1AQ0A

Barley 1,3-1,4-beta-glucanase in monoclinic space group
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
306
structure length
306
Chain Sequence
IGVCYGMSANNLPAASTVVSMFKSNGIKSMRLYAPNQAALQAVGGTGINVVVGAPNDVLSNLAASPAAAASWVKSNIQAYPKVSFRYVCVGNEVAGGATRNLVPAMKNVHGALVAAGLGHIKVTTSVSQAILGVFSPPSAGSFTGEAAAFMGPVVQFLARTNAPLMANIYPYLAWAYNPSAMDMGYALFNASGTVVRDGAYGYQNLFDTTVDAFYTAMGKHGGSSVKLVVSESGWPSGGGTAATPANARFYNQHLINHVGRGTPRHPGAIETYIFAMFNENQKDSGVEQNWGLFYPNMQHVYPINF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords 1,3-1,4-BETA-GLUCANASE
publication title Crystal structure of barley 1,3-1,4-beta-glucanase at 2.0-A resolution and comparison with Bacillus 1,3-1,4-beta-glucanase.
pubmed doi rcsb
total genus 102
structure length 306
sequence length 306
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.73: Licheninase.
pdb deposition date 1997-08-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00332 Glyco_hydro_17 Glycosyl hydrolases family 17
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1aq0A00
4LXFA 3UEQA 4AZCA 4JKLA 1VIWA 2DH2A 2VL4A 1M03A 2FHBA 1MXDA 1UKQA 5BRPA 4UFHA 2A3EA 3WNMA 4AIOA 3B8SA 1QPKA 3B9DA 3AS0A 2HVMA 3IJ9A 1GHSA 1MW1A 3CHFA 5GNZA 1TA3A 3CZKA 2E8ZA 4HOWA 3CZEA 3PZVA 5M3WA 1Q6EA 3SEPA 1OD0A 5IFTA 1PX4A 1C91A 1E73M 1UKPA 5TD4A 5C71A 1E56A 3VGEA 4GZIA 2WMHA 2WPGA 1J0KA 3VIIA 1L8NA 1ISZA 3B9EA 3EYPA 1W9DM 2EO7A 3VD7A 2GJRA 2J47A 5IDIA 3ZOAA 4AWEA 2V3DA 4W5UA 3W82A 2G4FA 1R7OA 1E3XA 1PBGA 1EGZA 1FOBA 5AYBA 2D0HA 2XSBA 1EHAA 4D1IA 2G41A 1HL8A 2AMGA 4F9DA 2E8YA 1LQ0A 3KL0A 1E40A 4HZ7A 4HOZA 3W81A 3W4RA 4HMDA 2FH6A 4E8CA 4MJ2A 4PTVA 4DWSA 1C8QA 3WL0A 1QVBA 1E15A 5BXRA 1W1VA 5BYWA 1X6LA 1QBBA 5ECUA 1CPUA 3CZGA 2VX5A 3B9AA 1RH9A 1ISYA 5JUVA 4GZJA 4U5IA 1C7SA 1FH7A 2BFGA 2DT1A 2UY4A 2Y8KA 1UQYA 3T0AA 3CUIA 1JNEA 5M03A 3A47A 2OWCA 4AEFA 1D2KA 1W3JA 2ZWZA 1UA7A 3KZSA 4PTMA 1CXKA 1HJVA 