The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2RQV A; 1PKS A; 1PKT A; 1G83 A; 2P4R A; 2VWF A; 4A63 B; 1JU5 C; 4WCI A; 1K0S A; 2KNB B; 3M0T A; 1U5S A; 3I5S A; 4Z89 A; 2MCN A; 3EG3 A; 2K7A A; 2RQW A; 1QKW A; 1AD5 A; 2EQI A; 1AOJ A; 2V1Q A; 3RBB B; 1K9A A; 1FMK A; 2F2W A; 2L3Q A; 4JZ3 A; 1M3A A; 3EG0 A; 3TVT A; 1E6H A; 3VS4 A; 4RTX A; 2HBW A; 3NPF A; 1BU1 A; 1MV3 A; 2YUO A; 2BZY A; 2J7I A; 2PNI A; 1SEM A; 4GLM A; 2LJ0 A; 3I35 A; 2AKK A; 2MOX A; 2OJ2 A; 1SPK A; 2M0Y A; 1Y57 A; 2CSQ A; 2OI3 A; 2W0Z A; 4KRT A; 3H41 A; 3VS0 A; 2JTE A; 4AFU C; 2ECZ A; 1AZG B; 3PVQ A; 2HEQ A; 2CDT A; 1QWE A; 2C0T A; 2D8J A; 1WYX A; 4JJC A; 1UFF A; 2JMC A; 3M0Q A; 2EGA A; 2HSP A; 5FWB A; 4HXJ A; 3R6N A; 1JEG A; 1S1N A; 1W1F A; 2BZ8 A; 4F17 A; 4RTV A; 4J9G A; 4D8D A; 1GFD A; 1HSQ A; 3REA B; 3ULR B; 2EYW A; 4M4Z A; 5L23 A; 1CKA A; 4EIK A; 5IHN A; 3REB B; 3NHN A; 1ZUU A; 2L0A A; 1U3O A; 2GNC A; 2DF6 A; 2YSQ A; 1X43 A; 2DYB A; 1A0N B; 2K9G A; 1FYN A; 2FPD A; 2ED1 A; 2JMA A; 1RLP C; 1WX6 A; 2RQT A; 2RN8 A; 1GFC A; 4J9C A; 1SRL A; 2DMO A; 2DA9 A; 2CUB A; 1GBR A; 2GGR A; 4JJB A; 2DE0 X; 5IXF A; 1K76 A; 1ZUK A; 4F16 A; 3ZL7 C; 1WLP B; 1YN8 A; 1GRI A; 2RNA A; 2RQR A; 1WIE A; 3QWY A; 4J9F A; 1WFW A; 2DL4 A; 4HCK A; 2H8H A; 2X3W D; 2LZ6 B; 2PZ1 A; 5ECA A; 2G6F X; 3M0P A; 1T0J A; 2O9V A; 4OML A; 2A08 A; 2J6O A; 4K11 A; 1V1C A; 4J9I A; 1X2Q A; 1WXU A; 1KSW A; 2RPN A; 3TSZ A; 4AG2 C; 1ZUY A; 2CRE A; 1VYU A; 2LQN A; 2YT6 A; 1GL5 A; 4DEY A; 2L3S A; 3KFV A; 5IHI A; 1ZX6 A; 4LNP A; 2CT3 A; 2KRO A; 3I5R A; 5GJV B; 1CKB A; 1M3B A; 1AWX A; 2YUP A; 2AZV A; 1NLO C; 2K6D A; 2EYZ A; 4AFS C; 1K0X A; 3SEM A; 1YWO A; 3M0R A; 4J9E A; 2DBK A; 2EVR A; 4CC7 A; 3EHQ A; 1W6X A; 1X69 A; 4J9H A; 1NM7 A; 1UG1 A; 1PHT A; 2B86 A; 4JJD A; 2E5K A; 2NWM A; 1JXO A; 2JS0 A; 2YUN A; 2VVK A; 2EBP A; 1X2K A; 2K3B A; 2KXC A; 1UJY A; 5I11 A; 4HVV A; 2ED0 