The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
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sequence length |
66
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structure length |
66
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Chain Sequence |
LVDPLTTVREQCEQLEKCVKARERLELCDERVSSRSQTEEDCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNSLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
UBIQUINOL CYTOCHROME C OXIDOREDUCTASE
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| publication title |
Electron transfer by domain movement in cytochrome bc1.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
19
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| structure length |
66
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| sequence length |
66
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-03-23 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| H | PF02320 | UCR_hinge | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge protein |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2A06 H; 3BCC H; 1KYO F; 3L75 H; 1L0N H; 3H1I H; 1P84 F; 4D6T H; 5KLV H; 1L0L H; 2IBZ H; 1NTZ H; 3H1H H; 1KB9 F; 1NTM H; 1NU1 H; 3CX5 F; 3L73 H; 1SQP H; 3H1J H; 3L71 H; 1SQX H; 1BGY H; 1BE3 H; 1BCC H; 1NTK H; 2FYU H; 3L72 H; 1EZV H; 1SQQ H; 1PPJ H; 3L70 H; 1SQB H; 1PP9 H; 3H1K H; 3CXH F; 3L74 H; 4PD4 F; 4U3F H; 3CWB H; 2BCC H; 1SQV H; 3TGU H; 3H1L H; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DWD C; 1N32 O; 4PEL A; 2EJ7 A; 4B7E A; 5LGN A; 4FJC C; 2BTO A; 2QTO A; 4I7Z B; 4RQE A; 4MW8 A; 2XT9 A; 1X59 A; 4U7N A; 3ZMZ A; 4IHJ B; 1F23 A; 1MOF A; 3H9V A; 3HKD A; 2YEV A; 1SET A; 4IT5 A; 3SYA A; 3RVZ A; 3RWR D; 1M9N A; 4XDL A; 2B5U A; 3CCQ V; 3B2E E; 4UUJ C; 4EKW A; 3W7X A; 1OCZ B; 1M4U A; 3S3X A; 4WBN A; 1DF4 A; 3ZRX A; 2R70 A; 2WLL B; 4DUZ O; 2JJ2 G; 1MG1 A; 3JAL B; 4TQF A; 4DXW A; 5EC1 C; 5EIB D; 2X0L A; 1N4C A; 1L0N H; 3AG1 C; 2YDE A; 4MVM A; 3JD2 A; 4JZG A; 3K5M A; 3K5L A; 3ZHV A; 1OCC B; 1GM8 A; 1UPG A; 4UVA A; 3GWO A; 4X1I B; 1JOY A; 2ZIM