1AF9 | Genus

Total Genus 110

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	110
sequence length	441
structure length	441
Chain Sequence	EDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Clostridial neurotoxin
molecule keywords	TETANUS NEUROTOXIN
publication title	Structure of the receptor binding fragment HC of tetanus neurotoxin. pubmed doi rcsb
source organism	Clostridium tetani
total genus	110
structure length	441
sequence length	441
ec nomenclature	ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date	1997-03-24

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07951	Toxin_R_bind_C	Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A	PF07953	Toxin_R_bind_N	Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.60.120.200	Mainly Beta	Sandwich	Jelly Rolls	Jelly Rolls	1af9A01
2.80.10.50	Mainly Beta	Trefoil	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A)	1af9A02

1DHKB 1SZ6B 2DWRA 2E4MA 2UURA 3M3QA 1CPMA 3WO3A 3BRGC 1WW7A 2EIGA 2W52A 1GNZA 2ERFA 4DPNA 3FJIA 1WD3A 1SR4A 4ASMB 1LENA 1ZM1A 3FJKA 1QNYA 1LCLA 4JC1A 5GALA 3POKA 2D3PA 4W65A 3NV3A 3IN9A 4RL7A 1GANA 5T55A 2P39A 4GXLA 1XZZA 3H6RA 2UWCA 2Q5TA 3CA3A 3O49A 5BP5C 1NZKA 1NUNA 3AJ5A 1PZZA 1AX1A 2AQZA 4Z9WB 4R9DA 2NVHA 1FAYA 3A0NA 1N47A 5JDBA 3JUTA 1WCSA 4F34A 3NJ5A 1AVAC 4Q26A 1LOFC 5BOWA 2Q3NB 1LJ7A 4XJAA 1PZ8A 3N3HA 3WV6A 2A6ZA 3D7WB 4IY8A 1B09A 4YM3A 1LEDA 1S0JA 4ZFWB 2ZMKA 3FJ9A 1IS4A 1W6OA 3N7MA 2DTYA 2DVGA 1NLSA 3T1MA 1UKGA 3IMNA 4LO0C 1V00A 1K5VA 1DFQA 4XJUA 4M3CF 3AH1A 2DU0A 5E88A 4JKXB 3MW4A 4YG3A 1V6WA 2BEBA 4SLIA 1RIRA 2A70A 1FNYA 5IK7A 5EG6C 3VWCA 5F8WA 4P9XA 5T52A 4FP2A 3QCWA 4XFTA 4OWLA 4TLPA 3AKGA 4ZA3B 2D7IA 3HALA 1PZ7A 4RA0A 4DEPA 1UZYA 