.A H 2.741 1.935 LYS 41.A NZ GLU 38.A OE1 LYS 41.A HZ1 2.875 1.998 ILE 42.A N ASP 128.A OD1 ILE 42.A H 3.029 2.173 MET 43.A N SER 40.A OG MET 43.A H 2.977 2.116 GLN 44.A N SER 40.A O GLN 44.A H 3.156 2.470 GLN 44.A N LYS 41.A O GLN 44.A H 3.209 2.625 LEU 45.A N LYS 41.A O LEU 45.A H 2.925 2.122 GLY 46.A N ILE 42.A O GLY 46.A H 2.745 1.888 LYS 47.A N LEU 231.A O LYS 47.A H 2.856 2.068 LYS 47.A NZ TYR 48.A O LYS 47.A HZ1 2.906 2.049 LYS 47.A NZ GLU 49.A OE1 LYS 47.A HZ2 2.794 1.922 GLU 49.A N TYR 233.A O GLU 49.A H 2.956 2.286 LYS 56.A N MET 88.A O LYS 56.A H 2.917 2.125 LYS 56.A NZ PRO 50.A O LYS 56.A HZ2 2.899 2.029 PHE 58.A N ALA 86.A O PHE 58.A H 2.668 1.811 PHE 60.A N VAL 84.A O PHE 60.A H 2.937 2.082 ALA 62.A N THR 82.A O ALA 62.A H 2.776 1.983 ASP 63.A N THR 82.A O ASP 63.A H 3.202 2.418 GLY 66.A N SER 79.A OG GLY 66.A H 2.875 2.040 TYR 68.A OH THR 78.A O TYR 68.A HH 2.733 1.894 GLN 74.A N GLY 71.A O GLN 74.A H 2.873 2.026 THR 82.A N ASP 63.A O THR 82.A H 3.100 2.266 THR 82.A OG1 ASP 63.A OD2 THR 82.A HG1 2.816 2.060 VAL 84.A N PHE 60.A O VAL 84.A H 2.740 1.923 ALA 86.A N PHE 58.A O ALA 86.A H 3.220 2.399 THR 87.A OG1 LYS 56.A O THR 87.A HG1 2.625 1.800 MET 88.A N LYS 56.A O MET 88.A H 3.325 2.550 ARG 89.A NE ALA 90.A O ARG 89.A HE 3.009 2.234 ARG 89.A NH2 ALA 90.A O ARG 89.A HH21 2.944 2.158 ALA 90.A N THR 54.A O ALA 90.A H 2.773 1.940 PHE 91.A N VAL 276.A O PHE 91.A H 2.906 2.085 LEU 93.A N MET 274.A O LEU 93.A H 2.707 1.890 VAL 95.A N ALA 272.A O VAL 95.A H 3.076 2.306 LEU 97.A N LEU 270.A O LEU 97.A H 2.894 2.081 VAL 99.A N VAL 268.A O VAL 99.A H 2.677 1.885 THR 100.A N MET 15.A O THR 100.A H 2.919 2.066 THR 100.A OG1 MET 15.A O THR 100.A HG1 3.091 2.344 LYS 101.A N ASP 266.A O LYS 101.A H 3.176 2.339 LYS 101.A NZ ASP 266.A OD1 LYS 101.A HZ1 2.640 1.881 GLU 102.A N GLU 102.A OE1 GLU 102.A H 2.729 2.029 PHE 103.A N THR 100.A O PHE 103.A H 2.790 2.152 LEU 104.A N THR 100.A O LEU 104.A H 3.363 2.600 ASN 105.A N LYS 101.A O ASN 105.A H 3.132 2.460 ASN 105.A N GLU 102.A O ASN 105.A H 3.162 2.497 TYR 106.A N GLU 102.A O TYR 106.A H 2.818 1.991 THR 107.A N PHE 103.A O THR 107.A H 3.046 2.439 THR 107.A OG1 HIS 17.A ND1 THR 107.A HG1 2.700 2.122 TYR 108.A N PHE 103.A O TYR 108.A H 3.017 2.198 SER 109.A OG LEU 104.A O SER 109.A HG 3.038 2.266 PHE 111.A N TYR 108.A O PHE 111.A H 3.081 2.265 GLU 113.A N GLN 