The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTHFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)
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| publication title |
The structures of deoxy human haemoglobin and the mutant Hb Tyralpha42His at 120 K.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-01-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3M39 A; 4FWZ A; 5CN4 A; 1V07 A; 3DHR B; 3PI9 A; 1Y45 A; 4F6I A; 4M4A A; 1YHR B; 1XZ2 B; 3BCQ A; 3TM3 A; 1YVT B; 5C6E A; 3D17 B; 6HBW A; 1Y8H B; 3UHU A; 5JDO C; 4OF9 A; 1UIW A; 3ZHW A; 1Y4V B; 2D5X A; 4DWT A; 103M A; 1G0A B; 1X46 A; 4KN3 A; 1GBV A; 1GZX B; 3HHB B; 2HBE A; 3G4Q A; 5AZQ A; 2ZFB A; 1YMA A; 1MTK A; 1YE2 B; 4XDI A; 4YU3 B; 2MGA A; 2BWH A; 3KMF A; 1GLI B; 1O1J A; 2QFN A; 4X0L A; 1T1N B; 4NI0 B; 1MLQ A; 3QJC A; 2SPN A; 3UHC A; 3CIU B; 1V4X B; 1JY7 B; 3QM5 A; 2ZS0 D; 1M6C A; 1MOB A; 3HRW B; 3V2Z A; 1NWI A; 3OZU A; 3KMF C; 1MTJ A; 3UHN A; 3E5O A; 3WCV D; 3GYS B; 1G0B A; 1HGC B; 1Y31 A; 1YG5 A; 1Y5J B; 1YEO A; 1MLK A; 2B7H B; 2Z6N B; 2BW9 M; 1HGB B; 3G4U A; 5KER A; 1O1K B; 1PBX B; 1MYH A; 1RTX A; 1R1Y B; 1MYM A; 3NG6 A; 1C7B A; 1RPS B; 2D2M D; 3QJE A; 3HYU B; 1IT2 A; 1Y4R B; 4TYX A; 2QLS A; 3UHW A; 5HBI A; 1G08 A; 3UHV A; 1NXF A; 3ZJS A; 2FAM A; 1A0U B; 4F6B A; 3VHB A; 1Y8W B; 2HBS B; 3GQG A; 2V1J A; 1A3N A; 1CP5 A; 1C7C A; 1THB A; 5ILR A; 4YU4 A; 3EU1 A; 2ZLW A; 3QJB A; 1SI4 B; 2ZSO A; 1FN3 B; 4XS0 A; 3QM7 A; 4MQJ A; 2EB8 A; 1AZI A; 1Y8K A; 1OUT A; 4UZV A; 1NIH A; 1IRD A; 4MU5 A; 2QU0 B; 4L7Y A; 1MCY A; 1A0Z A; 2ZSY A; 1LFY A; 2FRI X; 3UH5 A; 1CP0 A; 1CIK A; 4TWU A; 3GK9 A; 2ZLT B; 2MGM A; 1B0B A; 1TES A; 4OOD A; 1A6K A; 5CNF A; 1Y7G A; 1M9P A; 2W72 A; 1HBA B; 1HAC B; 3QJD B; 2NSR A; 3WFT A; 5HLQ A; 3NML A; 3BJ1 B; 1LH1 A; 1YOI A; 4ODC A; 3GKV B; 2BLI A; 3D1A A; 1A6M A; 3OO5 B; 3WI8 A; 3WCT B; 5JDO D; 3OO4 B; 3QM8 A; 3VRF A; 1Y85 B; 2W72 C; 3WFX A; 1YIE A; 3G4V A; 2OHB A; 4U8U A; 2OH9 A; 2D2N A; 2M6Z A; 1N9I A; 1CH3 A; 3ECL A; 5JGG B; 2ZST A; 3GOU B; 3UGY A; 1I3D A; 4BJA A; 5CNC A; 1MLF A; 3ECZ A; 1YCB A; 1HGA B; 3KUN A; 1DXC A; 3PI8 A; 1BZ6 A; 4U8U C; 1O1P B; 3WCP B; 1HBR A; 1LH5 A; 3ASE