The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
KKPLPPTPEDNRRSFQEPEETLVIALYDYQTNDPQELALRCDEEYYLLDSSEIHWWRVQDKNGHEGYAPSSYLVEKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transferase
|
| molecule keywords |
ITK
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| publication title |
Regulatory intramolecular association in a tyrosine kinase of the Tec family.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Mus musculus
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| total genus |
5
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| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1997-10-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2JM8 A; 3EG1 A; 1GBR A; 2DYB A; 2KYB A; 1AD5 A; 2RN8 A; 4AFZ C; 1YN8 A; 1X6G A; 2KNB B; 1NEB A; 1ZBJ A; 1QWE A; 2DRK A; 1NYG A; 2FO0 A; 4HXJ A; 2CT3 A; 5FWC A; 2EYX A; 4GLM A; 1ZUU A; 4RTY A; 2J06 A; 2ED1 A; 2RNA A; 1GCQ C; 2JS0 A; 5ECA A; 3PVL A; 2V1Q A; 4Z88 A; 2EKH A; 2ENM A; 4OMN A; 1RLQ C; 3M0U A; 2A36 A; 2DBK A; 2I0N A; 2K9G A; 1I0C A; 1SPK A; 1E7O A; 2RQU A; 4JJC A; 3GBQ A; 4CC3 A; 3LH5 A; 2KRM A; 1M27 C; 4HVW A; 2ABL A; 4F16 A; 4EIK A; 2OJ2 A; 2LJ1 A; 1X69 A; 2KR3 A; 1OEB A; 3M0S A; 3QWY A; 3NPF A; 3UAT A; 1HJD A; 4X1V A; 3I5S A; 5HCK A; 1OV3 A; 1AEY A; 1ABO A; 1JEG A; 2A28 A; 1A0N B; 1UFF A; 2LQW A; 1SRM A; 1PNJ A; 1ZX6 A; 2AZS A; 3NGP A; 1GL5 A; 2M51 A; 2CH4 W; 1SRL A; 2D1X A; 2HSP A; 2ROT A; 4LE9 A; 4E6R A; 1AWJ A; 1I1J A; 2K79 A; 2HDA A; 2YT6 A; 2CUB A; 2CDT A; 1UUE A; 1AZE A; 1Y57 A; 3PE0 A; 5I22 A; 4LUD A; 2GNC A; 1UJY A; 5FW9 A; 2EW3 A; 2J6F A; 2H8H A; 2QDL A; 4RTX A; 3O5Z A; 1T3L A; 4JPB W; 2M0Y A; 1UE9 A; 1M3B A; 2KE9 A; 1K0S A; 2D0N A; 3I9Q A; 2CSQ A; 3REA B; 4M4Z A; 5I11 A; 1VA7 A; 1YP5 A; 2LJ0 A; 1VYT A; 2DL5 A; 2PTK A; 4K11 A; 4Z89 A; 3THK A; 4JJD A; 2YUO A; 1MUZ A; 2JMA A; 1OOT A; 2F2X A; 2W0Z A; 1UGV A; 2FPD A; 1PKT A; 1GBQ A; 1MV3 A; 2LNH B; 4FSS A; 1UTI A; 1YCS B; 4LNP A; 4J9F A; 3REB B; 4JZ4 A; 2W10 A; 2DMO A; 3I35 A; 