110.A O GLU 113.A H 2.813 2.138 GLU 114.A N GLN 110.A O GLU 114.A H 3.018 2.185 MET 115.A N PHE 111.A O MET 115.A H 2.908 2.217 LYS 116.A N GLU 113.A O LYS 116.A H 3.323 2.531 LYS 116.A NZ GLU 113.A OE1 LYS 116.A HZ1 2.898 2.017 LYS 116.A NZ GLU 113.A OE2 LYS 116.A HZ1 3.369 2.759 ILE 119.A N MET 115.A O ILE 119.A H 2.888 2.093 ALA 120.A N LYS 116.A O ALA 120.A H 3.069 2.221 GLU 121.A N PRO 117.A O GLU 121.A H 3.076 2.225 ALA 122.A N MET 118.A O ALA 122.A H 3.041 2.239 PHE 123.A N ILE 119.A O PHE 123.A H 3.050 2.256 TYR 124.A N ALA 120.A O TYR 124.A H 2.894 2.052 LYS 125.A N GLU 121.A O LYS 125.A H 2.959 2.100 LYS 126.A N ALA 122.A O LYS 126.A H 3.054 2.239 PHE 127.A N PHE 123.A O PHE 127.A H 2.819 2.016 ASP 128.A N TYR 124.A O ASP 128.A H 2.896 2.038 GLU 129.A N LYS 125.A O GLU 129.A H 3.089 2.233 ALA 130.A N LYS 126.A O ALA 130.A H 3.225 2.487 ALA 130.A N PHE 127.A O ALA 130.A H 3.153 2.557 GLY 131.A N PHE 127.A O GLY 131.A H 2.988 2.197 ILE 132.A N ASP 128.A O ILE 132.A H 2.830 1.971 GLN 135.A N GLU 129.A O GLN 135.A H 2.974 2.136 GLY 136.A N GLN 135.A OE1 GLY 136.A H 3.262 2.535 ASN 138.A ND2 ALA 130.A O ASN 138.A HD21 3.174 2.457 ASN 138.A ND2 ASN 134.A OD1 ASN 138.A HD22 2.901 2.171 SER 143.A OG ASN 134.A OD1 SER 143.A HG 2.800 1.993 ILE 144.A N GLY 131.A O ILE 144.A H 2.999 2.185 ALA 145.A N ILE 132.A O ALA 145.A H 3.050 2.226 GLN 146.A N SER 143.A OG GLN 146.A H 3.051 2.239 GLN 146.A NE2 GLN 146.A O GLN 146.A HE21 2.953 2.247 SER 147.A N SER 143.A O SER 147.A H 3.023 2.276 SER 147.A OG SER 143.A O SER 147.A HG 2.706 1.867 ILE 148.A N ILE 144.A O ILE 148.A H 2.995 2.192 GLU 149.A N ALA 145.A O GLU 149.A H 3.095 2.272 LYS 150.A N GLN 146.A O LYS 150.A H 3.220 2.407 LYS 150.A NZ ASP 283.A OD2 LYS 150.A HZ1 2.995 2.222 THR 151.A N SER 147.A O THR 151.A H 2.867 2.017 THR 151.A OG1 SER 147.A O THR 151.A HG1 2.961 2.149 ASN 152.A N GLU 149.A O ASN 152.A H 3.149 2.434 LYS 153.A NZ LEU 170.A O LYS 153.A HZ2 3.067 2.506 VAL 154.A N ASN 152.A O VAL 154.A H 2.808 2.081 ILE 155.A N LYS 288.A O ILE 155.A H 2.870 2.086 GLY 157.A N VAL 290.A O GLY 157.A H 2.797 1.967 THR 160.A N ASP 158.A O THR 160.A H 2.746 2.012 ASN 163.A N THR 160.A OG1 ASN 163.A H 2.905 2.099 ASN 163.A ND2 ASP 158.A O ASN 163.A HD21 2.785 1.929 ILE 164.A N THR 160.A O ILE 164.A H 2.844 2.017 ILE 165.A N GLN 161.A O ILE 165.A H 2.961 2.136 