1MW2A 2J25A 2BHUA 4UFMA 2XUCA 3BSHA 3BAKA 2EPKX 3WNPA 2D1ZA 1Q4NX 4D6GA 2UY2A 3WF2A 3AIEA 2VURA 2UWFA 1J18A 1K9DA 1E43A 1PZ2A 1JD9A 2VTFA 1ZU8A 4PMUA 2W61A 4PTWA 5CSUA 1OD8A 3UG3A 1ZS2A 4JFWA 1JF6A 1VFOA 1B3WA 2V5DA 5M5DA 4CD7A 2YL8A 3BXWA 2UY3A 1OB0A 3VGHA 2RGMA 3TTQA 1ECEA 4W8LA 1V08A 5A8QA 1VFFA 1W9BM 3MUIA 1LL4A 3AS2A 3NIYA 1SR0A 3A3HA 2W5FA 4FK9A 1E6SM 1W3HA 1W32A 4IPNB 1FFRA 3BMWA 2E9MA 1H0IA 1LG1A 3AHTA 1UWRA 3OZOA 2WLYA 5DF0A 2DSUA 1AVAA 2FH8A 1XH1A 4P7NA 4AZIA 2GVYA 4JKKA 1E6QM 4CUCA 4ZFMA 3I3DA 3T0DA 4ZE4A 4FLSA 4AD1A 2WW5A 1C7TA 1A47A 3L2MA 2F2HA 2QV4A 4HZ8A 4UQCA 5ABFB 5DMYA 4J3SA 2XGBA 3VIPA 1HJUA 4W88A 5A6BD 3WSUA 1XV8A 4W93A 2CXGA 2ZUVA 3WF1A 1OM0A 4FLRA 1ZJBA 4GO9A 1CXIA 3CZJA 2WMFA 5A2CA 3BAIA 4WLCA 1H09A 3IK2A 2CBUA 4P8WA 3ZSTA 2XPKA 2WVTA 5FD0A 4DUWA 3ZJ8A 1SFSA 1CXHA 3N17A 1GOOA 4Z2IA 2ZUNA 2QMKA 4MDPA 3FN9A 3SCWA 2E9LA 1CLXA 1I1XA 4HA4A 1J0IA 3WL1A 5EFFA 5JIPA 4F79A 1ITXA 1GJWA 5IHRA 3MMDA 1WB0A 4JFSA 4YHEA 2D23A 1CEOA 2FGLA 2W66A 3AMCA 4CN4A 4HA1A 1GW1A 1UR8A 4EANA 4QLLA 2CBVA 4MNMA 3LMYA 1W1PA 2UY5A 3ARUA 2DIJA 4MNJA 2DSKA 3WUEA 2WC3A 4GPNA 1KBKA 1B90A 2WSPA 1UD3A 1O7AA 2WVUA 1UA3A 4W7UA 1M01A 1UWQA 1WE5A 5BWFA 1QI4A 3WMCA 1J10A 4UR9A 2PWEA 4QCFA 4AZ7A 1HXJA 4PMRA 4U33A 3OGSA 4JFTA 3TTOA 1CBGA 2CIPA 4GKLA 4V2XA 4CKQA 4UFLA 1V02A 1E0VA 3EMCA 4LX4A 1J12A 2VRJA 2WBGA 3I3BA 3PTQA 1FH9A 1PJ9A 5D9MA 1K9EA 3POCA 5ABEA 1GONA 2YJQA 2DH3A 1VAHA 2XIBA 1W91A 4MNLA 2D24A 1KWKA 1EQCA 2XSAA 1BF2A 3O9NA 2X05A 2EJ1A 4NSBA 1QNPA 1GQKA 4MNKA 3QHNA 2WM0A 1SMDA 1C90A 5M17A 1UR4A 1OGGA 2NT1A 4ZXOA 8CGTA 1U33A 1H49A 1H0GA 2DQXA 3WF4A 5D8WA 1A3HA 2VZSA 5A6BA 1UH4A 4D6EA 1V6VA 5HBFA 3IJ8A 1MFUA 4QFUA 1JZ4A 4LYPA 4AISA 2WHKA 2J77A 4ZXLA 3WY1A 1UD4A 4XZBA 2C8NA 1QI5A 4JAWA 1WDPA 2FGZA 1HKJA 3W26A 3ZR6A 4KGJA 1GZJA 2BHYA 4MAZA 1EDQA 3N15A 4RE4A 2JALA 5A6SA 2CESA 3DC0A 3CBWA 2ZUMA 4ACZA 4BS0A 1KR0A 1V6YA 