4YGDA 1AVUA 4XXAA 1MACA 3HSMA 2GMMA 3F1RA 2VW1A 4JCKA 3UJ0A 1UZZA 2ZMLA 4PC4A 2GZBA 4H04A 3PG0A 1DLLA 2RG9B 2Y9WC 1RZOB 1SLCA 1M16A 2P23A 2NMOA 3FJBA 1TEIA 3O4DA 4JQ0A 1SLAA 4YW4A 1Q8QA 1CN1A 2ZHKA 3VV1A 4G6MA 2LALA 4BOWA 4I37A 1JT5A 4Y22B 4ZFYB 3O5SA 4DFSA 3V0BA 1W0OA 4FPKA 5FZZA 3OYWA 4R9CA 1KQRA 4R6UB 3WDVA 3H6SE 4AN7B 4I2SA 2ZGKA 3IM0A 2HYKA 1SLBA 4YM2A 4CZSA 4FPJA 1KRIA 1Q8PA 4UW6A 2CNAA 1G82A 4LO3A 4BPZA 3ENRA 2EALA 1S1AA 4CTEA 3OJ2A 1V6LA 3DUIA 3WDXA 2WSVA 3PHZA 1SR4C 2VUAA 1VLNA 4P0JA 1T4QA 3O44A 3AKIA 4BLIA 2E7QA 2JJ6A 5KXEA 4L8QA 1Q04A 2AENA 1LECA 3AP7A 3ZXFA 1RG8A 1YXWA 1AJOA 1AXZA 1BFBA 4OWJA 1EYLA 3K1XA 2JE9A 4I4SA 4K20A 5GZFA 1CVSA 1CPNA 2DU1A 4JRAA 3WG1A 3AP4A 3BADA 5DUXA 4I4UA 1GZCA 1W6OB 1JLYA 5HCBA 1DQOA 4GP0A 3AYCA 2BFHA 1YIFA 2PHRA 3FFZA 3WMVA 2D20A 1PC8B 3SH3A 1WBCA 1AXYA 3HBWA 4BQ1A 5SV8A 4Q91A 5JOYA 1W6PA 1JYIA 1QOTA 2A3WA 2V5YA 5KXBA 1PUUB 4HA2A 3UJOA 1SBDA 2VU9A 3JUUA 1W3GA 1JHNA 2P37A 1OQ1A 3V65A 4WV8A 2DV9A 3FJCA 1FATA 3FJFA 2D6OX 3S8JA 4Y24A 1MVQA 2E7TA 4TZDA 3CNAA 3D6EA 5EYXA 2DVBA 1J1TA 4OZXA 4X39A 3VUOA 4WVWA 4IQPA 5H9PA 2DURA 1PUMB 1WW6A 3UK9A 3AZYA 3C2UA 4OUJA 3BA5A 4I4XA 1MS1A 4D69A 4Y1ZA 3AYAA 1W6MA 2F2FA 1MZ6A 5DUVA 1PZ9A 3BB2A 4ATEA 1GSLA 2GNDA 1V6IA 4FVVA 5EHAA 1XYFA 2VW0A 3WG3A 1DBNA 1TP0A 3WNXA 4LBOA 1Q8VA 3VT0A 3FJDA 4QD2C 1QOOA 1WD4A 2ZGTA 1FV2A 2Z49A 4LBQB 4X37A 4YZ4A 5IUQA 1Y7BA 5T5OA 1CESA 3FLPA 4J2SA 3JU9A 3OYWB 2NMNA 3M3EA 3IAGC 2KKIA 3HOMA 1W6NB 1WLCA 3PJQA 2A3YA 4Y1VA 1W3FA 4FOWA 1OFSA 4PF5A 5FRAA 3RQ0A 2ZGOA 2FO1A 4K21A 3ZX7A 1LEMA 3V0AB 3BAOA 2CWMA 2DUPA 4LO7B 1R1ZA 2WLQA 3SISA 1G8WA 2VH9A 1KJRA 5T5JA 5E8AA 1KITA 3BTAA 2DS0A 2FGFA 1S0EA 1TWMA 1MS9A 4LO3C 3FJEA 4I1BA 1CVNA 3ILNA 3EF2A 