1B1YA

Sevenfold mutant of barley beta-amylase
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
500
structure length
500
Chain Sequence
MKGNYVQVYVMLPLDAVSVNNRFEKGDELRAQLRKLVEAGVDGVMVDVWWGLVEGKGPKAYDWSAYKQLFELVQKAGLKLQAIMSFHQCGGNVGDAVNIPIPQWVRDVGTRDPDIFYTDGHGTRNIEYLTLGVDNQPLFHGRSAVQMYADYMTSFRENMKDFLDAGVIVDIEVGLGPAGELRYPSYPQSHGWSFPGIGEFICYDKYLQADFKAAAAAVGHPEWEFPNDAGQYNDTPERTQFFRDNGTYLSEKGRFFLAWYSNNLIKHGDRILDEANKVFLGYKVQLAIKIAGVHWWYKVPSHAAELTAGYYNLHDRDGYRTIARMLKRHRASINFTCAEMRDSEQPPDAMSAPEELVQQVLSAGWREGLNVSCENALPRYDPTAYNTILRNARPHGINQSGPPEHKLFGFTYLRLSNQLVEGQNYVNFKTFVDRMHANLPRDPYVDPMAPLPRSGPEISIEMILQAAQPKIQPFPFQEHTDLPVGPTGGMGGQAEGPTCG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (BETA-AMYLASE)
publication title The crystal structure of the sevenfold mutant of barley beta-amylase with increased thermostability at 2.5 A resolution.
pubmed doi rcsb
source organism Hordeum vulgare
total genus 164
structure length 500
sequence length 500
ec nomenclature ec 3.2.1.2: Beta-amylase.
pdb deposition date 1998-11-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01373 Glyco_hydro_14 Glycosyl hydrolase family 14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1b1yA00
5HDRA 5CGTA 4MADA 4W87A 2G3JA 3RJXA 5BRQA 1NARA 3SCUA 3W6MA 4PTMA 4P7QA 2VRKA 3AS2A 3VIPA 3AOFA 3HJEA 1V3LA 1CXIA 3AXXA 3ZSTA 4PMZA 4W8AA 2WCAA 1EA9C 1XYZA 2D0HA 2VUYA 2F8QA 3WBAA 1R7AA 2WK2A 3TONA 1L0PA 4WKHA 4FLSA 4WKAA 2HVMA 1YQ2A 1G9HA 3GZAA 3VGFA 1JZ6A 1A47A 3SCVA 1WZKA 1V6WA 2GJRA 3ZJKA 2VZVA 1CZ1A 2ZXBA 5HBFA 1XD0A 2BVTA 2WW5A 4XUYA 1NP0A 3N15A 1FA2A 3CUJA 2WBGA 1E6RA 2Y2WA 3EMZA 3BLKA 3UR8A 6TAAA 1H49A 2YA1A 5IDIA 5CXPA 4J3XA 1E6QM 4FLRA 2GK1B 3VDHA 5CJ5A 1CGTA 3MMDA 2G3MA 1K9TA 3NYDA 1C92A 2CEQA 5GNYA 3WKZA 4J28A 4URIA 3BAWA 3MMUA 4PTXA 2X0YA 3CZLA 5DF0A 5E09A 1UD2A 3GBDA 1UH3A 1JZ2A 3WNNA 2XGIA 4P8WA 1J0KA 4OKDA 2XIBA 3EMCA 4BQ2A 1CGWA 1EOMA 1GVIA 5EMYA 3AIUA 