A; 3W7U A; 1K4C C; 4PA9 A; 5BY1 A; 4MTG A; 4LF4 O; 3JSN A; 1Y74 A; 1PNL A; 2ETN A; 5CA1 A; 4W4L A; 3APO A; 5IYZ B; 4LFA B; 3FYE B; 4BIU A; 5C8Y B; 3LNN A; 1H8H G; 3OT7 A; 5KLV H; 5LOV B; 3SYP A; 3TXS A; 1CPY A; 4NKG B; 3H1J H; 4YHH O; 4UB6 Z; 5LMN O; 2YXH A; 1QQC A; 3SJA C; 3BAB A; 3OE7 G; 5BMV B; 3STZ C; 2NNU A; 4TV9 B; 2EUL A; 2EIN B; 2W0X A; 1VQP V; 3QTC A; 2XUM A; 3CCE V; 1XNR O; 3ABK B; 4X62 O; 1KYO F; 1I94 B; 4LFC O; 4HAM A; 1FJG B; 1VF7 A; 4ABM A; 1K4D C; 4B3R O; 2YXL A; 3ABM B; 2WLN A; 3KCY A; 2ADQ B; 3JAS B; 1MA1 A; 1VEW A; 2OCC C; 2WA4 A; 4JI6 B; 5IYD O; 1AI5 A; 5FL7 G; 4U7O A; 1YVW A; 3SPJ A; 2DMX A; 4GKJ O; 1P84 F; 3HKE B; 1V54 B; 4PDM A; 1EBO A; 1R6K A; 2N05 A; 3G71 V; 3CME V; 3M7M X; 4KL1 A; 3AK1 A; 2OT5 A; 3OW2 U; 4H13 B; 2F93 B; 2VQF B; 4Q6G A; 5J2T B; 5BXZ A; 1YXB A; 1PP9 H; 3SPH A; 2JVD A; 1IXB A; 1M93 A; 5IE9 A; 2WPD G; 3K79 A; 5JCO C; 4B3M B; 1S3J A; 2QGN A; 2JGD A; 4DR7 B; 3SYQ A; 5LXT A; 1ROP A; 2EX3 A; 2XAJ A; 1PNM A; 2CH7 A; 2Q67 A; 4K0K B; 1DLB A; 5B1N A; 4WFA V; 4LF5 B; 1SER A; 4X1Y A; 4E4E A; 1RFY A; 5A2Q N; 4YJ2 A; 3UT5 A; 4D7S A; 4DV5 B; 3AG3 C; 3CYO A; 1Q5O A; 4YIP A; 4PJ0 Z; 1ZUQ A; 1F4N A; 4WFB V; 3E22 B; 1HP8 A; 1GM9 A; 2Y4U A; 3J81 N; 4LBE C; 2BCC H; 4JTD B; 5JVD A; 3B4S A; 1GH6 A; 4GLX A; 5GON B; 4JV5 B; 5D5P A; 3C3T A; 3CXC U; 5LHI A; 4IL6 Z; 5JJE B; 2LP7 A; 2ZNJ A; 1QLE C; 4P9O A; 3CJH A; 1YTF D; 2RDC A; 3CEI A; 2EIM C; 2E74 B; 1CXZ B; 4LFB O; 4RUE A; 3CCS V; 3CS5 A; 4LFA O; 1VQO V; 2P5O A; 4FLW A; 2HVJ C; 2E5L B; 1H38 A; 3QF7 A; 4RAI A; 4JZ2 A; 1VQN V; 2Y69 C; 4X89 A; 1B6Q A; 2ILM A; 2QWO B; 1XL6 A; 1Y66 A; 1J5E B; 4ZBM A; 5BZB A; 3ZRS A; 5DED A; 1KU9 A; 5ITZ B; 1I94 O; 1FJG O; 3CD6 V; 1XMQ B; 1K73 W; 1NQT A; 2NLJ C; 1IBK B; 1AIL A; 1GN2 A; 2ZE5 A; 2Q69 A; 1HNZ B; 1XOU A; 3RVY A; 4JI6 O; 4JF3 A; 3T1C A; 4X1I A; 5CN0 A; 1FXK C; 4CZZ A; 1M56 C; 3P3N A; 3BVO A; 2EIJ C; 1P4R A; 2GTS A; 1RM1 C; 3L75 H; 3E35 A; 1US6 A; 2QE7 G; 5F2V O; 1IXM A; 2ZDI C; 2VQF O; 1OCR C; 3G6B A; 1FFX B; 4MTF A; 4CC5 A; 1SQV H; 4UCR A; 1V55 B; 2IJH A; 4FPP A; 3AK3 A; 5JH7 B; 4I5S