1OQLB 3O4CA 1FNZA 2GDFA 3QR5A 1QKQA 2BQPA 1LHOA 3POYA 5BQUA 4I1EA 3PVOA 2MIBA 1K5UA 1YF8B 3OY8B 2IWTB 1Z78A 2AGSA 4Q9GA 1ULGA 4XIOA 2WQZC 1QGLA 3MW3A 3O4AA 3WINA 4GOYA 5JMCA 1EVTA 1VIWB 4ISRA 4AYUA 2ZQNA 2GNTA 2ZAAA 1MC9A 1JLXA 1TFMB 3JRRA 3RSJA 2W08A 3AP6A 1Z2VA 2DUQA 1N4KA 3O4BA 1DQ0A 1HWNB 3SNVA 1ISXA 1HWPB 3KM5A 3M2MA 4KEKA 4MYEA 2JE7A 4YG0A 3T2TA 4K1ZA 1LOEA 1HDKA 1S0CA 3UL2A 1MS3A 2KLLA 3A21A 5EC5A 4Y26A 5JOZA 1G9CA 3W9TA 3WOGA 3FBYA 5GLVA 5H9SA 1F9KA 1IRAX 3PVNA 1WW5A 4OEFA 5E24E 3BA7A 1XG6A 1YI7A 3FUQA 2Y9XE 2ZGSA 1QQKA 1QQLA 3TAYA 1GGPB 1DQ1A 3AZXA 1CONA 3B01A 3POSA 4OEGA 2VSAA 4YLZA 4YFZA 4GALA 4GKYA 2ZABA 4GAIA 4KBBA 5BVPI 2XB6C 4YFWA 1LTEA 4Y22A 1BFCA 2CTVA 2CWSA 2GN7A 2A6YA 4FP3A 4GKXA 3AKFA 4XBNA 1C1LA 2HWAA 1C1FA 4UW4A 4D0TA 3AX4A 1FN0A 4I8MA 2NTDA 3CA4A 5FNXA 1FWVA 1ULCA 4Q9PA 4IYBA 2A6WA 5IT6A 4GA9A 2ZHMA 4QALA 1QU0A 1LU2A 1ENRA 2OW4A 4XMIA 1DGLA 1ULFA 3UJQA 3SNMA 2ZA9A 2IHOA 2KI6B 3LLPA 5DZFA 3BAHA 4QKSA 4XZPA 3BAVA 3WO2A 2ZMNA 5I1BA 1O4ZA 3POWA 4BM8A 5EXOA 1CQ9A 4PBOA 5BXRA 4ZBVB 1GZWB 4AGGA 5T5LA 4XFSA 1IRPA 3ZSJA 3P6IA 2PHUA 1SLTA 4K1YA 3WG2A 3Q7XA 1W3AA 3D4KA 4DENA 2D22A 5FZYA 4A7KA 3VKLA 1JXNA 2FFUA 4I4QA 3N35A 1V6KA 1V6UA 5KXDA 1JW6A 2P3IA 1GZ9A 3WDUA 2WT1A 3AH2A 5DZEA 1WLWA 1MS4A 2F8XC 2UUSA 4YZ2A 2AUYA 2WKKA 2A75A 1SBFA 1RINA 2YZ4A 5BQUC 2A71A 4GWNA 3F62B 1G9BA 2OUHA 4P9YA 2D7FA 5GZEA 4Q8LA 2YUGA 3OPZA 3WINC 1A8DA 3WO4A 3BOPA 4LBKA 4P0LA 3O0XA 3CA6A 1AVBA 2W39A 41BIA 2ZGQA 1LGCA 4PQ9A 2V73A 2KI4A 1AVWB 4L4HA 2A5ZA 2D6PA 3MPPG 2E53A 4Y20A 1N3PA 3RMXA 5DG1A 3OBRA 1OKQA 1IJTA 2OVUA 1ITBA 3R05A 1TTUA 1V6MA 4DQAA 3AZWA 4XTPA 4G6JA 2HWMA 3CU1B 2Y9GA 1IS6A 1BA7A 2YROA 3ZXDA 3WG4A 3Q7WA 2R0HA 2DREA 2VW2A 3WUDA 1BYHA 1ZA4A 