1A5B | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	268
structure length	249
Chain Sequence	MERYENLFAQLNDRREGAFVPFVTLGDPGIEQSLKIIDTLIDAGADALELGVPFSDPLANGPTIQNANLRAFAAGVTPAQCFEMLALIREKHPTIPIGLLMYANLVFNNGIDAFYARCEQVGVDSVLVADVPVEESAPFRQAALRHNIAPIFICPPNADDDLLRQVASYGRGYTYLLIEKLKEYHAAPALQGFGISSPEQVSAAVRAGAAGAISGSAIVKIIEKNLASPKQMLAELRSFVSAMKAASRA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
molecule keywords	TRYPTOPHAN SYNTHASE (ALPHA CHAIN)
publication title	Cryo-crystallography of a true substrate, indole-3-glycerol phosphate, bound to a mutant (alphaD60N) tryptophan synthase alpha2beta2 complex reveals the correct orientation of active site alphaGlu49. pubmed doi rcsb
source organism	Salmonella typhimurium
total genus	91
structure length	249
sequence length	268
ec nomenclature	ec 4.2.1.20: Tryptophan synthase.
pdb deposition date	1998-02-12

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00290	Trp_syntA	Tryptophan synthase alpha chain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1a5bA00

3VFLA 1XXXA 1JCNA 4E0CA 2DU2A 5FF2A 3GXTA 1KM3A 3C61A 4IWWA 1KFCA 3QC3A 5ABTA 2QJHA 3B04A 1RVGA 2FPYA 2NX1A 5LHFA 4XKYB 3LBMA 2GJNA 3HPZA 4JYEA 1PHQA 1VJIA 3N2XA 1XKYA 1TPEA 3GZ3A 1QR7A 2WQPA 3G1HA 5D32A 3E96A 1A50A 3DKJA 4RK8A 4MY9A 4S1FA 1IGSA 4UTIA 4ZQRA 1W31A 1XBYA 5D2TA 4MJMA 3QPYA 5L9FA 5KZEA 1FWSA 1ZAJA 3NPUA 2WSQA 4AHPA 5CZ0A 2C1HA 4BF9A 3TUUA 3M0ZA 4IMEA 3LHVA 4K7VA 4Q33A 2A1YA 4JTIA 5K9DA 4I7VA 2OT1A 3YPIA 4U4MA 2QJIA 1YTEA 3C2RA 3KVLA 4A2SA 1VQTA 3NQCA 3FKKA 1VCGA 3C0JA 3TC7A 2ZZ4A 3TX9A 2CLLA 1VCFA 1V7YA 3M16A 4NJHA 5G2IA 3QZEA 2VFGA 3CB8A 2QUTA 3LERA 3DZ1A 3PS7A 4LVFA 4Z1AA 1QPNA 3OIXA 4FX7A 3G1SA 4O1DA 4UFMA 2GJLA 2RFGA 2QCLA 1LOSA 3U8GA 3QRHA 1UUMA 2E09A 4UMAA 5AHMA 1Q6RA 2ZA1A 1R30A 3RMJA 3SI9A 3DKLA 1VCVA 2HS6A 4YLWA 4IX2A 2VXNA 5K9XA 1SO5A 3INPA 2E68A 3O6DA 2ZBTA 3UWZA 3UY7A 3F03K 4R33A 1LROA 4NNBA 3EWUA 1YDOA 3EX1A 3TNOA 4NZJA 3DBPA 4YCPA 3EXTA 1VYSX 3C52A 5K3VA 4NUWA 1FUYA 3WK1A 4N6EA 5E93A 4MZYA 3P8IA 4Z0SA 7TIMA 3GNNA 1B4EA 1K7XA 1TCDA 3HF3A 3NPWA 2R14A 3DU0A 4GWEA 