A; 2DL5 A; 1E7O A; 1AEY A; 4JPB W; 3UAT A; 1T3L A; 2CT4 A; 4GBQ A; 2KRN A; 1AWJ A; 2YUQ A; 1X6G A; 1BK2 A; 2HCK A; 4RUG A; 2IIM A; 1N5Z A; 1M3C A; 1GCP A; 1OV3 A; 1RI9 A; 1RUW A; 2AZS A; 2O2O A; 2DL3 A; 3H0F A; 4LUD A; 4Y92 A; 2DNU A; 2LNH B; 2JS2 A; 4LE9 A; 2CSI A; 1WI7 A; 1TUC A; 2I0N A; 1HJD A; 1SHG A; 5HCK A; 1YWP A; 3EGU A; 2KT1 A; 2KYB A; 1NEB A; 2LQW A; 1Z9Z A; 1ABO A; 2C0I A; 3TSW A; 1I07 A; 3THK A; 2AK5 A; 1UTI A; 2J6F A; 2JM9 A; 2JT4 A; 1OOT A; 2FO0 A; 1UDL A; 4OMP A; 3VS5 A; 1H3H A; 2EYY A; 1NYG A; 2EGC A; 1QCF A; 1SRM A; 1RLQ C; 2RMO A; 3H0I A; 1NYF A; 1X6B A; 2AKL A; 3NMZ C; 2BTT A; 2A37 A; 2ABL A; 2KYM A; 1WDX A; 3M0S A; 3FJ5 A; 2M51 A; 2GTJ A; 4Z8A A; 3VS3 A; 2CUD A; 1YP5 A; 2FPF A; 4OMO A; 2PTK A; 2EPD A; 2KXD A; 1E6G A; 1YCS B; 1ZSG A; 1KJW A; 2J6K A; 1QLY A; 2EW3 A; 2D1X A; 3UF4 A; 4J9D A; 4OMN A; 2EGE A; 1T0H A; 2JW4 A; 2DL7 A; 1QWF A; 2RF0 A; 4RTW A; 2V1R A; 3VRY A; 2LCS A; 4ESR A; 1GCQ C; 3JV3 A; 4Z88 A; 1MUZ A; 1W70 A; 2X3X D; 3H0H A; 2HDA A; 2XMF A; 1JQQ A; 2DRK A; 3I9Q A; 2FPE A; 3A98 A; 3C0C A; 1CSK A; 2A28 A; 1X27 A; 2MIO A; 3VRZ A; 4AFZ C; 3PVL A; 1B3Q A; 1I0C A; 3O5Z A; 4ORZ A; 1XOV A; 2DLP A; 2OAW A; 4CC4 B; 1B07 A; 1M8M A; 2FRY A; 2CH4 A; 2F2X A; 4RTU A; 2L2P A; 4LUE A; 4D8K A; 1NEG A; 2O31 A; 4LN2 A; 1QKX A; 2DBM A; 1ZBJ A; 1VYT A; 3NGP A; 1HD3 A; 2KEA A; 1OPK A; 2F2V A; 1ARK A; 2FRW A; 4HVW A; 5IH2 A; 1UHF A; 2L3P A; 2CH4 W; 5I22 A; 2KGT A; 3VS1 A; 2D8H A; 1NLP C; 2ENM A; 5IXB A; 2LJ1 A; 3EG1 A; 1UEC A; 2D0N A; 4F14 A; 1JXM A; 1VYV A; 3EG2 A; 4AG1 C; 4E6R A; 3QWX X; 2ESW A; 1UE9 A; 3UA7 A; 3VS2 A; 2KR3 A; 2FG0 A; 1KIK A; 1WXT A; 5FW9 A; 1SHF A; 2EKH A; 2JM8 A; 2JXB A; 1IO6 A; 2K79 A; 3VS7 A; 2EYX A; 5GJW B; 4AFQ C; 2SRC A; 2A36 A; 3U23 A; 2RQU A; 2DJQ A; 1J3T A; 1K1Z A; 1OEB A; 4IIO A; 4OMQ A; 3SHW A; 1H92 A; 4IIM A; 3RNJ A; 2KRM A; 1H8K A; 2VKN A; 3CQT A; 2GQI