3NV1A 1QNWA 2M49A 4QBVA 4IZEA 1GNHA 1CE7B 3M3OA 4USPA 3USUB 4WVVA 1DZCA 5GZDA 3L2YA 3I8TA 2YMZA 2CYFA 3PUBA 4I4RA 2P3KA 4LBQA 1DQ2A 3LTQA 2GO2A 2EAKA 3M3CA 2SBAA 1J0SA 1AJKA 1UPSA 1N1VA 1N1YA 2FMDA 4FPCA 3WVJA 1I1EA 4L4IA 3ZYPA 3OJBA 4DRRA 1W6NA 3FJ8A 4YW2A 2E4MC 2K4AB 5KXCA 1ISVA 3OGFA 4LO1A 2Y9FA 1VAMA 4KEIA 3LSDA 4LO2A 2WT0A 3RRDA 3V0AA 2LIQA 3ZSMA 9ILBA 4JP0A 5H9RA 4M01A 3MEPA 2XOAA 4I7IA 3ZXKA 2UWBA 1RITA 3D5OA 1SFYA 1UAIA 1GV9A 3TC2A 4YW3A 4AN6A 2D6LX 2A7AA 4XE9A 2ZGPA 3NBCA 2NP0A 1R8OA 4KEJA 2DRZA 1ULDA 2SLIA 3APBA 1YBIA 4I4PA 3WDWA 5GZGA 4FOYA 3OY8A 1GKBA 1BARA 4IZXA 4I30A 2LIEA 3E8LC 2E6VA 1IKPA 2ERMA 3LCPA 4XBQA 1ILR1 2ZZJA 4XJZA 3FJAA 1IILA 2AXMA 3BAGA 1BFFA 3RG0A 3CA1A 4U36A 2P2KA 2EF6A 1WUVA 2YV8A 2D6NA 4LBLA 1LULA 1N1SA 1VAVA 1ENSA 5LK5A 1LHUA 1SCSA 3HN1A 3WCSA 1S0LA 2PHWA 1Q1UA 3WLUA 4Q1RA 4R9AA 1IHKA 1FX5A 1LODA 3RTIB 1I3HA 4XOGA 1N3OA 1S0DA 1FMMS 2A6VA 1S0GA 4EFRA 4Y20B 1H30A 3IIRA 3S8KA 3VKNA 5D62A 4QC4A 3CQAA 1AF9A 3ZSKA 3FLTA 4NO4A 3AH4A 4QKRA 2P3JA 2D3RA 4C1WA 1LHWA 4XILA 2NYYA 3N0KA 4YM0A 1ABRB 1BZWA 4YGEA 4UW3A 3AJZA 3IM7A 3AJ6A 2R0FA 3DGTA 1BLAA 3MALA 4M3CA 3GALA 2D43A 4QBCA 3Q9OA 1GBGA 4M00A 2ZGMA 4XJWA 1LGBA 2D6MA 2TEPA 3H6QA 2PHFA 1JT4A 1FYUA 4AGVA 1I1BA 3A07A 3P53A 2NZ9A 4EEEB 1T9FA 1FGAA 2CY6A 3QLQA 4P6AA 1DQ6A 5GJ6A 3FUOA 4WBCA 1JBCA 4I6IA 5F8YA 5DXDA 2R1BA 3CRHA 3ILRA 1Q03A 4ZGRB 1FV3A 2JKBA 1GZWA 4ZLBB 2FHRA 1KDMA 4XJ8A 1JQZA 3UD9A 3OGGA 5L73A 4I4VA 1LOFA 1QOSA 4YM1A 4U2AA 2I1BA 5GLZA 4LO7C 1Q8OA 4PBPA 3RS6A 4J2YA 1IOAA 5D63A 4XKIA 1IT0A 1DIWA 5JOXA 3CAHA 1HKDA 5DSSB 3MW2A 5HPZA 2AH2A 4P14A 3GNEA 2JD4A 5H9QA 4YOLA 4I4YA 4EKXB 3BIWE 1IS3A 1LOCA 3IPVB 5GAQA 5D61A 5GLUA 3ILFA 1G9DA 4I4OA 2C9AA 4HANA 3B9CA 