2GK1A 4AD0A 1E56A 1E1FA 2C0HA 5A3HA 3VD5A 1BVZA 1CXFA 1XRVA 4D6DA 2D23A 2CPUA 5BXSA 1NWSA 3CHCA 4MDPA 4PTVA 1NM9A 4QLKA 4AMCA 1PX8A 4M29A 1PBGA 1OB0A 2GJPA 1TVPA 2OWWA 4AIUA 2BNJA 2ZICA 3MUZ1 3VIOA 1AMYA 1B3XA 2ZUSA 2ZXDA 3VIMA 1PIFA 2QMJA 4Y7EA 3F5JA 3VIIA 4TVDA 1LG1A 2W62A 3PTKA 5C71A 1H4PA 2CERA 2JIWA 2WKGA 1EIBA 2W67A 2YLAA 2EXOA 1W1PA 1SMAA 3CZGA 2WLZA 2YBUA 2WCSA 1OM0A 3W53A 1QI4A 1X1NA 4N42A 1B3VA 1QNPA 1ISYA 4AIOA 1V03A 2DSKA 1UWQA 1E0VA 4WLCA 3LPGA 3ARTA 2YL6A 3AQUA 3BAYA 4PSRA 4F9DA 1BG9A 4NRRA 2BVDA 3SCNA 1UWIA 1TA3B 4FLQA 1CXHA 1QNOA 1GHRA 1SFSA 4J3UA 5A6KA 2FH6A 5LA2A 4ACZB 2ZX7A 5FL1A 1QI2A 4GO9A 3ARUA 1XHGA 1W9VA 1V3MA 1E40A 4OOZA 1GOWA 2E0PA 4AZCB 1CDGA 5CZKA 2E4TA 4FK9A 2VX5A 3WENA 4JHZA 2GVYA 3NDYA 3U57A 2VZOA 1G1YA 1QOXA 5D9NA 4W85A 3BMWA 1TA3A 5DT5A 2O9TA 1VAHA 4MB1A 3CUIA 4OZOA 3ZR6A 1MXGA 1CPUA 3W28A 2J7DA 4ACZA 4LYPA 2YDQA 1W9BM 3VGEA 1E6XM 3RM8A 5I5RA 5E70A 1WDQA 4AZCA 3AIRA 2PWHA 1CTNA 4JIEA 2DH2A 3ZT6A 4W88A 4AZ6A 4JFVA 3AMGA 1UYQA 4M56A 4UFJA 3WD0A 3WQ6A 5M3WA 2TAAA 1JD7A 1Q4NX 3DC0A 1NH6A 3WD1A 1JXKA 1TUXA 2QV4A 3U7VA 1W9XA 3SCQA 2JF6A 2Z1SA 3GDBA 3WY1A 2G4FA 1OD8A 5BROA 1L8NA 1H1NA 2VR5A 2WNWA 5EBAA 1JD9A 2D0GA 5I23A 1EQPA 2E40A 3MUAA 4UQ9A 4HOXA 5HPCA 2YA2A 2WYSA 2BVYA 1E70M 4GKLA 3AISA 1UA7A 2CESA 1HN1A 1F4AA 1CENA 3OZOA 4OBSA 5E6YA 2FHCA 4YN5A 3G6MA 2Y4SA 2E9LA 2WMGA 1C7TA 4TOQA 1UKQA 1KXTA 5JBDA 1UKOA 1DWGM 4W8LA 2ZUVA 1GOKA 2BS9A 3AMDA 3T0BA 1E4IA 4CVUA 2VJXA 1VENA 3GNRA 2E3ZA 1X6LA 4AY1A 3BXWA 1MFVA 2ZX9A 1XGZA 1B1YA 3WNOA 1B3YA 3OA5A 1ODUA 2W92A 3MANA 4NRSA 2BHUA 5M17A 1FH9A 3WL0A 1RP8A 4BZYA 2E9MA 5BXPA 5I79A 4TUFA 3T2QA 3WQVA 1P6WA 1ZJAA 3WH6A 2EPLX 2O92A 2V5DA 4QCEA 1UKSA 1R7OA 2JEQA 4GQQA 1K6AA 2C8NA 4GXPA 1HL9A 2XIIA 1Q6GA 1Z32X 2ZWYA 2EPNA 1IV8A 3OGRA 4H04A 4H8HA 3GTNA 4CD6A 1W2PA 1V6UA 1CXLA 3B9EA 3VUPA 2WZIA 2FHBA 1H3GA 4M81A 4HOZA 2AMGA 3VNYA 2C7FA 3AI0A 5BWFA 2W61A 3E1F1 3AZRA 4BA0A 4R5EA 