1AQW | Genus

Total Genus 78

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	78
sequence length	209
structure length	209
Chain Sequence	PPYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIYTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Transferase/substrate
molecule keywords	GLUTATHIONE S-TRANSFERASE
publication title	Structures of class pi glutathione S-transferase from human placenta in complex with substrate, transition-state analogue and inhibitor. pubmed doi rcsb
source organism	Homo sapiens
total genus	78
structure length	209
sequence length	209
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date	1997-08-03

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF02798	GST_N	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A	PF14497	GST_C_3	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
1.20.1050.10	Mainly Alpha	Up-down Bundle	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2	1aqwA02
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1aqwA01

1GSDA 4K2DA 4ZL9A 3TGZA 1PKWA 3F4SA 3TKPA 3O3TA 5DDLA 3HDCA 1OVNA 3QDNA 2DJJA 2YANA 4MP4A 4O5RA 3MDKA 4WR4A 3HKRA 4XTSA 3FHKA 2HNLA 1SL0B 1OC3A 4XS1A 2EIRA 1PMTA 2GSTA 1ZOFA 2L4CA 3M9KA 3I43A 5L71A 5CRGA 1GTAA 1KTEA 1Q98A 4GSNA 3ZTLA 2B5YA 4NHWA 1SKWB 1WOUA 1ST9A 2E7PA 2I4AA 4POMA 4HJ2A 4TRXA 5CREA 1G7EA 5CAXA 2RUEA 4D73B 3KP9A 3ZL5A 1A23A 3QR6A 2FY6A 3FKFA 4L5OA 4J56E 3BOAA 2VLTA 4MPGA 4BVYA 1ZCPA 3PH9A 3J7Yk 1T4YA 2A2SA 5ECSA 2C3TA 4MMMA 4TW5A 1U3AA 5DQYA 5F07A 2JACA 3WT1A 2HYXA 1GWCA 3TDGA 2MMNA 4F0CA 2NDOA 3GFKA 4KW6A 1J0FA 3HVVA 4ZBBA 1DSBA 1AQXA 4USSA 4PQIA 4ILFA 3NZNA 4L5LA 2V2GA 1K3YA 5DJLA 2YWMA 5IOXA 4BVYB 2YWNA 4EF0A 2H1DA 4L0UA 3KZQA 1E6BA 1XBSA 5CO3A 2I9HA 2CVDA 4I8BA 1EOGA 4ECCA 3TRXA 1V57A 2B5XA 3F4TA 1WP0A 2LSTA 4QL9A 5B6MA 2CQ9A 2QKEA 4K6XA 4GSSA 4KGIA 1T8EB 1MTCA 5GSTA 3WGEA 3KXOA 2ON7A 3A2VA 2HRNA 1K0MA 3PGTA 3I6AA 3CSHA 2GZZA 5G1KA 4HU9A 1R5PA 1I9DA 4HOJA 2CZ3A 2NTOA 1Y25A 3EC3A 2XPDA 3MSZA 1BAYA 4YAVA 3FEUA 2YWOA 3ZMKA 5D9XA 4PTSA 3Q6OA 13GSA 3FZ4A 3KD0A 1HNBA 1YQ1A 4V2MA 3APQA 2RLIA 1FOVA 