A; 2NUZ A; 4FSS A; 1PNJ A; 4JZ4 A; 1VA7 A; 1AWO A; 2LP5 A; 2GTO A; 2W10 A; 1AWW A; 1OPL A; 4OMM A; 2ROT A; 3GBQ A; 1WXB A; 2KRS A; 2J06 A; 1K4U S; 1Z9Q A; 1EFN A; 1T3S A; 1UJ0 A; 4CC3 A; 1NG2 A; 4RTZ A; 1BBZ A; 3UA6 A; 1WA7 A; 2FEI A; 2J05 A; 2DM1 A; 2GBQ A; 2DX1 A; 1U06 A; 1SSH A; 3M0U A; 1GCQ A; 2DIL A; 3IQL A; 2LX7 A; 1UUE A; 5FWC A; 1GBQ A; 1M27 C; 1UGV A; 2O9S A; 1TG0 A; 4J9B A; 4RTT A; 4X1V A; 1TUD A; 1Y0M A; 2C0O A; 1LCK A; 3PE0 A; 1M30 A; 4HVU A; 2LJ3 A; 2ROL A; 2LMJ A; 1PWT A; 3LH5 A; 4QT7 A; 2O88 A; 2K2M A; 3EHR A; 3VS6 A; 1I1J A; 1KFZ A; 1YNZ A; 1MV0 B; 5EC7 A; 4ZNX A; 2QDL A; 1G2B A; 2BZX A; 1JO8 A; 1UHC A; 1PRM C; 1ABQ A; 2DVJ A; 2DL8 A; 4RTY A; 4DEX A; 2KT8 A; 2SEM A; 1BB9 A; 4R0K A; 2KBT A; 2KE9 A; 1AVZ C; 2DRM A; 5IHK A; 1AZE A; 1PRL C; 2YDL A; 1ZLM A; 4CC2 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2MAM A; 1BI3 A; 3CPW S; 2XI9 A; 1RAE B; 1PKT A; 2RK1 A; 1G83 A; 2P4R A; 3G1J A; 3UDC A; 4LXC A; 4F7U B; 2OAU A; 3JB9 J; 1PD0 A; 1D3B B; 4ME7 A; 5LJ3 f; 1VIE A; 5GAO m; 2MCN A; 3QO3 A; 2JOY A; 1QKW A; 2FZC B; 2IVW A; 1AOJ A; 3MEW A; 5CKH A; 1VQ6 T; 1FMK A; 3VYH B; 2CZ6 B; 3CCU T; 1XNI A; 3EG0 A; 3TVT A; 3VS4 A; 3URG A; 3RDV A; 4M78 A; 3C94 A; 3CCM T; 2VB6 A; 1YI2 Q; 5DLO A; 3I35 A; 2DKG A; 5AYF A; 2MOX A; 4HCZ A; 5KYU A; 5FRN A; 2OI3 A; 2VGN A; 4QQ6 A; 1OI1 A; 4KRT A; 2JTE A; 5FU6 C; 2CDT A; 1K8A R; 2HD0 A; 4J6Y A; 5KE3 A; 5DY9 A; 4PJJ A; 2EGA A; 3MKD A; 4X34 A; 3SDZ A; 1GXI E; 1W1F A; 4M75 A; 4RTV A; 1Q82 R; 3VYG A; 4D8D A; 1IZ6 A; 3ME9 A; 3N5B B; 2F5T X; 3VKI A; 5GAN 7; 1X6O A; 2EYW A; 3F70 A; 2HQE A; 1WHH A; 4EIK A; 1LOJ A; 3ASK A; 2M02 A; 1U3O A; 2LX9 A; 2HQX A; 2K9G A; 1FYN A; 2HKN A; 4EMK A; 1OX9 A; 2HZY A; 4IUV A; 1I81 A; 1QVG A; 3QYH B; 2X51 A; 1YIT T; 2V8I A; 2RN8 A; 2COY A; 2NUT B; 3EG9 A; 2DA9 A; 1GBR A; 5CKB A; 5IXF A; 1K76 A; 4LDX A; 3ZL7 C; 1K73 U; 4D6W A; 