1HP4A 3WUGA 3NDZA 3MV01 3VX1A 4KGJA 1FH8A 4JKLA 1BAGA 3NSNA 4J7RA 3EBVA 4W5ZA 1ZJBA 2ZE0A 1TE1A 3AIBA 1M03A 2VCCA 4WJXA 4A3YA 1VBUA 1WDRA 3WDRA 3DHUA 4W84A 4D71A 4CU6A 1V6YA 3N04A 4UOZA 2YL8A 4J3TA 2YL5A 3UR7A 1H0GA 3FHQA 4UZUA 3CUHA 3PN8A 3CO4A 4CCCA 1OCQA 4MB5A 4AZ7A 7TAAA 5IXEA 1HVQA 5A6JA 1KCLA 4MJ2A 4KRTA 4AC1X 2WC7A 5A6LA 4PMUA 2XFFA 4D72A 1KGUA 2VCBA 3L4VA 2DT2A 4UQEA 3WF0A 1E0WA 1XV8A 4HOWA 3BAJA 4U2YA 1DWJM 2ESCA 1MW3A 3VD7A 2WMJA 4H7VA 4JKKA 5D9OA 3AHZA 2D3NA 1FH7A 2VL4A 1B2YA 4PMQA 4W7VA 2QHAA 3BC9A 3CLWA 4GZJA 2DH3A 4V27A 3AROA 3IAPA 5DEZA 2WHLA 2WHKA 2J78A 1UR8A 3WSUA 5BXTA 1JDDA 1NP2A 2VVSA 1BSIA 5CSYA 3WELA 3ZQ9A 3WBEA 1GQJA 1Y7VA 2V38A 2PC8A 1CBGA 1C8YA 3SCPA 4AEFA 2PB1A 1HKJA 3EDJA 4HA3A 5LYRA 1ECEA 1WDPA 5E6ZA 2VQTA 2Y24A 3WH8A 2FGLA 3G6LA 3AMCA 3ARZA 2EPKX 5I0DA 5I24A 1V0MA 1XD1A 4P7LA 4E8DA 1I75A 4ZEPA 1UR4A 9CGTA 3N18A 3WF2A 3PBGA 2NW0A 2D22A 1FFQA 1H0IA 3KWXA 3W0KA 4OBRA 1BHGA 3EMQA 2WMKA 4JFSA 3WDIA 1E3ZA 2VR4A 4M82A 2J8FA 2W5FA 4Z2HA 3K1DA 3U5YA 2O9PA 1BPLB 1R8LA 4UFLA 3T2OA 1N82A 4LYQA 4RE3A 2WPGA 4U2ZA 3GXFA 2Y8KA 1U30A 1GJUA 2DT0A 3WDJA 1HP5A 1GQLA 1XYFA 5GPRA 4ZXLA 1TG7A 4ZXOA 4CUCA 1VIWA 1CYGA 3VO0A 3WDPP 4PMXA 1LLOA 1PZ2A 3WQ4A 2XUCA 4PYSA 3GH7A 2ZUWA 2DSUA 2VX7A 1CLXA 2DIJA 1VFUA 3FAXA 1G01A 3MKKA 3I3BA 3N11A 3ZIZA 3KZSA 3MMWA 5D4YA 4TX8A 4UOQA 2WMFA 2OYMA 1ODZA 1WNOA 5AC4A 2XGBA 3VIHA 4X0NA 4AD1A 4GINA 3M6DA 5A94A 1C93A 4CKQA 1GJWA 4Z2JA 3OLEA 1OD0A 5D9MA 1XCWA 1JDAA 3NJ3A 4HZ6A 2V3GA 2XVPA 2CIPA 1ESWA 1MQRA 3BSHA 2MANA 5A1AA 3GXIA 3ARRA 5F7UA 2V3EA 4CN4A 1C90A 1PAMA 4JCMA 3KE0A 2IXVA 3SCWA 3S2CA 4WF7A 1OBAA 1TZ7A 2OLHA 1JF6A 2WKLA 3ALGA 4LYRA 1PZ3A 4PCTA 3WFLA 1UQZA 1ZBVA 4M24A 4BS0A 4EE9A 1J11A 1HJXA 1X6NA 3T0AA 4PMOA 1W3HA 2A3CA 3MO4A 1Q6CA 3VX0A 1QI5A 5BCAA 3T0DA 4XV0A 1MFUA 2VZTA 7CGTA 2ZXAA 2UY5A 3WUFA 1K9FA 1ZBWA 1MQPA 2V3DA 1UZ4A 5C70A 4UFMA 3T09A 3ZSSA 4M1RA 5A6MA 2D24A 1B30A 1KQZA 4HZ7A 