A; 5C93 A; 4B3M O; 2ZIO A; 4OXS A; 1JCH A; 4DR7 O; 3KCX A; 1SQG A; 3HKC A; 3SJQ C; 1NTK H; 4WFE A; 3F5W C; 4MT8 A; 4FFK A; 2PI5 A; 1PPJ H; 1BSM A; 2BE3 A; 5LP6 A; 5KHJ A; 2P22 C; 2XHB A; 4MVU A; 4K0K O; 4MW3 A; 4J41 A; 1AI6 A; 4DV6 B; 3C3S A; 2P90 A; 2Y0P A; 1OV9 A; 1VQ9 V; 5IT9 N; 2F1M A; 3BRC A; 4WFG A; 5AG2 A; 5L3E A; 1XHZ A; 5L3D A; 4DV5 O; 3JAK A; 2Q8V A; 3OD4 A; 3P32 A; 2Z3Y A; 1TGO A; 1OCZ C; 3OFN G; 4H44 B; 2YEV B; 2CTW A; 3K5N A; 1NVP D; 3VOU A; 1BT8 A; 3CWB H; 1AP5 A; 4JV5 O; 4P9P A; 3J80 N; 4U3J B; 2JGU A; 3A2F A; 2HJF C; 3B77 A; 4YXW G; 5DM6 V; 4WBN B; 5H9C A; 2QTS A; 5B1O A; 4AI8 A; 2Z0A A; 1OCC C; 4JI5 B; 3GB7 C; 1IBL B; 3H1K H; 2DQ3 A; 4JI1 B; 4JYC A; 3CP1 A; 3ZJZ A; 2PYL A; 5KHH A; 2XAS A; 3EHB B; 1W0K G; 2E5L O; 2R72 A; 2CUG A; 1DK1 A; 1SQF A; 4YIO A; 3B09 A; 4J80 A; 2EIL B; 2IU0 A; 4LWS A; 1MZF A; 1G4Y B; 2Q6A A; 2PUS A; 4ASU G; 3M99 B; 5H5N A; 1Y74 B; 3HR0 A; 3CPW U; 5CA1 B; 1J5E O; 2ZXW B; 2HLD G; 3A0B Z; 3JD0 A; 2QKC A; 2EBO A; 2DN9 A; 4JPR A; 1Y4M A; 3MHS C; 2A79 B; 2EIN C; 4QPK A; 1XMQ O; 4GCZ A; 1IBK O; 4FLY A; 2JS3 A; 2QWQ B; 3SPG A; 1HNZ O; 4DR3 O; 3ABK C; 4XDK A; 2CTP A; 1BCC H; 3APQ A; 3U0Z A; 4PI0 A; 4O2A A; 3SYC A; 2GTA A; 4U3F H; 3LDC A; 1ZX3 A; 3E8B A; 1Q81 W; 3M8A A; 4W4K A; 2Q68 A; 1H2S B; 2PF4 E; 1VIB A; 3BHP A; 2DYR C; 3OTO O; 4LF6 B; 4PA6 A; 2QKA A; 1V54 C; 1MAB G; 5CMU A; 3A0R A; 3N27 A; 1NH2 B; 1WB7 A; 2AHZ A; 3J7A U; 4WCE V; 2WLK A; 3K06 A; 3AG4 B; 3L71 H; 3F7V C; 1ZTE A; 3UCS C; 4QPJ A; 4D6T H; 1R1B A; 5J9P C; 1FPO A; 3OUS A; 3ABL B; 3ZBH A; 1DF5 A; 2QM7 A; 4TOI A; 2YUA A; 3B8M A; 3K0D A; 2WLI B; 3W7T A; 2HVK C; 5LMN B; 4DV6 O; 4DR4 B; 1O9H A; 5IY5 B; 2VWK A; 5EYP A; 2RJZ A; 2PI4 A; 4E2L A; 2YSU B; 1U96 A; 4PDL A; 4EFE A; 2Q7H A; 5B3S B; 2ATK C; 5LMU O; 2V1D A; 5EK0 A; 1SC5 B; 3JAR A; 4OPH A; 3VQV A; 4LFC B; 2JGD B; 4BAY A; 5LXT B; 1XQ8 A; 4I50 A; 1MSW D; 2X7R B; 3CE2 A; 2CTR A; 4RQF A; 4FFB A; 2CH7 B; 4ZHQ A; 2X6B A; 4NB5 A; 2UUC O; 2AXT Z; 2OIE A; 2YXY A; 1YTF B; 1ARO P; 3FYI B; 1M90 W; 4X1Y B; 1Q6I A; 3D8C A; 3W7S A; 3UT5 B; 4DO2 A; 1K8A W; 3ML0 