1K4U S; 1MV0 B; 1BU1 A; 2JMC A; 2RPN A; 2JXB A; 4CC7 A; 3TSW A; 1AWW A; 3ZL7 C; 3EG3 A; 2X3W D; 1AWX A; 2DX1 A; 4LN2 A; 3VS3 A; 2JS2 A; 5L23 A; 4OMM A; 4GBQ A; 1U3O A; 2RF0 A; 2BZX A; 4J9D A; 1N5Z A; 2EPD A; 1BBZ A; 1UEC A; 2RMO A; 2AK5 A; 4RTT A; 2YSQ A; 2LJ3 A; 5GJW B; 1NYF A; 2KT1 A; 3M0R A; 3VS0 A; 2DJQ A; 1CKB A; 2KXD A; 2AZV A; 1WX6 A; 2EBP A; 1WA7 A; 2OAW A; 1QKW A; 2EYZ A; 2L2P A; 2J6K A; 1EFN A; 3EG0 A; 1KIK A; 1G83 A; 1W1F A; 2DL4 A; 1XOV A; 1WI7 A; 2LZ6 B; 2XMF A; 1H3H A; 3UF4 A; 3PVQ A; 2KT8 A; 1JXM A; 1WDX A; 3EG2 A; 1OPL A; 2DIL A; 1G2B A; 1ABQ A; 3ULR B; 3VS7 A; 2IIM A; 3M0P A; 2FPE A; 2O88 A; 2O31 A; 1PWT A; 1T0J A; 4J9B A; 2KXC A; 3VS1 A; 5IHK A; 2BZ8 A; 3VS5 A; 2MIO A; 1FYN A; 1SEM A; 2J05 A; 2DE0 X; 1Y0M A; 1TUC A; 2BTT A; 1YWP A; 2K2M A; 3JV3 A; 1IO6 A; 2X3X D; 1KFZ A; 2MOX A; 5IHN A; 4D8D A; 2DRM A; 1NLO C; 1K9A A; 3NHN A; 2DNU A; 2JM9 A; 1JO8 A; 1W70 A; 4QT7 A; 2CRE A; 3RNJ A; 1S1N A; 3M0Q A; 4R0K A; 2LX7 A; 2RQR A; 1X43 A; 4CC4 B; 3VRY A; 1E6H A; 1WXB A; 2KEA A; 2D8H A; 4J9I A; 2DLP A; 2DL8 A; 2V1R A; 1U5S A; 2EYY A; 1AVZ C; 2EGA A; 1VYU A; 2O9V A; 2VKN A; 2L0A A; 2DL3 A; 2DBM A; 2VVK A; 4IIM A; 5IH2 A; 4RTZ A; 1KJW A; 1ZLM A; 5IXB A; 1QKX A; 1TG0 A; 2O9S A; 4AFU C; 2C0I A; 2NWM A; 2J7I A; 1B07 A; 1PRM C; 4AG1 C; 1WIE A; 2D8J A; 4F14 A; 3VS4 A; 2CH4 A; 2HEQ A; 2F2W A; 1U06 A; 3UA6 A; 1PRL C; 2DA9 A; 2K7A A; 4D8K A; 4WCI A; 1B3Q A; 2PZ1 A; 2VWF A; 4J9H A; 4ESR A; 1NEG A; 3R6N A; 2L3P A; 1H92 A; 1BB9 A; 4HVV A; 1CSK A; 3KFV A; 4DEX A; 2K3B A; 2PNI A; 2CSI A; 1K0X A; 2YUP A; 1GFC A; 1K76 A; 1UJ0 A; 1GRI A; 1NLP C; 3H41 A; 4OMQ A; 1BK2 A; 2FG0 A; 2GBQ A; 1JXO A; 1YNZ A; 1SSH A; 2EGE A; 2ECZ A; 5IXF A; 1ZUY A; 2JTE A; 2BZY A; 2CUD A; 2ROL A; 3FJ5 A; 4RTV A; 4AG2 C; 2A37 A; 2YUQ A; 1Z9Z A; 2FRY A; 2A08 A; 3VS2 A; 1UG1 A; 2ED0 A; 3IQL A; 2KYM A; 2GTO A; 5EC7 A; 4CC2 A; 1JQQ A; 1X2K A; 2CT4 A; 1PHT A; 2KRS A; 1WFW A; 4J9E A; 2E5K A; 2LQN A; 4ORZ A; 2OI3 A; 4ZNX A; 1ARK A; 4IIO A; 2RQT A; 1AWO A; 1H8K