3VUZ A; 4M77 E; 3PIP A; 4NL2 A; 3CEY A; 4QVD A; 4J9F A; 4RG8 A; 5FLX E; 1WFW A; 1VQO A; 1OQK A; 1YIJ T; 2KSS A; 5KYW A; 4XTW A; 2J6O A; 2CZ1 B; 1V1C A; 3CPF A; 1X2Q A; 3I56 A; 2D0Q B; 4M77 A; 1FXX A; 2EQU A; 1KSW A; 2L3R A; 4C5I A; 3HFN A; 4AG2 C; 1VYU A; 2OTL A; 5FU6 B; 2XIC A; 1GL5 A; 5LJ5 d; 2L3S A; 3KFV A; 2CT3 A; 4JRI A; 3CCM Q; 5GJV B; 3SWN A; 2YUP A; 2CP5 A; 2EYZ A; 2HBP A; 4AFS C; 1K0X A; 1YWO A; 5LJ5 j; 3EH1 A; 1TWB A; 5HY6 A; 1Q7Y R; 2RHU A; 3EHQ A; 1PHT A; 2B86 A; 3GP8 A; 4V2S A; 5CQY A; 1JXO A; 1YJW A; 1C6V X; 4NL3 A; 2EFI A; 2CP0 A; 2EBP A; 5GAO r; 2K3B A; 3X25 B; 4J83 A; 5GAO l; 3V8K A; 2YHT A; 5GMK h; 3M57 A; 4HVV A; 4J5Y A; 5M9O A; 3C4S A; 1EIF A; 2XKO C; 1WJR A; 5CQX A; 4KGZ B; 2KRN A; 1AWJ A; 2X35 A; 2EQJ A; 2HCK A; 5GAN 5; 4M7A A; 2EJF A; 1N5Z A; 2JTF A; 3VV0 A; 4J6X A; 1YBY A; 2DL3 A; 4HCC A; 4Y92 A; 2DNU A; 1QQJ A; 3JCM e; 2BIV A; 4C0G A; 1TOV A; 2GFU A; 5I21 A; 2DER A; 1VUB A; 2I0N A; 1Q86 C; 3TRE A; 4M77 F; 2KK4 A; 2KT1 A; 5GAM d; 4A4K A; 2QQ9 A; 2LC4 A; 1Z9Z A; 2YWW A; 3TSW A; 3G6E T; 1I07 A; 1ZSZ B; 1QVG P; 3CCE T; 5GAM j; 1YI2 A; 4OMP A; 2D9T A; 1RAH B; 1M5Q 1; 4OGC A; 3QDF A; 1YIJ Q; 1M1G A; 4CRI A; 3A8O B; 3M0S A; 2RI3 A; 4Z8A A; 3FRN A; 1FMW A; 3FLG A; 2KXD A; 1E6G A; 1QVG S; 1KJW A; 4PJO G; 4A4F A; 5CKF A; 3JCM X; 1T0H A; 2JW4 A; 2V1R A; 1GCQ C; 2RHX A; 4Y91 A; 2X3X D; 3CMA Q; 3G71 T; 3L42 A; 4NS5 A; 2XMF A; 1VQ8 Q; 1K9M C; 3C0C A; 5CAI A; 2A28 A; 4JLI A; 4UC4 A; 4AFZ C; 5HK3 A; 1N8R R; 2Y4Y A; 1M8M A; 2FRY A; 4WTO B; 5LJ5 f; 2H3J A; 2L2P A; 4LUE A; 3JCM V; 1NEG A; 5I2S A; 5CK9 A; 3J80 E; 1M9S A; 4WF2 A; 3OYD A; 1PC0 A; 1JJ2 A; 3NGP A; 2KEA A; 4IUQ A; 2F2V A; 1ARK A; 1B34 A; 2FRW A; 4HT8 A; 5IH2 A; 5AT1 B; 1YFN A; 3G4S T; 1KQS A; 4C92 G; 3MJX A; 2C06 A; 3FEO A; 2KGT A; 3V7C A; 1OU8 A; 2QG9 B; 2K5L A; 2D8H A; 3V8J A; 5IXB A; 3MO8 A; 2MF2 A; 3DLM A; 1UEC A; 1LNX