1JUIA 3P6JA 3UJ4A 2H0BA 1V6XA 3HR9A 2K8RA 2D7RA 2A6XA 5GZCA 3O0VA 5FREA 1AX2A 1TWEA 4XJ9A 3A4UA 4BLJA 1C57A 5CA6A 2FDBM 4YW1A 1EV2A 5F9TA 1WBFA 3N36A 1WW4A 2RQ9A 3C9ZA 2AR6A 3FJJA 2EXKA 1LOGA 4TYSA 1YYNA 5DUYA 1V6VA 2L5XA 1JY0A 3I2AA 1DYKA 1BFGA 2ZKNA 3USUA 1FQ9A 3VKOA 3WHTA 3V79C 2WSUA 3SLIA 1F31A 5T50A 5IK5A 4Y1YA 3O5WB 2F2FC 4DCKC 4OW4A 4M3CB 4LBQD 3T1LA 3SITA 1KDKA 5B2HA 3N7JA 4Q1PA 3ZVXA 3WDYA 1LHNA 1AVXB 3CRGA 1DQGA 4XMAA 1DZQA 3WMUA 1SBEA 3BRDA 1YTOA 3OJVA 1WBLA 1D0HA 1TIEA 3NBEA 5CBLA 4LBMA 2ZHNA 3VSFA 4Q8KA 1E0OA 4J2XA 2AYHA 1TOOA 3QYDA 1JYCA 4ITCA 4AGRA 1UMZA 3AP5A 3NV4A 3BA4A 1FMZA 4QO3A 4GOVA 2EXJA 1BQPA 3B69A 4C1XA 2X2SA 1KNMA 1BXHA 1YO8A 1PWAA 2ZGUA 2VSEA 1U0AA 3R4UA 1IOBA 1II4A 4PCRA 3VT1A 1WLDA 1A78A 3INAA 1RMLA 5GM0A 4FOQA 5CB7A 4DS0A 1JOJA 1AZDA 5AVAA 3WZ1A 2D23A 2P34A 3AP9A 4ZXKA 1BJQA 4HR6C 3FLRA 1URXA 5IK4A 3WCRA 3IKWA 5FZUA 3B00A 1VCLA 2AAIB 1VALA 3CA0A 3N7LA 1Z0HA 2MLLB 3H0OA 3O0WA 5F8SA 2FFVA 3BX1C 2R9KB 1V6NA 2WT2A 4ATFA 2D6KA 1JT7A 2ARBA 2WJSA 4II0A 1SLIA 2R1DA 1GLHA 3AK0A 2Z42A 2DUOA 2JECA 2YY1A 1BASA 2GMPA 1V6JA 1M2TB 4XFUA 1LOAA 3AFKA 2EXHA 5CAZA 1O4YA 3VKFC 4BMEA 5F90A 2ZGNA 4H55A 1W6QB 3PVEA 3UDAA 4I0YA 4XHBA 1C4RA 4JAWA 3U4XA 1MR5A 1ISZA 4G9MA 1R8NA 4Z8BA 3NBDA 1Z4SA 4WZFA 2J3PA 1CIWA 4HL0A 1ISWA 3B9UA 3R4SA 5JVVA 3ZXLA 4HJJA 1UN1A 4YZ5A 1A3KA 1MZ5A 2B7YA 4FPYA 1P63A 2ZR1B 2VY0A 5DZUA 4YGBA 2Q9XA 1APNA 3ILAA 3I4IA 3WDTA 1AFCA 3A22A 2W68A 4IONA 3AJYA 3KMVA 4XDQA 1UL9A 1ISYA 1HCDA 2WBCA 5GLTA 1SCRA 2D44A 2GN3A 4Y1XA 5BYNA 1HWOB 3A23A 3CRIA 4P0KA 1ULEA 3HMYA 4YZ3A 1HQWA 1HKNA 5DUWA 4GWMA 3A0KA 2QN4A 4FPGA 4EB2B 2DVAA 2PHXA 1ONAA 1HIBA 4ISQA 3W59A 5T5PA 3O3QA 4F83A 1GICA 1DZDA 4M3CE 3V64A 3FGMA 1AXMA 4JPZA 