1AG1O

Monohydrogen phosphate binding to trypanosomal triosephosphate isomerase
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSQQSLSELIDLFNSTSINHDVQCVVASTFVHLAMTKERLSHPKFVIAAQNAIAKSGAFTGEVSLPILKDFGVNWIVLGHSERRAYYGETNEIVADKVAAAVASGFMVIACIGETLQERESGRTAVVVLTQIAAIAKKLKKADWAKVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEAHALIRSWVSSKIGADVAGELRILYGGSVNGKNARTLYQQRDVNGFLVGGASLKPEFVDIIKATQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase(intramolecular oxidoreductase)
molecule keywords TRIOSEPHOSPHATE ISOMERASE
publication title Anion binding at the active site of trypanosomal triosephosphate isomerase. Monohydrogen phosphate does not mimic sulphate.
pubmed doi rcsb
total genus 92
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence T
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 1997-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1ag1O00
3W1RA 1BWLA 4AEOA 5F1VA 3LBCA 1AW2A 3G1SA 4FXSA 1XI3A 2C14A 1I4NA 4HKPA 4JICA 5D2XA 7TIMA 5K4XA 4WUIA 1FQ0A 1MZHA 3NQAA 5TBOA 1PIIA 1TPFA 3P84A 4ORIA 3N2MA 5G5IA 3NEVA 1F76A 4HT3A 2NUXA 2XFWA 1Q6LA 2VEPA 4DXVA 2PURA 2X1UA 3SSJA 3F03K 1OX4A 3R89A 3WK0A 1ZNNA 1H7XA 3UPWA 4UTKA 3O15A 2E68A 3C4UA 4HHPA 4DO6A 2CZEA 2Y62A 4JYEA 4RLIA 1ONRA 4UTWA 2A85A 2ZRZA 1LBLA 1KTCA 1Q6OA 2JKAA 1PE1A 4N2YA 3GB6A 1FBAA 3W7RA 3PSVA 3WJYA 4ADUA 3B0VC 4JD4A 3TSMA 2W79A 2FB3A 5K9CA 3ABSA 4B5NA 4YWIA 4NNBA 4O57A 3TMQA 4TMBA 2C13A 2TYSA 3QW4B 1K7XA 1ICQA 3W73A 4BFAA 2Z6IA 1I2QA 5D38A 4FHAA 1YXCA 1F7BA 3G1YA 5FEPA 3WJSA 4IMFA 2NX9A 4OV4A 5CGQA 3IV3A 4X9SA 4LC6A 2PRLA 2C18A 1X7FA 1VQTA 3UWVA 2YCEA 2Y63A 2FB2A 5HWJA 1R47A 1LCOA 3EWYA 2J9ZA 5G2IA 4UUIA 1ZCOA 5C2XA 2ATMA 3BARA 2QCEA 3QMSA 4WQ6A 3KVMA 3HF3A 3DI1A 3ZFHA 2DZVA 3FYOA 2A6NA 5AN7A 1LLZA 5AC7A 3FJ6A 3GDRA 2Z2UA 5FF0A 1TV7A 5K9DA 1PVNA 2DJLA 5G4WA 5AFDA 3O63A 3O1NA 1OVDA 1BWKA 