A; 2W6V A; 2GDM A; 3UHG A; 1BZZ B; 1DXU A; 4N8T B; 3D1K A; 3G52 A; 4HRT B; 1SDL A; 2ZSP A; 3HF4 A; 4G51 A; 2VYY A; 1Y83 A; 2G11 A; 4H0B A; 2YRS A; 2EVK A; 1IWH B; 1WMU B; 4MAX A; 1UX9 A; 4HSW A; 4H07 A; 4N7N B; 1XZ5 B; 1CQX A; 3UGZ A; 1Y22 B; 1YMC A; 1Y4Q B; 2W6Y A; 2HHE B; 3B75 A; 3MKB A; 1JZL A; 5AZR A; 3K9Z A; 1MWC A; 1V4U A; 4N7O A; 3LR9 A; 1CMY B; 1XQ5 B; 1Y0A B; 1CPW A; 1VXD A; 5AB8 A; 1PMB A; 3A5A A; 1JDO A; 3BJ3 A; 3VRG A; 2ZS1 A; 1J40 B; 1LFT B; 2QMB A; 1G9V B; 5CN8 A; 1J3Y B; 3BJ2 A; 3P5Q A; 1F65 A; 1NEJ A; 2BLH A; 3DUT A; 1CO8 A; 1Y7Z A; 1S6A A; 3LB4 A; 1XZ7 B; 3QZX A; 2MYC A; 3NFE B; 2VLY A; 2AUO A; 2C0K A; 1YIH A; 2ZS1 C; 1BIJ A; 3E4N A; 1LFQ A; 1MBI A; 1BZ1 A; 3HXN A; 1YOH A; 1EW6 A; 3AT6 B; 5B85 A; 4MQI B; 1Y4F A; 4NK1 A; 1RVW B; 3A5G A; 2LH7 A; 2G0V A; 1FAW B; 1COH B; 1BIN A; 1HAB A; 1MWB A; 1BUW A; 1ECN A; 1LJW B; 2BK9 A; 4O4T A; 1Y7D B; 3PT8 A; 3TM9 A; 1V4W B; 1XXT B; 1V9Q A; 3WHM A; 1FSL A; 2PGH B; 5CHQ A; 3ARL A; 2RAO A; 1Z8U B; 4ROL A; 1HBH A; 3BOM B; 1MLN A; 2O5B X; 2IG3 A; 1A6G A; 1LFL B; 2DN1 B; 1H97 A; 2Z6S A; 5SW7 B; 4MQH A; 2R4X A; 1VXG A; 3EOK A; 2IN4 A; 3UH3 A; 1Q1F A; 2PEG A; 3OGB A; 4IRO A; 1J3Z A; 1HJT A; 1YEQ B; 1B86 B; 3FS4 A; 1NIH B; 4AVE A; 3WCW A; 2MYA A; 1G09 B; 1YEN A; 3D7O B; 1ABS A; 3O7N A; 4U8U D; 3UH6 A; 112M A; 3W4U A; 1Y4B B; 1OBM A; 5EUI A; 3GQR B; 1DXV B; 1DTM A; 1GBU B; 1NZ4 A; 1UMO A; 1FSX B; 2G0R A; 1HDS A; 1GCW A; 3FH9 B; 2DHB A; 2HHD A; 1HRM A; 2GL3 A; 3WCW C; 3A0G A; 1DWS A; 1YEU A; 3GLN A; 3IC2 A; 2DN3 A; 2R1H A; 5CMV A; 3QM9 A; 3PT7 A; 1O1M B; 2HBC B; 5E6E B; 1JP6 A; 1RQ3 A; 5HU6 A; 2GTL B; 2AUR A; 4N7P A; 2ZT4 A; 1QSH A; 1YH9 B; 2MYB A; 2O5L X; 4FC3 B; 1HBG A; 1MLM A; 5CHR A; 1HBB A; 1A9W E; 2H35 A; 1Y09 B; 2VLX A; 3QQQ A; 4HHB A; 2FRF A; 107M A; 1J7S A; 5C6Y A; 1GJN A; 2EKT A; 1Y5F A; 3MN0 A; 1BAB A; 1DTI A; 4NXA A; 2DC3 A; 4UUR A; 1XZ4 A; 5MBN A; 2MGD A; 1QXD B; 1ABY A; 2MGG A; 2Z8A A; 3SDH A; 3D1K B; 4O2G A; 3U3E A; 5HAV A; 1CG5 A; 1NAZ A; 1DO7 A; 2ZS1 D; 1YHU A; 1J3F A; 2YRS B; 4JAC A; 2D5Z A; 2WTH A; 1HHO A; 1O1N A; 1GDJ A; 1LHT A; 3AT5 B; 1QXE B; 1RQA B; 2LHB A; 1VWT B; 105M A; 4NI1 B; 2AA1 A; 1Y4P A; 2G14 A; 