4ADSA 1SPQA 1ZAHA 4HNVA 3MHUA 1JCJA 3OVQA 1JVNA 2WNQA 5HINA 3IIXA 2OCZA 3W7CA 4OGZA 4HNTA 2YYUA 4UFJA 1Q6OA 5D2YA 4PODA 1W56A 1G7UA 1CW2A 5KINA 1FWTA 2C18A 4MVAA 1SW3A 5KTLA 2A4AA 3LI1A 5AC8A 2B7QA 2Y7EA 4R53A 1OG0A 2YDAA 5HJLA 2H90A 2Q3OA 2XN2A 3Q2DA 4TO8A 1H7XA 4ZQCA 1KTCA 5H2ZA 2A0NA 3DXIA 1JQVA 2RHGA 4LVBA 3LV5A 3G8RA 4UTMA 1TYGA 2CFFA 4MYXA 5K4ZA 1H60A 4UTJA 1ZHAA 4QAIA 4UMCA 5DXXA 2RH9A 3W2NA 2QUVA 3MHGA 3UZ5A 1WX0A 4UFLA 3KX6A 3DENA 1WBJA 5HUOA 1JJKA 1YPFA 2ISWA 4NJJA 1SZEA 1ONRA 4R7JA 4MIMA 3G0SA 4JTFA 3W7LA 2Y70A 3C2OA 4JYDA 4E38A 5G4WA 3TIMA 3L21A 2DZUA 3C4UA 3QYQA 4D2JA 4IPIA 3NL5A 4CQ8A 2YR1A 4O1AA 1FDYA 3TAKA 3HMJG 4LNYA 1JRCA 1RZMA 5CZSA 1JULA 1W8SA 4OV4A 3GVGA 1LDCA 3W1XA 3I7SA 4WXZA 3W72A 3NDOA 1OYCA 1OX6A 3TFCA 2OT0A 1VHNA 4ZQMA 1ZENA 3W1NA 4BK9A 4Z0JA 3SW6A 3VE7A 3W07A 5I3FA 1I2QA 3MI2A 4X22A 3GAYA 4QISA 2CW6A 1BKSA 4X3ZA 2C6QA 5DCBA 1MXSA 3LLDA 1W5MA 1JUBA 1Y0EA 3MHFA 3C2EA 3LCIA 3GR8A 2QAFA 2NV2A 1ME7A 2CZEA 1FWRA 3G22A 1AL8A 2VEIA 1SO3A 3FKRA 2WO5A 5E0KA 3F4NA 1SR9A 5F4SA 1ME9A 3TSBA 3WJZA 1TPDA 2EKCA 4IXXA 4FIRA 3PC0A 3LLFA 1A53A 1OHLA 4YL2A 4K6AA 3C2VA 3GDLA 4MFEA 1OF8A 4JICA 3JRKA 1IF2A 3MMTA 3W7DA 3S5ZA 3BLEA 4GC4A 1M7OA 4NZFA 3W7MA 4O1BA 4OV9A 1HO1A 4LTSA 2B7OA 2NUWA 4M6VA 1EIXA 4I7UA 1OFOA 1H61A 2GQ9A 1KLZA 4FF7A 1W37A 4HIBA 1MO0A 1UBSA 3N3MA 3OG3A 2ZZ5A 3B0UX 1SSDA 2VFHA 4WOZA 3N73A 2JKAA 4O28A 3BW2A 4FX8A 5HR6A 5D2VA 1XBZA 3T55A 4FNSA 3FLUA 3TSMA 2QCEA 4TX9A 3GYEA 3G24A 1A5AA 2UV8G 3W2KA 5F4WA 2H8ZA 3I7RA 4CCEA 3B06A 1NAL1 3USBA 4A2RA 4CNOA 3BK0A 3R89A 3LB0A 3IIZA 4JXCA 1YXCA 3U2OA 3W74A 3SGZA 4QNWA 4MZ1A 4QIUA 3M1ZA 3S1UA 4NJKA 3T44A 3IGUA 1BEUA 3W84A 2JBMA 4WZHA 1LRQA 2DJXA 5EBUA 3TAOA 2ZZ7A 2ZRVA 1LM1A 1M7PA 3SGUA 5EY5A 1K3UA 3W6YA 3LDVA 4AF0A 3MW7A 1FY6A 1F6KA 3FOKA 4O15A 4IX0A 3ZWSA 4N02A 1UJPA 3KHJA 1HG3A 1WQ5A 3DHDA 1EUNA 3HG2A 3NYZA 3UWUA 3C56A 2A7PA 3IVTA 5EYWA 2ZTKA 2E5DA 1W5OA 5SWUA 1OX5A 5FEWA 5FF0A 4BWLA 3DFQA 2ZYFA 1OFBA 4RX0A 1TPC1 3NPVA 3IEBA 3A9IA 4LVGA 3I68A 4CCCA 5IM51 2Y89A 3MYOA 3BG5A 2FPTA 3GXNA 4YMZA 3UY8A 4DPPA 4RCXA 1F05A 5AN7A 4YCOA 3NVTA 