2JFEX 4J27A 3ZM8A 3O9NA 1AQHA 3I3DA 3SIMA 4IM4A 2ZX8A 4KRUA 2E8ZA 1LWJA 1M01A 1W9PA 2ZUTA 1LL6A 1WZAA 6A3HA 1QHPA 3UESA 3CPUA 4Z2LA 1EDGA 5EFDA 4UZSA 3W29A 3WNKA 3OB8A 2UY2A 1FOBA 1XSIA 4V28A 2EJ1A 4ML4A 3FAWA 1MYRA 1DHKA 2G3IA 3UCQA 1CWYA 1CGYA 3EYPA 4B9YA 1JZ4A 3PZIA 4KMQA 3SCTA 3L4WA 5I6SA 3FHAA 1WDSA 2FHFA 4GZIA 2VQUA 3RO8A 1UD8A 2VC9A 5BYWA 1ZL1A 4LGXA 2CBIA 5FKYA 1R86A 3L4XA 1VEOA 1HJQA 3WEZA 4F79A 3N13A 3AMLA 3VDCA 4Z2IA 2VMFA 2VTFA 3BAIA 5ABGA 1WPCA 1EO7A 1JAKA 4QFUA 5JIPA 3VILA 1EDQA 1B31A 3VIKA 3PZUA 3TP4A 5HNNA 2QPSA 3AS3A 3W38A 4H8UA 2J7CA 4PUDA 3WD3A 2WMHA 1WCGA 2DPEA 1BYCA 4UQBA 4BQ3A 4WK9A 2WVSA 3THCA 3W81A 3BMVA 4NI3A 3ARVA 3SURA 3GYCA 1CGVA 4K68A 1C3FA 3RDKA 1UD6A 4BQ5A 4EK7A 4HMDA 1BQCA 4P8XA 4CD8A 3VMPA 2CXGA 2JF7A 2XWDA 3POCA 3N1AA 4D6JA 4KGLA 2GDVA 1WKYA 1GQIA 4HU8A 2B31A 4AZIA 5KZ6A 2XHYA 1W9UA 3W4RA 2X8RA 1W1VA 4N0RA 3A47A 1C7SA 3K8KA 1LWHA 1I1WA 5IFTA 5FCZA 4HZ8A 1VFOA 3BLPX 4IISA 2NT0A 2WCGA 4QLJA 2VVNA 1A3HA 4L4OA 5A8NA 1ISVA 1PJ9A 3TTQA 4IUGA 1HIZA 1GW1A 3VD4A 4MAZA 3N17A 1NOFA 3OLGA 2ZIDA 1J0YA 1XSJA 3O6AA 4MNMA 1E3XA 2GFTA 1VFMA 3WEOA 3POHA 2PBOA 5CG0A 2VURA 4X0VA 4MAVA 3VIGA 4JFTA 1GUVA 2EBNA 1D7FA 1MVYA 3D3AA 3FN9A 5I78A 1SR0A 4OJYA 3W6LA 1US2A 2BY0A 5E9AA 1XSKA 1W9DM 3L4TA 3WL1A 2BHZA 4GI8A 3MV11 3WEMA 4ATWA 1VRXA 1QNQA 3VGGA 3W37A 1V6VA 1QVBA 1ZU8A 1UWRA 4X9YA 4CD7A 2BXZA 2NT1A 2DIEA 3DECA 2A3EA 1W1YA 3CMJA 4QCFA 4YHGA 1V0KA 2XVLA 4PBGA 1UWSA 1XH2A 4U3CA 1W91A 4NSBA 1UHVA 1UR2A 4F9JA 3VDBA 5JIWA 1RP9A 1F4HA 4RE2A 1E73M 1H11A 3AXIA 3PZTA 4AD3A 2VX6A 1FHDA 1J10A 4PTWA 3IJ8A 4P8UA 4PMNA 5HOSA 1ZBKA 4GI6A 4CD5A 3PZQA 3AS1A 4AD4A 4OOUA 4HP5A 1QBBA 2EEXA 1MXDA 4B3LA 5IHSA 1DEDA 4PMDA 1ISZA 3CZKA 4QAWA 4JFWA 2DT1A 1V02E 4UOJA 1OGSA 1Q6DA 1YHTA 1E6ZA 3O2LA 3VIJA 1E5NA 1FFRA 1H5VA 3ZOAA 2VRQA 3D5HA 1OT2A 3NIYA 1CEOA 1WB0A 3AYRA 1QHOA 4MNLA 2J7GA 2NSXA 1OIMA 3AHVA 1FP8A 5A8PA 5EFFA 1HKKA 2EPMX 1GZJA 2BV9A 4PMRA 2YA0A 5I77A 1U33A 4HTYA 3CZJA 4GZEA 1WO2A 2PF0A 1R85A 4B16A 4DUWA 2WVUA 1UQYA 3AZTA 4U31A 1E5JA 4CU7A 3WQWA 3IAQA 2OWXA 5M5DA 1KR0A 3L4YA 5JBFA 1GQKA 4J3SA 2J7BA 1HF6A 4XX6A 4ACYA 1VJZA 3PZVA 3HN3A 4TTGA 2W91A 1J0JA 3F5LA 1CXKA 1JNEA 1BYBA 3AHTA 3II1A 4KWUA 2YDSA 4QLLA 1KWKA 2RGLA 1TR1A 4BF7A 2XVGA 4Z2GA 1PX3A 2CHOA 5IHRA 5AY7A 5FL0A 3ZO9A 4JCLA 3KL0A 4A4AA 1GOMA 1EXPA 3WUBA 4Z2KA 1CLVA 3N12A 1ZB5A 4MTVA 3ZJ8A 2PWDA 5BRPA 5AYIA 4M80A 1CXEA 3VGBA 2Y8VA 4TVCA 2EPOA 2VT0A 3TTYA 2WC4A 2YDRA 3WNLA 1JDCA 4U5KA 4E2OA 1ZBCA 1HXJA 3QHOA 3U5UA 3SUSA 1UOKA 1ISXA 4PMYA 2GSJA 4S3JA 4HU0A 1E6PA 1OINA 1QHZA 1WP6A 3QHMA 1Q6EA 2JIEA 3TTOA 4CU8A 2D2OA 4EANA 3M07A 3THDA 3MUY1 5DT7A 4AD2A 1E43A 4W7UA 1W1TA 3J7HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5HDR A;  5CGT A;  4MAD A;  4W87 A;  2G3J A;  3RJX A;  5BRQ A;  1NAR A;  3SCU A;  3W6M A;  4PTM A;  4P7Q A;  2VRK A;  3AS2 A;  3VIP A;  3AOF A;  3HJE A;  1V3L A;  1CXI A;  3AXX A;  3ZST A;  4PMZ A;  4W8A A;  2WCA A;  1EA9 C;  1XYZ A;  2D0H A;  2VUY A;  2F8Q A;  3WBA A;  1R7A A;  2WK2 A;  3TON A;  1L0P A;  4WKH A;  4FLS A;  4WKA A;  2HVM A;  1YQ2 A;  1G9H A;  3GZA A;  3VGF A;  1JZ6 A;  1A47 A;  3SCV A;  1WZK A;  1V6W A;  2GJR A;  3ZJK A;  2VZV A;  1CZ1 A;  2ZXB A;  5HBF A;  1XD0 A;  2BVT A;  2WW5 A;  4XUY A;  1NP0 A;  3N15 A;  1FA2 A;  3CUJ A;  2WBG A;  1E6R A;  2Y2W A;  3EMZ A;  3BLK A;  3UR8 A;  6TAA A;  1H49 A;  2YA1 A;  5IDI A;  5CXP A;  4J3X A;  1E6Q M;  4FLR A;  2GK1 B;  3VDH A;  5CJ5 A;  1CGT A;  3MMD A;  2G3M A;  1K9T A;  3NYD A;  1C92 A;  2CEQ A;  5GNY A;  3WKZ A;  4J28 A;  4URI A;  3BAW A;  3MMU A;  4PTX A;  2X0Y A;  3CZL A;  5DF0 A;  5E09 A;  1UD2 A;  3GBD A;  1UH3 A;  1JZ2 A;  3WNN A;  2XGI A;  4P8W A;  1J0K A;  4OKD A;  2XIB A;  3EMC A;  4BQ2 A;  1CGW A;  1EOM A;  1GVI A;  5EMY A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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