4NQ1A 2NUWA 3EX6A 3QZEA 5HQEA 3W86A 4NUWA 4JTFA 3P74A 4ZQRA 1G69A 3H53A 3RF9A 3S1UA 1FWSA 1F5ZA 3BLFA 3RU6A 1G7VA 1SZGA 3LI1A 3DFTA 2G96A 2ZA3A 4XUGA 3B05A 3FA5A 3NNTA 3P60A 4HNTA 4O12A 3G0XA 1EP1A 4AWSA 4XWUA 4UC5A 3QFEA 1JQXA 5DY3A 4IMCA 3KHJA 3USBA 1TTIA 1G4SA 3F4NA 1AW5A 3N2XA 4WOQA 1KM5A 3BG9A 4U28A 3G18A 1ZAJA 1EP2A 3W23A 1WOBA 3SFKA 1XC4A 2B7PA 3KRUA 4ZZ9A 3TCEA 4NZFA 3BW2A 1YXDA 5D2YA 2ZRXA 3LTSA 2QCNA 3C61A 2LLEA 3O6DA 4IXHA 4PTNA 2G5WA 4IGHA 4ZQNA 1W1ZA 1AL7A 4JX4A 4IWWA 5D05A 2WNZA 1T96A 8TIMA 3DFQA 2X1TA 3GNDA 4NNAA 4Q32A 3LXCA 4MPQA 2BLEA 4N02A 4JDBA 6ALDA 4O52A 2DORA 3W07A 1KFCA 5K9XA 1WV2A 3STEA 3MI6A 2ZZ5A 4UFKA 3LXAA 3HPSA 4GUHA 5C55A 2WSQA 1SO5A 4LU0A 1DV7A 1YTDA 3PBYA 4UCGA 5AHFA 5AYXA 1Z44A 3W2NA 3CT7A 4QQ3A 3PBVA 4UIOA 2RDUA 3W72A 3IVSA 5FF4A 2Q3RA 4UTUA 1MSSA 3B0PA 4ONVA 1TIMA 3EB2A 3QJAA 1TJRA 3TQKA 4ZQPA 2Z1BA 3H54A 1CW2A 2CZDA 2FPYA 4AHQA 1HO1A 2J27A 1KFKA 1TQXA 2VFGA 4UTHA 2H3DA 3B04A 4FNTA 1P1XA 1X1ZA 3CB8A 3OBKA 4I7UA 2QDHA 5FEZA 2PC4A 5C5YA 2A7RA 1FDYA 3QEZA 4OGZA 1LRQA 4UXDA 3G1HA 3HQ1A 1TPB1 3KAOA 1UUOA 1H1YA 4DF1A 3S0CA 3HGSA 5U7SA 5I3HA 1UB3A 5CPNA 3GKAA 4QNWA 5K2ZA 4FNPA 4HNUA 3HG3A 4JTUA 4FEZA 1JJKA 2WSYA 3M41A 4RZ5A 1QCWA 1Z42A 1VR6A 3LM7A 1JCXA 5A8GA 1KFLA 4K36A 4NJGA 1C9DA 2A21A 2ZYFA 3SY5A 3NQVA 3NQMA 2ZZ3A 4LVFA 4QJ1A 2VC6A 4Y96A 4ADSA 1KA9F 3H55A 4XTDA 3GX9A 3P61A 5K4ZA 3T40A 3MYPA 1JCYA 2ZZ1A 1R30A 4Z1DA 1SW7A 3NA8A 3JRKA 4JYDA 1T8XA 3L0NA 3HBLA 1Q6RA 4JGDA 2Z6JA 4A3UA 4EVZA 3DHFA 2Y85A 1VRDA 4BF9A 2A4AA 5LNVA 2XN1A 1H1ZA 3RNDA 3SGUA 4O8RA 4K38A 2YFNA 4TMCA 4LVDA 1MEIA 4HIBA 4J9JA 2BTMA 4CNOA 2YDAA 4M7SA 5TQLA 1FDJA 1EA0A 3ATZA 3QM3A 3P7YA 4TU1A 1P0KA 3OHIA 1B9BA 3HGOA 3DFSA 3GYEA 2YW3A 2XN0A 1IXOA 3BK0A 4LUIA 4NJKA 1DQWA 3NL3A 2FDSA 5HUPA 3QSTA 3DBPA 3DZ1A 3UQNA 1O4UA 1S5WA 2OX1A 3PULA 4BI5A 1L6YA 1I2PA 1SU5A 4LRTA 4ML9A 4IMGA 4O13A 