3PI3 A; 1YGD B; 1MWD A; 2MGC A; 5MBA A; 1YZI A; 3PEL A; 1Y0D B; 1Y0T B; 1EBT A; 4MBN A; 3AQ9 A; 1H1X A; 2W6W A; 1S5Y B; 2HZ1 A; 4N7O B; 1HLM A; 1QSI A; 1DKE A; 1MNI A; 2ZLX B; 2ZFO B; 3WTG A; 4F4O B; 2HBF B; 1S5X B; 1NS6 A; 4O1T A; 2D60 A; 2ZLU B; 1LFZ B; 2V1G A; 1CG8 B; 1RQ4 A; 4F69 A; 3SZK B; 5EET A; 3IC0 B; 1YE0 A; 2HCO A; 1YVQ B; 3A9M A; 1V5H A; 1IOP A; 1VXC A; 2ZLV B; 1M6M A; 4MQG A; 2O5S X; 3S65 B; 4MXL A; 4FWX A; 1XY0 A; 1YHE A; 3R5I B; 4PQB A; 1NQP A; 1A4F A; 5D1V A; 4ZVA A; 3CY5 B; 1OUU B; 2QSP A; 1UFJ A; 2R4Y A; 1NS9 B; 3S66 A; 4HRR A; 2QSS A; 3WCW D; 3UHR A; 2H8D B; 4DWU A; 1CH1 A; 5ILP A; 1OFJ A; 2ZS0 B; 1Y7C A; 1YEV B; 2MYE A; 1MLH A; 1JZK A; 2R80 A; 4H2L A; 3ZOM A; 1GCV A; 1Y35 B; 2HHB A; 1K1K A; 3WCU A; 1N9H A; 3WCV B; 2DN2 A; 3M3A A; 3PIA B; 2MGE A; 1IBE A; 2ZSN A; 1Y4G A; 5ILM A; 2BKM A; 2WY4 A; 1OJ6 A; 1Y46 A; 1BBB A; 1J7W B; 4FH6 A; 1VXH A; 5EU2 A; 1UFP A; 3SDN A; 2XKH A; 2DXM A; 1VRE A; 1CLS A; 3ZJQ A; 4NK2 A; 1Y5K B; 2D2M B; 3WCU C; 5EQM A; 3GQP B; 1ABW B; 3LQD A; 1DUO A; 1IRC A; 3ONZ A; 2RI4 B; 2G0S A; 3G53 A; 2H8F A; 1O1L B; 1HDA A; 3NMM A; 1JP8 A; 4ILZ A; 1LHS A; 3K8B A; 1CO9 A; 1VXA A; 2GKN A; 1DWR A; 1MNJ A; 2VHB A; 4M4B A; 2DHB B; 1JEB B; 1HBS B; 1A6N A; 2MBW A; 1J41 B; 1ITH A; 1MYZ A; 3D4X A; 3A5B A; 1YCA A; 1MLG A; 2MHB A; 1A3O A; 3ODQ B; 1YEU B; 1URY A; 3AQ8 A; 1C40 A; 4KMW A; 3LHB A; 3A59 B; 5E29 A; 2W6X A; 3MVC A; 1XZU B; 5ILE A; 3UHI A; 2V1K A; 1CBL A; 1OFK A; 1DXT B; 1Y2Z B; 1LFV A; 1WLA A; 1XZV B; 2G3H A; 3OZV A; 5KDQ A; 4GZG A; 3NL7 A; 1A00 A; 3TLD A; 1QPW A; 1FCS A; 1A01 B; 1NZ2 A; 1MZ0 A; 1S0H A; 2HBD B; 2HZ2 A; 1CQ2 A; 1LA6 A; 5HY8 A; 1SPG A; 3MJU A; 1FHJ B; 1BAB B; 1Y0W A; 2OLP A; 1J7Y B; 1AJH A; 4MQC A; 1R1X A; 5JOM A; 3VAU A; 1C7D B; 109M A; 101M A; 4B3W A; 3S1I A; 1V75 B; 4ROM A; 3PI1 A; 3WR1 A; 3DHT B; 5E83 A; 1VRF A; 1K0Y A; 1AJ9 A; 1I3E A; 2D2N C; 1HCO B; 1KD2 A; 1UVY A; 1YFF B; 3RJN B; 1O1I B; 1MKO B; 1Y8I B; 4O4Z A; 1SDK A; 3HEO A; 1HDB B; 3OJ1 A; 1YGF A; 3IA3 B; 1MLO A; 1MOD A; 2D5Z B; 3PI9 B; 1Y45 B; 3HC9 A; 3VRE A; 4M4A B; 3BCQ B; 1LH2 A; 5C6E B; 3ARK A; 6HBW B; 2KSC A; 4AVD A; 3ED9 A; 1QI8 A; 2MB5 A; 1JW8 A; 1WVP A; 1YDZ A; 1UIW B; 1Y4P B; 1HV4 A; 2D5X B; 1GBV B; 5EV5 A; 2EB9 A; 1YHR A; 1XZ2 A; 2HBE B; 1YVT A; 1DM1 A; 3D17 A; 5JDO E; 1Y0C A; 1Y8H A; 2ZFB B; 1S69 A; 3K3U A; 1JF4 A; 1OR4 A; 1Y4V A; 2G12 A; 4G1V A; 1G0A A; 1O1J B; 4X0L B; 2EVP A; 1GZX A; 3HHB A; 111M A; 1KFR A; 3QJC B; 2D6C A; 1YE2 A; 4YU3 A; 1W92 A; 1LH7 A; 1GLI A; 3UHH A; 1MYF A; 2O5Q X; 1T1N A; 3WCU D; 4NI0 A; 1G0B B; 2FRJ X; 3UHY A; 1MYJ A; 1Y31 B; 1YG5 B; 1YEO B; 2G0Z A; 3QZZ A; 5KER B; 3ZJM A; 3CIU A; 1XY0 B; 3AG0 A; 3M3B A; 2GRF A; 1MBS A; 1V4X A; 1JY7 A; 3GDJ A; 2MGK A; 1O16 A; 1RTE A; 1F5P A; 2MGJ A; 3NG6 B; 3GYS A; 2SPM A; 1C7B B; 1HGC A; 4MBA A; 3QJE B; 1Y5J A; 2B7H A; 2Z6N A; 1HGB A; 1NZ3 A; 1O1K A; 5JDO F; 2QLS B; 1PBX A; 1G08 B; 5CNG A; 1R1Y A; 3E5I A; 4PNJ A; 1RPS A; 4F6D A; 3HYU A; 1MLS A; 1Y4R A; 3GQG B; 1CH7 A; 1DLW A; 2W31 A; 1A3N B; 1C7C B; 1THB B; 3V2V A; 4YU4 B; 2V1I A; 3EU1 B; 2ZLW B; 1MLL A; 2XKG A; 3QJB B; 4G1B A; 1UC3 A; 4XS0 B; 2GRH A; 1A0U A; 4MQJ B; 1Y8K B; 1OUT B; 1GDL A; 2V1H A; 1RSE A; 1Y8W A; 2HBS A; 4NS2 A; 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1Y4Q A; 3BJ3 B; 1MDN A; 4MXK A; 2HHE A; 3VRG B; 2JHO A; 2LH1 A; 1FDH A; 2ZS1 B; 3H58 A; 2CMM A; 1CMY A; 1XQ5 A; 2QMB B; 1Y0A A; 5CN6 A; 1NWN A; 1BZ0 A; 3BJ2 B; 3P5Q B; 3A2G A; 1NEJ B; 3DUT B; 4PQ6 A; 3ZJI A; 1Y7Z B; 3ZJP A; 3HEP A; 1CH5 A; 3HEN A; 1NPF A; 1YIH B; 1J40 A; 1LFT A; 1JF3 A; 1BIJ B; 3G4R A; 110M A; 5CNE A; 1KR7 A; 5HLX A; 1G9V A; 1LFQ B; 1BZ1 B; 3HXN B; 1J3Y A; 3O89 A; 3G4W A; 2FRK X; 3GDJ B; 1LTW A; 1GDI A; 1XZ7 A; 4JYQ A; 3NFE A; 1Y4F B; 5CN7 A; 1ASH A; 3OVU C; 4KMV A; 1HAB B; 1BUW B; 1MTI A; 3PT8 B; 3AT6 A; 3IXF A; 1JPB A; 3WHM B; 3KUO A; 1GDK A; 4MQI A; 1VHB A; 1HSY A; 2E2Y A; 1RVW A; 3R0G A; 1JL7 A; 1ECO A; 2RAO B; 1FAW A; 1CBM A; 4ROL B; 1HBH B; 3MBA A; 1COH A; 1SPE A; 1X9F D; 1LJW A; 3ZH0 A; 1Y7D A; 1V4W A; 1XXT A; 4MQH B; 4HBI A; 2PGH A; 4TWV A; 5D5R A; 1MOH A; 1CH4 A; 3EOK B; 1MLU A; 1DO3 A; 2PEG B; 1BVC A; 2ZT3 A; 4IRO B; 1J3Z B; 3BOM A; 3FS4 B; 1HLB A; 1LFL A; 5EE4 C; 3MJP B; 2DN1 A; 4ESA B; 5CN5 A; 3WCW B; 1YEN B; 5SW7 A; 2QRW A; 2R4Z A; 2R4W A; 1O1O A; 3W4U B; 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