4U2YA 2J62A 3RM9A 5BXTA 3VD5A 2EPNA 1WKYA 4LYRA 3IANA 4AIEA 5DEZA 1IZKA 5GQBA 1E1FA 1EH9A 1NOFA 1CLVA 3BH4A 3PZGA 3SURA 3WQ6A 2VNCA 2O9OA 3BAXA 2WANA 1HF6A 1BLIA 2WMIA 3WMBA 4E4PA 1H4PA 2YLAA 4ZE5A 2J75A 3AMDA 2XVLA 2VQTA 3GXFA 2CERA 2CKRA 1PIFA 2WLZA 2Y24A 2CKSA 4WKFA 3II1A 1CWYA 2XVKA 1CECA 4X0NA 3ALFA 6CGTA 1Y7VA 1HVXA 2YBTA 5D9OA 3VMPA 4AZHA 3WD1A 4PYSA 1E6PA 1R87A 4CCDA 1UWIA 3GNPA 3ZJKA 1VBRA 1E4MM 4HA3A 2CBJA 1VEMA 2VJXA 4D6IA 3VM5A 5I23A 3KE0A 1JDAA 3SUSA 1KWGA 8A3HA 1TR1A 4Z2KA 2GJXB 1OGSA 1UZ4A 2VO5A 4JFVA 2V3EA 3AIVA 1TFVA 3AYSA 4WK9A 1BSIA 4W85A 2OLHA 4DWSC 3ZIZA 1TVNA 3ARXA 1E4LA 2J79A 4NZCA 1JAKA 3OG2A 1GUVA 4L4OA 3VU2A 1B9ZA 4KRUA 4XB3A 4EK7A 1UUQA 3VPLA 4AD2A 2VR4A 2VUYA 3LPGA 4C7GA 2YIHA 1P6WA 4HMCA 4AZCB 1JYNA 1OWQA 3WD4A 4PSPA 4UZUA 1BAGA 1ZBVA 5FL0A 3A6OA 2QMJA 4D6JA 2DSWA 1OSEA 5BRQA 1VEOA 1BG4A 2JE8A 1UD2A 1ISVA 2D3NA 4ATDA 1PEZA 4UOJA 1Z32X 1E55A 1JYVA 3PBGA 2G3NA 1OGBA 1TA3B 1EOMA 1E5NA 1CIUA 1BYBA 2X0HA 3WNLA 3UG4A 1JD7A 1HL9A 4TX8A 1E0WA 1H5VA 1GNXA 3ZR5A 4UFKA 4PRWA 1HJSA 1B2YA 3CZ8A 1UWTA 2J7CA 2QF8A 4A3YA 1SMAA 1J01A 3BCFA 3AIBA 3GBEA 5E70A 3NCOA 1UD8A 5F7UA 2W67A 1JZ5A 1U30A 2OSWA 4K68A 2EQDA 1C3FA 4W8AA 4PBGA 3WN6A 1F4HA 3NDZA 2CPUA 4B15A 2NT0A 3PZTA 3TTSA 3M6DA 2WCGA 4X0VA 3W0KA 1MXGA 4AC1X 1D3CA 4HPHA 5EMYA 3VIOA 5HOSA 1CGYA 4XX6A 2WZHA 4P8VA 4QDMA 1JL8A 4TUFA 1MYRA 1JXKA 1V3JA 3VKKA 2BS9A 1NH6A 3U57A 2Y2WA 5BXSA 3NDYA 3RCNA 1XRVA 1VFUA 3MV11 1EDTA 2O9RA 2RGLA 3L4VA 3W29A 2V3FA 3W28A 4NF7A 3BC9A 3THDA 2CITA 2J4GA 3T0BA 1VJZA 3VMNA 4KWUA 2QPUA 4FLQA 3L4UA 2ZUUA 2VRKA 1DEDA 1DWGM 4J3TA 4PCSA 1KXQA 1E71M 2WHMA 3UETA 1V6WA 1XH2A 3DYPA 1V3KA 2CHNA 2VX6A 1CDGA 1I1WA 1E6ZA 4GIAA 1E70M 3PZUA 3VGDA 3CUGA 5BXPA 2EBNA 2XIIA 2B31A 3D3AA 3GXIA 3N1AA 1EO5A 4PMZA 4MPKA 4DUVA 4HPGA 2E0PA 1C8YA 3TTYA 4EAMA 1UWSA 3WH8A 3U5YA 4D1JA 3MSGA 3F4VA 1TMQA 3RJYA 1QOXA 4GQQA 2X1IA 5E09A 1YQ2A 