1JUKA 2FPVA 1DQXA 3TR2A 3AJXA 2Y88A 1IGSA 2GJNA 3QSRA 3SZ8A 1X1OA 1JCNA 1H5YA 5AHEA 1M7OA 4OHQA 1ME8A 3GXNA 2CFFA 1QDSA 1LZOA 3QQ0A 1W0MA 1YPFA 4UTIA 2YGYA 1UCWA 3LRKA 3SI9A 2VFFA 3NQ8A 1VCGA 2ABAA 3C2FA 3S5OA 2V0TA 4BK9A 3W7PA 2ISWA 1OYBA 3KX6A 4XKYA 1OFPA 3NM1A 3OEXA 3M9YA 3T4CA 4FO4A 2JBMA 1M6JA 3LHVA 1JRCA 3QC3A 1N55A 2ZZ7A 3NYZA 2YYTA 2DJXA 3W7MA 2J6XA 4MYAA 3HO8A 4U4MA 2QR6A 4JY9A 4N6FA 4LVAA 3EXRA 4NT0A 2EKCA 3T55A 2WNQA 1X8FA 4LVBA 1JUBA 1LLWA 1TRIA 3RLUA 3GDKA 1A5SA 1K7EA 2QCMA 4O18A 5HWMA 1SW3A 4JTJA 3CPRA 1KM2A 2GUUA 3HPZA 3MBDA 5CG7A 4TO8A 1XBYA 2E77A 4HN4A 5I3JA 1ZY9A 2Q8ZA 4MUZA 3PB0A 5G2WA 3UXAA 1LRNA 3LLDA 3VI2A 1G4EA 3FJLA 4L4LA 4AH7A 5H2ZA 1IF2A 5J5RA 3A24A 2B7OA 1WX0A 1OX5A 5KZDA 1GG1A 3QQ1A 3RFAA 3TC6A 3RLVA 4P2VA 3VE7A 1JR1A 1WA3A 3TA6A 3U2OA 2ZRUA 3KVKA 3W2MA 3PG9A 4XKYB 2Z0IA 2PCQA 3TFCA 5EL1A 3C2RA 4KWWA 1GYNA 4YMZA 4POCA 3LXBA 1B4EA 2ZTKA 3FOKA 2AGKA 2CZFA 5LNWA 2DZXA 1TMHA 5HJLA 3W7JA 2Y7GA 3HPXA 1TTJA 4JTSA 4UFMA 3CLMA 4IUOA 5BMXA 4LV9A 3QF0A 1SQ7A 1QWGA 4PODA 3L5MA 4LW7A 4UFLA 1H7PA 4TX9A 2FQIA 3UWQA 1H61A 4WXYA 4XTIA 2ALDA 3E9AA 3TSBA 5L9FA 1YDVA 4O1BA 3W7NA 3W87A 4WY0A 2V2DA 5AC6A 4UNKA 3G22A 4JIPA 2E1DA 5A5WA 3W2UA 4AF0B 1X6UA 3I65A 1VYPX 3U8GA 2V8ZA 3QMTA 1K3UA 1SSDA 3B4UA 1VCVA 3STCA 1UUMA 4M19A 4K37A 3EEGA 4JN6A 1KM6A 1M7PA 2RFGA 2E6AA 2R94A 5F1UA 2AAMA 4AXKA 2E5DA 3G0SA 4O10A 3C2OA 3KFTA 3M5XA 1P0NA 1G4PA 2VFIA 1XUUA 3UXDA 4E2BA 1LOLA 3LHUA 4DQWA 3C2VA 4MZ1A 4GUFA 2V2HA 1W54A 2TSYA 2EPHA 2NV2A 1RZMA 3GXTA 3LBMA 3W1AA 4ADTA 1VLWA 3CEPA 1GVSA 3LTPA 4HSOA 1PCKA 3W7QA 3ELFA 3N19B 2A7PA 4LS2A 2HS6A 5F4WA 1PS9A 4CLMA 4IMDA 4O14A 1G67A 4BWLC 4WY0F 2V9DA 2QF7A 5AYYA 1ME9A 3EX2A 3IIVA 2VEKA 3PB2A 3OVPA 1ICSA 5D30A 4IQLA 1GEQA 4MLJA 1ADOA 5KZMA 3MWAA 2QAPA 3P8IA 3M0ZA 5D2VA 4N9CA 2FJKA 1W37A 3W3OA 4Q33A 4O50A 1QPRA 4RZ6A 1A50A 1OG0A 2YXGA 2HS8A 