A; 2EQI A; 2YUN A; 3H0I A; 4KRT A; 4AFQ C; 3VRZ A; 2HCK A; 1GCP A; 1KSW A; 4A63 B; 3U23 A; 2KRO A; 2EYW A; 4DEY A; 4LUE A; 1J3T A; 4RTW A; 2GGR A; 4Y92 A; 1RUW A; 2FRW A; 2DVJ A; 1X6B A; 1SHF A; 2JW4 A; 2GTJ A; 2DM1 A; 3H0H A; 2RQV A; 1HD3 A; 1RLP C; 4HVU A; 2SRC A; 4JZ3 A; 1YWO A; 4RUG A; 2ESW A; 3C0C A; 1AZG B; 2J6O A; 1UDL A; 1QWF A; 2KBT A; 1GFD A; 1K1Z A; 2C0T A; 4JJB A; 1JU5 C; 2K6D A; 2LP5 A; 3M0T A; 1QCF A; 4F17 A; 1LCK A; 3EHQ A; 2KRN A; 1RI9 A; 3QWX X; 3EHR A; 3SHW A; 2NUZ A; 1T3S A; 2LMJ A; 4RTU A; 3RBB B; 1UHF A; 2B86 A; 4HCK A; 1V1C A; 1X27 A; 4OML A; 1W6X A; 2P4R A; 4OMO A; 2FPF A; 4Z8A A; 1WXU A; 2L3Q A; 1AOJ A; 1M3A A; 2C0O A; 5GJV B; 4AFS C; 3NMZ C; 2EGC A; 3SEM A; 1M8M A; 1T0H A; 2EVR A; 1VYV A; 1GCQ A; 2AKK A; 3A98 A; 1X2Q A; 2YDL A; 1M30 A; 2HBW A; 1UHC A; 4J9C A; 3H0F A; 5IHI A; 1OPK A; 2O2O A; 1SHG A; 2JT4 A; 4J9G A; 1ZUK A; 1ZSG A; 2SEM A; 1NM7 A; 1M3C A; 5FWB A; 1HSQ A; 2DF6 A; 1FMK A; 3EGU A; 3VS6 A; 2DL7 A; 2FEI A; 1WLP B; 2GQI A; 1NG2 A; 3TVT A; 1Z9Q A; 1E6G A; 2G6F X; 2KGT A; 2RQW A; 1WXT A; 1PKS A; 2MCN A; 1QLY A; 3UA7 A; 2LCS A; 3CQT A; 3TSZ A; 1I07 A; 2AKL A; 1CKA A; 1WYX A; 4OMP A; 1TUD A; 3I5R A; 2F2V A; 2L3S A; #chains in the Genus database with same CATH topology 1YIT A; 2JM8 A; 1AD5 A; 2RN8 A; 4AFZ C; 2PVO B; 5I2M A; 4M7D G; 1NJI U; 5FWC A; 3RKW A; 4UC4 A; 2EYX A; 5CQX A; 4RTY A; 2J06 A; 2FZC B; 5KE2 A; 2RNA A; 1KD1 C; 4M77 E; 3CD6 T; 2EKH A; 4J6W A; 4JJC A; 4M77 A; 5LJ5 e; 3CCL T; 1SPK A; 2RQU A; 1KQ1 A; 4M75 B; 2ZCF B; 2BE7 D; 2OJ2 A; 1X69 A; 3QJY A; 2E6N A; 1Y96 A; 4OB1 B; 3QYH B; 4WF2 A; 1VQP T; 1HJD A; 4RG2 A; 2E3H A; 1WHJ A; 1JEG A; 3CCR Q; 1N8R R; 4XK8 E; 5KYW B; 2LQW A; 1PNJ A; 2DTO A; 1F1B B; 2QQB A; 3M58 A; 2AZS A; 1QVG S; 2M51 A; 2CH4 W; 2HSP A; 4DBF A; 4R56 A; 1TWB A; 3G71 A; 4HCB A; 5AYF A; 3QUI A; 1K8A U; 1Y57 A; 3PE0 A; 4MZP A; 1UJY A; 5FW9 A; 1RAB B; 4JPB W; 2EJ9 A; 4JLI A; 4M77 C; 2ZPE B; 1KQS A; 2D0N A; 2BKD N; 2MPX C; 3OYC A; 1VQL T; 3GOX A; 1VA7 A; 2KI7 A; 