1LF1A 5A6AA 2V3GA 3THCA 1GQJA 2VQUA 2YL9A 2HISA 2PF0A 1PIGA 1B3XA 4YHGA 3AMKA 1B1YA 3OLEA 1PX3A 4A3HA 1KXTA 4J3VA 5HXMA 5I2UA 1EA9C 4QCEA 3ZSSA 4CVUA 3ARRA 1XH0A 1UG6A 1FH8A 5CGTA 2A3HA 4W89A 3VD3A 3VUPA 3WKZA 3WDHA 2ZXQA 4AEEA 4RL3A 3NSMA 1XYZA 1NOUA 2WVSA 2J7HA 5JBEA 1C8XA 4ML4A 2EPLX 2EPMX 1DWIM 1NWRA 4AZ6A 2YA1A 1GOWA 1Q6GA 3VGGA 5FCZA 1J0HA 4TVCA 4PUEA 1S46A 4WKAA 2D2OA 1UYQA 4J27A 4MTVA 3BAYA 1GQLA 4B9YA 3IAQA 3L4WA 1V03A 2W92A 2VI0A 1NM9A 1ODZA 1OT2A 1RD6A 4XV0A 3L4XA 3BAJA 3MUAA 2PBGA 2DDXA 1BVZA 4RE3A 4CCEA 1QNOA 1TUXA 2VC9A 1Q6DA 4LQ1A 3ZM8A 4V28A 3OZPA 4M1RA 4IPLA 1E4IA 1DWFM 4CD6A 4R27A 3DHUA 5A95A 3ARVA 4YN5A 3CHEA 4KH2A 4GINA 3SUVA 1MFVA 3WF3A 3T2PA 2J7DA 1GJUA 2X2YA 1ESWA 3UG5A 1JNDA 4CN1A 2WMJA 3OLDA 3QOMA 4ATWA 4UQDA 4AZBA 5I0DA 2BY1A 3ZO9A 1X1NA 3EDEA 3L2LA 1VB9A 6A3HA 3WDPP 4J28A 1XCWA 3APGA 1IV8A 3ZQ9A 1QNRA 5A8PA 2ZX5A 5LA1A 3OBAA 4J3WA 2D22A 4P7RA 3SCQA 4GQRA 2IXVA 1BYCA 2ZWYA 3OA5A 5AC4A 3QR3A 2FHFA 2ZXBA 3GNRA 3BAWA 1B31A 2XGIA 1E3ZA 1GOMA 4QP0A 2XG9A 4W84A 3PZOA 4M80A 3MO4A 2WKGA 4TOQA 1W9VA 2PWHA 3ARQA 2YBUA 5EB8A 3EDFA 4D6HA 3KL5A 4RE2A 5A8NA 2DT0A 1DWJM 4ZEPA 3MS8A 2YL6A 1KCLA 2VX7A 1V6UA 1G94A 5JIWA 2WC4A 4GZEA 3NSXA 1KGWA 3DYMA 4FF5A 4AXNA 4EE9A 3WDJA 4WIWA 4PMXA 1H11A 1LL7A 4AYSA 1RP8A 1UZ1A 1CGVA 1EDGA 2ZXDA 3WD2A 4PMDA 3GH7A 3TONA 1R7AA 1JXJA 2YA2A 1MVYA 4PSRA 2GK1A 1HKKA 3U7BA 4ACZB 4WSJA 4TTUA 2J8GA 4AD0A 5CG0A 2C7FA 3K8LA 1JG9A 3HJEA 5CPQA 3AI0A 2WK2A 4GI8A 3GXMA 4DM1A 3WD3A 3FAXA 1M04A 4L4PA 3VVGA 2GFTA 1GVYA 1LG2A 3VIHA 2WMIB 1PZ3A 3AHYA 3WUGA 3ZT5A 4C7FA 1AQ0A 2CYGA 3G6MA 1ODUA 4GXPA 4QLJA 1JI1A 4P8XA 1BTCA 3UERA 5C70A 1MQQA 4M82A 4PMVA 1HP5A 1UD5A 1K6AA 5IHSA 3FW6A 3O2LA 5LA0A 1UKTA 2E40A 1TZ7A 1XSJA 3HU7A 2FHCA 3ARTA 3NSNA 2DPEA 4TX6A 6TAAA 3WQ4A 3RILA 1UR2A 1DHKA 2Y8VA 1R8LA 2G3MA 1HKIA 4PTXA 1MQRA 4JL2A 4CU8A 1TG7A 1V0MA 3WH7A 4HTYA 4IISA 2JFEX 1JZ8A 1EIBA 