A; 3CHX A; 4I9Q A; 1KUQ A; 2P4K A; 4X64 B; 1G1X B; 1FYJ A; 3RYF A; 3G80 A; 4JI5 O; 1R6T A; 1IBL O; 2EZO A; 2IH3 C; 5FLX N; 1NT2 B; 1O9G A; 3KG2 A; 2JK5 C; 3RYC A; 3K59 A; 4JI1 O; 3RT3 C; 1XNQ B; 5JVD B; 1AJP A; 1EN6 A; 4IGG A; 5LYJ A; 2RQ6 A; 3O9O A; 1D2D A; 2HG5 C; 4YY3 B; 4JTC B; 3CJH B; 2QM8 A; 1K7D A; 1DTO A; 5KUK A; 3L9D A; 4UCS A; 3RW0 A; 1PM9 A; 2P67 A; 3OUF A; 4DV1 B; 1URF A; 3THO A; 4PA7 A; 1WJZ A; 3FD9 A; 3ZMS A; 4B08 A; 1RPR A; 4U3J A; 3H1H H; 5H6Q A; 3LSS A; 1TUB A; 5L3F A; 3STL C; 4D7T A; 2HKO A; 5B1A B; 3C90 A; 4TWK A; 3BAA A; 2QKS A; 4CC6 A; 1IBM B; 2DWE C; 4J7K A; 3LSU A; 2P7T C; 1GO3 F; 3SPC A; 2QM4 A; 3CC7 V; 4I55 A; 4KP4 A; 1WA8 B; 1P49 A; 4LF6 O; 4UCT A; 3SJC C; 1FKA O; 2AHY A; 1QLN A; 1JPX A; 2FYU H; 1YJW V; 1WN7 A; 3ZRW B; 1JR9 A; 3BFR A; 3IAY A; 1YJ9 V; 1H2G A; 4LFB B; 1VF6 C; 3W7W A; 3MDS A; 3JCU Z; 1JA8 A; 4P30 A; 2CE4 A; 1SA0 A; 2ZNI A; 1V55 C; 2Z5U A; 4LC1 A; 2JIZ G; 3I56 V; 3RBZ A; 1I5X A; 3HB3 B; 3ICX A; 4QNH B; 4DR4 O; 1AR4 A; 1PKX A; 4I4T A; 1WP8 A; 4DR5 B; 2BSK A; 1FXV A; 3D36 C; 4O4H A; 4BW5 A; 3VQY A; 1AI7 A; 1NVP B; 4C7U A; 1Q86 W; 1GMG A; 5B1B B; 2IM9 A; 3HKC B; 5L3G A; 2JRI A; 3ZIA G; 3L73 H; 2GSM B; 2LGW A; 5L3C A; 5LP6 B; 4WFF A; 3DSQ A; 3IJ4 A; 3ASN B; 5EIB C; 2MW2 B; 4UCV A; 1Y6X A; 1JJO A; 5E1A C; 4UB8 Z; 3UO3 A; 1AB3 A; 3T1H B; 2B1I A; 5JQG A; 3JD1 A; 3FB6 C; 3JAK B; 1H2L A; 4OPA A; 4X64 O; 1OZ0 A; 2ZIN A; 3CX5 F; 3X2Q B; 4DR1 O; 3K08 A; 1BGY H; 2JS5 A; 3FB7 C; 5H2F Z; 3S3W A; 1XNQ O; 1BZK A; 1KQS U; 3D3I A; 1K5S A; 1KBH A; 3MAQ A; 2RNB A; 4TQD A; 2WLI A; 3RYI A; 4B3S B; 4YY3 O; 1VMG A; 1XEQ A; 4LH6 A; 1Y76 A; 3RYH A; 2PTM A; 3TXQ A; 3PJS K; 3VBB A; 4PDR A; 1EFR G; 1GM7 A; 5KHG A; 1BQZ A; 3BY6 A; 4LCU C; 2EIL C; 3CXH F; 1CP9 A; 1PV0 A; 3LNM B; 4LNU A; 4N21 A; 1HNX B; 3VQX A; 2CDY A; 1WP7 A; 1COW G; 3K04 A; 4DV1 O; 5JJJ B; 4JAV A; 1TA8 A; 2ARH A; 2ZXW C; 2BOB C; 3QG5 A; 2UUA B; 1JX9 A; 2WSS G; 2WA3 A; 2GHY A; 4LWS B; 2QEX V; 3AG2 B; 1WNS A; 1AR5 A; 1EN4 A; 1OHH G; 3MHH C; 1IBM O; 3N2K A; 2E75 B; 2N74 A; 3UM7 A; 3CCV V; 4I0X A; 1TVK A; 4KUM A; 2OWO