1VHNA 3B03A 4L4MA 2B4GA 2JGQA 5G4EA 4IMEA 1G4TA 2HTMA 5DN1A 3NL2A 4OBTA 2NXHA 5FF2A 2ZQ0A 1VJIA 3TKFA 3O6CA 3Q37A 4O1CA 5T26A 4LS0A 3NQ6A 3Q58A 3S5ZA 3V75A 4GRSA 3L5AA 3T78A 3L0GA 1DOSA 3G8RA 2GQAA 2V82A 2EGZA 3TX9A 4O11A 4WOZA 2P0OA 5EYWA 3TV8A 2I9EA 5J5DA 2EAWA 3LGEA 1PHQA 3EWUA 3HB9A 1S3HA 2DZPA 3M5VA 1L6SA 5DCDA 1I2RA 1N7KA 1ICPA 5G1YA 1NVMA 2VENA 5EY5A 3L2IA 2A0NA 4MY9A 1W5MA 4PC8A 3W22A 1HO4A 1BTMA 1F2JA 4IX2A 3IGXA 1KV8A 2H3BA 1OYCA 3ABRA 3CIWA 5BMWA 3QH2A 1K03A 1OX4B 1B57A 4UTWC 4GXMA 3VNDA 4FX7A 2ISVA 2CLKA 3L67A 4H6KA 4LT9A 4FXRA 1GQNA 3P80A 4PFMA 3WK3A 2V30A 4ZQCA 3OVRA 1OFBA 4JTLA 5LGZA 3PVFA 2VKZG 3A22A 1YYAA 1G7UA 3IVTA 4N4PA 2Y7EA 4H3DA 2C15A 1B4KA 5FI8A 2A6LA 1TPWA 2C0AA 1VH7A 1QMLA 3YPIA 5LNSA 5DXYA 3IVUA 1EB3A 1TSIA 2A7NA 4Y8FA 1S5VA 3C3NA 2HSAA 4NZJA 4LV4A 3OA3A 1NF0A 4GFSA 3SGZA 1MEHA 4LY8A 4P61A 3A23A 4EF8A 3BG5A 2BSLA 4MY1A 3MP4A 3THAA 4Z08A 4AHPA 4LS1A 3M43A 3S5YA 4HPJA 4JTKA 4WX2A 3PUEA 4PL1A 4UTTA 1ZENA 3WJXA 3LHZA 1QOQA 1PHWA 3ZWSA 3EWXA 4IOTA 3GZ3A 3C2EA 3LERA 2NLIA 1OFRA 2YFOA 1RQEA 3CWOX 3E02A 3GIYA 3M16A 1G6CA 3LCXA 4Q4KA 2C3ZA 4PCFA 2NWRA 5FF3A 2X1SA 4M6VA 2EHHA 1NSJA 5D09A 2FFCA 1WBHA 1FXQA 5D2TA 3S5NA 3W1NA 1Y0EA 1FDZA 2GQ8A 2CZ5A 5CKSA 2ZA1A 4IJBA 1HTIA 2QUTA 2RH9A 3E96A 4Z1AA 3OG3A 1JVNA 5D02A 5DXXA 1K8ZA 3NZ1A 4O53A 4N9EA 3PWAA 3CEUA 4UR8A 3G3DA 3TFXA 2Y7DA 1FWNA 1EP3A 4RXGA 4BI7A 1KW1A 1WXJA 1KLYA 3NQFA 3TC7A 3TK7A 1GYLA 1WQ5A 5AHIA 4YL2A 4RXFA 4A21A 1F74A 1UJPA 2DZSA 1FCVA 1F6KA 3NPXA 5LGXA 1W3NA 3JS3A 2CLEA 2ZRYA 1TPVA 1XDLA 3W1QA 5EMUA 3BVJA 1H50A 1KTNA 2QJIA 1OFEA 2X1RA 1ZALA 3TIMA 4O54A 4FNRA 1GVOA 2QCGA 1KLZA 1TPH1 4M5PA 1P4CA 4D2JA 3ANYA 5F2LA 4N9BA 4GC4A 3W9ZA 3L65A 5D04C 3A5FA 2I14A 2E09A 1GVRA 3STGA 4S2CA 4NX5A 5HINA 1OFQA 4N9DA 4MVAA 3TSDA 2CLIA 2C6QA 2BZNA 4KFOA 4RZ4A 2Y7FA 1J5TA 5CZJA 2E6YA 3GDTA 3L21A 1EIXA 4OQVA 2X2GA 3ABQA 