1MEIA 1TPFA 3DHFA 4HT3A 3NGJA 4O4VA 4DO6A 3G3DA 3ABQA 1HTIA 1OYAA 5HNRA 4MYAA 2YGYA 3P8JA 2E77A 1ZNNA 1DL3A 5LHEA 3PSVA 4UMBA 3FYOA 1WDWA 3S42A 3ZFHA 1S3HA 2V30A 3LTPA 2I1OA 1R2TA 3NQDA 1I2NA 4P61A 4WQ6A 5HWNA 1FWWA 4JX5A 5F1UA 3EWZA 3P82A 4NNCA 1KM2A 3PULA 1MEHA 3KRZA 3LX9A 1O94A 3B8DA 3LHUA 2CLHA 3O63A 3IGXA 3TJLA 3V75A 1VHCA 1K7FA 2X1TA 2V5BA 5FEPA 5LNSA 3UNDA 2QCDA 2FFCA 4RLIA 1IXPA 4YWIA 1P0KA 2I14A 1G69A 3W2UA 1TIMA 1TB3A 2XN1A 1NSJA 2JK2A 3PF3A 1YXYA 1SU5A 2E6DA 3S1XA 1K8YA 2RDWA 1TMHA 4WJEA 1VH7A 4N4PA 4AVFA 3PG9A 5K4XA 5LGXA 3HG4A 4NXSA 3S1VA 1DVJA 3LXBA 1K7EA 5K2ZA 4GUJA 4P2VA 1FCUA 1LTDA 1TPWA 3TR2A 1UCWA 3L66A 2B7NA 2X1UA 4XQ6A 2ZZ2A 3UXDA 4FNUA 4UFKA 3N34A 3L68A 3D0CA 3L5AA 3MUXA 1GG1A 5FEZA 2VFIA 1EB3A 1L6SA 3UWQA 4N2YA 1B9BA 1XBXA 6ALDA 3THQA 4ALDA 5A8GA 5DCDA 3GK0A 3UQNA 5AYZA 1W5NA 5CSRA 1RV8A 2EGZA 1JCXA 3A23A 3PUEA 4LVAA 3OA3A 4B5NA 5BW6A 1OFDA 5G4EA 1W3IA 4JDYA 3WK0A 4ZQOA 5I3KA 3QPZA 1BWKA 3KVMA 5KMYA 1O5KA 1I2RA 4A22A 1ZY9A 4JY9A 5D37A 5H91A 4O10A 5HUPA 4I9AA 1OFRA 4DF2A 2ZTJA 1W5PA 5A5WA 1PCKA 3NZRA 2P1FA 3EX3A 4XKYA 1TQJA 3LGEA 5J5RA 4GE8A 3T4CA 3LRMA 3CT7A 4X2RA 1VR6A 3IV3A 2ZA2A 3SSJA 2Z6JA 5AC7A 1EEPA 1QOQA 4IOTA 2WNZA 5AB3A 3IIVA 1H7NA 5HR7A 3MYPA 3KVKA 2OX1A 3WJWA 1RD5A 4NJIA 3QMTA 1KLYA 2G95A 5AYYA 4OU1A 3EX2A 3H53A 3LI0A 3HJZA 1DJNA 4UFIA 4JN6A 4ADTA 2CLMA 2A6LA 4IMFA 3BLIA 1D3GA 2PURA 3P80A 2CU0A 1YDNA 1JCLA 4Q4KA 1NF7A 3BPWA 3W70A 5G2HA 2WKJA 4JTHA 1W1ZA 4LRTA 1S5VA 3TE9A 1R46A 3NQFA 2DZTA 1HO4A 3GLCA 1F7BA 5D05A 2DZVA 3TH6A 3PB0A 1TTPA 2F84A 1GEQA 1TJPA 2W6RA 5D38A 1KM5A 5AFDA 4I7WA 2GQAA 1ALDA 1GVOA 4JTUA 2YXGA 2PC4A 1LZOA 4UTTA 3TQKA 3P67A 1V5XA 2NWRA 1RPXA 1Q3NA 2GVJA 1KBJA 1QWGA 2P0OA 4JY8A 1YADA 4FXRA 2WOQA 3L0GA 4ML9A 2VFDA 2YZRA 2ZRUA 2CZ5A 1OF6A 1X6UA 5D03A 3GKFA 3W1AA 3O16A 2ZDRA 3FA5A 2TMDA 2X30A 4N9CA 4GBUA 1I45A 3A24A 1PCWA 2DZWA 3NQ6A 3P62A 3U6WA 4Q32A 3TROA 2YYTA 3ABSA 4LS0A 1XFBA 1NFBA 4LUIA 1OK4A 2XN0A 2W79A 3O6CA 1H7WA 1W54A 3W7OA 3W7IA 2V2CA 3C3NA 2A6NA 2JKEA 2FJKA 1H62A 4O11A 1SW7A 1VC4A 3G3MA 5LKYA 4AHQA 3NA8A 2EF9A 2YX0A 2DP3A 5F2IA 1B57A 