1YP5 A; 2LJ0 A; 2DJZ A; 4QQG A; 4C8Q G; 4DA4 A; 2PTK A; 4M75 F; 2HAX A; 4DBQ A; 3MJX A; 5KH6 A; 1Q81 U; 2RO0 A; 4JJD A; 4OP0 A; 4E2F B; 2F2X A; 2W0Z A; 1UGV A; 2FPD A; 2QEX T; 1GBQ A; 3FIF A; 1MV3 A; 2RK1 A; 1WHG A; 2LNH B; 4FSS A; 3UWN A; 4BY6 C; 4A4K A; 4N4H A; 1MV0 B; 1BU1 A; 5HKC A; 1JJ2 A; 2JXB A; 3KBG A; 4FT2 A; 4M7D B; 3TSW A; 3EG3 A; 2X3W D; 5GAM j; 1KHI A; 3G6E T; 4M7A D; 2O4X B; 2WSC E; 2XK0 A; 1BBZ A; 2H3E B; 1WHK A; 2P4T A; 4MZT A; 5D6X A; 1MHN A; 4RCB A; 2DKG A; 4NL3 A; 1KD1 U; 1YJW Q; 1WX6 A; 2FHD A; 1FMW A; 1QKW A; 2EAY A; 2PUK B; 1VQ7 Q; 2J6K A; 3MKD A; 1V29 B; 2XIC A; 4Y91 A; 1D1A A; 1NE8 A; 4E7J A; 1Q86 C; 3EG0 A; 4FU6 A; 4L6V 5; 1BCM A; 5AT1 B; 2MWP A; 1XOV A; 1WI7 A; 2LZ6 B; 2XMF A; 1JXM A; 4PFZ A; 1G2B A; 2E12 A; 1ABQ A; 4PJN A; 3MP6 A; 3LYI A; 4NL2 A; 2O88 A; 4J6X A; 1I5O B; 5GAO r; 3SFM A; 3HRT A; 2PUO B; 1PM3 A; 4ZN1 A; 3Q1J A; 4M7D F; 3D7S B; 3BFM A; 1YWP A; 1PCX A; 2YRC A; 1VQK A; 3LX7 A; 2DRM A; 3HRS A; 4C8Q B; 4MML A; 1H64 1; 4C0D C; 3QZ9 B; 2JM9 A; 3V8K A; 1QP3 A; 1R0B G; 2EIF A; 4R0K A; 1WXB A; 3ZBD A; 3CPW S; 2KEA A; 2HNI A; 2DL8 A; 3A8G B; 2M9U A; 2V1R A; 1PD1 A; 2EYY A; 1AVZ C; 2EGA A; 1VYU A; 2O9V A; 1MGQ A; 1WHM A; 4BUG A; 1M2V B; 2K4Y A; 1BCO A; 3CCJ A; 4RTZ A; 1KJW A; 5IXB A; 5KYY A; 1QKX A; 3I56 A; 1TG0 A; 4C0F A; 3OYE A; 4J7I A; 2O9S A; 5LL6 S; 4BI8 B; 4JUV A; 2J7I A; 3C4S A; 1WIE A; 2EQK A; 2LC4 A; 3CCR T; 4MDW A; 4V2S A; 2QTV A; 1QVF P; 4D8K A; 5HY6 A; 1D3B B; 1U1S A; 1X01 A; 1OUL A; 4ESR A; 4RG8 A; 1NEG A; 2CS7 A; 1I5L A; 3JCM X; 3KFV A; 1K73 R; 4DEX A; 2CP0 A; 2YLB A; 1KD1 R; 1ZHI A; 5CKH A; 4J8O A; 5D7U A; 1GRI A; 5C0M A; 3C94 A; 2RJF A; 1EX4 A; 1KK7 A; 3A8O B; 2PVD B; 3HP9 A; 4C5E A; 2GBQ A; 2GFU A; 4C5G A; 1RAI B; 1TXQ A; 2FL7 A; 2VXE A; 4M7A G; 2BZY A; 4IUT A; 3OYM A; 3J81 E; 3MEW A; 4C92 E; 3CBM A; 3FLG A; 1QCN A; 1BI3 A; 2KVQ G; 3VS2 A; 5CIU A; 2DXB A; 2KYM A; 1VQM Q; 4C92 A; 1Q86 U; 3RUX A; 1MNE A; 2V8K A; 5M9O A; 1X2K A; 3CC2 Q; 2CT4 A; 1C1A A; 5GAN f; 1PHT A; 2KRS