4CRQA 3AYEA 3ASIA 4YW5A 1ONKB 4G9NA 3VEQA 4AVTA 4A7YA 1NXD1 4H9WA 1SACA 3O12A 2C5DA 2XG3A 3H6RB 31BIA 1JT3A 2K43A 2X2TA 3NV2A 1QXMA 2KM2A 2DRYA 4IY9A 1V6OA 3AKHA 1G86A 4J2KA 2JDZA 2D3SA 5CNAA 1W0PA 2GALA 4XYXA 3I2XA 4DRVA 4FPLA 3BRFA 1FWUA 4YG6A 2ZHLA 3IPVA 2ZACA 3ZC8A 1LOBA 1S0FA 1BLDA 5FNWA 1MS5A 4LO8B 1S0IA 1DYPA 3IM5A 1QDOA 3M1HA 2AFGA 5DUUA 1AXKA 1GYKA 2DVDA 4Y1UA 1G7YA 4FQ4A 4AWDA 1BKZA 2I2SA 1G9AA 3RTJB 1AX0A 3AXEA 3ZYRA 2VLCA 1D2SA 2NM1A 1QF3A 2ZGLA 4LBNA 3CA5A 3BAQA 2CL2A 3WUCA 3BODA 1HWMB 3VKMA 3NWKA 4I96A 1HCEA 7I1BA 2DVFA 1MS8A 3OBTA 3PMEA 1EPWA 4XXPA 5DZGA 4ZKTB 2WNEA 4R9BA 3RMYA 1UX6A 2UU8A 3OJMA 2MC2A 6I1BA 4Q2FA 4X3AA 3NBNA 4A7ZA 4QD2B 4EFPA 5DVHA 2GNMA 4Q27A 3N7KA 1RY7A 3B3QE 2ZQOA 4D8HA 1H9WA 3ZXEA 4I3NA 5EYYA 2HZ9A 4KC3A 1QMJA 4FQZA 1X50A 2GMEA 3AYDA 2WRYA 4YZ1A 5E89A 5HCAA 1DQ5A 1MS0A 4YGCA 4FOVA 1WBAA 1IS5A 3WA1A 3ZSLA 1JTCA 1CR7A 2HW9A 3VSZA 1KJLA 3V0BB 1DQ4A 4IHZA 3FJHA 4GP3A 2D1ZA 5BP5A 4OEEA 2YXSA 3ZC9A 3AZZA 8I1BA 1HLCA 2E51A 5BXSA 4LO1C 1Q56A 2RSTA 4LO2C 5GLWA 4XBLA 21BIA 1LU1A 4FPFA 4D0ZA 2DYCA 3TB0A 4FPEA 3SH5A 4FPOB 4CJMA 1QDCA 1L2HA 4FGFA 1DFCA 2ET2A 4ZOTA 3T8SA 4XTMA 2ARXA 5HCFA 3BAUA 2QYIB 4BMBA 1H9PA 3UD8A 2LTNA 4LO0A 5T54A 2PELA 1IKQA 4X38A 4UW5A 5DG2A 2VXRA 1JN2P 4AVSA 2EXIA 2A3XA 2DTWA 3AXDA 2UWAA 4FPHA 3ATGA 2Z48A 2ENRA 4P9WA 1MD6A 1XQNA 4XHXA 2PHTA 2VXTI 2GNBA 1CJPA 2AREA 3IM6A 4G1RA 1Q8SA 1DJSB 2RHPA 2G4IA 3I29B 1N1TA 1W6QA 3VT2A 1W6PB 5G00A 5IK8A 4JKQA 1YRZA 3ZXGA 2BEAA 1G9FA 3LSEA 5JOWA 1F5FA 2NN8A 2R16A 4ENDA 2ES3A 4XIKA 3ZPYA 1S0BA 1HQLA 5BXPA 1ENQA 3ZXJA 1XHBA 1MVEA 5JLVA 4EFQA 5F5QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1AF9A

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