ASP 166.A N ASP 162.A O ASP 166.A H 2.714 1.868 LEU 167.A N ASN 163.A O LEU 167.A H 2.733 1.914 ALA 169.A N ILE 165.A O ALA 169.A H 2.736 1.890 LEU 170.A N ASP 166.A O LEU 170.A H 2.873 2.162 LEU 170.A N LEU 167.A O LEU 170.A H 3.308 2.628 LEU 171.A N GLU 168.A O LEU 171.A H 2.961 2.168 GLU 172.A N GLU 168.A O GLU 172.A H 3.170 2.352 ASP 173.A N ALA 169.A O ASP 173.A H 2.798 2.012 ASP 174.A N LEU 171.A O ASP 174.A H 2.851 2.006 GLU 175.A N GLU 172.A O GLU 175.A H 2.777 1.930 LEU 176.A N LEU 171.A O LEU 176.A H 3.266 2.423 ASN 179.A N GLY 226.A O ASN 179.A H 2.832 2.004 PHE 181.A N PRO 209.A O PHE 181.A H 2.895 2.062 ILE 182.A N ILE 224.A O ILE 182.A H 2.778 1.933 SER 183.A N VAL 211.A O SER 183.A H 2.946 2.153 LYS 184.A NZ SER 215.A O LYS 184.A HZ1 2.856 1.967 ASN 187.A N LYS 184.A O ASN 187.A H 2.856 1.995 ASN 187.A ND2 ARG 220.A O ASN 187.A HD21 2.988 2.189 ARG 188.A NE ASP 203.A OD1 ARG 188.A HE 2.988 2.152 ARG 188.A NH1 THR 185.A OG1 ARG 188.A HH12 2.737 1.956 ARG 188.A NH2 ASP 203.A OD2 ARG 188.A HH21 2.880 2.021 LEU 190.A N ASN 187.A O LEU 190.A H 2.959 2.174 LEU 191.A N ASN 187.A O LEU 191.A H 3.286 2.456 ARG 192.A N ARG 188.A O ARG 192.A H 2.844 2.003 TYR 198.A OH ASP 203.A OD1 TYR 198.A HH 2.707 1.906 ASP 199.A N SER 204.A O ASP 199.A H 3.144 2.298 SER 202.A N ASP 199.A OD1 SER 202.A H 2.774 2.005 SER 202.A OG ASP 199.A OD1 SER 202.A HG 2.713 1.883 SER 202.A OG ASP 199.A OD2 SER 202.A HG 3.498 2.840 SER 204.A N ASP 199.A O SER 204.A H 3.080 2.262 SER 204.A OG SER 202.A OG SER 204.A HG 2.456 1.636 LEU 205.A N LEU 208.A O LEU 205.A H 2.868 2.062 ASP 206.A N ILE 197.A O ASP 206.A H 2.949 2.089 LEU 208.A N LEU 205.A O LEU 208.A H 3.281 2.540 VAL 210.A N ASP 203.A O VAL 210.A H 2.977 2.122 VAL 211.A N PHE 181.A O VAL 211.A H 2.685 1.827 LEU 213.A N SER 183.A O LEU 213.A H 2.992 2.259 LYS 214.A NZ GLU 35.A OE1 LYS 214.A HZ1 2.801 1.918 LYS 214.A NZ GLU 38.A OE2 LYS 214.A HZ2 2.906 2.088 SER 215.A OG GLU 129.A OE2 SER 215.A HG 2.593 1.772 ASN 217.A ND2 GLU 129.A OE2 ASN 217.A HD21 2.640 1.808 LYS 219.A NZ ASN 217.A O LYS 219.A HZ1 2.893 2.025 ARG 220.A NH1 GLN 186.A O ARG 220.A HH11 2.871 2.071 LEU 223.A N LEU 289.A O LEU 223.A H 3.053 2.243 ILE 224.A N ILE 182.A O ILE 224.A H 3.138 2.286 THR 225.A N ALA 287.A O THR 225.A H 2.975 2.137 THR 225.A OG1 ALA 180.A O THR 225.A HG1 2.613 1.810 ASP 227.A N ALA 