1H4OA 4K7OA 2ALBA 2G2QA 1AW9A 10GSA 4POKA 1WE0A 5GAPD 1TDIA 3HA9A 4WR5A 4Q5FA 2RUFA 2H6ZA 1USBA 1TTZA 3ZMLA 1ON4A 1HQOA 3IV4A 3DXBA 3FR9A 1THXA 5IMFA 2JZRA 5LCZA 3L4NA 2MZCA 2FNOA 3PPUA 5ECLB 2CAQA 4TR1A 2MMZA 2K9FA 4FH8A 4BWQA 3P90A 1OE8A 3L9UA 1NHYA 4RQXA 2G0FA 3EWLA 1YEPA 3H93A 5G30A 5IO2A 4KSOA 18GSA 5GAND 2VL9A 4IHUA 2HSMA 1XXUA 1G7OA 1MDJA 2DBCA 4JZQA 5EY6A 1PRXA 3DD3A 2TRCP 4EUYA 1FHEA 3ZZXA 2H73A 2VD0A 1PQNA 5EPFA 4MK3A 1YF0A 1Y6EA 4TR1B 1O6JA 1M7TA 2UZ8A 2P31A 1B8XA 4O7HA 2ZUPA 4MZBA 2JSZA 1XVWA 5ECQB 4TVEA 9GSSA 3L9VA 1T7PB 3KGKA 3GUSA 2P5QA 2VUPA 2J23A 3HVXA 4HQSA 1GSSA 1QK8A 5A4UA 2JSYA 2C4JA 2PN8A 2MBSA 2K8VA 2GTUA 4NV5A 3IC4A 4DSSA 1A2LA 1B9YC 3GMFA 4LA1A 5JCGA 2LJKA 4ISDA 3MWHA 1FO5A 3ISOA 3EU4A 1AIUA 1YZXA 4O92A 4IELA 2H0GA 1ZL9A 4KF9A 14GSA 2MMAA 1O85A 3FYGA 4MJEA 2OKAA 2X99A 4K1FA 3HVSA 1S3AA 3FZ5A 1K3LA 5IMVA 3FZAA 5GZZB 1M9AA 3UVTA 4IQAA 4KDYA 1SJIA 1TJDA 4GSTA 2C1YA 1DBYA 4EXJA 3HCZA 1SYXA 5ENUA 1SK0A 2FCHA 2R37A 2LV3A 4PGTA 4BL7B 1YDKA 1CQHA 1SENA 5CRDA 5IIZA 5DALA 3ZFBA 4PUAA 1TI1A 3ZIJA 8GSSA 4F2IA 3M8NA 4GLTA 1UC7A 5CP1A 4IVFA 4ZBAA 2HE3A 3HYPA 2WS2A 3RHBA 3HJOA 2F9SA 4KUNA 4GCIA 5AIXA 3WGDA 1T4ZA 1C72A 2VLUA 2VCZA 4XS4A 5DALB 1XOBA 2HZEA 2LQOA 3GA4A 2VL2A 5AGYA 4IJ3A 5HR1A 4XCSA 3GX8A 1FB0A 4OFTA 1ZYQB 3L78A 1TW9A 3BJ5A 2X8GA 4EDZA 2HSYA 3SWLA 4HDEA 3DGQA 4BVXB 2F8FA 2F3MA 3DKSA 4LMVA 4IBPA 1G6YA 2GZPA 1PX6A 2OBIA 4FYCA 2AAWA 4KDXA 2O87A 3DEXA 1XWGA 2GSRA 4XS4B 1UVZA 2YWIA 2HRKA 5F06A 1QMVA 1I5GA 2B5EA 2LS5A 3BCKA 4MF5A 3VWVA 1W89A 2IFQA 5J4UA 4K9ZA 3GURA 5DAKA 2FHEA 5IMDA 1TXXA 3IPZA 2OE3A 3TKSE 2FWGA 1GTIA 3M0FA 2GT5A 1SU9A 1S3CA 4MJCA 1FVKA 5IO0A 1JFUA 2HT9A 3LORA 1AXDA 4NWYA 4V2NA 3G7YA 1JZRA 3BBYA 1F3BA 1XW9A 1VRSD 5E4WA 2JADA 3Q18A 2IJYA 2LJAA 5F0GA 3ED3A 2H1BA 3GIXA 2H0IA 3GTUA 2C0GA 3EMXA 20GSA 3ZYWA 3UBLA 1ZZYA 1GLQA 3VPQA 1R4WA 2IFQB 5DVBA 1XWKA 1HYUA 1T1VA 4WBRD 5IMAA 4ZL7A 4AF2A 3LWAA 2I3YA 3P2AA 1LJRA 3D4TA 1A2JA 3R3EA 2L6DA 5C00A 1QXHA 1O81A 3GTUB 6GSYA 5KN0A 2K18A 1BEDA 3U6VA 3TJKA 2YP6A 3KMNA 1NW2A 2L5OA 3QFAC 1HD2A 2PUKC 1WRYA 3TB2A 1B4PA 1O73A 1SD8A 4PNGA 