A; 1WPB A; 3OMA B; 2AZ2 A; 3OEE G; 3G6E V; 5IDJ A; 3OEH G; 2FTK A; 4OGQ B; 4K35 A; 1VQ5 V; 1E79 G; 3FB8 C; 1IVS A; 3CCJ V; 2QDO A; 3CRQ A; 4F6R B; 4O2A B; 1NI8 A; 4CH4 A; 4NVP A; 1Z5V A; 1FXH A; 4TUY A; 1GTO A; 2P4V A; 2RMK B; 2ZE7 A; 4KFM A; 2IW5 A; 1N33 O; 2OTL V; 3AG4 C; 2GDS A; 4PA3 A; 1WAZ A; 2EZP A; 2LFR A; 1NU1 H; 2YI8 A; 1LUW A; 2WWW A; 3IFX A; 1QBZ A; 2Y48 A; 4J9Z B; 3SDL A; 1KKC A; 3ABL C; 3CB2 A; 1NZ6 A; 1KP2 A; 1NR7 A; 3DTU B; 5LA6 A; 5H6R A; 4DR5 O; 1YI2 V; 4GYC B; 4NXN B; 4JI4 O; 1WA8 A; 4BWA A; 1SRY A; 2VQE B; 4UV9 A; 5B3S C; 2W6I G; 1Z5W A; 3OMI B; 4DR3 B; 3R66 A; 2IJJ A; 4ZI7 A; 4XDJ A; 4J7Z A; 5EYP B; 2LW7 A; 3ZRW A; 4CS2 A; 1VQ8 V; 4UFZ A; 3T1H O; 3E8H A; 4NTY A; 1J95 A; 2KKW A; 3G4S V; 4GX5 A; 3JAR B; 3JSL A; 4JAA A; 4X66 B; 2Y4T A; 4I50 B; 4CH6 A; 1R3K C; 1ENV A; 4FFB B; 4ZHQ B; 3OTO B; 5FPR A; 3JD4 A; 4RWU A; 4QJF B; 2EIK B; 3A8T A; 2W0F C; 2WAM A; 4FM1 A; 3AG1 B; 4B3S O; 3JAT A; 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2BSK B; 4O4H B; 3ASN C; 2H8P C; 3K57 A; 2UXC B; 1YEW A; 2B9Z A; 4X66 O; 4I9W A; 4YJ3 A; 4ZOL A; 4MVS A; 2LQT A; 1S77 D; 4PDV A; 3CCR V; 4UV8 A; 1YSC A; 3BEH A; 3N2G A; 3X2Q C; 4DW0 A; 1KC8 W; 4NYK A; 4LF7 B; 1PL0 A; 3OR6 C; 1XBL A; 5JQG B; 1RSO A; 1HW7 A; 4FLT A; 3P3P A; 4MVO A; 5EBW C; 4X20 A; 5B5E Z; 2XAH A; 4F6E A; 3K03 A; 3AEI A; 3CRR A; 1ZWI C; 2Y0I A; 4GX0 A; 4MS2 A; 2UXB O; 1I08 A; 2O57 A; 1YZB A; 3RYI B; 3CCM V; 4CS3 A; 3QO8 A; 4JI3 O; 3ASO B; 4X1K A; 4G2K A; 1AJQ A; 1Y76 B; 4X9Q A; 1K3E A; 3DC6 A; 3RYH B; 3OGI B; 3ETQ A; 1L8D A; 2FL4 A; 3JD3 A; 2L6L A; 4LNU B; 4J11 A; 1M5I A; 3AG2 C; 1N36 O; 4BW9 A; 2IJI A; 1HDJ A; 4L87 A; 4IIJ A; 1W0J G; 4OX9 B; 1KP3 A; 1Z2G A; 1XHX A; 2XAG A; 3DXR A; 3WG7 B; 1WLE A; 2UXD B; 4JI8 B; 3N2K B; 2A7W A; 1IX9 A; 3FX7 A; 5TIS Z; 2LW1 A; 1TVK B; 4I0X B; 5EBM C; 1ZAU A; 3QNE A; 4DR1 B; 1SQB H; 2HHH B; 1XIL A; 1BL8 A; 1F51 A; 5IJ9 A; 3K9S A; 4O4J A; 5CA3 A; 5EC2 C; 3CRM A; 4X8A A; 1K33 A; 4QIW F; 5L3B A; 4GUN A; 3U11 A; 5DN6 G; 4DR2 O; 2EJR A; 1TUE B; 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