1QI2A 1ZJAA 3AFBA 4S3JA 5E6ZA 5A8OA 5D9PA 3FHQA 1UHVA 1E4NA 1JFHA 4U3CA 1B3ZA 4GO8A 2QHAA 4HP5A 4XZWA 3WUBA 3VDHA 1TCMA 3M07A 3QGVA 4Z2GA 5A69A 1W9PA 2A3CA 4V27A 4ZENA 4CN6A 5HPOA 4CVWA 4M8UA 2XWDA 4CU7A 1JAEA 3AJ7A 2VMFA 1J11A 2DGAA 2WSKA 1ISWA 1B3YA 2EPOA 3FY1A 3EBVA 4MB1A 1AQHA 2VZOA 3WQ5A 3WBAA 5ABGA 3WQVA 1HIZA 4LYQA 3L4TA 4JL1A 3CZLA 4OKDA 1JDCA 2CEQA 1WZLA 4CCCA 2GDUA 2WXDM 1O6IA 4EKJA 3M46A 3WDRA 4MJ4A 4OOUA 2WHLA 3SCTA 3OIHA 1EQPA 3CGTA 3RM8A 3WNOA 3ZMRA 3GYCA 3VD4A 2DIEA 2Y5EA 3GBDA 1JGIA 3AXIA 4AD3A 3KWXA 1DP0A 5DFAA 1OIMA 1WDQA 5A6MA 2ZX6A 3AHXA 3BLKA 3BLPX 4F66A 1BFNA 2WVVA 3N9KA 3PHAA 5FIPA 2PWGA 2XWEA 1QBAA 1M7XA 2J74A 3MV01 1VBUA 3AMGA 1DWHM 5I3DA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4LXF A;  3UEQ A;  4AZC A;  4JKL A;  1VIW A;  2DH2 A;  2VL4 A;  1M03 A;  2FHB A;  1MXD A;  1UKQ A;  5BRP A;  4UFH A;  2A3E A;  3WNM A;  4AIO A;  3B8S A;  1QPK A;  3B9D A;  3AS0 A;  2HVM A;  3IJ9 A;  1GHS A;  1MW1 A;  3CHF A;  5GNZ A;  1TA3 A;  3CZK A;  2E8Z A;  4HOW A;  3CZE A;  3PZV A;  5M3W A;  1Q6E A;  3SEP A;  1OD0 A;  5IFT A;  1PX4 A;  1C91 A;  1E73 M;  1UKP A;  5TD4 A;  5C71 A;  1E56 A;  3VGE A;  4GZI A;  2WMH A;  2WPG A;  1J0K A;  3VII A;  1L8N A;  1ISZ A;  3B9E A;  3EYP A;  1W9D M;  2EO7 A;  3VD7 A;  2GJR A;  2J47 A;  5IDI A;  3ZOA A;  4AWE A;  2V3D A;  4W5U A;  3W82 A;  2G4F A;  1R7O A;  1E3X A;  1PBG A;  1EGZ A;  1FOB A;  5AYB A;  2D0H A;  2XSB A;  1EHA A;  4D1I A;  2G41 A;  1HL8 A;  2AMG A;  4F9D A;  2E8Y A;  1LQ0 A;  3KL0 A;  1E40 A;  4HZ7 A;  4HOZ A;  3W81 A;  3W4R A;  4HMD A;  2FH6 A;  4E8C A;  4MJ2 A;  4PTV A;  4DWS A;  1C8Q A;  3WL0 A;  1QVB A;  1E15 A;  5BXR A;  1W1V A;  5BYW A;  1X6L A;  1QBB A;  5ECU A;  1CPU A;  3CZG A;  2VX5 A;  3B9A A;  1RH9 A;  1ISY A;  5JUV A;  4GZJ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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