3ZWTA 1K02A 2TSYA 5AYXA 3NL6A 4H6KA 4RR4A 3E12A 4DBDA 3CQ0A 5CZJA 3BVJA 2NXHA 3PY2A 2QCMA 4NQ1A 2BWGA 1EWDA 4Y9AA 3NQ7A 1K8ZA 2ZRZA 3SFKA 2Y88A 3BGGA 3IGSA 3CIWA 1R47A 1RQBA 3W1RA 4GFSA 4AAJA 4E2DA 4W9TA 1G7VA 2H6RA 4UR8A 4ZMGA 1SUXA 4LY8A 5EPDA 4ZZ9A 3EB2A 2AQWA 3LV6A 2HMCA 3P74A 8TIMA 4FNRA 1VPXA 1NVMA 4TIMA 4Y8FA 3W1QA 2FB3A 3H55A 4JTJA 3DH7A 1TTJA 1XUUA 1Q6LA 1DORA 1TPH1 1WOAA 3TKFA 3NZ1A 3LRKA 1JUEA 3L0KA 3NEVA 1I2OA 2FPVA 3N14A 3O15A 5IBXC 3B0PA 1W3TA 2FDSA 1GG0A 4M5PA 2XFWA 3ZS4A 3GDTA 3MWAA 3LCWA 3W9ZA 3FFSA 1UB3A 1IXOA 1KM0A 3TV8A 3CC1A 3N9SA 2H8XA 2QUUA 3DFTA 2CLEA 1G4PA 3QF0A 1VYRA 2ZCGA 2F7FA 5K9CA 1H51A 5CSSA 3HG5A 1XL9A 5D02A 1KA9F 4MPQA 4FHAA 4DO4A 4LU0A 3W2JA 2VOMA 4Z1CA 4UTWC 3UZJA 1L6YA 1LRNA 3NQMA 1GQNA 1FQ0A 3L2IA 3P60A 1SW0A 3P5ZA 4TMBA 1P0NA 4QM1A 5LZLA 1YLVA 3LTSA 2C16A 3HG3A 2ZZ3A 3UWYA 3L5LA 4JX6A 1NEYA 2E1DA 3G0XA 1GYLA 3QW4B 4O18A 4OBTA 2R94A 1FCQA 4NT0A 1Z41A 1H7PA 5KITA 1EP2A 4WX2A 4RJEA 1OFAA 1AW5A 5DLCA 4RV8A 1RQEA 3BARA 3QMSA 3ELFA 4BI6A 1GVRA 4G1KA 3C8FA 1H50A 4EF9A 4EOUA 5GVJA 2IQTA 1BTMA 1DHPA 2VEKA 4XZ9A 3NAVA 2BX7A 5CPLA 3LCGA 1H5YA 4KFNA 3JS3A 3PR2A 3QEZA 1OABA 3IVUA 1JUKA 2BLEA 4MY1A 3TJXA 1KFJA 3W1PA 2R91A 1WBHA 1L9WA 1KTNA 4N4QA 1X1ZA 1F76A 3HGOA 3BW3A 3ATYA 3FS2A 4AXKA 2ABBA 4JTEA 3EKLA 4L4MA 5CGQA 1TRDA 3FYPA 5CKSA 1G67A 4Y90A 3BG3A 4O17A 5FESA 3N9RA 3O1NA 5EMUA 1KM6A 2WNNA 3M9YA 1G4EA 3JR2A 1OYBA 3Q37A 3R2GA 2VFEA 4FEZA 3TCEA 3L65A 4HHPA 4GXMA 2V81A 2VFFA 5C6MA 4ONVA 4M19A 3RF9A 3W7KA 4OHQA 4CCDA 3VCRA 4S2BA 5G5IA 4XBSA 4IPJA 4BFAA 3GAKA 4QNEA 1TREA 1WA3A 2WSRA 4N6FA 3QSRA 5FF3A 1LCOA 4O1CA 2BZNA 3KRSA 4ZQNA 4DF0A 1EP1A 1Z48A 5HMSA 3PUOA 4O8RA 3Q58A 2B7PA 3GX9A 4CLMA 3W1TA 4NNAA 1TPUA 1N8FA 4KKXA 3UWWA 3RK8A 2E5CA 3CWOX 1IIGA 3NQVA 3TU9A 2B4GA 4PCFA 3OHIA 4C1KA 1A5BA 3KAOA 5CG7A 4K8EA 4OQVA 4U28A 4JDBA 3A22A 3LM7A 3NQEA 3LCLA 1CX9A 2FTPA 3AO0A 1C29A 2QCHA 2E6AA 2A85A 1QOPA 3LHWA 5LNVA 4KWVA 5BOOA 3GNDA 4QQ3A 1I2PA 1WXJA 1G4SA 4XUGA 1U83A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1A5BA

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