A; 4QVZ A; 2D0N A; 3GIB A; 1JXM A; 5KYN A; 1KC8 C; 3LX7 A; 4AG1 C; 3M56 A; 4ELY C; 4HCB A; 2YRC A; 4F7U A; 3OYJ A; 3UA7 A; 2P84 A; 2FG0 A; 2L8D A; 1D3B A; 5FW9 A; 1KIK A; 2B8A A; 4KUL A; 4FYV B; 1TUG B; 1VQK Q; 3OS0 A; 3VS7 A; 4JUV A; 3KUF A; 2A36 A; 5GAN e; 1PSE A; 2DTI A; 2DXB A; 2M9U A; 3CCM A; 3OQ5 A; 3CCE Q; 2VKN A; 1YCY A; 4BI4 A; 1D0Y A; 3QHS A; 1PNJ A; 1AWO A; 2LP5 A; 4ELZ C; 5GAM f; 1AWW A; 1XQH A; 3JCM f; 3CCJ T; 1KD1 R; 1WXB A; 3P8B B; 4KUI A; 1YHQ Q; 5D6X A; 3OMC A; 2BE7 D; 5GAN j; 3M54 A; 1R0C B; 4GLK A; 4F04 B; 4CC3 A; 4KGX B; 7AT1 B; 2ATC B; 3FDR A; 3E9F A; 3HL8 A; 4O6J A; 3OYH A; 2ZPI B; 2ZZD A; 2GBQ A; 1SSH A; 4RKU E; 2HMA A; 3RKY A; 2K5I A; 2O9S A; 4OB2 B; 3G71 Q; 1Y0M A; 4OB0 B; 3JCM J; 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1M1K R; 1CKA A; 4M78 G; 4XTY A; 1IGQ A; 1VQ4 Q; 2LCL A; 1O75 A; 3NHN A; 1UGS B; 3CCV Q; 1QP2 A; 2DF6 A; 2DYB A; 3OMG A; 2FPD A; 2GQV A; 1C1A A; 2AHJ B; 1VQK A; 2ED1 A; 2JMA A; 1RLP C; 3CCS T; 3A8G B; 2RQT A; 4JS5 A; 2E41 A; 1GFC A; 1SRL A; 2OTJ Q; 1JB0 E; 2CUB A; 1QVP A; 4JJB A; 4OVA A; 1QW1 A; 4F16 A; 3RUX A; 2AT1 B; 1WLP B; 3CCE A; 1GRI A; 3WVD B; 4M75 G; 4PLL A; 1BCO A; 4BDZ A; 1WNL A; 2DL4 A; 4IUU A; 2X3W D; 3M0P A; 2O9V A; 1YHQ A; 4X9D A; 1AT1 B; 4K11 A; 2EYQ A; 1Q7Y U; 1RAD B; 4EDU A; 4C92 C; 2RPN A; 2LQN A; 2DIG A; 1M2O A; 2F1L A; 4FT4 A; 4BI8 B; 4DEY A; 3RKW A; 3GLX A; 3G71 A; 1M3B A; 3ZBD A; 2K3Y A; 1H3Z A; 3SEM A; 3OYK A; 2DBK A; 4CC7 A; 5CCA A; 4A4G A; 1N6A A; 3QJ6 A; 1G5V A; 4J9H A; 1NM7 A; 2QTX A; 3E2U A; 3PTA A; 3FC3 A; 2E6N A; 4JJD A; 3FB9 A; 2NWM A; 3FJP A; 3CCR A; 4RMO A; 3RMS A; 3JB9 I; 2X4Y A; 1K73 C; 4FL6 A; 2MWO A; 1YJ9 T; 1KQ2 A; 5I11 A; 4M77 G; 1E7O A; 1AEY A; 2CT4 A; 1BIB A; 2YUQ A; 1BK2 A; 4RUG A; 4PFP A; 3CCQ Q; 3PMI A; 1H64 1; 1OV3 A; 1RI9 A; 1RUW A; 5D7U A; 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