2F8AA 3FR6A 2O7KA 1X9SB 2L59A 4NV2A 1BQ7A 2PGTA 4G9HA 4GF0A 1BJXA 5EL8A 2LNTA 2HSHA 3J7Yb 5G1LA 5IPGA 4N0ZA 4ZBDA 3UJ1A 3LXTA 1S3DA 4D73A 1ILOA 3F6DA 1GSYA 3F6FA 2EIOA 3TCOA 4PX1A 3Q74A 3UMAA 4OFNA 3A5WA 2VL3A 2A4VA 2IMDA 1ERUA 1QFNA 4F03A 4WXTA 5J3RA 3LYKA 2H19A 3DYRA 1KNGA 5ECOB 1JZOA 4PURA 3IR4A 1EP7A 4Z7XA 5A4VA 2LTKA 5HFGA 1DE1A 2DIYA 2WJUA 1PGTA 4ACSA 4JR6A 1VF3A 3RPPA 4HU7A 2NVLA 3M3MA 2YV9A 4OO5A 1W4VA 1Z6NA 2N5FA 5ECMB 3WYWA 4V1Ap 2X8CA 3WD6A 2M46A 4KSMA 3TRQA 4DSQA 2FUG2 6GSVA 1X9WB 4J2FA 2H75A 4K8MA 2OE0A 2VD1A 2GQLA 1YKAA 4ZB8A 5ECKB 3C71A 2REMA 5JWOB 1LBKA 1WMJA 4FYUA 1GNEA 1M2BA 3CSJA 1GTUA 3UBKA 4F0BA 3H8QA 4Q5QA 3D0ZA 3GL5A 3F63A 3VWUA 3H79A 2ON5A 2H74A 3FY7A 1H75A 2H76A 1GL8A 2CV4A 4G0IA 3KIJA 3CTGA 2LRNA 1V9WA 5H5RA 3LYPA 2PPTA 3LG6A 3D5JA 5HR3A 3ERFA 6GSXA 1EV9A 3M1GA 5COHA 3S9FA 3QAGA 4FQUA 5B8AA 3TJJA 2XBQA 4G10A 4F82A 3R2QA 4ZB9A 5H5QA 4IP6A 2F51A 2O89A 4KA0A 4L0WA 2AV4A 3FR3A 3F8UA 5F8BA 1X5DA 4IJIA 2FD3A 5HR0A 2OJLA 3ZLPA 2PMTA 3RAZA 1ERTA 2B1LA 5J5NA 3ZVJD 4E8HA 4TXVA 5D93A 4XRDA 3TKSA 3HJMA 1VF1A 3UVHA 1UA5A 4ECBA 1V58A 2NPBA 3DVXA 2WRTA 1AC1A 3U5RE 3TOTA 1A0FA 2BTOT 1YKCA 3I9V2 1X9MB 4YQVA 4MJAA 2H30A 3TJFA 4MCUA 2VO4A 4K7IA 4MJBA 1K0NA 1O8WA 2YJ7A 1ERVA 1Z9HA 3ZIVA 2PVQA 3P8WA 2C0FA 4N0VA 2WCIA 3GKKA 1XZOA 4PNFA 3EMPA 4IGJA 3GH6A 5EVOA 2HXKA 4XHMA 1WIKA 2V6OA 1V2AA 2DJKA 1GLPA 1GNWA 5G5FA 2YN1A 5J9CA 2HQTA 2PWJA 2R3XA 2OE1A 5J41A 3A2WA 3GKXA 1EV4A 2YCDA 1B4QA 3IC8A 1XW5A 1JLVA 4LLRA 1IYIA 2N5AA 1GUKA 1U88A 3D4MA 1WJKA 4V1Ag 2B3SA 2H01A 3CRTA 2ZCTA 1HNAA 2QC7A 4XS6A 1EOHA 3ME8A 1SK2A 3TOUA 3IHQA 1TKDB 1HNCA 5INYA 5H5SA 4I5QA 5CRWA 3IAS2 2VLVA 2VAFA 2WULA 3E9JB 2H1GA 2HLSA 3G7JA 2MMOA 2CVKA 4AJ6A 1EZKA 3EURA 2H1AA 4YQMA 2VCTA 4POBA 4DSRA 4MZWA 3TKRA 4BL7A 2XPEA 4IQ1A 3UOMA 3A3TA 3LJRA 1SJ6A 5HR2A 3IE3A 3V1WA 3O76A 2WFCA 3HJPA 1IYHA 3I69A 1YJ6A 2DJ1A 1VGLA 3NOFA 3ZITA 4X1UA 2R4VA 5D96A 5CRHA 2WDUA 1FW1A 2H66A 2K8SA 1OC8A 2WB9A 1Z5YE 3IRAA 1GUHA 4KB3A 3ZRDA 2IPAA 2VIMA 2QGVA 2KP2A 4QQ7A 2DIZA 2X8HA 4TXOA 1N2AA 2VOCA 5F05A 1XFLA 4PQ1A 5LNKe 3IDVA 4IN0A 5JCWA 2GQMA 1B48A 