285.A O ASP 227.A H 2.959 2.212 ASP 229.A N ASP 227.A OD1 ASP 229.A H 3.315 2.535 LYS 230.A N ASP 227.A O LYS 230.A H 2.892 2.047 LYS 230.A NZ ASP 227.A OD2 LYS 230.A HZ1 2.835 1.964 LEU 231.A N PHE 228.A O LEU 231.A H 3.238 2.394 ILE 232.A N HIS 279.A O ILE 232.A H 2.826 1.976 TYR 233.A N LYS 47.A O TYR 233.A H 2.968 2.145 GLY 234.A N ALA 277.A O GLY 234.A H 3.100 2.302 GLU 240.A N THR 273.A O GLU 240.A H 2.939 2.112 LYS 242.A N ARG 271.A O LYS 242.A H 2.798 1.947 LYS 242.A NZ ASP 244.A OD2 LYS 242.A HZ1 2.885 2.058 ASP 244.A N ALA 269.A O ASP 244.A H 2.902 2.061 THR 246.A N ASP 244.A OD1 THR 246.A H 2.927 2.099 ALA 247.A N ASP 244.A OD1 ALA 247.A H 2.819 1.982 LEU 249.A N VAL 260.A O LEU 249.A H 2.873 2.023 LYS 253.A N ASN 10.A O LYS 253.A H 2.852 1.997 ASN 254.A N THR 258.A O ASN 254.A H 2.745 1.919 ASN 254.A ND2 GLN 265.A OE1 ASN 254.A HD22 3.172 2.314 GLY 257.A N ASN 254.A O GLY 257.A H 2.979 2.135 THR 258.A N ASP 256.A OD1 THR 258.A H 2.778 1.935 THR 258.A OG1 ASP 256.A OD1 THR 258.A HG1 2.569 1.747 VAL 260.A N LEU 249.A O VAL 260.A H 3.104 2.348 ASN 261.A ND2 GLU 264.A OE1 ASN 261.A HD21 2.792 1.944 LEU 262.A N ALA 247.A O LEU 262.A H 3.111 2.273 GLN 265.A N ASN 261.A O GLN 265.A H 3.123 2.326 GLN 265.A NE2 ASN 254.A OD1 GLN 265.A HE22 2.918 2.122 ASP 266.A N PHE 263.A O ASP 266.A H 3.424 2.619 MET 267.A N LEU 262.A O MET 267.A H 2.928 2.101 VAL 268.A N VAL 99.A O VAL 268.A H 2.755 1.921 ALA 269.A N ASP 244.A O ALA 269.A H 3.025 2.197 LEU 270.A N LEU 97.A O LEU 270.A H 3.254 2.434 ARG 271.A N LYS 242.A O ARG 271.A H 2.788 1.948 ALA 272.A N VAL 95.A O ALA 272.A H 3.021 2.175 THR 273.A N GLU 240.A O THR 273.A H 3.048 2.238 THR 273.A OG1 GLN 237.A OE1 THR 273.A HG1 2.980 2.157 MET 274.A N LEU 93.A O MET 274.A H 2.866 2.078 HIS 275.A N GLN 237.A O HIS 275.A H 3.307 2.511 VAL 276.A N PHE 91.A O VAL 276.A H 3.008 2.188 ALA 277.A N GLY 234.A O ALA 277.A H 2.829 2.082 HIS 279.A N ILE 232.A O HIS 279.A H 2.724 1.893 ALA 281.A N LYS 230.A O ALA 281.A H 2.714 1.893 LYS 284.A N ASP 282.A OD1 LYS 284.A H 3.064 2.229 LYS 284.A NZ ASP 174.A OD2 LYS 284.A HZ1 2.770 1.935 ALA 285.A N ASP 282.A O ALA 285.A H 3.163 2.308 ALA 287.A N THR 225.A O ALA 287.A H 2.841 1.998 LYS 288.A NZ GLU 222.A OE1 LYS 288.A HZ1 2.635 1.823 LEU 289.A N LEU 223.A O LEU 289.A H 2.817 1.969 VAL 290.A N ILE 155.A O VAL 290.A H 2.866 2.061