3DKJA 4GUIA 4QNEA 1F05A 3FS2A 1K8XA 1B3OA 3FIGA 4GJ1A 4GE8A 5DY2A 1ML1A 3QRHA 3TMLA 4FNUA 3O6YX 2DZTA 3EX4A 4JR5A 1SZEA 3PY2A 1OFAA 1TPDA 4XBSA 3T7VA 3PG8A 3L68A 2PRMA 3BLIA 1RVGA 3G8EA 1JRBA 2YX0A 3O8AA 4ALDA 4MKNA 1FUYA 1KFEA 1R2SA 1VS1A 4YXGA 4MOZA 1EWEA 3F1QA 1YDNA 5KSWA 3MP3A 1H63A 3A21A 1TTQA 3LV5A 1LORA 1XBXA 5D2WA 3IIZA 5CPMA 1FX6A 1I8JA 1S5TA 2J88A 1OHLA 2E6FA 5LKYA 5C54A 2RDTA 4CCCA 1O5KA 1K7FA 1RPXA 3DENA 3BPWA 3NL5A 4TR9A 5DCBA 2DZUA 3CU2A 3P5ZA 1FY6A 4O16A 4QM1A 1U5JA 1T0OA 5F4XA 4WXZA 5I3KA 1HUVA 2A1YA 2FIQA 2F7FA 3N9SA 4RR4A 4S1FA 4GWEA 4JIQA 4X2RA 4Z0SA 3R12A 4FIRA 3GXPA 4JYFA 1D9EA 2I1OA 2ZZ4A 4UFIA 3B06A 3TW6A 4JX5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4X63 A;  2VX4 A;  5F1V A;  2DPE A;  3SJN A;  3LBC A;  4C1N A;  4EP8 C;  1XI3 A;  4JIC A;  5K4X A;  3MMD A;  1FQ0 A;  3SFW A;  3F5J A;  1TX2 A;  1MUW A;  5FL0 A;  3P84 A;  1W9B M;  3WX7 A;  3OQE A;  1A0D A;  4Q6J A;  2WAN A;  2XUC A;  3QV9 A;  4S39 A;  3SSJ A;  4RNH A;  3N3T A;  1KR1 A;  2P76 A;  4RV3 A;  2ZX8 A;  1KBK A;  3N6H A;  3ZVH A;  2OSX A;  2CZE A;  4R3U A;  2BP1 A;  1UP3 A;  4ZXL A;  2A85 A;  1Q6O A;  1RH9 A;  1TEL A;  1PE1 A;  1FBA A;  3W7R A;  3WJY A;  3T07 A;  2FKP A;  5IDI A;  5K9C A;  2VGB A;  4W7V A;  3E2R A;  4WDW A;  3ZVI A;  3K5X A;  2TYS A;  3QW4 B;  5ECV A;  2CIT A;  1PX4 A;  3OGR A;  4BFA A;  4AEF A;  4TVD A;  4H8N A;  5D38 A;  2HRO A;  1T5A A;  1EXP A;  1DE5 A;  3W29 A;  3IK2 A;  3QHM A;  3EWY A;  2XH4 A;  2J9Z A;  4UUI A;  1ZCO A;  5C2X A;  1B0I A;  3VGF A;  1FVP A;  2QCE A;  4A35 A;  3VMN A;  4J2M A;  2A6N A;  1LLZ A;  3FJ6 A;  5K9D A;  4Q8U A;  3BAX A;  5AFD A;  3O63 A;  1F61 A;  1BWK A;  3W86 A;  4AYG A;  3H53 A;  3I4E A;  3TYU A;  3POC A;  1F5Z A;  1SZG A;  1M7J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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