4CHSA 4OCEA 3QD9A 3H4KA 4AGSA 4BVXA 1MD4A 3PR8A 1PKZA 1K0BA 3DMLA 2GVPA 5C04A 2GSSA 3QFBC 2YZHA 1TK0B 3L0HA 3TRPA 4TXOB 1F2EA 1J9BA 2VCQA 2TRXA 3D21A 4K7NA 2AJQB 3GRXA 5D9WA 2DJ3A 3APSA 4G19A 1JHBA 2LJRA 2CX3A 3US3A 4BA7A 4I2TA 1TOFA 3G9BA 4IS0A 4E8EA 1Z7RA 4Q5NA 4WEYA 4F9ZA 1G0TA 3A2XA 1U87A 2HRAA 2DJ2A 2B7KA 5DBQA 5ABRA 4OWYA 3CTFA 2K6VA 4ECIA 2QSIA 2AHEA 3C1RA 2LKUA 3CRUA 3KJYA 5J9BA 5IPHA 5G5EA 3LGCA 3ZFLA 1SL1B 4MF7A 2AUVA 3GL3A 5KN1A 2BJXA 5HFIA 2H72A 2LNSA 2ES7A 1A24A 4OFMA 2E2MA 4KCEA 6GSUA 2CVBA 3CYNA 3KCMA 2C3NA 2IMIA 2H0HA 5KEJA 4WBJA 3CMIA 3QPMA 2D2ZA 4GQCA 5JWQB 3RPNA 4JU5A 1V40A 22GSA 2C3QA 1DE2A 3GSTA 2CT6A 1BG5A 2IIYA 5ELAA 4TOPA 3EYTA 5E59A 1TRUA 1SD9A 2B7JA 1K0AA 4WETA 1EEMA 4ID0A 1EGRA 1A2MA 1MD3A 4ULXA 2R2JA 1M2DA 4RI7A 3VI7A 3C73A 5JWRB 3FRCA 3QCPA 1EEJA 4AJ8A 1EGOA 2MYGA 3N5OA 4WKWA 3VURA 5IQYA 17GSA 1Z6MA 1DUGA 2MBTA 3FZ9A 4NXIA 3GNJA 1VF2A 2IL3A 4RUVA 3SBCA 3VFIA 1FVJA 4ML6A 4FIWA 3UIWA 2GLRA 1GRXA 2JZSA 3VWXA 3N9JA 5IMCA 2LEGA 5D8IA 5FWGA 4RI6A 2KOKA 1OKDA 3KMOA 1ERWA 1F3AA 2GDRA 5D9TA 2DJ0A 2HSNB 4I2UA 1TRWA 4HQZA 2GZYA 1YY7A 3TKQA 1NM3A 2B1KA 3VWWA 2HZFA 3C1SA 5A4WA 1O7UA 5LD0A 1F6MC 4POLA 1PA3A 5ECNB 19GSA 2L6CA 4L8EA 1LU4A 4YH2A 2JL4A 1FB6A 1SKSB 2IN3A 4PQHA 4MH2A 2AB6A 5ELGA 1JZWA 2YJHA 3EU3A 4ZIJA 3IK7A 5ECPB 1CQGA 3UEMA 3JCML 2JZTA 2X64A 4TR3A 4ML1A 4PUFC 4MZCA 1Z7PA 4JBBA 5JCUA 2EC4A 1Z3EA 1XVQA 4EDYA 4YQUA 4TR0A 3QAVA 2CA8A 3HY2A 2VM2A 3F0IA 4GQFA 2VCVA 4DVCA 4PXOA 2VL2C 2C80A 2A2RA 2OA7A 5B7CA 3HD5A 4LL1B 4NHZA 3RBTA 2DLXA 1ZGNA 4LL4B 3QMXA 3GN3A 3HZ4A 1XW6A 1ML6A 2E2GA 2IWTA 2GSQA 1MEKA 1PD21 3L9SA 3W8SA 4FO5A 7GSSA 2CAIA 2P5RA 4HEA2 5ID2A 1EWXA 4OCFA 2RM6A 3CXGA 1KBNA 4GXZA 3WGXA 4AJ7A 4HJMA 3CBUA 3IK9A 4V2LA 2VCWA 3F3QA 2EIQA 2FLSA 4KDUA 3P7XA 1RW1A 2HI7A 1K0OA 4I97A 1XWBA 4I6XA 5AISA 3F4RA 3Q19A 3MNGA 1K0DA 1A8YA 2H6YA 5FHIA 1QUWA 5DCHA 2DMMA 3ZVJA 3DVWA 2RIIA 1B9XC 5ID2B 2H8LA 1GSEA 1M9BA 5HQPA 4K0GA 2XBIA 5IMZA 2R6KA 2I1UA 4G2EA 3H1NA 1X5EA 3UL3A 2YPMA 4Q5RA 3GYKA 4HI7A 5DCGA 3KH9A 4MDCA 2KP1A 3LXZA 4QL7A 5AIVA 2H70A 4LMWA 3IAM2 3DRNA 1K3OA 4WF5A 2C0DA 1O8XA 