A; 1ZSZ B; 4J9E A; 3EG9 B; 2LQN A; 5FU6 B; 1W2B S; 3VKI A; 1M1F A; 3GP8 A; 2ZPH B; 1YFN A; 5LJ3 f; 1ARK A; 4IIO A; 2RQT A; 4AMC A; 4XTV A; 2KY9 A; 4PL6 A; 1SSF A; 3VRZ A; 1SG5 A; 3U23 A; 2KRO A; 4DEY A; 4LUE A; 2FVU A; 3LWI A; 2DEQ A; 5CKD A; 1ACM B; 1RAC B; 1RLP C; 4OB0 B; 4BAC A; 1TU0 B; 1YHQ Q; 3GLX A; 2LT4 A; 2BE9 B; 2J6O A; 1WNL A; 4LDV A; 4PJO E; 2EJF A; 2JTM A; 4C92 C; 1K1Z A; 3CCE Q; 1JU5 C; 2K6D A; 1YJW T; 3L1A A; 4C0G A; 4PJO A; 5CAI A; 1PSF A; 1QCF A; 3QPH A; 1UGQ B; 4PNO A; 2R5M A; 5LJ5 f; 3CEY A; 4QKU A; 3TCJ A; 2EFI A; 4E7S A; 1N8R C; 1VIF A; 2C06 A; 3S3O A; 3CME Q; 1T3S A; 2XD0 A; 4M78 A; 3JCM P; 4LDU A; 1MMG A; 2P0Q A; 4KUI A; 4PJM A; 3EFO B; 4HCK A; 3OW2 P; 2H3J A; 1AOJ A; 1M3A A; 2GFA A; 4A4H A; 4AFS C; 4E47 A; 3SEM A; 1V76 A; 2JTF A; 1MMN A; 2AKK A; 2EVR A; 2XID A; 1BIA A; 4HCC A; 4ZTF A; 1ZA2 B; 3JAM E; 4M7A B; 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1K0S A; 4BE0 A; 3CD6 A; 3I9Q A; 5KYX A; 2CSQ A; 4F7U A; 2VC8 A; 1TOV A; 2CP6 A; 5I11 A; 4ZN3 A; 3G71 Q; 2CZ7 B; 1C6V X; 4HT8 A; 3HSB A; 1RAD B; 2BIV A; 4B6M A; 3JB9 J; 3THK A; 4CI0 C; 1OOT A; 4C92 D; 2P0P A; 2QK0 A; 1XTD A; 2VB6 A; 5J3B A; 1UTI A; 1Y96 B; 1YHQ T; 3JCM g; 4JRI A; 4J9F A; 3REB B; 4JZ4 A; 4BDY A; 4E7Z A; 2DMO A; 4II1 A; 2YLC A; 3I35 A; 4EMK C; 2CYZ B; 3E2U A; 3CCE T; 5FRN A; 5A0G A; 4CC7 A; 3OW2 A; 3VS3 A; 4KH0 B; 1PG5 B; 5GAN h; 2CZ0 B; 2JZ2 A; 3CME T; 3OYF A; 4HT9 A; 1FMV A; 5IT9 E; 2AK5 A; 3CCM T; 5GAO m; 1B34 A; 1WGS A; 5LJ3 h; 3VS0 A; 2DJQ A; 1JBM A; 1TSF A; 1K73 C; 2E64 A; 1TH7 A; 2AZV A; 1WA7 A; 1QW1 A; 2HQH A; 2OAW A; 4A4F A; 1EZZ B; 2VGM A; 4J7F A; 5D6W A; 3LLR A; 4MZM A; 2P84 A; 3PTA A; 1C0M A; 2JJ9 A; 1KIK A; 3J7A F; 3CCS T; 2DL4 A; 2PVG B; 1S72 Q; 3PVQ A; 4MMK A; 2LX9 A; 1WDX A; 2MAM A; 5GAN d; 1IHW A; 4KGV B; 2B8A A; 4HA8 A; 2XG8 D; 2IIM A; 2FPE A; 1NZ9 A; 2IVW A; 2RD1 A; 1UGS B; 1QCO A; 2LRQ A; 5LJ3 d; 2X35 A; 1OYX A; 2MIO A; 5LJ5 h; 2ZGW A; 5GAN 8; 1FYN A; 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