1PSQA 2KLXA 1M2AA 3UAPA 3ME7A 3PINA 2GS3A 1OYJA 5DQSA 2HFDA 2E0QA 1SK1A 1GULA 2ZNMA 3KM6A 2L4QA 4MF6A 4KE3A 2YOIA 3ERWA 4HUAA 3DIEA 3W6GA 4WF4A 1OAZA 1U6TA 2LRTA 5DJMA 3WT2A 1WWJA 3C8EA 1XOAA 3IA1A 4JEDA 4OO4A 1AQWA 2YNXA 1PL2A 2VM1A 3LSZA 2WGRA 3OR5A 5D9VA 1X5CA 3APOA 2V1MA 3GV1A 4MLYA 4ZILA 2PBJA 1PX7A 4EE0A 2XC2A 3LQ7A 4DEJA 3KEBA 1ABAA 5FT3A 4YAPA 1THOA 5KN3A 3IOSA 3W8JA 2HSMB 2V41A 4TN8A 4G0KA 2WZ9A 4OD7A 3LFLA 3GHAA 5IM9A 4KH7A 3O6TA 2PU9C 1FAAA 3MAKA 1TK5B 1ZYEA 4K0NA 2YZUA 3BD2A 2I81A 2DSAA 2RM5A 4ZL8A 1XIYA 1A0RP 3ZREA 4H86A 1QGVA 4P3YB 3M9JA 4BWSA 3BCIA 2GT6A 3DWVA 1GSUA 5ECHB 3NIVA 3HXSA 3F9UA 1SYRA 4OMVA 4RQRA 4GTUA 2AYTA 4G0LA 1JLWA 2DMLA 11GSA 1ZMAA 1MDIA 2FA8A 5ECIB 4NMUA 3HZ8A 2FWEA 2L57A 1URMA 4MA9A 4TKYA 3C7MA 1MDKA 3K8NA 1R5AA 5G31A 1X0RA 2YV7A 3IBHA 2LUSA 2TIRA 1M0UA 2O85A 4DSSB 3E0UA 2GGTA 1U3IA 3D22A 3QOUA 1T3BA 3QAWA 1M99A 1E2YA 1A8LA 1XWAA 3G7IA 5ECRB 3VPTA 1V98A 1KEBA 2NBSA 3F3RA 1R7HA 5HFKA 2FWFA 4EC0A 2CX4A 1OKTA 3EVIA 4HZ4A 1AQVA 3EINA 2R5GA 4X43A 2B6MA 2PERA 1TRSA 2OADA 1AUCA 1Q4JA 5D73A 4BPYA 4IKHA 3GH9A 3TJGA 4N10A 2OACA 1RQMA 6GSTA 1TU7A 2M80A 1GTBA 1OE7A 1YEXA 2KHPA 1GUMA 3D6IA 2C8UA 3IXRA 4KAEA 3KP8A 12GSA 4TR4A 1SJZA 1T00A 4MABA 16GSA 6GSSA 3CSIA 5G2ZA 2O8VB 3UARA 3TUEA 1PN9A 2VCXA 4MH3A 3TKSC 4ZXGA 2IMFA 3E3EA 3GSSA 1WPIA 5B6NA 4KCAA 4CDOA 3KTLA 1G6WA 3GKNA 4J57E 4IP1A 2JU5A 1R26A 1TP9A 4NPBA 2H6XA 1K0CA 1EP8A 2FWHA 5GSSA 2HZEB 2OBKA 1N8JA 2KUCA 2H71A 1J08A 2PVOC 1SL2B 1BYEA 5A5KA 3FK8A 1F37A 3FW2A 1GP1A 2DC5A 1YF1A 4JRRA 4XIHA 2XHFA 1JZDA 4KX4A 4JR4A 4HZ2A 1UN2A 4EKZA 3LEFA 3ERGA 1OC9A 1FG4A 2P0GA 2CZ2A 1XWCA 1GH2A 1TU8A 2LQQA 2HRKB 4N30A 1PL1A 2L5LA 5BMUA 3KH7A 5IOWA 5CNWA 4MPFA 2GQKA 2IMKA 2J9HA 3VI5A 5DAKB 4ECJA 1QQ2A 4KNDA 4O32A 2C0EA 4CW9A 3AY8A 4GWRA 4EL1A 4HS1A 1AAZA 1XPVA 5CYYA 1TK8B 2HRFA 3RDWA 5B8BA 2Z9SA 3HHVA 3RHCA 4EVMA 1F9MA 4ZB6A 4X0XA 1OC9B 2V32A 3GX0A 1ACVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1AQWA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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pfam database annotations